3HS4 | Genus

Total Genus 80

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	80
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__5530139449024465__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__5530139449024465__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3hs4/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__5530139449024465__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"5530139449024465","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3hs4/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__5530139449024465__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	High-resolution structure of human carbonic anhydrase II complexed with acetazolamide reveals insights into inhibitor drug design. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	80
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2009-06-10

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	3hs4A00

4RUXA 2VVBX 5FNKA 5FDCA 1BZMA 3PO6A 4Q99A 2X7TA 2NWZA 5C8IA 2POWA 4ITOA 3HKNA 4QJWA 3FFPX 4R5BA 3RLDA 1LZVA 3CYUA 2NNVA 4FVOA 3SBHA 2EU3A 1CRAA 5FNHA 3S72B 3S77B 4BF6A 1HUGA 4RIUA 4TWLA 3D93A 4RIVA 5JGTB 5FL4A 3MNJA 4KNJA 3U3AX 1KOPA 4XE1A 1LUGA 4K13A 3V3FA 4YX4A 3F8EA 4YHAA 1CNWA 4YXUA 4Q09A 2NMXA 3TVNX 1YDAA 3FW3A 4E3GA 4QJMA 1CNCA 4Z1EA 2HKKA 1FQRA 5FL6A 4RH2A 3M40A 1G4JA 2VVAX 2X7SA 2WD2A 1CNJA 5DSOA 2QOAA 3MHMA 1HCAA 5EHWA 5DSPA 4QIYA 3V3JA 2O4ZA 5FLPA 3CZVA 3MHLA 4DZ9A 1BNVA 1I9MA 4YGKA 1A42A 2CBAA 4MO8A 2FNMA 1ZH9A 1ZSAA 4Q0LA 1OKNA 4Q49A 3M1WA 5E5RA 5EH7A 3FE4A 3KNEA 3DC9A 3NI5A 2CABA 3U45X 1TG3A 4CA2A 2NN1A 3ZP9A 3N2PA 3V2MA 4ZX0A 1YO2A 3R17B 3RJ7A 3EFTA 1CINA 4Q78A 5BYIA 1DCAA 2F14A 3DCSA 1I8ZA 5SZ5A 4WUPA 4K0TA 3P55A 3RYYA 5JESB 1ZSBA 8CA2A 3IEOA 3MHCA 4L5WA 2NXSA 3UYNA 1YDBA 3RYVB 5JEPB 3M1JA 3KKXA 5DOGA 3N4BA 5LMDA 1YO0A 4LU3A 4Q08A 1G6VA 4BCWA 3PYKA 3MNIA 3M2YA 3P3HA 2WEJA 4PQ7A 5FLSA 3P3JA 4N16A 3JXFA 4K1QA 1FQMA 1ZFQA 5EOIA 3RYXB 5G0BA 1TH9A 1UGFA 2NWOA 1V9EA 2FMZA 