3IAIA

Crystal structure of the catalytic domain of the tumor-associated human carbonic anhydrase ix
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
GPDQSHWRYGGDPPWPRVSPACAGRFQSPVDIRPQLAAFSPALRPLELLGFQLPPLPELRLRNNGHSVQLTLPPGLEMALGPGREYRALQLHLHWGAAGRPGSEHTVEGHRFPAEIHVVHLSTAFARVDEALGRPGGLAVLAAFLEEGPEENSAYEQLLSRLEEIAEEGSETQVPGLDISALLPSDFSRYFQYEGSLTTPPCAQGVIWTVFNQTVMLSAKQLHTLSDTLWGPGDSRLQLNFRATQPLNGRVIEASFP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the catalytic domain of the tumor-associated human carbonic anhydrase IX.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 9
total genus 67
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-07-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3iaiA00
2HFWA 2AW1A 4RUXA 2HNCA 4CNXA 3M14A 3B1BA 3F4XA 1J9WA 1F2WA 1RZEA 4BF1A 3MHLA 5SZ6A 1XQ0A 4WW6A 4YWPA 4XE1A 3RYXB 3R17B 2FW4A 1CALA 1UGFA 4Q7VA 3S77B 5CLUA 5DSMA 4XIWA 1ZGFA 4KP8A 2CBEA 1KWRA 5E2SA 4LU3A 2HOCA 3MMFA 3L14A 5EHVA 3OYQA 5JGTB 2VVAX 4HT0A 4Z1EA 5JG3B 4MDMA 1CAZA 5LMDA 4KNNA 3S72B 1LGDA 2FOYA 4Q0LA 3TVOX 4MLTA 4TWMA 4Y0JA 4JSSA 3S76A 2NXSA 1HVAA 3MHCA 5SZ4A 4RH2A 4PXXA 5EHWA 2NNOA 3HLJA 1FR4A 4DZ9A 3M1WA 4FPTA 5A25A 2NNVA 4RN4A 5JESB 1TB0X 4QJXA 3W6HA 5FLQA 2NXTA 3KWAA 1FQMA 3MNJA 5A6HA 3S97A 4PQ7A 3P3HA 2NWZA 5G01A 1ZGEA 4HEWA 1DCAA 4YXIA 3M1JA 4ITPA 6CA2A 3RYYA 4Q07A 3MHOA 1OQ5A 5DSKA 1YO0A 1UGDA 3D92A 4ZWIA 3OKVA 2NWOA 3N0NA 4HU1A 3U3AX 3ML5A 1YDBA 3DCCA 4YXUA 1URTA 5JQ0A 4CACA 4L5WA 3RJ7A 5FLPA 5SZ5A 1CVHA 1I9LA 4YGFA 5DOGA 1TTMA 3M2XA 3PO6A 1IF6A 4WL4A 4G0CA 4JSAA 1THKA 4R59A 5J8ZA 2CBDA 3D93A 1I9PA 3HKNA 4IDRX 4ZX1A 3RZ0B 5C8IA 3CA2A 2WEOA 5EH5A 3SBIA 3FFPX 1LG5A 3D8WA 1OKLA 1JV0A 4QIYA 4TWLA 3MDZA 5DOHA 3MWOA 1FSRA 4WW8A 4CQ0A 2CBAA 2EU2A 1CNIA 2ABEA 3R16A 5G03A 1CNHA 1CNJA 5E2NA 3RG3A 3S9TA 3BL1A 2QO8A 3K34A 4YHAA 5SZ0A 1EOUA 2CABA 2Q1BA 5BNLA 5E28A 1IF9A 4K1QA 3RGEA 3V3IB 3U47A 1ZH9A 1TH9A 3GZ0A 1JCZA 5IPZA 5FNGA 2WD3A 1UGCA 4JSZA 4ETQC 4HF3A 1RAZA 3LXEA 2POUA 2Q38A 3M67A 2NMXA 1CVEA 1RJ6A 5E2KA 5DSPA 4Q6DA 4CNVA 2CBCA 3RYZA 3T5UA 3RLDA 1H9NA 2POWA 4FVOA 1CCUA 1MUAA 3FE4A 8CA2A 3OIKA 1G1DA 3P55A 4QY3A 1BNNA 3C7PA 3DVBA 4Q99A 1G52A 5SZ7A 3RYVB 