3C7PA

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii in complex with stx237
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Anticancer steroid sulfatase inhibitors: synthesis of a potent fluorinated second-generation agent, in vitro and in vivo activities, molecular modeling, and protein crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3c7pA00
3RJ7A 3RZ8A 5DOHA 5E2RA 4YHAA 4WUQA 5BRUA 1THKA 4Q07A 2VVBX 1UGBA 4FU5A 3P3HA 3PYKA 3RG4A 1BNUA 1CCUA 2X7UA 4KP8A 3MNUA 3UYQA 3B1BA 5CJFA 4WW8A 1G3ZA 1IF4A 1ZSCA 3M2ZA 4MLTA 1RAYA 4Q9YA 4UOVA 3HKTA 3V5GA 1LUGA 4YGNA 5FLQA 3DCSA 3M1KA 4KV0A 3DCWA 3T5ZA 3C7PA 1FLJA 3CA2A 2GEHA 3U47A 1G53A 4HBAA 4PQ7A 5A6HA 4QJ0A 5BRVA 5FNKA 3M1QA 3M67A 5G0BA 4CQ0A 1CALA 1ZNCA 3U45X 1Z97A 1RZCA 1V9IC 3DVBA 1DCBA 3HLJA 3N3JA 4QSBA 4Q83A 4YVYA 4Q81A 3P58A 4MDMA 4FPTA 2POWA 3FFPX 5AMLA 4E4AA 1CAMA 3M1WA 1KWRA 3MNHA 5FLRA 4FVNA 4Q78A 5E2SA 5EHVA 4JSAA 4MDGA 1FR4A 1T9NA 1G1DA 1A42A 3KOKA 1G0FA 3IBNA 3MMFA 1MUAA 4L5UA 1LZVA 3NB5A 3KIGA 1YDDA 1I8ZA 3M5EA 3V3HB 2OSFA 2CABA 2FW4A 4RH2A 4WW6A 4R59A 4CNRA 1ZFQA 3M2XA 5CACA 4E3HA 1UGFA 1CVFA 4E3FA 3VBDA 1KOQA 2NNVA 3V7XA 1FQRA 3V3JA 1F2WA 3RYZA 1JCZA 1CNIA 4QK3A 4XFWA 5JEGB 1MOOA 1UGAA 1IF5A 3F7BA 3P5AA 1OKLA 3OYSA 5EH5A 5BNLA 4ZX0A 2QO8A 3MYQA 3P4VA 4ZWXA 1BZMA 2HFWA 3FE4A 4Z1EA 1CAYA 3ZNCA 1RAZA 4FRCA 1CVAA 5DSKA 4ILXA 1FQLA 3S97A 4HEWA 1V9EA 1RZBA 2FOUA 1TB0X 3OYQA 4Q6EA 1CVBA 4E5QA 3IEOA 5E5RA 3RZ5A 3TMJA 1EOUA 2EU2A 3DD8A 1RZAA 1OKNA 1Y7WA 1JD0A 1CA2A 4TWLA 2EZ7A 5J8ZA 4QY3A 3LXEA 9CA2A 1FSQA 1BN4A 5DSMA 3BETA 3S76A 1ZFKA 4L5WA 1XEGA 2AX2A 4CA2A 4FL7A 4RIUA 2CBAA 3MNKA 1H9QA 1CIMA 2FOYA 4Q8ZA 5IPZA 1FQNA 4JSZA 4QSIA 5G0CA 4Q8XA 1G45A 5EKHA 3T84A 5CA2A 4KAPA 1UGGA 2QP6A 5JESB 4PYYA 4RFDA 4YXUA 5SZ2A 4QK2A 3S75B 1LG6A 3UYNA 1CCTA 3P3JA 1IF7A 3RYXB 3NI5A 4Z0QA 5SZ0A 1CRAA 3V2MA 1I90A 1CAIA 5FNHA 4QSAA 5FLTA 3T5UA 3HKUA 1BCDA 4Q6DA 1TBTX 4XIXA 2NWYA 1CAJA 1RJ5A 3DBUA 1XQ0A 3S71B 3MNIA 2WD2A 4JSSA 3M14A 4WR7A 3M1JA 4Q08A 3MHOA 5JEPB 3T83A 4Q7PA 5FNIA 4QK1A 1HECA 5FL4A 