4HEWA 1HUHA 1ZGEA 2HOCA 5FNIA 3C7PA 4HEYA 4K0ZA 3T85A 4WL4A 4XIXA 2NNSA 4Q07A 5G0CA 2ILIA 4QJXA 3BL0A 4M2WA 1TG9A 2CBCA 2IT4A 3SBIA 5DSJA 3MWOA 4JSAA 2NXTA 3T84A 2ZNCA 3ZNCA 1RZAA 4ILXA 1ZFKA 1FQLA 2EZ7A 1CAZA 2OSMA 1UGEA 4ZWXA 1CNKA 3JXHC 5BNLA 1RAZA 2FMGA 1CRMA 1DMXA 1CCSA 1YDDA 1G0FA 5JDVB 4CNRA 3L14A 3M96A 4YYTA 4LP6A 4RN4A 3U47A 4L5UA 4ZX1A 4HT2A 4Y0JA 4E9OX 3S75B 3M67A 5DRSA 1HECA 1CA2A 1BICA 3BL1A 5DVXA 3T5ZA 5FNJA 3DVDA 2AW1A 4M2UA 1I9LA 3V2JA 3M5EA 4K0SA 4XFWA 4IWZA 4KUVA 3M2NA 3DCWA 2FOUA 3MNUA 3V3IB 5BRWA 4GL1X 1CNGA 3U7CA 1CZMA 1BNQA 1CALA 1TB0X 2H4NA 4Z1KA 1I9PA 2AX2A 3P4VA 3RG4A 4PZHA 4YGLA 4ZWYA 3P58A 4Q87A 3S8XA 4IDRX 3KIGA 2W2JA 5DOHA 1OKLA 1THKA 1V9IC 4E3DA 1IF5A 3K7KA 4YGNA 3KLDB 1I91A 2Q1QA 1EOUA 3T82A 5EHVA 4BF1A 1HVAA 1G48A 1CNHA 4Q6DA 3HKQA 3EFIA 1CCUA 3MDZA 3M1KA 5E2MA 5FNGA 3P5AA 5DSKA 4YWPA 1JD0A 2WD3A 5SZ0A 1RZEA 4X5SA 3RZ7A 2HD6A 2CBBA 5AMDA 3S97A 5AMLA 2POVA 4CACA 5EKJA 5DSIA 4XIWA 3M1QA 1CNXA 5EKHA 3KWAA 4Q8XA 4E4AA 3DD8A 5E2RA 3KS3A 4Z1NA 1Z9YA 4E49A 1AM6A 2FOSA 1I9OA 3IAIA 3N0NA 4E3HA 1CAHA 1UGDA 5FLRA 1LGDA 4Z1JA 3IBUA 4COQA 3RZ8A 1IF8A 4ETQC 1G53A 4CNVA 4QSBA 3DD0A 3CAJA 4QK3A 3RGEA 3B1BA 1G52A 3S73B 4Q7WA 2NN7A 4KP8A 5JQ0A 4CNXA 3HLJA 1KEQA 4KNMA 5L3OA 4MDLA 4JSWA 4KP5A 1UGGA 1YO1A 4Z0QA 4PYXA 3KOKA 2NNOA 3SAXA 9CA2A 1BN3A 3W6IA 1LG5A 5EH5A 1AVNA 4HU1A 4R59A 2NWPA 4FVNA 5JG3B 3MMFA 4QY3A 1CNYA 1BNTA 5SZ7A 3JXGA 4YGJA 3OIMA 4C3TA 1FSNA 5SZ3A 2ABEA 1RJ5A 1BNMA 1H9NA 4ZAOA 1G3ZA 2NXRA 1CNBA 1IF7A 4LHIA 5EIJA 5DSNA 4HEZA 4KNIA 5IPZA 3KOIA 3OYSA 4QK2A 4UOVA 3MHOA 3NB5A 3ML5A 4WUQA 5EH8A 1J9WA 3ML2A 1CVBA 4HBAA 4RUYA 1FLJA 1KWQA 2GEHA 3HS4A 5G01A 1BV3A 4YVYA 1G4OA 4E5QA 2WEOA 5BRVA 4KUWA 1CIMA 4QEFA 4G7AA 3DV7A 4FIKA 2HFWA 4WW6A 4N0XB 3T5UA 3Q31A 3RG3A 1DMYA 3M14A 5EKMA 1HCBA 3S78B 5CLUA 3DVCA 3TMJA 3DC3A 3S9TA 3V5GA 1G1DA 4Q6EA 2CBDA 1FQNA 5JGSB 5G03A 3M2XA 5FLOA 4KUYA 4G0CA 5FNLA 4QSJA 1CVFA 3N3JA 5EZTX 3SAPA 2FOYA 1JV0A 1ZE8A 2Q38A 5CA2A 1FSQA 5A25A 1G46A 1HEBA 2HNCA 