The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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Knots found |
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sequence length |
258
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structure length |
249
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Chain Sequence |
WCYEIQTEDPRSSCLGPEKWPGACKENQQSPINIVTARTKVNPRLTPFILVGYDQKQQWPIKNNQHTVEMTLGGGACIIGGDLPARYEAVQLHLHWSNGNDNGSEHSIDGRHFAMEMHIVHKKLKFAVLAFMIEVGDKVNKGFQPLVEALPSISKPHSTSTVRESSLQDMLPPSTKMYTYFRYNGSLTTPNCDETVIWTVYKQPIKIHKNQFLEFSKNLYYDEDQKLNMKDNVRPLQPLGKRQVFKSHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structures of murine carbonic anhydrase IV and human carbonic anhydrase II complexed with brinzolamide: molecular basis of isozyme-drug discrimination.
pubmed rcsb |
| molecule tags |
Lyase
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| source organism |
Mus musculus
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| molecule keywords |
CARBONIC ANHYDRASE IV
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| total genus |
62
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| structure length |
249
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| sequence length |
258
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| other databases |
 KnotProt 2.0: K +31
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| ec nomenclature |
ec
4.2.1.1: Carbonic anhydrase. |
| pdb deposition date | 1998-02-10 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Alpha carbonic anhydrase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3IAI A; 1YDC A; 1KWQ A; 4FL7 A; 4L5U A; 4QY3 A; 2HOC A; 1CIN A; 3M2X A; 2X7T A; 3P5A A; 1YO1 A; 4FVO A; 1G0F A; 1CZM A; 2OSM A; 4Q08 A; 1CVB A; 3IBU A; 4YX4 A; 1TE3 X; 3ML5 A; 3RZ8 A; 4JSZ A; 4ETQ C; 3DV7 A; 3M3X A; 5IPZ A; 4Q8X A; 5FNL A; 1ZNC A; 4CNV A; 2OSF A; 3S9T A; 5SZ2 A; 1BIC A; 2IT4 A; 2Q1Q A; 3M40 A; 4HBA A; 4RUZ A; 5FL6 A; 5FLO A; 2Q1B A; 1ZFK A; 1ZGE A; 3MNA A; 4Q83 A; 4UOV A; 3DAZ A; 3DD8 A; 1AM6 A; 1BN4 A; 1MOO A; 1CRA A; 3KOI A; 3MNI A; 2POW A; 1CNW A; 4QJX A; 4Q9Y A; 5EHV A; 3C7P A; 4QJW A; 2CBD A; 1G3Z A; 4GL1 X; 5FDI