3DCSA

Use of carbonic anhydrase ii, ix active-site mimic, for the purpose of screening inhibitors for possible anti-cancer properties
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Design of a carbonic anhydrase IX active-site mimic to screen inhibitors for possible anticancer properties
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3dcsA00
1CNCA 2EZ7A 1HCAA 2CBBA 1G6VA 1CNKA 4KNIA 3OKUA 4PXXA 1YO1A 4QK2A 1UGDA 3KS3A 3V2JA 5EIJA 4YGFA 1FQLA 5FNHA 2NNSA 1IF5A 4ZX1A 4MDGA 4QTLA 5FL5A 4K13A 4Q78A 5J8ZA 3MNUA 1CCSA 1CNJA 2NN1A 1G52A 3M67A 3OIMA 5DVXA 5G0BA 3M2YA 2HFWA 4QSBA 1XQ0A 2IT4A 1I90A 3IEOA 4QJ0A 4ZX0A 1Y7WA 3DVBA 3V3GB 3JXHC 1CALA 3W6IA 3OYQA 4Q8XA 1CNGA 1BCDA 4QJWA 1CNHA 4MTYA 1IF4A 3BL0A 1FSRA 1YO0A 3DD0A 2NMXA 4R59A 3D92A 4QIYA 5FDCA 2W2JA 1CAHA 5BYIA 3RLDA 4RFCA 4YHAA 1CA3A 2FW4A 5E2NA 3MNKA 3HKTA 3FE4A 5DSIA 5DRSA 3DCCA 4RN4A 3IGPA 1RJ6A 4E3FA 2POVA 5FNGA 1IF7A 4JSZA 1LUGA 1CVDA 7CA2A 1TH9A 5DSPA 1CAMA 4KNMA 3RZ0B 4Q9YA 2FMGA 1T9NA 1TBTX 3RG4A 4RUXA 3RYVB 4CACA 2HD6A 4QJOA 4RIVA 4PYXA 3RJ7A 5FLOA 4JSAA 5BRVA 4G0CA 5JEHB 2Q38A 4K0ZA 3MNIA 1HEBA 4HT0A 2HNCA 2POUA 4KNNA 3VBDA 3RYJB 4QJPA 4RH2A 3UYQA 3HKNA 5JG5B 2FOVA 3V3JA 4RIUA 4Q87A 3MHCA 2WEHA 5E2MA 5SZ2A 2FOYA 5JGSB 1G48A 1YDAA 3N0NA 4KUYA 1TB0X 2H4NA 1KEQA 3RZ5A 5E2KA 2NNGA 3NI5A 1TEQX 1Z9YA 2GD8A 5DSQA 4FU5A 1BN4A 5DSKA 1UGEA 4YVYA 1CIMA 3R17B 4KP8A 3MHOA 5JQ0A 1CINA 4ZWIA 3T85A 4QK1A 1CNYA 1DCAA 2H15A 5EKMA 4Q0LA 1I9PA 1CNWA 1CZMA 2Q1BA 1G3ZA 4Z0QA 1CAOA 3PO6A 5BRUA 1KOPA 9CA2A 5JEGB 5JEPB 3MNAA 2CBDA 2CBCA 2WEJA 1KOQA 1G0FA 3M14A 3U7CA 3KONA 4L5UA 1CNXA 4CQ0A 4Q08A 2QOAA 3P3HA 4Q81A 5E2RA 5EH7A 1MOOA 1AVNA 4M2WA 4ZWZA 3GZ0A 1THKA 4YXOA 2NXTA 4FIKA 4R5AA 3TMJA 1CCUA 3CA2A 3N3JA 4FL7A 1RAZA 1TG9A 3DD8A 3SAXA 3IBIA 5CJFA 5SZ5A 3CYUA 4ILXA 3IBLA 2HL4A 1ZGEA 4Q83A 4QSIA 1FQNA 4HEYA 5BNLA 1UGBA 3P5AA 3R16A 5JDVB 4KP5A 5SZ7A 1RZEA 1XEVA 3CAJA 3IBUA 5FLPA 3M1KA 5EOIA 1LG5A 3U47A 1FR7A 4PYYA 3B4FA 3MHIA 3KKXA 4E9OX 4Q8YA 4QK3A 6CA2A 2OSFA 2HOCA 1IF8A 3D0NA 4JSSA 1UGCA 1LZVA 1UGFA 3RZ7A 