3P5LA 4KNNA 4QIZA 3RZ0B 3UYQA 1TBTX 4HT0A 3R16A 4XZ5A 1BNWA 3RZ1B 3OKUA 5E28A 5JG5B 1IF4A 4ZWIA 1DCBA 1G54A 4QJPA 4WW8A 2FW4A 4Q8ZA 1H9QA 1LG6A 3V7XA 3PJJA 4MDGA 4JS6A 1TTMA 1TEQX 4MLXA 3OIKA 3DCCA 3IBIA 5EHEA 3F4XA 3RYZA 1BNUA 1OKMA 1OQ5A 4L5VA 3B4FA 3M98A 5FDIA 5FNMA 2QP6A 3MYQA 4CNWA 2EU2A 3D0NA 5SZ2A 4R5AA 1URTA 1CA3A 3IBNA 4CQ0A 4QSIA 4Q7VA 5AMGA 2FOQA 1FSRA 3OY0A 4YXIA 1ZSCA 3MNHA 1T9NA 3S74B 4Q81A 3OKVA 3HFPA 3M3XA 4MTYA 5DSLA 5E2KA 3M04A 4FPTA 1I9NA 2OSFA 3DAZA 1Z97A 1I9QA 1MOOA 4TWMA 1UGBA 1F2WA 5FLQA 7CA2A 4PYYA 1CNIA 4Q06A 2H15A 3D8WA 3MZCA 1CILA 3M5SA 4KAPA 3HKUA 2NNGA 1G0EA 3V3GB 3S71B 4E3FA 4Q7SA 5DSMA 1RZBA 5E2NA 4Q7PA 3RZ5A 1CVEA 3TVOX 2Q1BA 2WEHA 3IBLA 4MLTA 3IGPA 3F7BA 2QO8A 3BETA 3F7UA 5DSRA 5HPJA 4ZWZA 3DA2A 5L6KA 5JEHB 1KWRA 4M2VA 4QJOA 3M2ZA 4YGFA 1XEVA 4Q8YA 1G45A 3GZ0A 1XEGA 1IF9A 2FOVA 3HKTA 3OILA 4KV0A 5E2SA 1FR7A 4YXOA 3W6HA 1JCZA 1Z93A 3D92A 4DZ7A 2CBEA 3RYJB 4JSZA 5CJFA 1MUAA 1BNNA 1AZMA 1TEUX 1YDCA 1CANA 1XQ0A 1CVDA 1CAOA 4RUZA 3CA2A 2HL4A 2FNNA 3S76A 3K34A 1H4NA 4JSSA 4MDMA 4FU5A 1UGAA 5BRUA 1RJ6A 3D9ZA 1BN1A 3LXEA 5SZ1A 5JQTA 1BN4A 5SZ6A 5FL5A 3V3HB 2CA2A 1HEAA 1Y7WA 3K2FA 5FLTA 4Q83A 5JEGB 4Q9YA 1CCTA 3MNAA 3DVBA 2FNKA 4PXXA 5SZ4A 3VBDA 1CAIA 1KOQA 1XPZA 1RZDA 3NJ9A 5E5UA 4FRCA 3DBUA 12CAA 4QK1A 4ITPA 4WR7A 3T83A 5J8ZA 4RFDA 1CAYA 1CAKA 6CA2A 4Q90A 4QJ0A 1CVCA 1IF6A 4RFCA 1I90A 1BCDA 1ZGFA 1ZNCA 3M5TA 3KONA 5DSQA 2X7UA 1HEDA 1CVHA 3QYKA 5A6HA 1RAYA 4M2RA 4QTLA 1UGCA 1RZCA 1FR4A 4HF3A 1CAJA 2GD8A 1CAMA 2WEGA 2POUA 4FL7A 5CACA 1TE3X 3P44A 3OYQA 3MNKA 4QSAA 1CVAA 3MHIA 2NWYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4RUX A;  2VVB X;  5FNK A;  5FDC A;  1BZM A;  3PO6 A;  4Q99 A;  2X7T A;  2NWZ A;  5C8I A;  2POW A;  4ITO A;  3HKN A;  4QJW A;  3FFP X;  4R5B A;  3RLD A;  1LZV A;  3CYU A;  2NNV A;  4FVO A;  3SBH A;  2EU3 A;  1CRA A;  5FNH A;  3S72 B;  3S77 B;  4BF6 A;  1HUG A;  4RIU A;  4TWL A;  3D93 A;  4RIV A;  5JGT B;  5FL4 A;  3MNJ A;  4KNJ A;  3U3A X;  1KOP A;  4XE1 