3IBNA

The crystal structure of the human carbonic anhydrase ii in complex with an aliphatic bis-sulfamate inhibitor
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Carbonic anhydrase inhibitors. Comparison of aliphatic sulfamate/bis-sulfamate adducts with isozymes II and IX as a platform for designing tight-binding, more isoform-selective inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 73
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3ibnA00
1MUAA 1I9NA 3M98A 1YO1A 3HKUA 1CNCA 5BNLA 1ZFQA 1JCZA 1HEAA 3KONA 5EKJA 3VBDA 4CQ0A 4E3DA 5E2SA 4X5SA 4MDGA 2NXSA 2NN7A 4Q09A 3TVOX 5SZ4A 3RGEA 4KAPA 1OKNA 4Q87A 3M40A 5C8IA 3T84A 3BL1A 3M1WA 4ZAOA 5JG3B 2X7SA 1LG6A 3S75B 5EIJA 4Q49A 3T85A 1TE3X 3R17B 3TVNX 4L5UA 3N3JA 2WD2A 4KUYA 5DSKA 3FE4A 1TEQX 4Z0QA 4Q8ZA 4HT2A 3IBNA 3DC3A 3M5TA 1CVFA 3SBHA 1CVHA 3F4XA 3K34A 3FFPX 1IF7A 5E2RA 4MTYA 3S77B 3SAXA 3MMFA 1CANA 1BNMA 5JDVB 3S72B 5JG5B 2X7TA 5SZ0A 3MHIA 1DCAA 3BL0A 1CRAA 1I9LA 1XQ0A 2GD8A 3DBUA 3D0NA 1G0FA 3KLDB 3PYKA 1IF4A 1UGDA 3PJJA 5DSNA 2FNNA 4RIVA 4XIWA 1G4JA 3L14A 1RAYA 2NN1A 5FLOA 4ITOA 4YHAA 1CNKA 5EH8A 2FOSA 3M2ZA 3CYUA 3EFIA 4RFCA 1BN3A 1CAMA 2VVBX 5EH5A 1V9IC 2NWYA 1CINA 3RYJB 2NNSA 2NNOA 3GZ0A 1CVCA 4JSZA 4HEYA 3V3GB 4L5VA 4C3TA 4KNMA 2NWPA 1G52A 1HCBA 1I91A 2EU3A 3M5SA 4ZX0A 1I9QA 4E4AA 1G0EA 5JQ0A 3F7UA 5FDCA 5E2MA 5G0BA 3RYXB 4PYYA 3LXEA 2CABA 3TMJA 4XIXA 1YDAA 3MNAA 4TWMA 4BCWA 4Q07A 4CNVA 12CAA 2F14A 1TH9A 5FLQA 5EKHA 1Z9YA 4IDRX 5BYIA 3RZ7A 3T83A 1G3ZA 2AX2A 5FNIA 1DMXA 4FVOA 3RZ1B 4MLTA 1DMYA 2FOYA 1ZFKA 1RZDA 1HUHA 5JGSB 1MOOA 3IEOA 2HFWA 2WEGA 3NB5A 4Q90A 3HS4A 1FQNA 3M5EA 3RYZA 3KOKA 4WW6A 5EZTX 3DA2A 4IWZA 3KS3A 4M2VA 4KNNA 3K7KA 3M1JA 3HKTA 4Q0LA 1URTA 3D9ZA 1FR4A 5FL4A 2HL4A 4CNRA 1I9PA 3B4FA 1EOUA 1BNUA 1G54A 1CNHA 5JEPB 1ZSCA 2WD3A 2ZNCA 3S97A 3SAPA 2POVA 3DAZA 1OQ5A 1AZMA 1BNTA 4Y0JA 5JESB 4ETQC 5DOHA 3S73B 3OKVA 4E9OX 1CAYA 5JEHB 1FQMA 4L5WA 5EHVA 4MLXA 4KNJA 3P3JA 1HVAA 4QSAA 3RZ0B 4QJ0A 5DSLA 1CVDA 3IBIA 3V3IB 3HLJA 1TG9A 3RJ7A 2EZ7A 2OSFA 3MNHA 1BCDA 4Z1NA 2GEHA 3M1QA 1CNYA 5A25A 1KWRA 