1RAYA 3MNJA 5FLTA 1RJ5A 4MLTA 4TWMA 2VVBX 3RYXB 4JSWA 4E5QA 4UOVA 1KWRA 1ZE8A 1CVAA 1IF9A 3V7XA 1ZSBA 3KOIA 4BCWA 3D93A 4HF3A 4YXIA 3N4BA 3IAIA 4E3DA 3OILA 4K0SA 3S8XA 4MO8A 1LGDA 4PZHA 2CABA 1G4OA 3QYKA 4HEZA 4YGKA 1YDCA 3DBUA 5FDIA 1TTMA 3S77B 1HUHA 1OKMA 1H9NA 5FLRA 4C3TA 1ZFQA 3K2FA 4DZ7A 3DVDA 5JQTA 1DMYA 5CACA 3HS4A 3OIKA 4FRCA 3DCWA 1TEUX 1G54A 3M1JA 3T5ZA 1FQMA 4KV0A 5FL6A 3DAZA 1I8ZA 5E28A 1BNNA 2CA2A 4Z1NA 5EKJA 3V3FA 1CRAA 1BN1A 4N0XB 4RUYA 5JGTB 1URTA 3S74B 3MDZA 1I9LA 4WUPA 4LU3A 3KNEA 4WUQA 3FW3A 4Q7PA 3T5UA 5SZ4A 5FLSA 5DSOA 3P5LA 2CBAA 5JG3B 2FNNA 1YDBA 2NXSA 3D9ZA 3K7KA 2NNOA 1CAZA 4ZAOA 1JD0A 1I91A 4Q49A 1ZFKA 2WEOA 4Q6EA 4WW8A 5EKHA 3SBIA 4QSAA 1HUGA 5FLQA 3B1BA 3MHMA 3RZ8A 4QY3A 4CNRA 3DV7A 4HT2A 5EHEA 5A6HA 3KIGA 2FOSA 4QIZA 2FMZA 4HU1A 4Q7WA 1CAJA 5DSMA 1XEGA 4YXUA 4HBAA 2AW1A 4MDLA 5SZ0A 1G45A 3LXEA 4X5SA 4ETQC 1HEAA 1AZMA 3M2XA 3ML5A 4XZ5A 2QO8A 3M96A 1ZSAA 3PYKA 3DC3A 5EH5A 3CZVA 1ZH9A 3P55A 4Q8ZA 3T84A 1BNUA 3HKQA 3HKUA 4N16A 4YYTA 4Q09A 3S78B 1CA2A 1BNWA 5G03A 1BN3A 3EFTA 1BNVA 2WEGA 1BV3A 4XFWA 3F4XA 2WD2A 1I9NA 1CVHA 1Z93A 1BZMA 4XIWA 1CRMA 1HEDA 3KOKA 4QJXA 3RZ1B 4CA2A 4COQA 5E5RA 1CNIA 4MDMA 4HEWA 1G46A 4ZWXA 4M2RA 3SAPA 2GEHA 3IBNA 2X7TA 1F2WA 1OKLA 4CNWA 2EU2A 3U45X 4CNVA 1RZBA 3M1QA 4XIXA 2NWPA 3NJ9A 3U3AX 5AMGA 3KLDB 1CAKA 4ITPA 1A42A 4K1QA 4BF6A 5JESB 1J9WA 3K34A 4R5BA 1OKNA 4Z1JA 5FNMA 2QP6A 4IWZA 4E49A 3M3XA 4TWLA 1FQRA 8CA2A 1CVBA 4FVOA 1MUAA 3S76A 4CNXA 2NN7A 1V9IC 5DOGA 3F8EA 1I9QA 2WD3A 5DSRA 4YX4A 4KUVA 5E2SA 3N2PA 2FNMA 2FOQA 3L14A 5SZ3A 4Z1KA 4ZWYA 3DA2A 4Q90A 5DSNA 2Q1QA 3DC9A 3BETA 1JCZA 3ZNCA 2ZNCA 3P4VA 1TG3A 2FNKA 5FNLA 3HLJA 1I9MA 1CANA 5A25A 1BNTA 3V2MA 12CAA 4YGLA 1CVEA 4LP6A 3F7BA 2X7UA 5CLUA 1LG6A 2AX2A 3JXFA 4DZ9A 5IPZA 3TVOX 4E4AA 3W6HA 1DCBA 1BNQA 3M5EA 5DSJA 5EH8A 3RYZA 4L5VA 4Q07A 4RFDA 1CVFA 3RGEA 5C8IA 5EHVA 4Q7SA 2EU3A 2FOUA 3UYNA 3M1WA 5G0CA 1BNMA 1RZDA 4GL1X 3S73B 4JS6A 3Q31A 3RYYA 1JV0A 4FPTA 4QSJA 3V5GA 1Z97A 3M5TA 3KWAA 2POWA 3OKVA 1FR4A 3M98A 5LMDA 1CAYA 1UGAA 3MNHA 4BF1A 1ZGFA 4ITOA 5SZ6A 