3DD8A

Carbonic anhydrase inhibitors. interaction of the antitumor sulfamate emd-486019 with twelve mammalian isoforms: kinetic and x-ray crystallographic studies
Total Genus 77

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTI2 (12-15)TIV1 (9-12)TI1 (8-11)3H1 (16-18)TVIII1 (18-21)3H2 (21-24)TIV8 (241-244)AH1 (131-135)S13 (191-196)TIV2 (25-28)TVIa1 (200-203)TIV5 (105-108)S8 (108-109)S1 (32-33)S2 (39-40)TI5 (35-38)TI6 (41-44)S3 (45-50)TIV4 (75-78)TVIII2 (72-75)S10 (116-124)TI7 (51-54)S4 (56-61)TII1 (169-172)AH2 (158-163)AH3 (220-227)3H5 (164-166)S7 (87-97)TIV3 (62-65)S5 (66-70)S6 (78-82)TII'1 (81-84)TVIII3 (98-101)TI8 (100-103)TIV6 (108-111)3H3 (125-128)TI9 (137-140)3H6 (181-183)S11 (141-150)S15 (216-218)3H4 (155-157)S12 (172-178)TII2 (233-236)TIV7 (176-179)TI'2 (251-254)TI4 (34-37)S9 (112-113)O1 (128-130)S14 (207-212)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
publication title Carbonic anhydrase inhibitors. Interaction of the antitumor sulfamate EMD 486019 with twelve mammalian carbonic anhydrase isoforms: Kinetic and X-ray crystallographic studies
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 77
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3dd8A00
3B1BA 4FU5A 3V5GA 4XE1A 1OKLA 2QO8A 3S75B 5BRUA 1FQLA 4QEFA 4JSSA 3P55A 3M5EA 3M2NA 5FLOA 3KKXA 5DOGA 3P58A 4ZX0A 4Q83A 1I8ZA 1CVFA 5CACA 3M1WA 1CALA 4COQA 1G3ZA 1RZCA 1CVEA 4ZWXA 1IF6A 3LXEA 4M2WA 4RUXA 3M1QA 2NNVA 4YWPA 4YVYA 4RH2A 1G52A 3FFPX 3DV7A 4R59A 4E3FA 2H4NA 1LG5A 4Z1EA 4MLXA 1RZDA 3TVOX 1CNBA 5E2MA 1F2WA 1TG9A 1I9LA 3DCSA 4MTYA 4Q7WA 3RYJB 1I9NA 1YO2A 2CA2A 3HFPA 2NWZA 2IT4A 1BNTA 3HKQA 1OKMA 5E2NA 3U7CA 3D92A 4RUZA 2NWYA 1BICA 1CA3A 1CAKA 1AZMA 1HUHA 2Q38A 3P5AA 1HEDA 1HEBA 3F7BA 3RYXB 3K2FA 3M98A 5FLRA 5SZ7A 2HD6A 2CBEA 3PO6A 4KUVA 5EOIA 3HLJA 3MHIA 3T83A 5FL6A 5DSRA 3BL1A 12CAA 1BV3A 4ZX1A 4LU3A 4WR7A 3P4VA 3MNUA 5BRWA 9CA2A 2CBBA 4N16A 1AM6A 3V7XA 1H9NA 4PXXA 6CA2A 4G7AA 3JXGA 3HKUA 4YGJA 1ZGFA 1CCTA 3RG3A 2FNMA 1BNNA 5JGTB 3HKNA 4L5WA 1I9QA 1CA2A 3IEOA 3EFTA 3M3XA 4QSJA 1FQNA 2ILIA 1ZSAA 4QSAA 1FQRA 1Z97A 1BNWA 4BCWA 2NXRA 5AMGA 4WL4A 4ZWIA 3RZ5A 3T82A 1OKNA 1BCDA 4RFCA 1HVAA 3S8XA 1G48A 1OQ5A 4KP5A 3MNAA 5EH8A 2CBCA 3P5LA 3S97A 5E5UA 3S71B 2OSFA 4K0ZA 5LMDA 5SZ5A 5FL4A 1BNVA 5G0CA 1FLJA 5A6HA 2GD8A 5DSOA 4M2UA 3RYYA 5FLQA 