2Q1QA 1BNWA 2NMXA 3MHLA 5FNGA 1CCUA 3ML5A 2FW4A 1LUGA 3V3JA 1CZMA 1HEBA 2WEOA 4RUXA 4WR7A 1KEQA 1FQLA 1G1DA 3P5AA 4WW8A 5DSIA 5L6KA 1UGGA 7CA2A 4QSJA 4YXUA 1IF6A 1CRMA 1ZGEA 3V3HB 3PO6A 1RZEA 4BF1A 4FPTA 1YO2A 3T5ZA 4Q7PA 5CACA 4YGLA 2FOQA 1BV3A 5DSJA 2FOVA 5SZ5A 1CCTA 1CAZA 4QK3A 1G48A 3IAIA 4LHIA 3M2NA 3T5UA 1V9EA 3HFPA 4QSBA 2ILIA 1TTMA 3MNKA 1RZAA 2W2JA 1XEVA 4QIYA 3BETA 3MYQA 4M2UA 2IT4A 4JSSA 3RZ5A 3KWAA 1JV0A 4HU1A 2QO8A 4QJPA 5A6HA 4QIZA 4E49A 1FLJA 1LG5A 4FL7A 3RLDA 1CILA 3V5GA 1G6VA 3S8XA 3KKXA 1H9NA 4HBAA 6CA2A 1RJ6A 4JSAA 1YDDA 3V7XA 2NNVA 4RFDA 5G03A 4ZX1A 3JXGA 5AMLA 5LMDA 1BN4A 4Q83A 4FIKA 4Q78A 1CA3A 3T82A 2NWOA 3UYQA 3OYSA 4ZWIA 4KP5A 1KOQA 5FNKA 2WEJA 4E3GA 5BRWA 1G4OA 1HUGA 1CVEA 5EH7A 1KOPA 2CBBA 2CBDA 1G45A 2POWA 4QEFA 1AM6A 3MHCA 5E5RA 1UGCA 2ABEA 4Q81A 2FOUA 5DRSA 2CBEA 8CA2A 3DD8A 4WUPA 5SZ2A 3DCSA 4XE1A 4BF6A 1CNWA 5FNMA 3W6IA 3HKQA 3D93A 1CALA 4YWPA 3MWOA 4PXXA 3FW3A 2FMGA 3MHMA 1Z97A 4QJOA 3DCWA 5FLSA 3V2JA 4RUZA 2QOAA 5FNJA 4CA2A 4ZWYA 3SBIA 4RIUA 3S71B 5J8ZA 4DZ7A 3HKNA 1CAIA 1TB0X 1CAKA 4HT0A 5G01A 5BRUA 1T9NA 4E3HA 3IBUA 5DSRA 4Q6DA 3OKUA 2X7UA 1CA2A 1LZVA 1ZGFA 2QP6A 3KOIA 3P58A 4FU5A 1BNVA 1RZBA 5AMDA 1CIMA 2HNCA 2CA2A 4LP6A 3N2PA 1FR7A 5EKMA 4GL1X 2Q38A 3MDZA 1H4NA 3S9TA 5FDIA 1CAJA 4R5AA 4Q7VA 4R59A 1FSNA 1TG3A 3ML2A 4KP8A 3CAJA 4KUWA 3F7BA 4YXOA 3P44A 4Z1EA 4YGFA 4YYTA 3P55A 5E5UA 3S74B 3KIGA 1DCBA 5EHEA 5FL6A 3M3XA 1ZNCA 4HEZA 5G0CA 3B1BA 5BRVA 4HEWA 3M67A 1HECA 3CA2A 4JSWA 3ZP9A 3N4BA 1I9MA 4DZ9A 1BNNA 4Q8YA 2Q1BA 4Q7WA 5SZ7A 3P5LA 4E3FA 3U3AX 5EOIA 4K0ZA 4WUQA 2FNMA 2O4ZA 1KWQA 2AW1A 4MO8A 3V2MA 4K13A 1OKLA 4QJXA 1HCAA 9CA2A 3OIMA 2HOCA 3K2FA 5FLTA 4R5BA 3U45X 3M14A 1CVAA 4YGKA 4Q99A 1BICA 3MZCA 1CNBA 4E5QA 5E2NA 5AMGA 4KNIA 1XPZA 1TBTX 4UOVA 3V3FA 4N16A 1RAZA 3OYQA 1G46A 4TWLA 5FNHA 5DOGA 3MHOA 3MNUA 5SZ3A 1A42A 1RJ5A 3RYYA 3S78B 4YX4A 1CAOA 1CVBA 2POUA 1UGEA 1FQRA 3DVCA 1UGFA 1I9OA 4LU3A 3DVDA 4Z1JA 3IGPA 4QK1A 5JGTB 1ZH9A 1HEDA 4Q06A 1I90A 4PZHA 2HKKA 1CAHA 1IF9A 4ZWZA 4Q08A 3D92A 4YGJA 4XFWA 4K0SA 1RZCA 4RN4A 3DCCA 3DC9A 4FVNA 1ZSBA 3MNIA 