3FW3A

Crystal structure of soluble domain of ca4 in complex with dorzolamide
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
Knots found
sequence length
262
structure length
249
Chain Sequence
WCYEVQAESSNCLVPVKWGGNCQKDRQSPINIVTTKAKVDKKLGRFFFSGYDKKQTWTVQNNGHSVMMLLENKASISGGGLPAPYQAKQLHLHWSDLPYKGSEHSLDGEHFAMEMHIVHEKEKPEDEIAVLAFLVEAGTQVNEGFQPLVEALSNIPKPEMSTTMAESSLLDLLPKEEKLRHYFRYLGSLTTPTCDEKVVWTVFREPIQLHREQILAFSQKLYYDKEQTVSMKDNVRPLQQLGQRTVIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Thioether benzenesulfonamide inhibitors of carbonic anhydrases II and IV: structure-based drug design, synthesis, and biological evaluation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 4
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 66
structure length 249
sequence length 262
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3fw3A00
2X7UA 3V3GB 1CVHA 4Z0QA 5FLPA 4Z1EA 5JDVB 5DSIA 4MLXA 4RFCA 1LG5A 1HUGA 4Q07A 5DSKA 2IT4A 3R17B 5BNLA 3CYUA 4RFDA 4WL4A 1ZFKA 1KOPA 5AMGA 4ZAOA 1CAOA 1Y7WA 3R16A 1F2WA 1I90A 3EFIA 3HKTA 4QSAA 2FNMA 4QJOA 1CNYA 1CAMA 2CBEA 4QIZA 3BETA 1ZNCA 3BL1A 1G4OA 3TMJA 5EHVA 4L5UA 4KNIA 4JSAA 3ML5A 1KOQA 5CLUA 2WEJA 4KUVA 1H9QA 5HPJA 5E5UA 5JGSB 9CA2A 3S74B 1G3ZA 4E5QA 3K2FA 3OKVA 4YYTA 4M2VA 1KEQA 3V3FA 5SZ5A 3V5GA 1FQMA 5JEPB 4XFWA 3OIKA 2CA2A 1I9QA 3S72B 4CACA 1CNIA 4XE1A 3T84A 2WD3A 2CBCA 1RZCA 2POVA 2GD8A 3V2MA 1HEDA 2NN7A 3M2ZA 3P5LA 3M2YA 4MTYA 3VBDA 4XIXA 3U45X 8CA2A 4CNXA 1HCAA 2FW4A 4K0TA 1AM6A 3M04A 4WW8A 1TTMA 5IPZA 1IF5A 2POWA 1TE3X 5BRWA 3NB5A 3MHMA 1BNWA 1TEQX 3OIMA 1G4JA 5G0BA 1HVAA 1CALA 4JS6A 5AMDA 2W2JA 5E2RA 3P44A 5DSJA 3S75B 5C8IA 4HU1A 4IWZA 2OSFA 3RLDA 3M1WA 7CA2A 3M14A 3QYKA 3S97A 3U3AX 4XIWA 3RYYA 3KLDB 4ZWZA 3KWAA 3N2PA 4BCWA 4MDGA 1H4NA 3L14A 1G53A 2NWYA 5FNJA 3F4XA 1RZAA 4CNRA 4CQ0A 5EOIA 2O4ZA 1LG6A 4E9OX 1DCBA 1G0EA 1MUAA 3FE4A 2FOUA 4K0ZA 1BNNA 1FQRA 1I9LA 4RIUA 1YO1A 1CAKA 4KV0A 4QJPA 2X7TA 4HEWA 1HUHA 4Q06A 4HT2A 5DSLA 3V3JA 1BN1A 4MDMA 5DSMA 1ZGFA 3OKUA 4YGLA 1AZMA 3OYSA 1CA2A 4K13A 1BNTA 3N4BA 3V3IB 4N0XB 3DVDA 3PYKA 4Q8YA 2WEGA 3MHLA 3DV7A 5FLRA 5EH8A 5DOGA 4Q7SA 5FNIA 3SBHA 4QEFA 1YO0A 1CVEA 1JD0A 1IF4A 2OSMA 5EKMA 3W6HA 4YGKA 4Q8XA 1CAHA 