1CRAA 4QJWA 3JXFA 2CA2A 4KUVA 1I9OA 3T82A 4QIZA 2IT4A 4E3GA 4Q7WA 3V2MA 5SZ2A 4RFDA 1YDDA 3PYKA 1ZFKA 5FLSA 1OKNA 2X7UA 4KP5A 3F7BA 3K7KA 2POVA 4CNRA 3M5SA 4ZX0A 3F7UA 5EKJA 4Z1NA 1CAKA 1CRMA 4QJMA 4KNMA 4HEYA 3T84A 1MOOA 5JEPB 3U7CA 1G53A 9CA2A 3NB5A 5DRSA 2QOAA 2W2JA 3KIGA 1IF7A 4Q81A 4CNWA 1DMYA 1IF8A 5DVXA 4Q8YA 1CCSA 1Z9YA 4Q08A 1DCBA 2FOQA 3BL0A 3M1QA 1G48A 3KNEA 5HPJA 3DC9A 3ML2A 5E2RA 4Q09A 3M2NA 4XZ5A 2O4ZA 3DD8A 3P5LA 1G4OA 1RZDA 3RZ5A 5JQTA 1HEAA 1CA2A 2HD6A 4KV0A 1H9QA 4KAPA 4RUYA 2H15A 3N2PA 5CACA 3TMJA 1G3ZA 3NJ9A 1AVNA 1YDCA 1BN4A 1FQNA 3D0NA 3MYQA 1I90A 3MNAA 4MTYA 1YO2A 3EFTA 3NI5A 1CAIA 2WEGA 1ZFQA 2NWPA 4E49A 1ZSCA 2FMZA 3UYQA 4QSIA 1DMXA 1HUHA 1YO1A 3JXGA 3K2FA 5BRWA 1Z93A 1OKMA 5DSOA 3V2JA 1CVCA 2FOVA 3IBLA 2NXRA 2NNSA 2NNGA 5JEGB 4Q83A 2HL4A 2X7TA 3DCSA 1HCAA 3FW3A 1CVDA 4MDLA 3F8EA 4M2RA 1ZSAA 1IF4A 3P5AA 4MO8A 3MNKA 3V5GA 1UGEA 4FVNA 1G0FA 4M2UA 2ILIA 1BN3A 4KUWA 1G0EA 1V9EA 1UGAA 5BRUA 4C3TA 1RJ5A 4RIVA 3M5TA 2EU3A 3DAZA 4ILXA 5FNHA 3VBDA 1HCBA 2X7SA 1BNQA 4QEFA 3KOKA 1AZMA 5FLOA 1CCTA 5DSNA 1CAHA 4YGLA 4QJPA 1G6VA 1HEDA 5L3OA 7CA2A 4E9OX 4K0TA 4YGNA 3IBIA 3S73B 5FLTA 1TE3X 2GEHA 3DC3A 3RZ8A 2WEJA 3OIMA 3MZCA 4E3FA 4HBAA 5EH8A 4CA2A 1T9NA 1G54A 4YXOA 3D9ZA 4M2WA 3KONA 4E4AA 4YGJA 5JG5B 4M2VA 4ZWXA 1UGGA 1TG9A 3QYKA 5JDVB 3DBUA 3T83A 3MNHA 4QJOA 3M2ZA 4ZWYA 4E3HA 3KOIA 2VVBX 5CJFA 1I9NA 3KLDB 4QSBA 4YVYA 1ZNCA 3OY0A 5FLRA 2HKKA 2FMGA 5DSLA 2FNKA 1BNMA 1RZCA 4COQA 4FL7A 4Q8ZA 5CA2A 4L5VA 2ZNCA 3S78B 4E5QA 4QK1A 5BRVA 1A42A 5EH7A 2FNMA 3KS3A 3N4BA 4N0XB 5DSRA 3ZNCA 4HEZA 4N16A 4ZWZA 2GD8A 3M1KA 1G46A 4KUYA 1KEQA 4FU5A 2QP6A 1FR7A 3KKXA 4YX4A 3TVNX 1TEUX 4RUZA 3U45X 4JS6A 4WR7A 5L6KA 4HT2A 3DV7A 3M40A 4R5AA 3IBUA 5EZTX 1CILA 1FLJA 2AX2A 3P44A 3RG4A 3M5EA 12CAA 4Q6EA 1CAMA 1BN1A 4Z1KA 1XEGA 5E5RA 1CANA 2FOSA 4QK2A 5FNMA 3W6IA 1H4NA 2WD2A 1G4JA 1TG3A 3M96A 5FNLA 1CNYA 3V3FA 2F14A 5DSIA 5FDCA 5FNIA 1FSQA 5FNJA 1XPZA 4K0ZA 4Q06A 4G7AA 5SZ1A 4QSJA 4QJ0A 2CBBA 3CAJA 3V3JA 4PYXA 3EFIA 1KOPA 1FQRA 4UOVA 2NN7A 5FDIA 3MNIA 3IEOA 4Q78A 3SAPA 1I91A 3OKUA 1BZMA 4E3DA 5EOIA 1CAJA 3M04A 1HEBA 3OYSA 1AM6A 3RZ1B 4KNJA 4Q7SA 1RZBA 4X5SA 3HS4A 3MNUA 1BICA 1HUGA 3MHMA 5G0CA 2FOUA 