4KUWA 1BNUA 1HEAA 2WEOA 4HEWA 1YDBA 1G45A 4Q99A 3M2ZA 1LUGA 3S74B 1CNCA 3D0NA 3DAZA 3M5TA 1CZMA 1CNGA 2FOVA 4K0SA 4JS6A 3S77B 2NWPA 3EFIA 3K7KA 2FOQA 4Q81A 1CNXA 3DCWA 5JG5B 1RZBA 2FMGA 3KS3A 4QK3A 1G4JA 1FR4A 5EKJA 5CA2A 4Y0JA 1UGGA 4HF3A 3OKVA 3M5SA 4TWMA 4FIKA 1I9OA 1ZFQA 3QYKA 5JGSB 2HKKA 3CA2A 1TB0X 4ZWZA 1YO0A 2NMXA 4MDMA 1CCSA 2FNNA 4E3DA 1CVDA 1TTMA 5SZ6A 2NNOA 3RLDA 4X5SA 5EH5A 1UGDA 3T5ZA 3DCCA 3MZCA 5DVXA 3RZ7A 1RAZA 3F8EA 4G0CA 1UGEA 5EHVA 1TEUX 3M67A 4E3GA 2FNKA 8CA2A 4XZ5A 1JD0A 1ZSBA 5JEGB 3UYNA 3M2YA 4ITOA 4L5UA 5C8IA 4YYTA 3IGPA 4ZAOA 1YO1A 3KONA 4CQ0A 4WW6A 3BL0A 4LHIA 3P44A 3V3HB 1IF9A 2EZ7A 1Z93A 1JV0A 4E9OX 3DA2A 1THKA 4FVNA 5SZ3A 1CAMA 2CABA 3SAXA 3GZ0A 2X7UA 3KNEA 3M14A 3MNIA 3U3AX 1IF5A 2OSMA 2NXSA 4R5BA 4N0XB 1HECA 4BF6A 3KWAA 3MNHA 3MNJA 3UYQA 2GEHA 4KNIA 2NXTA 4QK2A 3RYVB 2ABEA 5HPJA 4Q7VA 3D8WA 3DD8A 1G46A 1A42A 4YXOA 5CJFA 3IAIA 3JXHC 3OILA 4CNRA 2HOCA 4ILXA 4QIZA 4MLTA 3KOIA 4Q78A 4HT0A 2WEJA 1CAOA 3K34A 5EZTX 4CACA 2EU2A 1RJ5A 4RN4A 3DBUA 4M2VA 4WW8A 5FNIA 4YXUA 3RZ8A 1Z9YA 2QOAA 5FNJA 1ZGEA 4Z1JA 1G6VA 4QTLA 5EIJA 4XFWA 4HBAA 5JESB 3IBLA 3S9TA 1IF4A 4CNVA 5A25A 3DC3A 1TE3X 2Q1BA 3S78B 1YDAA 4Q6DA 3S76A 1CANA 3RZ1B 2W2JA 2NNGA 4E49A 1LZVA 2CBDA 4Q6EA 3CZVA 3B4FA 4PZHA 4Q87A 5EHWA 1CILA 3ML2A 4XIXA 1TEQX 2QP6A 3PJJA 4E5QA 1CAJA 1TH9A 3OIKA 3C7PA 1MOOA 2VVAX 2WD3A 3T84A 3U47A 1H9QA 2F14A 4ETQC 3M1JA 3IBUA 1DCBA 1JCZA 1RZEA 5BRVA 3MYQA 1CAZA 3DVCA 3F7UA 4KNJA 4K0TA 1CRAA 4L5VA 3MNKA 4XIWA 5G03A 1LGDA 4QJOA 2HFWA 1CAYA 3OYQA 3N3JA 1XEVA 2FOSA 3M04A 5FNHA 5FNGA 2HNCA 4KUYA 4FPTA 3SBIA 4MDLA 4YGLA 4FL7A 3JXFA 1RJ6A 2CBAA 3OY0A 4QJXA 2X7SA 2AX2A 1EOUA 3TVNX 4E4AA 5DSJA 1KOQA 1CVAA 1BZMA 1UGAA 4DZ9A 4MDGA 1DCAA 4Q8ZA 5JQ0A 4QJPA 1CNIA 5J8ZA 1BN3A 4LP6A 5DSMA 4Q9YA 1ZH9A 2FMZA 1CNHA 5EHEA 1I9PA 3DVDA 1DMYA 5FNKA 4Q49A 5L6KA 4YHAA 3DVBA 4YGKA 3V3IB 2FOYA 2NN1A 4PQ7A 5CLUA 4YXIA 3M1KA 2POWA 2WEGA 3KOKA 1FQMA 4Q06A 5DRSA 5JEPB 7CA2A 1G54A 4Q7SA 3SBHA 1CCUA 4YGFA 1HCAA 2EU3A 1DMXA 1V9EA 1J9WA 3RZ0B 2X7TA 4RFDA 5G0BA 1CNJA 1V9IC 5JEHB 2NN7A 3V3JA 5AMLA 4YX4A 4YGNA 1KWQA 4GL1X 5DSIA 2H15A 4FRCA 4BF1A 4Z1NA 3W6HA 3MHLA 3N4BA 3NI5A 5FNMA 5AMDA 2NNSA 4K13A 4Q7PA 5SZ1A 3F4XA 4KAPA 4JSZA 2AW1A 1G4OA 3NB5A 1XQ0A 4CNXA 1AVNA 3V2JA 1TBTX 1CVHA 3HS4A 4KV0A 1IF8A 1I9MA 3OKUA 5IPZA 1IF7A 1I91A 2Q1QA 3T5UA 1CVCA 