4Q7VA 2NXRA 1CZMA 4MDLA 3RG3A 1I9OA 3HKUA 4FU5A 4Q6DA 4Q0LA 3DCCA 2HFWA 4Q81A 3MNAA 1CRAA 4PYYA 1DCAA 1YO2A 4FIKA 3TVNX 1CRMA 1FSNA 4HF3A 5FNMA 4C3TA 4Q6EA 5JQTA 3T85A 2EZ7A 5JGTB 3PO6A 3BL0A 2NMXA 3DC3A 3SAPA 3B1BA 3S77B 4HEZA 3MWOA 1THKA 5CACA 6CA2A 4E4AA 3D8WA 1FSRA 3C7PA 1RAZA 1G0FA 4Q78A 1G46A 4IDRX 3V7XA 2ZNCA 1DMYA 4KP5A 3TVOX 1UGAA 4QIYA 5FNLA 4Q99A 5CA2A 4L5WA 4MO8A 3IBLA 5FL4A 5SZ6A 4QSJA 4MLTA 4PXXA 4TWMA 5FNGA 4Q9YA 1FR7A 1RJ6A 5E2SA 5EIJA 1KWRA 3KOKA 5FLSA 3RYJB 3MNUA 3MHIA 3M5TA 3HLJA 3M96A 4DZ9A 3NI5A 4KP8A 1ZSBA 4QK3A 3RYXB 3D92A 4Z1JA 5JG5B 3ZNCA 3S76A 5E2KA 3S73B 4WUPA 1CNJA 3MNJA 1ZGEA 4YGJA 3D9ZA 3CZVA 5FNKA 5DVXA 5EKJA 1BNUA 2Q38A 3FW3A 4M2RA 2NWPA 1LGDA 2FMZA 4FRCA 4ZWXA 2HL4A 1CINA 1I9MA 1LUGA 5A25A 3RZ5A 3MNKA 2EU3A 3KNEA 3M3XA 3M40A 5G01A 3UYQA 2X7SA 4YGNA 4PYXA 3DD8A 1IF8A 5EHWA 3MYQA 3DCWA 4Q09A 1UGBA 1I8ZA 4WR7A 1ZSCA 1CCSA 5BRUA 4RIVA 4TWLA 4E3HA 3M5SA 2HNCA 4JSZA 2HD6A 3OILA 4E3DA 1CNKA 1CAZA 2CABA 4YXIA 2NN1A 1HEBA 3P58A 12CAA 3JXFA 5JESB 1V9IC 4RH2A 2POUA 4PZHA 1CIMA 4FVNA 1BN3A 1OKMA 4QJMA 5EH5A 3K7KA 5JEGB 1H9NA 5EHEA 5SZ2A 1CNCA 3KKXA 4M2UA 1CA3A 5E5RA 1XEGA 3HS4A 5DSOA 4ZX1A 1G1DA 3IAIA 1CCUA 1RAYA 4E3GA 4HEYA 2AW1A 1HEAA 5LMDA 3ML2A 4M2WA 5JQ0A 5DSQA 1TB0X 1AVNA 1KWQA 3IGPA 2CBAA 1UGEA 2VVBX 5SZ1A 4G7AA 4FL7A 1Z9YA 1UGCA 3UYNA 4YX4A 4FPTA 5L3OA 5CJFA 3V2JA 2CBBA 2NWOA 3F7UA 3RGEA 4RUXA 4UOVA 2NXSA 3D0NA 3DCSA 1URTA 5AMLA 5DSPA 1UGGA 3U7CA 1I91A 1FQNA 4K0SA 2FOYA 2NNVA 5E2MA 1EOUA 1Z93A 2VVAX 3S78B 2H4NA 3CA2A 4LHIA 3SBIA 4Y0JA 2EU2A 4ZWYA 5BYIA 1G54A 3IBNA 1TG9A 3N0NA 1FR4A 1RZEA 1CNGA 1V9EA 4KNJA 1G52A 4QK1A 4Z1NA 3NJ9A 2CBDA 3MHOA 4QTLA 4WUQA 3KS3A 1CANA 1JV0A 5FLQA 3MZCA 4LU3A 3M2NA 2NWZA 4R59A 2NNGA 4RUZA 2FOSA 1XPZA 4QSBA 5SZ7A 2ILIA 4R5BA 3RZ8A 4ITPA 1HCBA 5BRVA 3B4FA 4Q87A 3RYVB 4COQA 4QJWA 1HECA 1CAYA 3HKNA 4Q90A 1OKLA 3HKQA 1T9NA 5G0CA 4KNMA 3RZ1B 5FLTA 1TH9A 1FQLA 1A42A 5SZ0A 4YXOA 3S9TA 3W6IA 1UGFA 1YDCA 1YDBA 3IBIA 2NXTA 4E49A 3S71B 3F7BA 3S8XA 4QK2A 3RZ0B 1G6VA 5EKHA 4CNWA 3EFTA 2WEHA 2HOCA 5A6HA 4ZX0A 4HT0A 5DOHA 4CA2A 3IBUA 4Q49A 3U47A 1XQ0A 2QP6A 1CVBA 3N3JA 2NNOA 4YGFA 3FFPX 4FVOA 1IF6A 2HKKA 5DSRA 3GZ0A 3DAZA 1CVDA 1J9WA 1CVFA 4Q7WA 2QO8A 4RUYA 4K1QA 