2W2JA

Crystal structure of the human carbonic anhydrase related protein viii
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
EEEGVEWGYEEGVEWGLVFPDANGEYQSPINLNSREARYDPSLLDVRLSPNYVVCRDCEVTNDGHTIQVILKSKSVLSGGPLPQGHEFELYEVRFHWGRENQRGSEHTVNFKAFPMELHLIHWNSTLFGSIDEAVGKPHGIAIIALFVQIGKEHVGLKAVTEILQDIQYKGKSKTIPCFNPNTLLPDPLLRDYWVYEGSLTIPPCSEGVTWILFRYPLTISQLQIEEFRRLRTHVKGAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDRVIRAAFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Human Carbonic Anhydrase-Related Protein Viii Reveals the Basis for Catalytic Silencing.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE-RELATED PROTEIN
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 268
sequence length 268
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2w2jA00
2WEHA 3RJ7A 1YO1A 3U7CA 3V5GA 4YGNA 1CCUA 1YDBA 3P5AA 5BRVA 1HCBA 3CA2A 1CCSA 1Z97A 1CAOA 4QJ0A 5JDVB 1CNBA 3S73B 3R16A 4RIVA 2HNCA 5DSIA 3DA2A 4ILXA 4K0SA 5C8IA 3D8WA 3PYKA 3U47A 2IT4A 1BCDA 3SAXA 1FLJA 4MDGA 1A42A 1HECA 4K1QA 1LUGA 4M2VA 5JEGB 4PQ7A 1G0FA 2AW1A 1CANA 2NXRA 4MLTA 4TWMA 3ZP9A 1KEQA 5AMGA 5FLTA 1CNIA 1TG3A 3MNIA 1CVFA 2ZNCA 2CBBA 1G1DA 1CAJA 4Q6EA 3N4BA 4Q8XA 3NJ9A 5EH7A 2FOVA 1RAZA 2FOQA 4N16A 2ILIA 1CZMA 5BYIA 1YO2A 3U45X 5BRUA 9CA2A 5CACA 2AX2A 4YGFA 2CABA 1IF7A 5BRWA 1KOQA 1CAYA 2NNGA 2ABEA 4E5QA 5G03A 1ZE8A 4CA2A 1IF5A 1CRMA 1G45A 4KAPA 1CCTA 1JV0A 4RUYA 4RFDA 4LHIA 5DSLA 5L3OA 2O4ZA 4XZ5A 1ZGFA 2QP6A 1UGDA 1ZSCA 4CQ0A 2FMZA 5AMDA 3HKNA 1V9EA 4CNWA 1BNNA 3IBLA 1DCBA 2HOCA 1XEVA 4KNNA 5E5UA 3MMFA 5FNMA 3DD0A 4ZWIA 1LGDA 2OSMA 5JEHB 5FDCA 1CAZA 2H15A 4JSZA 1UGGA 1G54A 1KOPA 1HUHA 4Z1EA 1G48A 3M1KA 1CNGA 4QSAA 4Q0LA 4FIKA 2POWA 5DOGA 5DSJA 3RZ7A 3KONA 4DZ9A 4RFCA 4Q7WA 3K2FA 1YDDA 3MHIA 5EZTX 1RZAA 3OKUA 1YDAA 1ZFKA 1BNMA 4Q78A 2WEGA 2HFWA 1FR4A 3KOKA 3Q31A 3MDZA 4MDMA 4YHAA 4YXUA 2CBCA 4FRCA 4KNJA 5JEPB 3F7BA 1CVAA 1AM6A 4QJPA 2FNMA 1I9QA 4GL1X 4QK1A 5FNIA 3DVDA 5E2MA 3V3GB 4BCWA 1I9PA 3B4FA 4QK2A 4E4AA 2H4NA 2CA2A 3V2JA 4QSBA 3OIKA 3MZCA 1CVBA 5L6KA 4CNRA 3P58A 5SZ3A 3DCWA 3K34A 4QJOA 4RH2A 5EKHA 2POUA 4L5VA 4XIWA 3HS4A 3S74B 4YGKA 4ZX0A 5FDIA 3OILA 1Z93A 5EHEA 3ML2A 1CAMA 3V7XA 2NNVA 5J8ZA 