1G0FA 3V3FA 1KWRA 3VBDA 3PYKA 1G1DA 5BNLA 2WEHA 1UGBA 5DSQA 5BYIA 1G53A 3FW3A 4Q8YA 1ZFKA 1XEGA 5SZ0A 4ITPA 1LG6A 3N2PA 1CINA 4IDRX 4ZWYA 1MUAA 4QSIA 4JSAA 2NWOA 3ZP9A 3DC9A 4RIUA 4WUPA 4CNWA 5DSKA 1H4NA 4RIVA 1HCBA 1BNQA 1T9NA 5FDIA 4Z1KA 1KOPA 4Q8XA 4WUQA 5FLTA 5E2RA 5DSLA 4TWLA 4UOVA 2POVA 4KNNA 5FLSA 4Z0QA 4FVOA 3BETA 3KLDB 5DSPA 5G01A 3KIGA 4R5AA 3M96A 4JSWA 1YDCA 4Q09A 5FNLA 4PYYA 3MHOA 4K1QA 3RYZA 1ZSCA 5FLPA 1UGCA 4HEYA 1URTA 3M2XA 1XPZA 1ZNCA 1FSRA 1KEQA 5E5RA 1ZE8A 3SAPA 2O4ZA 1HUGA 4RUYA 1CAHA 1CNKA 3MDZA 4QK1A 3W6IA 4QIYA 5DSNA 4KP8A 4Q08A 1CVBA 3NJ9A 3ML5A 1CRMA 1FR7A 3P3JA 3CYUA 4HEZA 3Q31A 3R17B 3R16A 2FW4A 4HT2A 4MO8A 4DZ7A 1RZAA 3D9ZA 3CAJA 4M2RA 3MHCA 2FOUA 3V3GB 4QJ0A 4Q90A 3IBNA 2WD2A 3N0NA 1CIMA 3MMFA 5EH7A 5FL5A 4C3TA 4Q07A 2ZNCA 5E28A 3S72B 1RAYA 3OIMA 5SZ2A 3RGEA 1CNYA 3OYSA 3RJ7A 3HKTA 3ZNCA 3T85A 3U45X 5DOHA 4QJMA 3MWOA 4E3HA 2VVBX 1CNWA 4QY3A 4QSBA 3MHMA 5EKHA 5E2KA 5L3OA 3S73B 4QJWA 1BN1A 3FE4A 5JDVB 1CAIA 2POUA 3V2MA 5JQTA 1Y7WA 4PYXA 5SZ4A 3RG4A 1YDDA 4CA2A 1I90A 3L14A 1BN4A 4KNMA 1UGFA 4Q0LA 3TMJA 1TG3A 5EKMA 5FDCA 1FSQA 3P3HA 4IWZA 3IBIA 5JG3B 3DD0A 1FSNA 1BNMA 1G0EA 3D93A 5E2SA 3M40A 2HL4A 4HU1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3B1B A;  4FU5 A;  3V5G A;  4XE1 A;  1OKL A;  2QO8 A;  3S75 B;  5BRU A;  1FQL A;  4QEF A;  4JSS A;  3P55 A;  3M5E A;  3M2N A;  5FLO A;  3KKX A;  5DOG A;  3P58 A;  4ZX0 A;  4Q83 A;  1I8Z A;  1CVF A;  5CAC A;  3M1W A;  1CAL A;  4COQ A;  1G3Z A;  1RZC A;  1CVE A;  4ZWX A;  1IF6 A;  3LXE A;  4M2W A;  4RUX A;  3M1Q A;  2NNV A;  4YWP A;  4YVY A;  4RH2 A;  1G52 A;  3FFP X;  3DV7 A;  4R59 A;  4E3F A;  2H4N A;  1LG5 A;  4Z1E A;  4MLX A;  1RZD A;  3TVO X;  1CNB A;  5E2M A;  1F2W A;  1TG9 A;  1I9L A;  3DCS A;  4MTY A;  4Q7W A;  3RYJ B;  1I9N A;  1YO2 A;  2CA2 A;  3HFP A;  2NWZ A;  2IT4 A;  1BNT A;  3HKQ A;  1OKM A;  5E2N A;  3U7C A;  3D92 A;  4RUZ A;  2NWY A;  1BIC A;  1CA3 A;  1CAK A;  1AZM A;  1HUH A;  2Q38 A;  3P5A A;  1HED A;  1HEB A;  3F7B A;  3RYX B;  3K2F A;  3M98 A;  5FLR A;  5SZ7 A;  2HD6 A;  2CBE A;  3PO6 A;  4KUV A;  5EOI A;  3HLJ A;  3MHI A;  3T83 A;  5FL6 A;  5DSR A;  3BL1 A;  12CA A;  1BV3 A;  4ZX1 A;  4LU3 A;  4WR7 A;  3P4V A;  3MNU A;  5BRW A;  9CA2 A;  2CBB A;  4N16 A;  1AM6 A;  3V7X A; 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