3GZ0A

Apo-human carbonic anhydrase ii revisited: implications of the loss of a metal in protein structure, stability and solvent network
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Apo-Human Carbonic Anhydrase II Revisited: Implications of the Loss of a Metal in Protein Structure, Stability, and Solvent Network .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-04-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3gz0A00
1ZE8A 5AMDA 1KOPA 1FQNA 5G0CA 4QEFA 2AX2A 4Q49A 4CA2A 1BNUA 3DVBA 4XIXA 2NN7A 5AMGA 3DCCA 4CQ0A 1CAOA 1HCBA 4Q90A 4RIUA 3M1QA 1RZDA 1CIMA 3V3FA 1BNVA 4QSIA 1BN3A 1TBTX 4UOVA 4QJMA 2WD3A 4E3FA 2NN1A 5SZ0A 3M96A 3LXEA 4YGLA 1CILA 3DV7A 3M98A 3T5ZA 5FNHA 5EKMA 4KNJA 4RIVA 1ZSBA 2WEJA 4QIZA 3M2NA 5DSLA 2FMGA 4XE1A 3RZ0B 3S78B 3N3JA 2FMZA 5SZ2A 2FNKA 5DOHA 4ZWZA 3D92A 1YDAA 4MDMA 4Z1EA 2QOAA 5CA2A 3S97A 5E5UA 3DVCA 3SAPA 4YGKA 3RJ7A 1H9QA 4CACA 4YVYA 1BZMA 4Q7VA 3UYNA 1DMYA 3U3AX 4E3HA 5E2RA 2F14A 4LP6A 1Y7WA 4E3DA 1BICA 5G01A 2ZNCA 2WEOA 1G52A 1F2WA 5FLTA 1LG6A 2EZ7A 4RN4A 1CNJA 3CZVA 1IF5A 3L14A 1KWQA 4HT0A 4QSBA 3IEOA 1YDBA 3KNEA 1T9NA 5DOGA 1G4OA 3EFTA 3M2ZA 5FNMA 3K34A 3MMFA 1YO2A 4CNXA 4YGFA 1OKNA 3NJ9A 5G0BA 4HT2A 3U7CA 3V3GB 1I91A 5FNIA 2IT4A 3RYXB 4Q6EA 4RFDA 2H15A 4YWPA 5LMDA 1UGDA 2NNOA 3IBUA 1DMXA 3V3IB 5SZ4A 1RJ5A 4QJXA 1CNBA 1G54A 1HVAA 1DCBA 1HCAA 2EU3A 4KUWA 4Q7WA 1I9PA 3DAZA 3MHCA 3OKUA 1HEAA 1CCTA 2Q1QA 2W2JA 3HFPA 4FVOA 4L5UA 3RYZA 3T84A 3TMJA 4E9OX 4Z1KA 2CBCA 4QJPA 3D8WA 3ML5A 4QK1A 1I90A 1FQRA 1YDCA 2HL4A 3HKQA 1TTMA 2H4NA 4QSAA 3RZ8A 4R5BA 2FOVA 4G0CA 4IWZA 5FLRA 5E5RA 4HU1A 4Q7PA 5EKJA 4ZWYA 1CNWA 1THKA 4Z0QA 4C3TA 3P4VA 3M5SA 1BNMA 3T82A 4QK2A 4IDRX 2X7UA 3N2PA 1DCAA 1MUAA 5JDVB 3OYSA 2ABEA 4WL4A 5E2NA 4ITOA 5FNJA 1HEBA 3V2MA 4G7AA 1XEGA 5JESB 1CAHA 2AW1A 1CZMA 1YO0A 2CABA 1HECA 1UGEA 5FLQA 2WEHA 4FU5A 1EOUA 4ILXA 5AMLA 4K0TA 5DSRA 3VBDA 1RZEA 4M2VA 4QIYA 5DSPA 4ZX1A 3S9TA 4Y0JA 1CCUA 2NNSA 3S72B 5EH5A 3M40A 3P3JA 3BETA 1CVFA 1CAZA 1TEQX 3F4XA 2HD6A 2CBBA 5DRSA 1RJ6A 5SZ6A 5BRUA 1I9QA 5BYIA 3MYQA 1I9LA 4MTYA 1YO1A 