3M40A 4LP6A 1YO1A 1XPZA 4CACA 4QIYA 1HUHA 5E2MA 4YX4A 3EFIA 3P5LA 5JGTB 3RYVB 1CNJA 3PO6A 4DZ7A 3R17B 3M98A 2ILIA 2VVAX 4L5VA 5DSNA 4G7AA 4IWZA 4KNMA 3BL0A 4Q8YA 3M5TA 1CVHA 3IBUA 4HT0A 3DC3A 4FVOA 2FNNA 3U3AX 2O4ZA 4Z1NA 3KWAA 3ML5A 1HEBA 3SBIA 2WEOA 1HUGA 4QIZA 3PJJA 5SZ1A 4G0CA 4YXOA 3P44A 3R16A 4FIKA 4E9OX 1TH9A 1YDCA 1CAOA 4Q0LA 3F7UA 3OIKA 4RUXA 4BF6A 5DSJA 1OKMA 4M2RA 2NN1A 4Q7WA 2NXTA 4ZWYA 1H4NA 1ZE8A 3HKQA 4YGKA 2CBDA 3KS3A 4Q99A 3RZ1B 5EKMA 1G46A 3JXGA 4Q09A 5DSIA 4XZ5A 3HFPA 1RZEA 4N0XB 4PXXA 3L14A 2NNGA 3MZCA 3OKUA 4HU1A 1I9OA 2ABEA 1G4JA 3S72B 3S9TA 2NWZA 4ETQC 1BNQA 1LGDA 5CLUA 5JG5B 4RFCA 3D0NA 3QYKA 4XE1A 4RIVA 3RZ0B 4HF3A 2X7TA 5E2NA 1BV3A 2Q38A 3MHIA 4GL1X 4IDRX 2WEHA 3F4XA 5EHEA 4XIWA 1CAZA 2Q1QA 4LHIA 4JS6A 1BNTA 3D9ZA 3S73B 4RUYA 3ZP9A 1CINA 2H15A 5BYIA 5EZTX 3MNAA 4E49A 1AVNA 2AW1A 4Q87A 1CAHA 3IGPA 3GZ0A 5AMDA 4CNXA 1IF8A 1Z93A 1HCBA 3MHMA 4YGFA 3OIMA 2CBBA 4C3TA 5FDCA 2NNSA 4E3DA 5SZ6A 5SZ5A 1CNXA 1UGDA 1TG9A 2GD8A 4M2UA 5DSQA 3DAZA 3RYJB 1YO0A 3HKNA 4RUZA 2NWPA 3MDZA 4M2WA 4YGLA 3RZ7A 2HNCA 4DZ9A 4KNIA 1RJ6A 4M2VA 4X5SA 4Q90A 3N4BA 3M3XA 3RYYA 5JDVB 5JQTA 5EKJA 4ZWZA 3RG3A 3IBLA 4ITPA 3T82A 1YO2A 4BCWA 4JSWA 4CNVA 3DCCA 4QJMA 1CNHA 3KOIA 4Q7SA 1HCAA 1J9WA 4ZWIA 3HS4A 1BNMA 4Z1JA 4BF1A 1FQMA 5HPJA 1CAKA 1CNWA 4E3GA 3M04A 5LMDA 1G6VA 1I9MA 2NXSA 4Q06A 1CNCA 4Y0JA 4KUWA 5EH8A 1ZH9A 4LU3A 2FNMA 1I9PA 3DC9A 4QEFA 2Q1BA 3SAPA 3IAIA 1UGEA 4HT2A 3MHCA 3FW3A 5E5UA 5EHWA 4N16A 3D8WA 4YXIA 2WEJA 5FNMA 1JV0A 5DOGA 2NN7A 4QJOA 3V3FA 5JGSB 5FLOA 4R5AA 5AMGA 5FL6A 2POVA 1CNYA 1FR7A 1I9LA 5L6KA 5C8IA 3N2PA 1UGCA 5EIJA 5EH7A 3W6IA 2NMXA 3CZVA 1BNVA 3ML2A 1AM6A 2FMGA 5EOIA 2ZNCA 1G52A 1CA3A 1IF6A 1KOPA 1AZMA 3DD0A 3JXFA 5DSPA 4ZAOA 5FLPA 4COQA 3S8XA 1OQ5A 5DRSA 3N0NA 4MTYA 3K7KA 4Q7VA 3KLDB 4PZHA 3DA2A 1CCSA 4K1QA 4MO8A 4WL4A 1Z9YA 2FMZA 3M2YA 4PYXA 4YWPA 2F14A 2NWOA 4K0TA 1CZMA 1G54A 2FOSA 5G03A 1TG3A 2EU3A 3S74B 4K0SA 3S78B 5SZ4A 4K0ZA 4RN4A 12CAA 3DVCA 3F8EA 3M96A 3M2NA 2CA2A 5SZ3A 1I9NA 1CNKA 5E28A 4HEYA 1CILA 3EFTA 5FDIA 2FOVA 