A;  1LUG A;  4K13 A;  3V3F A;  4YX4 A;  3F8E A;  4YHA A;  1CNW A;  4YXU A;  4Q09 A;  2NMX A;  3TVN X;  1YDA A;  3FW3 A;  4E3G A;  4QJM A;  1CNC A;  4Z1E A;  2HKK A;  1FQR A;  5FL6 A;  4RH2 A;  3M40 A;  1G4J A;  2VVA X;  2X7S A;  2WD2 A;  1CNJ A;  5DSO A;  2QOA A;  3MHM A;  1HCA A;  5EHW A;  5DSP A;  4QIY A;  3V3J A;  2O4Z A;  5FLP A;  3CZV A;  3MHL A;  4DZ9 A;  1BNV A;  1I9M A;  4YGK A;  1A42 A;  2CBA A;  4MO8 A;  2FNM A;  1ZH9 A;  1ZSA A;  4Q0L A;  1OKN A;  4Q49 A;  3M1W A;  5E5R A;  5EH7 A;  3FE4 A;  3KNE A;  3DC9 A;  3NI5 A;  2CAB A;  3U45 X;  1TG3 A;  4CA2 A;  2NN1 A;  3ZP9 A;  3N2P A;  3V2M A;  4ZX0 A;  1YO2 A;  3R17 B;  3RJ7 A;  3EFT A;  1CIN A;  4Q78 A;  5BYI A;  1DCA A;  2F14 A;  3DCS A;  1I8Z A;  5SZ5 A;  4WUP A;  4K0T A;  3P55 A;  3RYY A;  5JES B;  1ZSB A;  8CA2 A;  3IEO A;  3MHC A;  4L5W A;  2NXS A;  3UYN A;  1YDB A;  3RYV B;  5JEP B;  3M1J A;  3KKX A;  5DOG A;  3N4B A;  5LMD A;  1YO0 A;  4LU3 A;  4Q08 A;  1G6V A;  4BCW A;  3PYK A;  3MNI A;  3M2Y A;  3P3H A;  2WEJ A;  4PQ7 A;  5FLS A;  3P3J A;  4N16 A;  3JXF A;  4K1Q A;  1FQM A;  1ZFQ A;  5EOI A;  3RYX B;  5G0B A;  1TH9 A;  1UGF A;  2NWO A;  1V9E A;  2FMZ A;  4HEW A;  1HUH A;  1ZGE A;  2HOC A;  5FNI A;  3C7P A;  4HEY A;  4K0Z A;  3T85 A;  4WL4 A;  4XIX A;  2NNS A;  4Q07 A;  5G0C A;  2ILI A;  4QJX A;  3BL0 A;  4M2W A;  1TG9 A;  2CBC A;  2IT4 A;  3SBI A;  5DSJ A;  3MWO A;  4JSA A;  2NXT A;  3T84 A;  2ZNC A;  3ZNC A;  1RZA A;  4ILX A;  1ZFK A;  1FQL A;  2EZ7 A;  1CAZ A;  2OSM A;  1UGE A;  4ZWX A;  1CNK A;  3JXH C;  5BNL A;  1RAZ A;  2FMG A;  1CRM A;  1DMX A;  1CCS A;  1YDD A;  1G0F A;  5JDV B;  4CNR A;  3L14 A;  3M96 A;  4YYT A;  4LP6 A;  4RN4 A;  3U47 A;  4L5U A;  4ZX1 A;  4HT2 A;  4Y0J A;  4E9O X;  3S75 B;  3M67 A;  5DRS A;  1HEC A;  1CA2 A;  1BIC A;  3BL1 A;  5DVX A;  3T5Z A;  5FNJ A;  3DVD A;  2AW1 A;  4M2U A;  1I9L A;  3V2J A;  3M5E A;  4K0S A;  4XFW A;  4IWZ A;  4KUV A;  3M2N A;  3DCW A;  2FOU A;  3MNU A;  3V3I B;  5BRW A;  4GL1 X;  