2WD3A

Highly potent first examples of dual aromatase-steroid sulfatase inhibitors based on a biphenyl template
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Highly Potent First Examples of Dual Aromatase-Steroid Sulfatase Inhibitors Based on a Biphenyl Template.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
total genus 74
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2wd3A00
4QSBA 2FMGA 2NNGA 2HOCA 1CVHA 1CZMA 3RLDA 4WUQA 3CAJA 9CA2A 2WEGA 2WD3A 4YGJA 3B4FA 4JSZA 4MTYA 4KNMA 3P4VA 4FVNA 5FLPA 4Q8ZA 4JSAA 3T5UA 4XE1A 4Y0JA 1CNBA 2EZ7A 3FE4A 3HLJA 3DVDA 12CAA 1LG6A 3D0NA 2CBDA 4YX4A 4YGKA 4CNWA 5DVXA 3QYKA 4Q90A 4E3FA 1CA3A 4RFDA 5FNLA 1HEDA 3MNKA 5C8IA 4ITPA 2CBEA 3IBIA 4C3TA 5E2MA 2NN7A 2EU3A 1CVEA 3S72B 4RUXA 4CACA 4M2RA 3P3HA 2HFWA 4E3DA 5SZ1A 1TG9A 3PJJA 4Q81A 5SZ6A 1G4JA 5FLOA 1G3ZA 2VVBX 3R17B 4PYXA 3OY0A 3NB5A 4XZ5A 5EKMA 1BNVA 3DA2A 4QK1A 5CJFA 4QJWA 4E3GA 3S75B 5BRVA 1CVCA 5DSKA 5JGTB 2HD6A 3T83A 1I8ZA 3BL1A 1YO2A 4K0TA 4RIVA 3RG3A 3KNEA 3IBNA 5FNGA 3V2JA 2NN1A 1XEVA 5JG3B 5FLSA 4YGNA 3M04A 3RZ7A 4BF6A 3DD0A 4HEZA 2CBBA 5SZ4A 2FOUA 4KNNA 5DRSA 4Z1EA 1CILA 2NWPA 4Q7WA 4YYTA 1JD0A 1ZGFA 1KWQA 4E4AA 4Z0QA 2HNCA 3IAIA 3V3JA 3M3XA 4QSJA 1I9LA 3MHOA 2HL4A 1ZSCA 4QJOA 4ZWIA 3FW3A 3ML2A 4E3HA 1UGEA 3KWAA 3DCSA 1Z93A 5FNHA 1TBTX 1YDBA 4QIYA 4RIUA 5FLTA 1FQMA 3MYQA 3HKNA 5AMLA 1ZE8A 3RYXB 1YO1A 4Q6DA 4HEWA 5EH7A 2QOAA 3HFPA 1CCUA 5FLRA 4MDMA 2CA2A 4HT2A 3W6HA 1RAZA 4LP6A 4KNIA 1CAJA 1FQRA 5DOGA 4Q78A 5FDCA 5AMDA 4KP5A 3MNHA 5DSIA 2NWYA 4ZAOA 3T82A 3D9ZA 4Q9YA 2HKKA 4Q07A 3TVNX 2AW1A 1H4NA 2FMZA 4Z1NA 3PYKA 3V3HB 5AMGA 1TB0X 5JG5B 3W6IA 3F4XA 3KIGA 4M2VA 4XIWA 4Q09A 4HT0A 4X5SA 2Q38A 1BICA 1FR4A 1KOQA 4CA2A 5BNLA 5SZ5A 3FFPX 1G4OA 1HUHA 4JSWA 1HEAA 3T85A 1CNXA 4FRCA 3S71B 3P58A 4G0CA 4RH2A 3S9TA 3N0NA 1OKNA 5DSRA 5JQTA 4BF1A 3CZVA 4QJPA 1Z97A 2FOSA 5E2RA 2OSMA 5A6HA 5FL6A 1BN1A 3V2MA 1UGGA 4DZ9A 2ILIA 3KS3A 4FIKA 2O4ZA 1XPZA 4ILXA 5EKJA 4WUPA 4Q49A 3B1BA 2POWA 1UGFA 4YXIA 4KP8A 1BNNA 5DSPA 1ZGEA 4ZX1A 1RJ6A 4YVYA 1G0EA 4HU1A 1ZH9A 1CAIA 