1CVCA 4HBAA 5FLOA 1XEVA 1CNWA 5SZ4A 4R5AA 1TBTX 2FOQA 5DRSA 3M1KA 3DBUA 5JEHB 4Q83A 4Q7PA 2AX2A 5J8ZA 2Q1QA 2QOAA 3OY0A 1I9NA 4QJXA 3M1QA 3MMFA 4QY3A 2ABEA 4YWPA 3M67A 5JG3B 1Z97A 3DD0A 1FLJA 4YVYA 3M2XA 3SAXA 5FDIA 3PJJA 3T82A 4XZ5A 1BICA 1CNBA 4BF6A 3M1JA 4Q08A 4ETQC 2GEHA 3RYZA 1BZMA 5E2NA 4G0CA 1ZFQA 1RZBA 4YXUA 3DVBA 4KAPA 1OQ5A 4L5VA 3JXGA 3MNIA 1OKNA 2NNSA 3JXHC 3F8EA 4ILXA 3KONA 3LXEA 2Q1BA 3DA2A 4QJ0A 2F14A 4QSIA 4Z1KA 5FNHA 5L6KA 5FL6A 4N16A 4ZWIA 3P55A 1UGDA 1TG3A 4GL1X 4PQ7A 1BV3A 1CCTA 1MOOA 3T5UA 3V3HB 5EZTX 1ZE8A 2FNNA 1LZVA 2WD2A 5E28A 3MHCA 3CAJA 1ZSAA 1YDDA 1CAJA 1CILA 3MDZA 1CNXA 4JSSA 1IF7A 3M5EA 3IEOA 1RJ5A 3KIGA 4E3FA 1BCDA 1CNHA 1BNMA 1YDAA 4JSWA 3T5ZA 2FNKA 3KOIA 3ZP9A 4KNNA 3K34A 1G45A 3T83A 1BN4A 3RZ7A 2FOVA 4BF1A 2H15A 4YHAA 4KUYA 1CVAA 5SZ3A 3RJ7A 3HFPA 3Q31A 1G48A 1JCZA 1BNVA 1FSQA 5FL5A 5G03A 3D93A 4ITOA 3P5AA 1BNQA 5FDCA 4RN4A 3P4VA 1CAIA 1ZH9A 4LP6A 4DZ7A 3P3JA 1RZDA 2WEOA 4Q8ZA 3MNHA 1DMXA 3M98A 5EH7A 1IF9A 1TEUX 3DVCA 4WW6A 4CNVA 2FMGA 5DSNA 3RG4A 4X5SA 1I9PA 4KUWA 3OYQA 3P3HA 3DC9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2X7U A;  3V3G B;  1CVH A;  4Z0Q A;  5FLP A;  4Z1E A;  5JDV B;  5DSI A;  4MLX A;  4RFC A;  1LG5 A;  1HUG A;  4Q07 A;  5DSK A;  2IT4 A;  3R17 B;  5BNL A;  3CYU A;  4RFD A;  4WL4 A;  1ZFK A;  1KOP A;  5AMG A;  4ZAO A;  1CAO A;  1Y7W A;  3R16 A;  1F2W A;  1I90 A;  3EFI A;  3HKT A;  4QSA A;  2FNM A;  4QJO A;  1CNY A;  1CAM A;  2CBE A;  4QIZ A;  3BET A;  1ZNC A;  3BL1 A;  1G4O A;  3TMJ A;  5EHV A;  4L5U A;  4KNI A;  4JSA A;  3ML5 A;  1KOQ A;  5CLU A;  2WEJ A;  4KUV A;  1H9Q A;  5HPJ A;  5E5U A;  5JGS B;  9CA2 A;  3S74 B;  1G3Z A;  4E5Q A;  3K2F A;  3OKV A;  4YYT A;  4M2V A;  1KEQ A;  3V3F A;  5SZ5 A;  3V5G A;  1FQM A;  5JEP B;  4XFW A;  3OIK A;  2CA2 A;  1I9Q A;  3S72 B;  4CAC A;  1CNI A;  4XE1 A;  3T84 A;  2WD3 A;  2CBC A;  1RZC A;  2POV A;  2GD8 A;  3V2M A;  1HED A;  2NN7 A;  3M2Z A;  3P5L A;  3M2Y A;  4MTY A;  3VBD A;  4XIX A;  3U45 X;  8CA2 A;  4CNX A;  1HCA A;  2FW4 A;  4K0T A;  1AM6 A;  3M04 A;  4WW8 A;  1TTM A;  5IPZ A;  1IF5 A;  2POW A;  1TE3 X;  5BRW A;  3NB5 A;  3MHM A;  1BNW A;  1TEQ X; 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