A; 5E2M A; 1CRM A; 1FQM A; 1LUG A; 3D0N A; 4QSI A; 3P55 A; 4TWL A; 4YXO A; 4QJM A; 3MNH A; 5LMD A; 3RJ7 A; 3FE4 A; 1BNQ A; 4KV0 A; 4YGF A; 3N2P A; 4CQ0 A; 3D92 A; 5SZ0 A; 5E2N A; 1ZFQ A; 3R17 B; 12CA A; 5E2R A; 4KUW A; 1CAJ A; 3BL1 A; 3HS4 A; 3MNK A; 1FR4 A; 3OKV A; 5EZT X; 5JDV B; 5BRV A; 3IBL A; 4HEZ A; 5A25 A; 1FSQ A; 3DBU A; 3D93 A; 3IEO A; 1YO2 A; 3S75 B; 1CNK A; 4JSW A; 3F7B A; 3M96 A; 1KOQ A; 4Z1K A; 5DOH A; 3P44 A; 4E3F A; 1MUA A; 1AVN A; 1LZV A; 3RLD A; 1DCB A; 1ZSB A; 1BNN A; 4BF6 A; 4Q8Z A; 4N16 A; 5JGT B; 4K0S A; 4FU5 A; 1LGD A; 3T84 A; 3W6H A; 2POU A; 4QK2 A; 2NNS A; 3ZP9 A; 1G48 A; 3K7K A; 3P3J A; 3S73 B; 1XEG A; 3OY0 A; 1ZGF A; 3OYS A; 4QTL A; 4E4A A; 3CAJ A; 5G0B A; 3PYK A; 4YHA A; 4WUP A; 3CYU A; 1TEU X; 2WEO A; 3SBH A; 3U7C A; 4RFD A; 1IF8 A; 3MZC A; 2EU2 A; 4Q90 A; 4Z1N A; 1DMY A; 2FOV A; 3T5Z A; 1G1D A; 3M04 A; 3OIM A; 1FQR A; 5E2K A; 3DCW A; 1YO0 A; 4QJO A; 4QSJ A; 4BF1 A; 7CA2 A; 3MHI A; 5G0C A; 1CCU A; 3LXE A; 3V5G A; 5L6K A; 1HUG A; 1CNX A; 3M1J A; 5FL4 A; 4ZX0 A; 3N4B A; 3T85 A; 1CIL A; 1I9Q A; 4JSS A; 4Q81 A; 3K2F A; 4RUX A; 4E49 A; 3B1B A; 1CNI A; 3F7U A; 1XEV A; 1BV3 A; 1FR7 A; 5SZ6 A; 1YDB A; 5FLP A; 3DD0 A; 4QIY A; 4YGL A; 2CA2 A; 3DC3 A; 4Q99 A; 5EH7 A; 5JGS B; 1TEQ X; 2FMG A; 3S77 B; 4PYX A; 1G6V A; 4Q7W A; 1BCD A; 3U47 A; 1IF7 A; 5EH5 A; 3JXF A; 1CNJ A; 4QK3 A; 2HD6 A; 4C3T A; 2NWZ A; 5JQT A; 6CA2 A; 4Q78 A; 4HT0 A; 1HCB A; 1OKN A; 4XE1 A; 3RZ5 A; 4DZ9 A; 2NN7 A; 1IF5 A; 4FVN A; 2QO8 A; 1BNU A; 4ILX A; 1CVH A; 3KKX A; 5JG3 B; 4QSB A; 5FNK A; 4MDG A; 5SZ1 A; 3D9Z A; 3M2Y A; 3OIK A; 4E3H A; 4IWZ A; 3KWA A; 1RZD A; 3V2M A; 3PJJ A; 5CA2 A; 3MHO A; 3V3J A; 3IGP A; 1G53 A; 1IF6 A; 2Q38 A; 4RN4 A; 5JEG B; 1JCZ A; 1CAL A; 2NWO A; 4Q06 A; 4CAC A; 3M5T A; 2AX2 A; 3P3H A; 2NXR A; 5SZ3 A; 3RYX B; 2HKK A; 4Q07 A; 4ITO A; 4FIK A; 5BYI A; 5EKJ A; 5JG5 B; 3S71 B; 1OQ5 A; 4RIV A; 4ZAO A; 2FNN A; 1TTM A; 5E5U A; 3T83 A; 4CNW A; 4M2W A; 1CNG A; 4RFC A; 3HKN A; 1CNB A; 1CAO A; 1CAM A; 2X7U A; 5EHE A; 3VBD A; 1I9L A; 5EIJ A; 1G52 A; 5C8I A; 4L5V A; 4LHI A; 5JQ0 A; 1CVC A; 1G0E A; 3KNE A; 4KP5 A; 4RIU A; 2NMX A; 3KS3 A; 2POV A; 4MLT A; 4YYT A; 3D8W A; 5EKM A; 1TG9 A; 3MNJ A; 5J8Z A; 1HEC A; 4PYY A; 4Q0L