3HKNA 1LUGA 3RLDA 1IF7A 4KNMA 4MLTA 3UYQA 1H9NA 4KNIA 4QTLA 4R5AA 3GZ0A 4YXUA 3JXHC 3BL0A 1CVAA 3W6IA 3B1BA 3ZNCA 4E4AA 5JG5B 2NWPA 1CVHA 1Z9YA 3NI5A 5BRVA 4JSWA 3ML2A 12CAA 1CAYA 3T5UA 3M14A 3DCSA 3P58A 5JEHB 2NMXA 3M2YA 5JQTA 1CANA 5EHEA 2NWZA 4Q07A 3D93A 3S74B 1FSNA 2POWA 7CA2A 4KP5A 3M5EA 3P5AA 3CAJA 3MNKA 3KOKA 4FIKA 3RG4A 5EH7A 1OKMA 1ZNCA 4Q78A 3M3XA 3Q31A 3KIGA 2CBDA 4Q8ZA 5EHWA 2FOYA 3MNUA 4FVNA 3SBIA 3F7BA 2NXRA 2CA2A 3OILA 4K13A 4ITPA 1G6VA 1CA3A 3S75B 3KONA 1CAJA 1HUGA 3HLJA 1CNXA 3DC3A 4ETQC 4HEWA 3TVOX 4QSJA 4WUPA 1JD0A 5JG3B 4Q09A 4HEZA 4Q83A 4MLXA 1OQ5A 4WW6A 1G3ZA 3P44A 3F7UA 3RYYA 4XZ5A 4HF3A 4MDLA 3P55A 1MOOA 3KS3A 5FDIA 5FNKA 2FNMA 1KEQA 4Q99A 1RZCA 1G53A 1UGFA 4QJ0A 3V3JA 2EU2A 4TWMA 3T83A 3V3HB 3FFPX 1HEDA 5EOIA 5DSQA 3BL1A 3RGEA 3K7KA 2Q1BA 4KP8A 5EIJA 2POVA 1G1DA 2O4ZA 1CNYA 4Q06A 1OKLA 1Z97A 4RUYA 4YHAA 5DSIA 3SBHA 1CRAA 1G4JA 4KV0A 4ZX0A 1AM6A 5L3OA 4DZ7A 3MNJA 3M1KA 1FQMA 1ZFKA 1JV0A 1LG5A 3V7XA 1IF4A 1IF8A 3M1JA 3B4FA 4Q8XA 1ZFQA 4YGJA 1IF6A 1CA2A 2HNCA 3MDZA 3JXFA 4LU3A 4N0XB 3MHMA 5DVXA 4YXOA 1XQ0A 3K2FA 1G0FA 3DD8A 1CVEA 3PO6A 3MNIA 4Q8YA 1CNKA 4PYYA 4BF1A 1ZGEA 5EH8A 4QK3A 2NNVA 3M1WA 2FOQA 1IF9A 4HEYA 1TG3A 4RFCA 4Q81A 5FLOA 2CBAA 1FLJA 3MWOA 3D0NA 5E2MA 3RG3A 4TWLA 1BNTA 1CCSA 2X7TA 5E28A 4ZAOA 4FL7A 1ZSCA 4CNWA 4ZWIA 4MO8A 1UGBA 4Z1JA 3D9ZA 3T85A 4FRCA 3OKVA 3PYKA 2OSFA 1AZMA 4N16A 2FOUA 4RH2A 5E2SA 1I8ZA 3QYKA 1TH9A 2POUA 4K0ZA 4KAPA 3KWAA 4JSAA 4XFWA 1UGCA 4JSZA 1TB0X 1FSRA 5IPZA 3IGPA 5CJFA 5SZ3A 1XEVA 5DSKA 3P3HA 2X7SA 3F8EA 2ILIA 2QP6A 3FW3A 3U45X 5EKHA 4E5QA 2GEHA 2Q38A 4X5SA 4Q6DA 5EHVA 3S8XA 1BNWA 2OSMA 6CA2A 4BF6A 2HKKA 1CNIA 4JSSA 4Q0LA 1V9IC 3S76A 1J9WA 2NXTA 3R16A 3RYJB 2VVAX 1ZSAA 5A25A 4LHIA 5J8ZA 5DSOA 1AVNA 3OIKA 5DSJA 2FW4A 2FNNA 1I9NA 1XPZA 5L6KA 1TE3X 3RZ7A 5JQ0A 5CLUA 5FDCA 1FR7A 1I9MA 4QJOA 3M5TA 4XIWA 3U47A 4YX4A 5SZ1A 1LZVA 1CINA 5JGTB 4CNRA 1BNQA 3MHOA 5SZ7A 3P5LA 1LGDA 3C7PA 4E49A 1BV3A 3M2XA 4PYXA 2NWOA 3DC9A 4Q08A 3MNHA 1CRMA 3CYUA 4PQ7A 3MHIA 3OY0A 5HPJA 1H4NA 1BN1A 3V5GA 3HKUA 3KLDB 3KOIA 5FLPA 5BNLA 3CA2A 