3CZVA

Crystal structure of the human carbonic anhydrase xiii in complex with acetazolamide
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human carbonic anhydrase XIII and its complex with the inhibitor acetazolamide.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3czvA00
4MO8A 1CVAA 3RG4A 5EOIA 1OKLA 3T83A 1Z9YA 1HECA 5SZ0A 3T5ZA 1CVFA 3M1KA 4RFCA 4CACA 3N0NA 1I91A 5JEPB 4E3GA 2NNGA 4ZWZA 4FPTA 5DSRA 2AW1A 4MDLA 1CNBA 5E2MA 3HKTA 3S71B 4YXIA 3MNKA 1HUHA 3S72B 1IF8A 4YGLA 4Q6EA 4FVNA 5G03A 1Y7WA 3N3JA 5CLUA 1BNWA 1I9OA 1IF9A 4UOVA 5BRUA 4Q8ZA 1KWQA 4Z1NA 3EFIA 4GL1X 4XZ5A 4YGKA 3RYXB 1G3ZA 5JDVB 3RYZA 3MZCA 4Q8YA 4XFWA 3RLDA 4Q9YA 2CBAA 4K0SA 2FMZA 4HU1A 5E5UA 4HT2A 4WUQA 3M67A 3U3AX 1RJ5A 1BNUA 3R17B 4MDMA 3KONA 4WW8A 5FNLA 3UYNA 1DCBA 5AMDA 3S8XA 2NNVA 2HKKA 2HNCA 3V2JA 4KV0A 1CAKA 1HEBA 3IBNA 3M1JA 1CAJA 1CCSA 4ZX0A 1G48A 3OYSA 1YDDA 5EHEA 4Q90A 5AMGA 3SAPA 4WUPA 3RZ5A 3M2ZA 5DSKA 3QYKA 2X7UA 3TVOX 5FNJA 1UGEA 4RUYA 4N0XB 5JESB 5G01A 5EZTX 2CBCA 1CVBA 1I9NA 3RZ0B 5CJFA 5C8IA 2ZNCA 5FLRA 1FQMA 3IBUA 3U45X 1CNKA 1IF5A 4ITPA 4L5UA 5DSQA 3RYVB 5A25A 3N4BA 4RUZA 3TVNX 2NXSA 4Q09A 3DC9A 4JS6A 1CVDA 4QEFA 4YYTA 3DVCA 1CAIA 1BCDA 5E2KA 1CANA 2NN1A 5DSJA 4RFDA 4C3TA 3MHLA 1FLJA 5L3OA 1G52A 2NXRA 4CNXA 5JEGB 5DSOA 1UGFA 4QTLA 5A6HA 5FLOA 5FNKA 4Q81A 1UGAA 3IGPA 2FOVA 4TWLA 2EU2A 4Q49A 5EKMA 3MNHA 3KOKA 3IBIA 5CACA 4CNWA 4YGNA 4WL4A 1CNXA 3V3GB 5FLQA 3DAZA 4L5WA 1CA3A 1KOPA 3HS4A 2EZ7A 4CNVA 3IAIA 3OIKA 1CAOA 1CCUA 4G0CA 5DVXA 5JGTB 3D92A 3M5TA 1CALA 4KAPA 2WEGA 4QSJA 4ZWIA 5DSLA 5DSMA 1FSNA 1T9NA 1YO2A 3P3JA 1CNIA 3DA2A 2W2JA 4K0ZA 1LZVA 4Q8XA 3MMFA 3T85A 5HPJA 2Q1BA 4FU5A 1RJ6A 4E4AA 1ZSBA 2OSMA 1EOUA 4QK3A 3T84A 2FNMA 2FNKA 4E3FA 3V3HB 5FLSA 5E28A 3MHIA 1CNGA 1CAZA 4ZWXA 1V9IC 2QOAA 3KS3A 5G0BA 5FLTA 4Q08A 1CVCA 3CYUA 8CA2A 3MWOA 4QY3A 3D93A 4IWZA 4QK2A 1ZSAA 4R5BA 1CVEA 1HCAA 3KNEA 1FSQA 3RYJB 4Y0JA 1CRAA 4ILXA 4K13A 3HKQA 3OYQA 1G53A 1I9LA 1BICA 5EH7A 5FL4A 2NNOA 5SZ6A 5JG3B 3LXEA 5EH8A 2OSFA 2X7TA 4MDGA 5SZ5A 