A; 4Q7S A; 2NWP A; 3S76 A; 2EZ7 A; 5DSI A; 2CBC A; 3CZV A; 3MMF A; 5DSP A; 1KOP A; 4ITP A; 1BNT A; 5AMG A; 3M67 A; 2VVB X; 5DSJ A; 1FLJ A; 1UGG A; 5L3O A; 3M98 A; 2F14 A; 5HPJ A; 1J9W A; 2GD8 A; 3S97 A; 1LG5 A; 5JES B; 4Z1E A; 4Q09 A; 4KNJ A; 4R5B A; 3UYQ A; 3DVB A; 1RZA A; 3W6I A; 3HLJ A; 3DVC A; 3NB5 A; 5AMD A; 1JV0 A; 2FNM A; 1IF4 A; 4KP8 A; 3KOK A; 5JEP B; 4MLX A; 5SZ4 A; 3FFP X; 3MNU A; 3GZ0 A; 4N0X B; 4YGN A; 4LP6 A; 4MO8 A; 4ZWZ A; 4QEF A; 4PZH A; 5BRU A; 1CNC A; 3F8E A; 1Z9Y A; 1RJ5 A; 3PO6 A; 4R5A A; 3NI5 A; 3RG4 A; 1UGE A; 1BN3 A; 3MWO A; 4Q7V A; 3ML2 A; 1BN1 A; 3NJ9 A; 4YXU A; 5AML A; 1CAK A; 1TBT X; 3DCS A; 4Q7P A; 5FNM A; 3OKU A; 1EOU A; 2HNC A; 3T5U A; 1G54 A; 5SZ5 A; 3BL0 A; 1BNV A; 1I91 A; 5FDC A; 3SAP A; 4E9O X; 2NN1 A; 2H15 A; 2ZNC A; 4IDR X; 1RZB A; 5EHW A; 2HL4 A; 4HU1 A; 3FW3 A; 5SZ7 A; 2WD3 A; 5DSL A; 1HUH A; 5FLT A; 2NXS A; 4K0T A; 3TVN X; 4G0C A; 1HCA A; 4G7A A; 4KNM A; 1FQN A; 1BNM A; 3EFI A; 1HEB A; 4DZ7 A; 1CCT A; 1CVE A; 1V9E A; 3HKT A; 4KAP A; 1CA2 A; 5G03 A; 1CCS A; 1CAH A; 2ILI A; 4Q87 A; 2NNG A; 5EKH A; 5CAC A; 3EFT A; 1G4O A; 2WD2 A; 5CLU A; 5FL5 A; 5CJF A; 4YWP A; 2CBB A; 1HEA A; 5FNI A; 4Z1J A; 3HKU A; 1CIM A; 4CA2 A; 1ZH9 A; 3MHL A; 1IF9 A; 1TB0 X; 2FMZ A; 2H4N A; 3U3A X; 4FPT A; 1CVF A; 2FOU A; 2NNO A; 1G45 A; 3HKQ A; 8CA2 A; 4WL4 A; 4COQ A; 2FOY A; 4Q6E A; 3RYZ A; 1UGA A; 3RZ1 B; 2NWY A; 2X7S A; 3RGE A; 1BNW A; 5FLQ A; 1LG6 A; 1Z93 A; 1RJ6 A; 3U45 X; 4JSA A; 4E5Q A; 3S74 B; 2CBE A; 3M5E A; 2GEH A; 1YDA A; 4KUY A; 4PXX A; 3UYN A; 1H9N A; 3P5L A; 4WUQ A; 1T9N A; 4WW6 A; 1UGB A; 4M2U A; 4HEY A; 4M2V A; 3DVD A; 9CA2 A; 1HED A; 3S72 B; 3B4F A; 1G4J A; 4XIX A; 4XFW A; 1YDD A; 1FSR A; 4ZWX A; 4Q49 A; 1I9O A; 3M5S A; 4K0Z A; 3V2J A; 2AW1 A; 1OKM A; 3F4X A; 5EH8 A; 1CAZ A; 5DVX A; 4M2R A; 4RUY A; 1F2W A; 3M2N A; 1CAY A; 3RZ7 A; 1TH9 A; 1OKL A; 4JS6 A; 4WR7 A; 5DSK A; 4FRC A; 5FNG A; 3DC9 A; 1KWR A; 1URT A; 5JEH B; 3MHM A; 1XPZ A; 2WEG A; 3MHC A; 1XQ0 A; 5EOI A; 3M1W A; 2CAB A; 1V9I C; 1Y7W A; 1AZM A; 4QJP A; 1A42 A; 3V3I B; 2FW4 A; 3KIG A; 3N0N A; 1HVA A; 4HEW A; 1Z97 A; 2ABE A; 1RZC A; 5DSM A; 4ZX1 A; 2QP6 A; 3RYV B; 3V3H B; 4CNR A; 5FLR A; 4KNN A; 4TWM A; 4MTY A; 3K34 A; 2WEJ A; 3T82 