5DSMA 4HBAA 1RZAA 5C8IA 3DVDA 4Q87A 1G0EA 2FOSA 2QO8A 3R17B 3W6HA 4WR7A 4WUQA 3DCWA 4ZWXA 5FL5A 1CVBA 4K0SA 2NNGA 2VVBX 1CALA 5EZTX 4CNVA 4BCWA 1KOQA 3N0NA 4R59A 1RAYA 3MNAA 4WW8A 4PXXA 1BCDA 1URTA 3S73B 3V2JA 1CAMA 1JCZA 3TVNX 3SAXA 5SZ5A 3M67A 1A42A 2HFWA 5E2KA 4DZ9A 3OYQA 4Q9YA 3MHLA 1G45A 1ZH9A 3N4BA 2HOCA 5FNLA 1YDDA 4FPTA 4Z1NA 3IBNA 5CACA 3JXGA 5FL4A 3IAIA 1CNHA 4K1QA 4M2RA 4Q7SA 2NWYA 4E3GA 1KWRA 1RAZA 4QJWA 1CNCA 4YXIA 4M2WA 1I9OA 5JGSB 1G48A 4QY3A 1HUHA 5DSNA 3DBUA 4RUXA 1TEUX 1CAIA 1FQLA 2CBEA 1FSQA 1CVDA 3HKTA 4KUYA 1UGGA 3S77B 1CAKA 1G46A 5FLSA 4YGNA 3RZ1B 2WEGA 4COQA 1V9EA 4YYTA 4MDGA 3S71B 3KKXA 3PJJA 3IBIA 1TG9A 3RYVB 3EFIA 5G03A 3IBLA 1RZBA 4PZHA 3NB5A 1ZGFA 3M04A 1BN4A 3DA2A 4GL1X 4KUVA 5FL6A 1UGAA 5JEGB 2GD8A 3DD0A 4KNNA 1CVCA 9CA2A 4L5WA 5FNGA 4L5VA 3MZCA 8CA2A 2NXSA 4JS6A 3OIMA 1BNNA 3HS4A 5A6HA 3RZ5A 1FR4A 5JEPB 5BRWA 2WD2A 4M2UA 4RUZA 3FE4A 1CNGA 3ZP9A 1Z93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZE8 A;  5AMD A;  1KOP A;  1FQN A;  5G0C A;  4QEF A;  2AX2 A;  4Q49 A;  4CA2 A;  1BNU A;  3DVB A;  4XIX A;  2NN7 A;  5AMG A;  3DCC A;  4CQ0 A;  1CAO A;  1HCB A;  4Q90 A;  4RIU A;  3M1Q A;  1RZD A;  1CIM A;  3V3F A;  1BNV A;  4QSI A;  1BN3 A;  1TBT X;  4UOV A;  4QJM A;  2WD3 A;  4E3F A;  2NN1 A;  5SZ0 A;  3M96 A;  3LXE A;  4YGL A;  1CIL A;  3DV7 A;  3M98 A;  3T5Z A;  5FNH A;  5EKM A;  4KNJ A;  4RIV A;  1ZSB A;  2WEJ A;  4QIZ A;  3M2N A;  5DSL A;  2FMG A;  4XE1 A;  3RZ0 B;  3S78 B;  3N3J A;  2FMZ A;  5SZ2 A;  2FNK A;  5DOH A;  4ZWZ A;  3D92 A;  1YDA A;  4MDM A;  4Z1E A;  2QOA A;  5CA2 A;  3S97 A;  5E5U A;  3DVC A;  3SAP A;  4YGK A;  3RJ7 A;  1H9Q A;  4CAC A;  4YVY A;  1BZM A;  4Q7V A;  3UYN A;  1DMY A;  3U3A X;  4E3H A;  5E2R A;  2F14 A;  4LP6 A;  1Y7W A;  4E3D A;  1BIC A;  5G01 A;  2ZNC A;  2WEO A;  1G52 A;  1F2W A;  5FLT A;  1LG6 A;  2EZ7 A;  4RN4 A;  1CNJ A;  3CZV A;  1IF5 A;  3L14 A;  1KWQ A;  4HT0 A;  4QSB A;  3IEO A;  1YDB A;  3KNE A;  1T9N A;  5DOG A;  1G4O A;  3EFT A;  3M2Z A;  5FNM A; 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