1G3ZA 3T84A 3M5TA 2X7UA 4KP5A 1UGBA 4E3HA 4Q87A 4JSWA 4M2UA 3RZ1B 1FSQA 3S71B 4R5AA 2WEOA 3MNHA 4QIYA 3RYYA 4E49A 5JGSB 2OSFA 1CAKA 4YXOA 3F7UA 4RUXA 3TVNX 4Q08A 4WUQA 1LG6A 3M3XA 4YVYA 5DOHA 4Q90A 2NWPA 4KUWA 4QIZA 1V9IC 3OY0A 5EKJA 1RJ6A 4HEZA 5E2RA 4KNIA 3IEOA 3CZVA 3F8EA 3F4XA 3S9TA 1CVDA 4RIUA 2HKKA 5SZ1A 1CIMA 3RLDA 4HBAA 4Q49A 4WL4A 3HKTA 4HEYA 2FNKA 1F2WA 4G0CA 5EKMA 1CRAA 4Q09A 4ZX1A 3RG4A 1CA2A 1FQNA 2QOAA 5FNHA 4KNMA 1ZSBA 4Q9YA 3IGPA 1JCZA 1I9LA 3C7PA 4DZ7A 5LMDA 3V3FA 4Y0JA 2NWYA 3DVCA 5G0CA 3RYVB 4JS6A 1DCAA 1TE3X 4Q7PA 4Q7SA 3S75B 3FE4A 3KLDB 4HU1A 1HVAA 1J9WA 3BL1A 3DVBA 3T85A 5JGTB 4Q7VA 4Z0QA 5EH5A 3NB5A 3KNEA 3W6IA 5JQ0A 1G0EA 4XFWA 2GD8A 3SBIA 3FFPX 2CBAA 1TH9A 3KOIA 2CBEA 2NXTA 4ITPA 5DSQA 4HT0A 1RAYA 1RZDA 3JXHC 2FOUA 4QK3A 3UYQA 1IF6A 1OKLA 3MNUA 4QSJA 3T83A 5DSMA 1OQ5A 3HKUA 1CVEA 1BV3A 4FU5A 3P3HA 1TTMA 2FOSA 1FR7A 3DV7A 4Z1JA 5CJFA 1BN4A 1HCAA 3BL0A 3GZ0A 3IBIA 5A6HA 4YGLA 3P55A 1KWQA 3T5UA 4YYTA 3RZ0B 4N0XB 3M96A 3HKQA 3M67A 3KKXA 3BETA 1HUGA 2WEJA 1Z9YA 4ITOA 1LZVA 2X7TA 4MO8A 1CILA 1HEAA 3CAJA 4UOVA 1OKMA 3M5SA 3S72B 5DSPA 5FNLA 3M2ZA 1H4NA 2FOYA 1YO0A 5BNLA 3KS3A 4HEWA 4WR7A 4C3TA 2CBDA 3OIMA 5A25A 5JG5B 4QJXA 3MWOA 5EIJA 2NNOA 1DMYA 4ZAOA 1G6VA 3RGEA 4Q83A 3R17B 4YGJA 1G53A 5E2SA 5SZ5A 2NN1A 1I9NA 1IF8A 3DBUA 4ZWXA 3UYNA 5DSRA 4E3DA 4QJMA 5E28A 1H9NA 1G52A 1TB0X 1MUAA 4PXXA 5SZ4A 3DCSA 3M2XA 4FVNA 3S8XA 1I90A 1FSNA 5E2NA 1ZFQA 4IDRX 4LU3A 4WUPA 4E9OX 3V3IB 3TVOX 5FNJA 3M2YA 1BNWA 3M14A 3ZNCA 1CVCA 1KWRA 1LG5A 1JD0A 3D9ZA 3IBNA 1FSRA 3MNJA 3RYXB 4QSIA 5FNGA 4YWPA 3MHCA 4ZWZA 3TMJA 3DD8A 3PJJA 4BF6A 2NWZA 3RG3A 4FPTA 1I91A 3OYQA 2HD6A 2NNSA 1FQLA 3PO6A 5E2KA 3M1JA 3M1WA 2POVA 4M2WA 2FW4A 1ZSAA 1I9OA 1BNQA 3SBHA 5CA2A 3P5LA 3QYKA 2NN7A 4KV0A 4WW6A 4ETQC 3KWAA 1BNUA 1FQRA 5G0BA 1T9NA 3P3JA 1ZGEA 4RN4A 1UGEA 4CNVA 4WW8A 3JXFA 4ZWYA 1TEUX 5CLUA 3RZ5A 4E3FA 7CA2A 1G4JA 1XPZA 4Q81A 1I8ZA 2WD2A 3N3JA 5SZ6A 1CNWA 3RYZA 5IPZA 3OKVA 4IWZA 3MNKA 2VVBX 3M1QA 5EHWA 4JSSA 3EFTA 4Q99A 1CVHA 2EU2A 1RZCA 3CYUA 4K0TA 1CAIA 1TBTX 4R59A 3IBUA 5EHVA 1G4OA 2WD3A 1CNHA 1TEQX 1RZEA 4PZHA 4QJWA 1TG9A 4Q06A 2GEHA 3HFPA 1XEGA 2Q1QA 4PYXA 8CA2A 1CNKA 5FL4A 4QTLA 3IAIA 2Q38A 4Q6DA 