1BCDA 3DCCA 3HKTA 5L3OA 4KAPA 3TVOX 1HUGA 4FPTA 3JXHC 5G01A 3SAPA 5IPZA 1G1DA 3MDZA 3UYQA 1URTA 4WW6A 1UGDA 1RAYA 2QP6A 3SAXA 3RGEA 3U45X 2AX2A 2ABEA 1BNQA 3OIMA 1CALA 3MNAA 4PZHA 5DOHA 1I9MA 2EU2A 3DCWA 5E2KA 3KOIA 2NNVA 3Q31A 5E2NA 1AZMA 3DV7A 2CBCA 4QJXA 1LZVA 1G45A 3KONA 3M14A 3DVCA 1YDCA 4Q0LA 3PO6A 3CYUA 4QJ0A 1IF7A 3RYYA 5A25A 3HS4A 5EH5A 2VVAX 3MMFA 1HEBA 1CRMA 1I90A 3OILA 1ZFQA 3OYSA 5EKHA 2NNSA 3MNUA 4G7AA 1CCTA 2FOYA 4MDLA 5SZ7A 1TEUX 1CCSA 3ML5A 1EOUA 5DSOA 1RZAA 1F2WA 1Z9YA 4RN4A 4QK3A 3U7CA 2X7UA 4RUZA 3U3AX 1CAYA 4GL1X 4YXOA 4LU3A 1YDAA 5SZ3A 1RZCA 3M1JA 3OIKA 1CNWA 1DCAA 4QEFA 1G54A 4Z1KA 1KOPA 4Q99A 2FW4A 1CAZA 1YO0A 3DVBA 3JXFA 4QY3A 1G0FA 4ZWZA 3DC9A 1BNTA 3RYJB 4Q8XA 1FR7A 1RZDA 1DCBA 1RJ5A 4Q08A 5BRWA 2NXSA 2X7TA 3RZ1B 3N2PA 3T5ZA 1CVDA 3EFTA 2FOQA 5FL4A 5FNKA 3V3IB 3KLDB 1CIMA 3DAZA 4HF3A 3P5LA 3U47A 1BV3A 1I9NA 5E5RA 1DMYA 3F7BA 1TEQX 2H15A 4XIXA 3RG4A 3M5SA 3P3JA 4MDGA 4QIZA 1HVAA 3JXGA 4HEYA 4Q7VA 1I91A 5EOIA 1G6VA 1CAHA 4YXUA 1J9WA 4E5QA 3S76A 3ZNCA 1FSRA 3ZP9A 4WR7A 4E9OX 1BN3A 3MHIA 1AVNA 4TWMA 3RZ5A 4Q6EA 3MNJA 5JQ0A 3P5AA 3VBDA 3IGPA 4CQ0A 1ZNCA 4LHIA 1CVAA 2NXTA 3DD8A 3MHMA 5BRUA 1V9EA 1I9QA 1FLJA 3M5EA 3M2NA 5G03A 3M1KA 1IF5A 3M40A 4N0XB 4Q06A 5FDIA 1V9IC 4JSSA 5E2SA 3N4BA 5L6KA 4PYYA 3N3JA 2POVA 4L5UA 3K34A 5JGSB 1CNCA 3MZCA 3F8EA 1CVFA 1TH9A 3V3GB 3BETA 1RZEA 4QJMA 3M96A 1UGAA 7CA2A 6CA2A 3MHCA 1CAMA 4K1QA 1ZFKA 4ZWXA 1LG5A 5E28A 3S97A 1LUGA 2WEJA 4YWPA 4L5VA 3M5TA 4Q87A 1H9NA 1ZSBA 1BNUA 1LGDA 1IF9A 5FL5A 1G53A 4ITOA 1UGBA 1CNHA 3M1QA 1A42A 3P55A 4RFCA 5FNJA 4L5WA 3L14A 5SZ0A 3BL0A 1H9QA 1KWRA 1I9PA 2WD2A 2WEOA 4QTLA 2CBAA 4YGFA 1FSNA 4FVOA 4JS6A 1BNWA 1MUAA 5BYIA 4KNJA 3HKQA 2NMXA 4KV0A 4UOVA 2POUA 4CNVA 1THKA 5DSMA 1CINA 2NWOA 5CLUA 5DSLA 3IBUA 1TG3A 4K0ZA 4PXXA 5FLQA 3MHLA 3S78B 3DBUA 4CNXA 1CNKA 2IT4A 1YDDA 1ZSAA 3SBHA 2NNOA 4KUVA 2ZNCA 3M2ZA 3M98A 5E5UA 3LXEA 4XFWA 4Z1JA 3IEOA 1XEGA 5JESB 1FSQA 2WEHA 1Y7WA 3T84A 8CA2A 1FQNA 1G48A 4KUWA 1CNGA 2FNNA 5CACA 2FOVA 4R59A 4Q8YA 4Q7PA 3F7UA 4KUYA 4N16A 3KOKA 2NXRA 4PQ7A 1BZMA 