A; 1CAI A; 2FNK A; 5DSR A; 4L5W A; 3MDZ A; 4YXI A; 3TVO X; 4YVY A; 3MYQ A; 1RZE A; 3RYY A; 1ZSA A; 5E28 A; 1DMX A; 4KNI A; 1I8Z A; 2HFW A; 2EU3 A; 2NNV A; 4QK1 A; 4QJ0 A; 4R59 A; 1KEQ A; 5DSQ A; 4MDM A; 1BZM A; 5G01 A; 4E3G A; 4HF3 A; 3V3G B; 2FOS A; 1I9P A; 3JXG A; 1CA3 A; 3HFP A; 1CVA A; 3JXH C; 3SAX A; 4MDL A; 4WW8 A; 3M1Q A; 3RG3 A; 2NXT A; 5E5R A; 1H4N A; 1I9N A; 1I9M A; 3RZ0 B; 1UGC A; 2FOQ A; 4Y0J A; 3DCC A; 2CBA A; 3ZNC A; 2WEH A; 1UGF A; 3L14 A; 4PQ7 A; 4Q8Y A; 4CNX A; 1H9Q A; 1THK A; 3V3F A; 4LU3 A; 1RAY A; 3M2Z A; 3P4V A; 3N3J A; 4ZWY A; 5DSO A; 1UGD A; 5BNL A; 4XZ5 A; 3M1K A; 1G46 A; 2W2J A; 1CNH A; 5FNH A; 4RH2 A; 5FNJ A; 4KUV A; 2VVA X; 4XIW A; 5DSN A; 1DCA A; 3OIL A; 1FSN A; 3Q31 A; 1RAZ A; 1CNY A; 5DOG A; 5FLS A; 3S78 B; 3P58 A; 3KLD B; 3M14 A; 4Q6D A; 2QOA A; 3IBN A; 1ZE8 A; 1JD0 A; 4E3D A; 1CVD A; 4X5S A; 4BCW A; 1I90 A; 3DA2 A; 3QYK A; 3BET A; 1TG3 A; 1CAN A; 3TMJ A; 5DRS A; 4YGK A; 4YGJ A; 4QIZ A; 1ZSC A; 3V7X A; 3IBI A; 3OYQ A; 3KON A; 4HT2 A; 4Z0Q A; 4ZWI A; 4K1Q A; 3SBI A; 4K13 A; 1FQL A; 5BRW A; 3CA2 A; 4QSA A; 5A6H A; 3RYJ B; 2O4Z A; 5E2S A; 3S8X A; 3R16 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3IAI A; 1YDC A; 1KWQ A; 4FL7 A; 4L5U A; 4QY3 A; 2HOC A; 1CIN A; 3M2X A; 2X7T A; 3P5A A; 1YO1 A; 4FVO A; 1G0F A; 1CZM A; 2OSM A; 4Q08 A; 1CVB A; 3IBU A; 4YX4 A; 1TE3 X; 3ML5 A; 3RZ8 A; 4JSZ A; 4ETQ C; 3DV7 A; 3M3X A; 5IPZ A; 4Q8X A; 5FNL A; 1ZNC A; 4CNV A; 2OSF A; 3S9T A; 5SZ2 A; 1BIC A; 2IT4 A; 2Q1Q A; 3M40 A; 4HBA A; 4RUZ A; 5FL6 A; 5FLO A; 2Q1B A; 1ZFK A; 1ZGE A; 3MNA A; 4Q83 A; 4UOV A; 3DAZ A; 3DD8 A; 1AM6 A; 1BN4 A; 1MOO A; 1CRA A; 3KOI A; 3MNI A; 2POW A; 1CNW A; 4QJX A; 4Q9Y A; 5EHV A; 3C7P A; 4QJW A; 2CBD A; 1G3Z A; 4GL1 X; 5FDI A; 5E2M A; 1CRM A; 1FQM A; 1LUG A; 3D0N A; 4QSI A; 3P55 A; 4TWL A; 4YXO A; 4QJM A; 3MNH A; 5LMD A; 3RJ7 A; 3FE4 A; 1BNQ A; 4KV0 A; 4YGF A; 3N2P A; 4CQ0 A; 3D92 A; 5SZ0 A; 5E2N A; 1ZFQ A; 3R17 B; 12CA A; 5E2R A; 4KUW A; 1CAJ A; 3BL1 A; 3HS4 A; 3MNK A; 1FR4 A; 3OKV A; 5EZT X; 5JDV B; 5BRV A; 3IBL A; 4HEZ A; 5A25 A; 1FSQ A; 3DBU A; 3D93 A; 3IEO A; 1YO2 A; 3S75 B; 1CNK A; 4JSW A; 3F7B A; 3M96 A; 1KOQ A; 4Z1K A; 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