2WD3A 2HL4A 4Q49A 5DSLA 1I9QA 2CBEA 1CANA 5G01A 3CYUA 2IT4A 4HEZA 1HEAA 4QJWA 3BL1A 1BNWA 1G4OA 1HEDA 3KONA 1FSRA 3RLDA 3W6HA 2X7SA 2OSMA 1TTMA 5A25A 5JQ0A 1BN1A 4R5BA 5FL5A 3T85A 2FNKA 1XEVA 2FOQA 1ZGEA 4KP5A 4Z1KA 3NJ9A 4ZX1A 2W2JA 2HOCA 1YDBA 5DSOA 3DVDA 3DV7A 2WEGA 4QJXA 3S77B 1CNBA 1TE3X 7CA2A 2CBCA 1ZSAA 4ITOA 4KNNA 2QOAA 3Q31A 4MLXA 4YGJA 3SBHA 1RZDA 3SAXA 1FSNA 3D92A 3RGEA 1CNGA 3MHLA 3OILA 4MDLA 2NNOA 4WUPA 1ZGFA 1BICA 3P55A 3KKXA 1CVCA 3V2JA 4K13A 3TVNX 3TVOX 3D93A 3MNJA 8CA2A 5BRWA 1LG5A 3CAJA 4QJPA 3K2FA 1YDAA 3IBIA 1CVDA 4TWMA 5DSRA 5JG3B 4QTLA 1ZSBA 1DCAA 1HVAA 5DVXA 4KUVA 5L3OA 5JEHB 4CNWA 4KUYA 1URTA 5FLSA 1KWQA 1KEQA 3KNEA 1TEUX 5FNLA 1H9NA 2POUA 3JXHC 5E2KA 3OY0A 5FNJA 4YYTA 1CVEA 3K34A 5SZ7A 2HD6A 3M5SA 3OKVA 4KNJA 1CRMA 3U7CA 2HKKA 3B4FA 4QSJA 1BN3A 1IF9A 1TEQX 2NXRA 5FNGA 1I91A 1DMXA 1DMYA 2H4NA 3V3IB 1BNNA 1G48A 6CA2A 3MWOA 3V3GB 1G0EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RJ7 A;  3RZ8 A;  5DOH A;  5E2R A;  4YHA A;  4WUQ A;  5BRU A;  1THK A;  4Q07 A;  2VVB X;  1UGB A;  4FU5 A;  3P3H A;  3PYK A;  3RG4 A;  1BNU A;  1CCU A;  2X7U A;  4KP8 A;  3MNU A;  3UYQ A;  3B1B A;  5CJF A;  4WW8 A;  1G3Z A;  1IF4 A;  1ZSC A;  3M2Z A;  4MLT A;  1RAY A;  4Q9Y A;  4UOV A;  3HKT A;  3V5G A;  1LUG A;  4YGN A;  5FLQ A;  3DCS A;  3M1K A;  4KV0 A;  3DCW A;  3T5Z A;  3C7P A;  1FLJ A;  3CA2 A;  2GEH A;  3U47 A;  1G53 A;  4HBA A;  4PQ7 A;  5A6H A;  4QJ0 A;  5BRV A;  5FNK A;  3M1Q A;  3M67 A;  5G0B A;  4CQ0 A;  1CAL A;  1ZNC A;  3U45 X;  1Z97 A;  1RZC A;  1V9I C;  3DVB A;  1DCB A;  3HLJ A;  3N3J A;  4QSB A;  4Q83 A;  4YVY A;  4Q81 A;  3P58 A;  4MDM A;  4FPT A;  2POW A;  3FFP X;  5AML A;  4E4A A;  1CAM A;  3M1W A;  1KWR A;  3MNH A;  5FLR A;  4FVN A;  4Q78 A;  5E2S A;  5EHV A;  4JSA A;  4MDG A;  1FR4 A;  1T9N A;  1G1D A;  1A42 A;  3KOK A;  1G0F A;  3IBN A;  3MMF A;  1MUA A;  4L5U A;  1LZV A;  3NB5 A;  3KIG A;  1YDD A;  1I8Z A;  3M5E A;  3V3H B;  2OSF A;  2CAB A;  2FW4 A;  4RH2 A;  4WW6 A; 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