4L5VA 3PYKA 1CNWA 1UGBA 4M2UA 1TB0X 4CA2A 1YO0A 2FNNA 4Q06A 3CA2A 3ML5A 3ZP9A 1OKNA 3GZ0A 1CNJA 2NWOA 2QO8A 5CA2A 3W6IA 1HEDA 3M96A 4E9OX 4YX4A 4BF1A 3F4XA 1CAMA 1KEQA 3M40A 3DBUA 1IF7A 4HT0A 4YXOA 4CQ0A 3RZ8A 3M5SA 3S77B 4RH2A 4QIZA 3C7PA 5FNGA 5SZ2A 3L14A 4YGJA 3T5UA 4X5SA 4DZ7A 1AM6A 5G0CA 2IT4A 5JQTA 4HF3A 4PQ7A 3M1QA 12CAA 2POVA 4Q7WA 4ZWYA 3BL0A 3ML2A 1RZEA 1RAYA 3P58A 3SAXA 4PZHA 5JGSB 2POWA 5DRSA 5FL5A 3MHCA 3DV7A 1CNCA 1G0FA 1XEVA 2VVAX 2CBBA 1I9PA 4IDRX 1AVNA 1DMYA 1Z97A 3K2FA 2FOSA 4Q6DA 4QSBA 3FE4A 1I9MA 3V5GA 2NWZA 5FDIA 5FNMA 3V3JA 2Q1QA 3S78B 2FW4A 4Q87A 1TEUX 3TMJA 1ZE8A 2WEJA 5DSIA 1ZNCA 3MDZA 1ZFQA 2EU3A 2NNSA 3ZNCA 4QJMA 3DD0A 3SBHA 2AX2A 3OKVA 3CZVA 4JSZA 3EFTA 4KNMA 4Q0LA 3OKUA 1RZDA 1XPZA 4Q7PA 3OILA 3F7UA 1CILA 4M2VA 2FOYA 4ZAOA 1YDCA 3U47A 1JCZA 4YHAA 1RZBA 3F8EA 1ZH9A 4Q07A 1TH9A 3DCSA 5SZ7A 3V3IB 2H15A 4XIWA 5E5RA 1RZAA 2HL4A 5EIJA 3CAJA 3F7BA 3S97A 2GD8A 1BNMA 5BYIA 1BN3A 3MNAA 3BETA 4RUXA 1RZCA 4JSWA 2WD2A 1DCAA 5FDCA 1MOOA 1BNVA 3U7CA 1G46A 4MLXA 4QSIA 4FVOA 1I9QA 5BRWA 4FIKA 4QSAA 1OKMA 3V3FA 1V9EA 4E49A 2NWYA 1G1DA 4JSAA 4KUWA 2WD3A 3DD8A 3NI5A 3M3XA 3D0NA 3NJ9A 4WR7A 1TTMA 4Q7VA 3BL1A 3OIMA 3M5EA 3P5LA 1XEGA 1G4OA 4QJPA 5E2NA 3RZ7A 1A42A 3PJJA 1BN4A 3DVBA 3S74B 2CBDA 1CIMA 1FQNA 5BNLA 5LMDA 4ETQC 3HLJA 4Q78A 1TG9A 4QJXA 4K1QA 2WEHA 1ZGFA 2WEOA 3IEOA 2FMGA 1ZFKA 1IF6A 4ITOA 2X7SA 1Z93A 3KOIA 4JSSA 3RJ7A 1XQ0A 4PYXA 3DCWA 3JXGA 4Z0QA 1LUGA 5L6KA 2ILIA 3HKNA 3D9ZA 4PXXA 4KP8A 3M1WA 1I8ZA 2NWPA 4Z1JA 5EHWA 5IPZA 4BCWA 4DZ9A 2VVBX 4KNNA 1JV0A 3IBLA 2CABA 1J9WA 2ABEA 1AZMA 1CA2A 3P44A 4PYYA 3KWAA 4E5QA 6CA2A 4LP6A 1OQ5A 3MNUA 2CA2A 1HVAA 4KUVA 4R59A 3M14A 3HFPA 1FR7A 5E2RA 1TBTX 3DCCA 1FQLA 3M98A 4MTYA 3N2PA 3P3HA 1CAHA 4MLTA 5FL6A 4Z1EA 1CRMA 3P5AA 5JEHB 1YDBA 4YGFA 3Q31A 4QJ0A 1LGDA 2Q38A 2FOQA 1THKA 3P4VA 4QJWA 1CNHA 3RYYA 4K0TA 4TWMA 3S76A 4Q7SA 3R16A 4QIYA 2FOUA 4RN4A 4E3HA 3FW3A 3MYQA 3JXHC 2NN7A 4XE1A 1H4NA 3MHMA 3S75B 1HUGA 2H4NA 1FSRA 1I90A 3B4FA 1HCBA 3M2NA 5FNHA 4FRCA 1CINA 3FFPX 