3HKNA

Human carbonic anhydrase ii in complex with (2,3,4,6-tetra-o-acetyl-beta-d-galactopyranosyl) -(1-4)-1,2,3,6-tetra-o-acetyl-1-thio-beta-d-glucopyranosylsulfonamide
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title S-glycosyl primary sulfonamides--a new structural class for selective inhibition of cancer-associated carbonic anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3hknA00
3F7BA 3LXEA 5DSIA 3N3JA 1ZSBA 2NN7A 2FOSA 3P44A 4KUWA 1LUGA 5FNGA 4KNMA 3NI5A 1XEGA 1HEDA 3ML5A 1IF5A 1YO2A 4YGLA 4BF6A 3DBUA 3S75B 4XIWA 5JQTA 1CNBA 3HKQA 1XQ0A 2QO8A 3HLJA 4Q8ZA 3RZ0B 4CNRA 4WW8A 3S97A 3RYXB 1RZCA 6CA2A 4QIYA 3T82A 3EFIA 1CNIA 4E3HA 1CNYA 1HECA 2NXRA 3HKTA 5EHWA 1G0EA 4KP8A 3DCCA 3M98A 4QIZA 4R5BA 4K13A 1Z9YA 1OKMA 1ZSCA 5G0CA 1IF7A 3P58A 4HEYA 1TEUX 4QJOA 3DVDA 4FU5A 4KP5A 4MLTA 3S78B 1G3ZA 3HKUA 1OKLA 1CNKA 1TEQX 1J9WA 3TVNX 1KWQA 3M5TA 1RZDA 3OKUA 4ZWXA 4IWZA 1DMYA 1HCBA 4RIUA 3SAPA 2CBDA 5FNLA 4Q49A 2POWA 3QYKA 1ZNCA 3R17B 1G52A 4K1QA 4KV0A 1CANA 5L6KA 4YYTA 4N0XB 3VBDA 5BRWA 4Q6DA 4M2VA 5FL5A 1OKNA 5HPJA 3MHMA 3MHOA 2POUA 3DAZA 3KONA 1JV0A 4HBAA 1FSQA 4UOVA 1H4NA 4JSAA 4ZAOA 3HFPA 1I90A 1CA2A 2HL4A 3V5GA 3V3JA 2OSMA 1G6VA 2EU3A 3PYKA 2NXTA 1OQ5A 1TBTX 4Y0JA 5EIJA 1CNHA 3DCWA 4FRCA 2NWYA 4YVYA 2ZNCA 4LU3A 3IBLA 4YXUA 2FMGA 2HD6A 4ZWIA 3U7CA 5DSNA 4L5WA 5E2NA 5FL4A 5FLSA 4Z1KA 1IF8A 3RYYA 3T84A 1CRMA 4QY3A 3RG4A 1V9EA 4XE1A 5JG3B 4ZX1A 5FDCA 5C8IA 1CNGA 3V3GB 3M2ZA 1UGEA 1Y7WA 4E3DA 2CA2A 2IT4A 5JG5B 3SAXA 4MLXA 2WEHA 1G45A 5DSOA 3RG3A 5SZ6A 4Q9YA 2VVBX 4Q7SA 4ILXA 1BV3A 4KAPA 4FVNA 4G0CA 4M2WA 1ZFQA 1CCTA 1TH9A 3Q31A 5DOHA 1JCZA 4N16A 2O4ZA 3IAIA 3RYJB 4YX4A 1I9NA 3P3HA 3IGPA 3DA2A 2X7SA 3KKXA 2FOVA 1FR4A 2ILIA 5E2KA 3B4FA 3MNJA 1AM6A 1FQMA 4RUZA 3D93A 5EHVA 5G0BA 3M04A 3M1KA 4CACA 3RZ1B 3MNKA 3R16A 4YGFA 4L5UA 5CA2A 4QJWA 5FDIA 4CNVA 1UGCA 3KNEA 1G46A 3JXFA 1CNJA 1G0FA 3MZCA 1TTMA 5A6HA 3FFPX 4G7AA 5AMDA 2FOUA 3OKVA 5E5RA 5DVXA 3DVBA 1FQNA 1Z93A 5G01A 4HT2A 3M1QA 4QSBA 4CA2A 3RZ8A 3OYQA 1I9QA 3S72B 4QTLA 3T83A 4Q07A 5DSLA 1CALA 5DSRA 3T5ZA 