3CZVA 4IWZA 3UYNA 4BCWA 3DA2A 3OILA 1V9IC 3HKUA 4LP6A 1CVAA 1CA3A 2FNNA 5FNKA 5DSQA 3JXHC 4Q87A 1BNVA 3M3XA 5E5UA 4LHIA 1LUGA 3DVDA 1CNKA 5BYIA 5DSJA 5JEHB 4BF6A 3M98A 1Y7WA 2OSFA 3P4VA 4QK3A 2H4NA 5EIJA 1CNGA 1I8ZA 4JSWA 1CNXA 4PZHA 3S71B 3T85A 3IAIA 4PYYA 3M2YA 1CNWA 1LZVA 1CAOA 1BNWA 1CNCA 3CYUA 4FRCA 3P58A 1TEQX 1CINA 3HFPA 1CVFA 3IBNA 3SBHA 3DCWA 3V3HB 5SZ3A 4K0SA 5EKHA 4YGKA 1UGBA 3DVCA 4FIKA 3IGPA 1I9MA 4MLXA 3B4FA 3Q31A 4Q8XA 1CZMA 3PJJA 4Q9YA 4RFCA 5G0BA 1BV3A 4WUPA 3RZ7A 4DZ7A 1JD0A 3S8XA 1CNBA 3V7XA 4ITOA 4RIUA 3BETA 4Z0QA 5EKMA 5E2MA 3RYJB 3MHIA 4ZAOA 5AMLA 5AMDA 4QSAA 3T5ZA 4Q49A 2WEHA 1CVBA 5JGSB 1Z97A 4R5BA 2EZ7A 4WUQA 4XFWA 5EHEA 3N3JA 1G45A 4L5UA 4Q90A 1XEVA 1FSNA 5FL4A 4KNIA 2OSMA 1RZAA 3V3GB 5FL5A 1RAYA 4GL1X 3P3JA 1TBTX 1BNTA 1ZE8A 4XIXA 3S74B 4K13A 1I9QA 2NN1A 3ZP9A 3DD0A 4Q7PA 1BCDA 1KWQA 1LG6A 3S75B 3HKTA 1YDAA 4Z1JA 4MDGA 2Q1QA 1CAYA 1HECA 1KOQA 1FQLA 5AMGA 4QTLA 3SAXA 4YYTA 1BNUA 3HKQA 1IF5A 1ZSBA 2NWYA 5FL6A 1CIMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HFW A;  2AW1 A;  4RUX A;  2HNC A;  4CNX A;  3M14 A;  3B1B A;  3F4X A;  1J9W A;  1F2W A;  1RZE A;  4BF1 A;  3MHL A;  5SZ6 A;  1XQ0 A;  4WW6 A;  4YWP A;  4XE1 A;  3RYX B;  3R17 B;  2FW4 A;  1CAL A;  1UGF A;  4Q7V A;  3S77 B;  5CLU A;  5DSM A;  4XIW A;  1ZGF A;  4KP8 A;  2CBE A;  1KWR A;  5E2S A;  4LU3 A;  2HOC A;  3MMF A;  3L14 A;  5EHV A;  3OYQ A;  5JGT B;  2VVA X;  4HT0 A;  4Z1E A;  5JG3 B;  4MDM A;  1CAZ A;  5LMD A;  4KNN A;  3S72 B;  1LGD A;  2FOY A;  4Q0L A;  3TVO X;  4MLT A;  4TWM A;  4Y0J A;  4JSS A;  3S76 A;  2NXS A;  1HVA A;  3MHC A;  5SZ4 A;  4RH2 A;  4PXX A;  5EHW A;  2NNO A;  3HLJ A;  1FR4 A;  4DZ9 A;  3M1W A;  4FPT A;  5A25 A;  2NNV A;  4RN4 A;  5JES B;  1TB0 X;  4QJX A;  3W6H A;  5FLQ A;  2NXT A;  3KWA A;  1FQM A;  3MNJ A;  5A6H A;  3S97 A;  4PQ7 A;  3P3H A;  2NWZ A;  5G01 A;  1ZGE A;  4HEW A;  1DCA A;  4YXI A;  3M1J A;  4ITP A;  6CA2 A;  3RYY A;  4Q07 A;  3MHO A;  1OQ5 A;  5DSK A;  1YO0 A;  1UGD A;  3D92 A;  4ZWI A;  3OKV A;  2NWO A;  3N0N A;  4HU1 A;  3U3A X;  3ML5 A;  1YDB A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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