1UGGA 3SBHA 4K0TA 2O4ZA 4PQ7A 1FSNA 3S71B 4QEFA 5HPJA 5DOHA 1G0EA 1BICA 5FL4A 1IF6A 1TE3X 4WL4A 1FLJA 1V9EA 3M2NA 3DCSA 1KWQA 5CA2A 2ABEA 4KNJA 1RZCA 1HCBA 4M2VA 3DVCA 3P58A 5FNJA 5SZ1A 3MMFA 4YGJA 3MHLA 3JXGA 2NWZA 3BL1A 2HKKA 4KAPA 5AMDA 3P44A 5E5UA 4YGNA 3C7PA 3OY0A 5AMLA 1YDDA 1AM6A 4KUWA 4IDRX 1HVAA 3P3JA 4Y0JA 3V3HB 5L6KA 3M40A 1CCTA 4Q6DA 3D8WA 1CNBA 2VVAX 3T83A 5DSLA 5FNIA 1G53A 4RUZA 3M2ZA 3S72B 2OSMA 2NXRA 4E3GA 5EHWA 3MWOA 2NWOA 4Q99A 3ML2A 3MZCA 4WW6A 1H9QA 2X7SA 3M04A 3PJJA 5G01A 4FVNA 3RG3A 1DMXA 2ILIA 2NWYA 4QJMA 5BRWA 1RZAA 1CVCA 3EFIA 5EZTX 3FFPX 1H4NA 3F7UA 5FNKA 1G4JA 1CAIA 1I9OA 1YO2A 2CBEA 4Q7VA 4Z1EA 3S75B 4E3HA 1OQ5A 1ZSCA 4WR7A 1CILA 1G1DA 1ZNCA 5L3OA 3V3IB 3S9TA 1FSQA 2NNVA 4L5WA 4Q06A 1XPZA 3TVNX 4LHIA 3NB5A 1EOUA 3S97A 4YWPA 3MYQA 3OYSA 3T82A 4M2UA 4G7AA 1HECA 3HFPA 4XE1A 3M5SA 4MLXA 3ZP9A 2F14A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CNC A;  2EZ7 A;  1HCA A;  2CBB A;  1G6V A;  1CNK A;  4KNI A;  3OKU A;  4PXX A;  1YO1 A;  4QK2 A;  1UGD A;  3KS3 A;  3V2J A;  5EIJ A;  4YGF A;  1FQL A;  5FNH A;  2NNS A;  1IF5 A;  4ZX1 A;  4MDG A;  4QTL A;  5FL5 A;  4K13 A;  4Q78 A;  5J8Z A;  3MNU A;  1CCS A;  1CNJ A;  2NN1 A;  1G52 A;  3M67 A;  3OIM A;  5DVX A;  5G0B A;  3M2Y A;  2HFW A;  4QSB A;  1XQ0 A;  2IT4 A;  1I90 A;  3IEO A;  4QJ0 A;  4ZX0 A;  1Y7W A;  3DVB A;  3V3G B;  3JXH C;  1CAL A;  3W6I A;  3OYQ A;  4Q8X A;  1CNG A;  1BCD A;  4QJW A;  1CNH A;  4MTY A;  1IF4 A;  3BL0 A;  1FSR A;  1YO0 A;  3DD0 A;  2NMX A;  4R59 A;  3D92 A;  4QIY A;  5FDC A;  2W2J A;  1CAH A;  5BYI A;  3RLD A;  4RFC A;  4YHA A;  1CA3 A;  2FW4 A;  5E2N A;  3MNK A;  3HKT A;  3FE4 A;  5DSI A;  5DRS A;  3DCC A;  4RN4 A;  3IGP A;  1RJ6 A;  4E3F A;  2POV A;  5FNG A;  1IF7 A;  4JSZ A;  1LUG A;  1CVD A;  7CA2 A;  1TH9 A;  5DSP A;  1CAM A;  4KNM A;  3RZ0 B;  4Q9Y A;  2FMG A;  1T9N A;  1TBT X;  3RG4 A;  4RUX A;  3RYV B;  4CAC A;  2HD6 A;  4QJO A;  4RIV A;  4PYX A;  3RJ7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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