3DC3A 3S73B 5EHEA 2H4NA 3M67A 4ZX0A 2Q1BA 4M2WA 4R5BA 2QO8A 3NI5A 5DSQA 1HECA 3M2XA 3D93A 4R5AA 4HBAA 3HKUA 1T9NA 3C7PA 3RJ7A 5EH8A 3KKXA 5G0CA 1JV0A 4TWLA 5DSJA 2FNKA 4E49A 3EFIA 5JEGB 4QSAA 4K0SA 1IF4A 5EZTX 4Q7SA 5LMDA 1CAOA 4ETQC 2W2JA 1UGCA 4WW8A 5J8ZA 1HCBA 1CNJA 1IF8A 3MWOA 1MOOA 1BN4A 1OQ5A 4WL4A 1CA2A 3OKUA 5JEPB 2NWZA 4FU5A 3GZ0A 2FNMA 1FQLA 4FL7A 4ZWYA 5CA2A 3P44A 3K7KA 3M2YA 5G0BA 3V3FA 3RZ8A 5DSNA 5FNMA 2CABA 3NJ9A 1CVBA 3TMJA 3IBLA 3OKVA 5JEHB 2Q1QA 3OYQA 1CANA 1RZBA 1CNIA 4IDRX 1G46A 4MO8A 3RYVB 5EIJA 4COQA 3MNIA 3M1WA 4QK2A 1OKMA 4CNRA 4BCWA 3CA2A 3SBIA 3D92A 2OSFA 4QSIA 3V5GA 5JDVB 2GD8A 4MLXA 3S74B 3S77B 4M2UA 4K13A 4MLTA 3S8XA 1TTMA 5SZ2A 1CNYA 1DMXA 5FNIA 3UYNA 1AM6A 2F14A 3RYZA 1TE3X 1XQ0A 4DZ7A 1OKLA 4YGLA 1BNMA 5EHVA 2GEHA 4Q83A 1IF6A 3RZ0B 1KEQA 1G52A 4RUYA 4YHAA 1CAKA 1CRAA 2X7SA 4IWZA 5EHWA 1HCAA 1I9OA 3V7XA 3K2FA 5HPJA 3D8WA 3R16A 1JCZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4QSB A;  2FMG A;  2NNG A;  2HOC A;  1CVH A;  1CZM A;  3RLD A;  4WUQ A;  3CAJ A;  9CA2 A;  2WEG A;  2WD3 A;  4YGJ A;  3B4F A;  4JSZ A;  4MTY A;  4KNM A;  3P4V A;  4FVN A;  5FLP A;  4Q8Z A;  4JSA A;  3T5U A;  4XE1 A;  4Y0J A;  1CNB A;  2EZ7 A;  3FE4 A;  3HLJ A;  3DVD A;  12CA A;  1LG6 A;  3D0N A;  2CBD A;  4YX4 A;  4YGK A;  4CNW A;  5DVX A;  3QYK A;  4Q90 A;  4E3F A;  1CA3 A;  4RFD A;  5FNL A;  1HED A;  3MNK A;  5C8I A;  4ITP A;  2CBE A;  3IBI A;  4C3T A;  5E2M A;  2NN7 A;  2EU3 A;  1CVE A;  3S72 B;  4RUX A;  4CAC A;  4M2R A;  3P3H A;  2HFW A;  4E3D A;  5SZ1 A;  1TG9 A;  3PJJ A;  4Q81 A;  5SZ6 A;  1G4J A;  5FLO A;  1G3Z A;  2VVB X;  3R17 B;  4PYX A;  3OY0 A;  3NB5 A;  4XZ5 A;  5EKM A;  1BNV A;  3DA2 A;  4QK1 A;  5CJF A;  4QJW A;  4E3G A;  3S75 B;  5BRV A;  1CVC A;  5DSK A;  5JGT B;  2HD6 A;  3T83 A;  1I8Z A;  3BL1 A;  1YO2 A;  4K0T A;  4RIV A;  3RG3 A;  3KNE A;  3IBN A;  5FNG A;  3V2J A;  2NN1 A;  1XEV A;  5JG3 B;  5FLS A;  4YGN A;  3M04 A;  3RZ7 A;  4BF6 A;  3DD0 A;  4HEZ A;  2CBB A;  5SZ4 A; 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