1CNG A;  3U7C A;  1CZM A;  1BNQ A;  1CAL A;  1TB0 X;  2H4N A;  4Z1K A;  1I9P A;  2AX2 A;  3P4V A;  3RG4 A;  4PZH A;  4YGL A;  4ZWY A;  3P58 A;  4Q87 A;  3S8X A;  4IDR X;  3KIG A;  2W2J A;  5DOH A;  1OKL A;  1THK A;  1V9I C;  4E3D A;  1IF5 A;  3K7K A;  4YGN A;  3KLD B;  1I91 A;  2Q1Q A;  1EOU A;  3T82 A;  5EHV A;  4BF1 A;  1HVA A;  1G48 A;  1CNH A;  4Q6D A;  3HKQ A;  3EFI A;  1CCU A;  3MDZ A;  3M1K A;  5E2M A;  5FNG A;  3P5A A;  5DSK A;  4YWP A;  1JD0 A;  2WD3 A;  5SZ0 A;  1RZE A;  4X5S A;  3RZ7 A;  2HD6 A;  2CBB A;  5AMD A;  3S97 A;  5AML A;  2POV A;  4CAC A;  5EKJ A;  5DSI A;  4XIW A;  3M1Q A;  1CNX A;  5EKH A;  3KWA A;  4Q8X A;  4E4A A;  3DD8 A;  5E2R A;  3KS3 A;  4Z1N A;  1Z9Y A;  4E49 A;  1AM6 A;  2FOS A;  1I9O A;  3IAI A;  3N0N A;  4E3H A;  1CAH A;  1UGD A;  5FLR A;  1LGD A;  4Z1J A;  3IBU A;  4COQ A;  3RZ8 A;  1IF8 A;  4ETQ C;  1G53 A;  4CNV A;  4QSB A;  3DD0 A;  3CAJ A;  4QK3 A;  3RGE A;  3B1B A;  1G52 A;  3S73 B;  4Q7W A;  2NN7 A;  4KP8 A;  5JQ0 A;  4CNX A;  3HLJ A;  1KEQ A;  4KNM A;  5L3O A;  4MDL A;  4JSW A;  4KP5 A;  1UGG A;  1YO1 A;  4Z0Q A;  4PYX A;  3KOK A;  2NNO A;  3SAX A;  9CA2 A;  1BN3 A;  3W6I A;  1LG5 A;  5EH5 A;  1AVN A;  4HU1 A;  4R59 A;  2NWP A;  4FVN A;  5JG3 B;  3MMF A;  4QY3 A;  1CNY A;  1BNT A;  5SZ7 A;  3JXG A;  4YGJ A;  3OIM A;  4C3T A;  1FSN A;  5SZ3 A;  2ABE A;  1RJ5 A;  1BNM A;  1H9N A;  4ZAO A;  1G3Z A;  2NXR A;  1CNB A;  1IF7 A;  4LHI A;  5EIJ A;  5DSN A;  4HEZ A;  4KNI A;  5IPZ A;  3KOI A;  3OYS A;  4QK2 A;  4UOV A;  3MHO A;  3NB5 A;  3ML5 A;  4WUQ A;  5EH8 A;  1J9W A;  3ML2 A;  1CVB A;  4HBA A;  4RUY A;  1FLJ A;  1KWQ A;  2GEH A;  3HS4 A;  5G01 A;  1BV3 A;  4YVY A;  1G4O A;  4E5Q A;  2WEO A;  5BRV A;  4KUW A;  1CIM A;  4QEF A;  4G7A A;  3DV7 A;  4FIK A;  2HFW A;  4WW6 A;  4N0X B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3HS4A

Total Genus

Knots found

sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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