3JXFA 1LG6A 4HEYA 4R5AA 4RIUA 5DOHA 1BV3A 1TEQX 1TG3A 1UGGA 5DOGA 4YXUA 3PO6A 5E2SA 5J8ZA 3M04A 1ZSCA 1BNQA 4ZX1A 1G0EA 3MHOA 3NB5A 4HBAA 4XIXA 1FR4A 1RAZA 3M2YA 1FQRA 3K34A 5DSNA 4M2RA 1KWRA 1CZMA 2HOCA 3SBIA 2GEHA 2NXTA 4FL7A 4HEZA 1G4JA 1G54A 2O4ZA 5JG5B 5SZ1A 2NMXA 3RGEA 4CNRA 1TE3X 4Z1KA 1BZMA 4KUYA 3DVDA 2POUA 5FNIA 4WW6A 3DC3A 1BNNA 4BF6A 4COQA 1ZGEA 5JQ0A 5SZ4A 3V2MA 3V7XA 3RG3A 1CCTA 1H9QA 4YWPA 7CA2A 1BN1A 3RZ1B 1CVHA 1URTA 3KKXA 4HEWA 4RIVA 1DMXA 1CAYA 1IF4A 3MNJA 3W6HA 3MNIA 5SZ3A 5EH5A 1UGDA 1G6VA 3B1BA 4G7AA 4Q83A 4N16A 2QP6A 4KNIA 4QK1A 3KLDB 3VBDA 5DSPA 1KOQA 3OY0A 5FLPA 5EKJA 1LG5A 5EHVA 4YVYA 3HKUA 3S73B 1F2WA 3M2XA 4KNJA 1MUAA 1G45A 1YO1A 4E3DA 1HEAA 4Q99A 2CBEA 1CNYA 2HD6A 5AMLA 1UGCA 3P55A 4M2WA 1H9NA 5BRVA 1BNTA 2F14A 3D8WA 4LHIA 5EKHA 3T82A 4LU3A 9CA2A 3S9TA 2HFWA 3UYQA 1YDAA 4QJOA 1JD0A 3K7KA 4KP5A 3KIGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4MO8 A;  1CVA A;  3RG4 A;  5EOI A;  1OKL A;  3T83 A;  1Z9Y A;  1HEC A;  5SZ0 A;  3T5Z A;  1CVF A;  3M1K A;  4RFC A;  4CAC A;  3N0N A;  1I91 A;  5JEP B;  4E3G A;  2NNG A;  4ZWZ A;  4FPT A;  5DSR A;  2AW1 A;  4MDL A;  1CNB A;  5E2M A;  3HKT A;  3S71 B;  4YXI A;  3MNK A;  1HUH A;  3S72 B;  1IF8 A;  4YGL A;  4Q6E A;  4FVN A;  5G03 A;  1Y7W A;  3N3J A;  5CLU A;  1BNW A;  1I9O A;  1IF9 A;  4UOV A;  5BRU A;  4Q8Z A;  1KWQ A;  4Z1N A;  3EFI A;  4GL1 X;  4XZ5 A;  4YGK A;  3RYX B;  1G3Z A;  5JDV B;  3RYZ A;  3MZC A;  4Q8Y A;  4XFW A;  3RLD A;  4Q9Y A;  2CBA A;  4K0S A;  2FMZ A;  4HU1 A;  5E5U A;  4HT2 A;  4WUQ A;  3M67 A;  3U3A X;  1RJ5 A;  1BNU A;  3R17 B;  4MDM A;  3KON A;  4WW8 A;  5FNL A;  3UYN A;  1DCB A;  5AMD A;  3S8X A;  2NNV A;  2HKK A;  2HNC A;  3V2J A;  4KV0 A;  1CAK A;  1HEB A;  3IBN A;  3M1J A;  1CAJ A;  1CCS A;  4ZX0 A;  1G48 A;  3OYS A;  1YDD A;  5EHE A;  4Q90 A;  5AMG A;  3SAP A;  4WUP A;  3RZ5 A;  3M2Z A;  5DSK A;  3QYK A;  2X7U A;  3TVO X;  5FNJ A;  1UGE A;  4RUY A;  4N0X B;  5JES B; 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