5EH5A 4Q99A 1XEVA 1XPZA 1I9MA 3M14A 1YO1A 3P4VA 3F4XA 4E3FA 4Q81A 3HKNA 8CA2A 2NNSA 3BL1A 3PJJA 5E28A 3S77B 3S74B 4CNWA 1CAKA 1CAHA 4RIVA 4Q83A 2VVAX 1YDBA 1YDDA 2NNGA 3FE4A 1FR7A 1UGFA 1ZGFA 1HUGA 3KIGA 4E5QA 1I9PA 1DMXA 5DSQA 3K34A 5CJFA 3MHLA 4LP6A 4QJXA 3RZ7A 5FNKA 1CA3A 1BNQA 4YGNA 3JXHC 2FOQA 2CBCA 2NMXA 3MMFA 4FPTA 4ITOA 4MO8A 1BNTA 1G4OA 4QSAA 3S9TA 1CAYA 1URTA 4FVOA 1TB0X 3CZVA 4K0SA 4YXOA 1YO0A 3U45X 3HS4A 3MYQA 1LG5A 5E2RA 3TMJA 2CBAA 4WL4A 3S73B 2FW4A 3M96A 12CAA 1YDCA 4RUXA 3KWAA 3DVCA 1FSNA 5SZ4A 1YDAA 1RJ6A 4KUYA 4MTYA 3CA2A 2HKKA 1I91A 4Q7PA 4PZHA 1ZFKA 1DCAA 1RAZA 3V2MA 3W6IA 3M1WA 4QSJA 1BN3A 1CVAA 2FNMA 1ZGEA 5CLUA 5EOIA 2FNKA 4Q08A 3FW3A 1CAIA 3JXGA 1BZMA 2AX2A 3S8XA 4WUQA 1CIMA 3M67A 5EHEA 4YWPA 1HEAA 3K7KA 4QSIA 4E49A 1V9IC 3D8WA 4LHIA 3IBUA 4Q7WA 4Q7VA 4WW6A 1HCAA 5JGSB 1CAMA 2FNNA 3MDZA 4Q6EA 3M2XA 4BCWA 1CVHA 3PO6A 4MDMA 4E4AA 5BNLA 3V3IB 3T5UA 3BETA 4WUPA 4Q87A 1FQRA 1IF4A 1CINA 5SZ7A 3M1JA 3F7UA 3RJ7A 3UYNA 4XIXA 2WD2A 1LZVA 1MUAA 5FNMA 3OIKA 3OILA 3M2NA 5EZTX 2NWOA 3RZ5A 1G4JA 3MNIA 4HT0A 5FLRA 3RYZA 2Q1BA 2GEHA 1TE3X 3P55A 4QK1A 3M40A 2F14A 3BL0A 5BRUA 1UGDA 2HOCA 1I9OA 3MNAA 3F8EA 4IDRX 4CQ0A 4E3GA 5FLTA 4YGJA 3RYVB 4PXXA 1HEBA 2NWPA 5DSJA 2X7UA 4QK3A 5EKJA 4WR7A 3V7XA 3D92A 5E2SA 3NJ9A 2AW1A 3S76A 1H9NA 3V3HB 3MHCA 3N0NA 1T9NA 3DC9A 4MDLA 3N2PA 4YXIA 5JESB 1ZE8A 3DD8A 5EH8A 4Q90A 1Z97A 4Q8YA 5LMDA 5FL6A 3OYSA 4DZ7A 5E2MA 1CCSA 1BN1A 1CNXA 2HNCA 1G1DA 3MNUA 3ZP9A 3C7PA 1CNCA 3P5LA 3IBIA 5DSPA 5E5UA 5DRSA 1IF6A 4QK2A 4PYYA 4ITPA 3UYQA 1DCBA 5FLPA 4RUYA 1A42A 3P5AA 4QJ0A 2CBEA 4JS6A 1UGAA 3IBNA 4RH2A 1THKA 2X7TA 9CA2A 3MNHA 4PQ7A 5G03A 1CNWA 1KEQA 5EH7A 1ZSAA 4COQA 5BRVA 4HEZA 4QJPA 1BN4A 3TVOX 4M2RA 4Q0LA 3NB5A 4R59A 3U3AX 1CVEA 3DCSA 4TWMA 3DD0A 5EKHA 1G48A 3D9ZA 3CAJA 1IF9A 1MOOA 2CBBA 1CRAA 5SZ5A 5CACA 2W2JA 1CZMA 1HVAA 5JQ0A 2QOAA 3V3FA 2H15A 1KWRA 4KNJA 1UGBA 4MDGA 2NWZA 1FSRA 1CVDA 3M3XA 4FIKA 2H4NA 3T85A 4YHAA 3SBHA 4HU1A 4ZWZA 3V2JA 4Q78A 3ZNCA 4JSSA 2HFWA 1I8ZA 4XZ5A 5L3OA 3B1BA 4L5VA 4CNXA 1JD0A 4ZX0A 1G54A 1CVBA 