3V3HB 1CINA 1CAHA 1BN3A 1EOUA 1G46A 1I9MA 2NMXA 3M40A 3S76A 3U3AX 5JQTA 3P44A 2FMGA 1URTA 4X5SA 3S78B 4FL7A 4COQA 4MTYA 2F14A 3KIGA 1AZMA 3V2MA 4TWLA 1CNCA 4Q07A 3SAPA 5JESB 4RUZA 5DRSA 2VVAX 5DSOA 1YDCA 3MYQA 5FL5A 5HPJA 4Z1NA 3LXEA 4M2RA 4L5WA 4XE1A 3V3JA 1BNTA 4MLXA 1IF9A 4L5UA 3S77B 5DSNA 3T5ZA 3M2NA 3L14A 5SZ2A 5SZ7A 4G7AA 2EU3A 4XIXA 1CNYA 1THKA 2QO8A 3P4VA 5EH8A 1XQ0A 4K0ZA 3HLJA 3D92A 4JSAA 1HEDA 1CNXA 3MHOA 5AMLA 3OYSA 4PYYA 1CNJA 2EZ7A 3M5EA 4KUYA 1ZNCA 3VBDA 3FW3A 3RYJB 4QEFA 2FNNA 1FQMA 3NI5A 3ML5A 4Q8YA 3MNAA 1BZMA 3DC9A 1AVNA 3MHMA 3RZ8A 3W6HA 1MOOA 5FLOA 4FVOA 3N2PA 3JXGA 3M98A 3S97A 4CACA 4YXIA 5FLQA 1DMXA 2NWOA 5DVXA 4Q8ZA 1BICA 4HT2A 5FLSA 4KUVA 2HL4A 4R5BA 3D0NA 2W2JA 1BN1A 1IF4A 2NXSA 5FLRA 4QY3A 4HF3A 5FLPA 1BNVA 3T82A 4BF1A 1H9QA 5DSKA 5G01A 1RZBA 4KP8A 3B1BA 1UGCA 12CAA 4CNXA 4E3GA 5FL6A 1CALA 2X7SA 2Q1BA 3MHLA 1RJ5A 3D93A 1HEBA 3DAZA 3N0NA 4LP6A 5FNKA 1OKNA 1UGFA 5JG3B 1Y7WA 1ZH9A 6CA2A 5E5RA 4MDLA 3DC3A 3EFIA 4K13A 5SZ0A 3K7KA 4Z1KA 4YX4A 5EOIA 1UGAA 3DCCA 3M04A 1CA3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WEH A;  3RJ7 A;  1YO1 A;  3U7C A;  3V5G A;  4YGN A;  1CCU A;  1YDB A;  3P5A A;  5BRV A;  1HCB A;  3CA2 A;  1CCS A;  1Z97 A;  1CAO A;  4QJ0 A;  5JDV B;  1CNB A;  3S73 B;  3R16 A;  4RIV A;  2HNC A;  5DSI A;  3DA2 A;  4ILX A;  4K0S A;  5C8I A;  3D8W A;  3PYK A;  3U47 A;  2IT4 A;  1BCD A;  3SAX A;  1FLJ A;  4MDG A;  1A42 A;  1HEC A;  4K1Q A;  1LUG A;  4M2V A;  5JEG B;  4PQ7 A;  1G0F A;  2AW1 A;  1CAN A;  2NXR A;  4MLT A;  4TWM A;  3ZP9 A;  1KEQ A;  5AMG A;  5FLT A;  1CNI A;  1TG3 A;  3MNI A;  1CVF A;  2ZNC A;  2CBB A;  1G1D A;  1CAJ A;  4Q6E A;  3N4B A;  4Q8X A;  3NJ9 A;  5EH7 A;  2FOV A;  1RAZ A;  2FOQ A;  4N16 A;  2ILI A;  1CZM A;  5BYI A;  1YO2 A;  3U45 X;  5BRU A;  9CA2 A;  5CAC A;  2AX2 A;  4YGF A;  2CAB A;  1IF7 A;  5BRW A;  1KOQ A;  1CAY A;  2NNG A;  2ABE A;  4E5Q A;  5G03 A;  1ZE8 A;  4CA2 A;  1IF5 A;  1CRM A;  1G45 A;  4KAP A;  1CCT A;  1JV0 A;  4RUY A;  4RFD A;  4LHI A;  5DSL A;  5L3O A;  2O4Z A;  4XZ5 A;  1ZGF A;  2QP6 A;  1UGD A;  1ZSC A;  4CQ0 A;  2FMZ A;  5AMD A;  3HKN A;  1V9E A; 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