1FSRA 3NJ9A 1YDCA 1F2WA 3M04A 3RG4A 1FSQA 5CLUA 2CBCA 5SZ1A 1J9WA 2VVAX 2CBAA 1CNXA 4YGNA 5HPJA 5DSQA 3DD0A 1XEGA 3KNEA 4JS6A 5E2KA 1YDBA 5FLPA 2FMZA 4CNWA 2H4NA 4QJWA 5CJFA 3RZ8A 4K0TA 1THKA 2HD6A 1UGAA 3RG3A 2H15A 5CA2A 4ZWXA 3S76A 2FNKA 2OSMA 4CNXA 4COQA 1CNJA 1ZE8A 1G53A 4KV0A 4Q8XA 4G0CA 4Q6EA 5DSMA 4YXIA 4WL4A 4K1QA 4Z1KA 3M2YA 4HF3A 4RUYA 5E28A 4QJMA 5DSPA 3QYKA 4N0XB 4Q9YA 4XZ5A 4KUVA 5IPZA 3OY0A 3NI5A 1UGBA 4YVYA 1Y7WA 1CCSA 3UYNA 3IBLA 4M2WA 3CZVA 4FRCA 4MDMA 4Q7SA 4ITPA 3JXHC 3R16A 1IF5A 1I8ZA 2WEHA 1IF8A 1JD0A 2NNGA 4G7AA 1H9QA 1TEUX 4PYXA 3RYVB 3U7CA 1YO0A 3OIKA 1OKMA 1BN1A 5JEGB 4QY3A 3EFTA 3F8EA 3W6HA 4PQ7A 1BNQA 2NXTA 1Z93A 2NXRA 4RH2A 3JXFA 3M2XA 4QK2A 3ZNCA 1AVNA 3C7PA 5FLRA 3U47A 1CNIA 3DV7A 5SZ6A 4ILXA 3P4VA 1CNGA 5FL5A 1LGDA 1ZSAA 3D8WA 3M96A 4M2RA 5JQTA 4QSIA 5L3OA 3OILA 5EHWA 4MDLA 4QTLA 1BZMA 4CACA 2EU2A 5FNLA 3M1KA 5DVXA 3P3HA 3Q31A 3DVBA 3N0NA 2NWZA 5DSOA 3MNJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1MUA A;  1I9N A;  3M98 A;  1YO1 A;  3HKU A;  1CNC A;  5BNL A;  1ZFQ A;  1JCZ A;  1HEA A;  3KON A;  5EKJ A;  3VBD A;  4CQ0 A;  4E3D A;  5E2S A;  4X5S A;  4MDG A;  2NXS A;  2NN7 A;  4Q09 A;  3TVO X;  5SZ4 A;  3RGE A;  4KAP A;  1OKN A;  4Q87 A;  3M40 A;  5C8I A;  3T84 A;  3BL1 A;  3M1W A;  4ZAO A;  5JG3 B;  2X7S A;  1LG6 A;  3S75 B;  5EIJ A;  4Q49 A;  3T85 A;  1TE3 X;  3R17 B;  3TVN X;  4L5U A;  3N3J A;  2WD2 A;  4KUY A;  5DSK A;  3FE4 A;  1TEQ X;  4Z0Q A;  4Q8Z A;  4HT2 A;  3IBN A;  3DC3 A;  3M5T A;  1CVF A;  3SBH A;  1CVH A;  3F4X A;  3K34 A;  3FFP X;  1IF7 A;  5E2R A;  4MTY A;  3S77 B;  3SAX A;  3MMF A;  1CAN A;  1BNM A;  5JDV B;  3S72 B;  5JG5 B;  2X7T A;  5SZ0 A;  3MHI A;  1DCA A;  3BL0 A;  1CRA A;  1I9L A;  1XQ0 A;  2GD8 A;  3DBU A;  3D0N A;  1G0F A;  3KLD B;  3PYK A;  1IF4 A;  1UGD A;  3PJJ A;  5DSN A;  2FNN A;  4RIV A;  4XIW A;  1G4J A;  3L14 A;  1RAY A;  2NN1 A;  5FLO A;  4ITO A;  4YHA A;  1CNK A;  5EH8 A;  2FOS A;  3M2Z A;  3CYU A;  3EFI A;  4RFC A;  1BN3 A;  1CAM A;  2VVB X;  5EH5 A; 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