1ZH9A 1BNMA 5JGTB 1KOQA 1RZEA 1BNWA 4Z0QA 4KNIA 4FL7A 2EU2A 1RJ5A 4E9OX 1BICA 3K2FA 4JSWA 2Q38A 5A25A 4ETQC 4HEWA 5DSMA 5SZ2A 5FNJA 5DOGA 5SZ1A 5JEPB 1TG9A 2EZ7A 3EFTA 3KS3A 1CILA 5FNHA 4R5AA 3RLDA 1CCUA 4PYXA 2NN1A 1I9LA 1LGDA 3M2YA 1RAYA 3L14A 2FOYA 4RFDA 2WD3A 4Z1JA 3CYUA 1BNVA 1CVCA 1FLJA 1CAOA 4K0TA 4YGKA 4Q8XA 3M5EA 3RGEA 1BCDA 3OIMA 4Z1NA 1HUHA 2CABA 5FLQA 1RZAA 2Q1QA 3KLDB 4ZWYA 4TWLA 4XFWA 4GL1X 3N4BA 1AZMA 3IEOA 4KNNA 5JEGB 1RZBA 1CAJA 4Q09A 5JEHB 3KOKA 5FLOA 1F2WA 1H9QA 3MHIA 4Q06A 2FMZA 5J8ZA 2NNOA 4RFCA 3M5SA 1UGGA 1G53A 4K0ZA 4JSZA 5AMGA 3MWOA 5EKMA 2POVA 1EOUA 2WEGA 1FQLA 3DC3A 3KOIA 3ML2A 2NNVA 1LG6A 3S71B 3DV7A 5FNIA 4KUVA 3P3JA 1KOPA 2OSFA 2QP6A 2ABEA 7CA2A 3D0NA 1BNUA 4RN4A 4HF3A 5IPZA 2WEJA 2GD8A 2WEOA 1CVFA 1TG3A 3OY0A 4QJMA 4C3TA 5BYIA 2NXSA 1BNNA 3GZ0A 5SZ0A 3U47A 5DSKA 5SZ3A 3W6HA 1AVNA 4M2UA 4BF1A 4Z1EA 4DZ9A 4X5SA 5AMLA 5JDVB 1CAZA 4QEFA 3SBIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3F7B A;  3LXE A;  5DSI A;  3N3J A;  1ZSB A;  2NN7 A;  2FOS A;  3P44 A;  4KUW A;  1LUG A;  5FNG A;  4KNM A;  3NI5 A;  1XEG A;  1HED A;  3ML5 A;  1IF5 A;  1YO2 A;  4YGL A;  4BF6 A;  3DBU A;  3S75 B;  4XIW A;  5JQT A;  1CNB A;  3HKQ A;  1XQ0 A;  2QO8 A;  3HLJ A;  4Q8Z A;  3RZ0 B;  4CNR A;  4WW8 A;  3S97 A;  3RYX B;  1RZC A;  6CA2 A;  4QIY A;  3T82 A;  3EFI A;  1CNI A;  4E3H A;  1CNY A;  1HEC A;  2NXR A;  3HKT A;  5EHW A;  1G0E A;  4KP8 A;  3DCC A;  3M98 A;  4QIZ A;  4R5B A;  4K13 A;  1Z9Y A;  1OKM A;  1ZSC A;  5G0C A;  1IF7 A;  3P58 A;  4HEY A;  1TEU X;  4QJO A;  3DVD A;  4FU5 A;  4KP5 A;  4MLT A;  3S78 B;  1G3Z A;  3HKU A;  1OKL A;  1CNK A;  1TEQ X;  1J9W A;  3TVN X;  1KWQ A;  3M5T A;  1RZD A;  3OKU A;  4ZWX A;  4IWZ A;  1DMY A;  1HCB A;  4RIU A;  3SAP A;  2CBD A;  5FNL A;  4Q49 A;  2POW A;  3QYK A;  1ZNC A;  3R17 B;  1G52 A;  4K1Q A;  4KV0 A;  1CAN A;  5L6K A;  4YYT A;  4N0X B;  3VBD A;  5BRW A;  4Q6D A;  4M2V A;  5FL5 A;  1OKN A;  5HPJ A;  3MHM A;  3MHO A;  2POU A;  3DAZ A;  3KON A;  1JV0 A; 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