3M1JA

The crystal structure of a nami a-carbonic anhydrase ii adduct discloses the mode of action of this novel anticancer metallodrug
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The x-ray structure of the adduct between NAMI-A and carbonic anhydrase provides insights into the reactivity of this metallodrug with proteins
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-03-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3m1jA00
4E3FA 4Q49A 3OKVA 5DSMA 3ML5A 4CACA 3RG4A 4FVNA 12CAA 4QK1A 4JS6A 2HFWA 1I9QA 4QEFA 3RYZA 1TG3A 3DVDA 5FNKA 4LU3A 3B4FA 1UGFA 4MDGA 5J8ZA 1CNBA 2IT4A 5JG3B 5G0CA 1BZMA 3S72B 5DSNA 1ZFKA 5EKHA 4Q87A 1CVDA 3DC3A 3HKUA 4MTYA 5FDIA 3N0NA 4DZ9A 3P55A 4RFCA 1TTMA 3MYQA 4Q8YA 5EKMA 5SZ3A 2CBEA 1CANA 3V3IB 5FNGA 3M04A 4XIWA 4CNXA 2H15A 3CAJA 1YDAA 5DSRA 3TMJA 2CABA 3M1QA 5FLTA 3ZP9A 5FNMA 1J9WA 4KP5A 4Q8ZA 1G52A 3RLDA 1BNNA 1TE3X 1ZE8A 4QJOA 1BNUA 3RYYA 1BICA 1CIMA 5JDVB 3JXGA 3P3HA 4HU1A 5JEHB 3M2XA 1KWRA 3M1WA 2WEJA 3M2YA 4QJPA 2POUA 4R59A 1HECA 1CVHA 1AM6A 1KOQA 4RUZA 1CAKA 1I9OA 4C3TA 3BETA 1G1DA 1FQMA 4HEYA 4UOVA 3M3XA 3D8WA 3T83A 3Q31A 1FQLA 3OY0A 4ITOA 1BNMA 4G0CA 1TEQX 4Z1JA 4KUYA 5JGSB 3D93A 1F2WA 3P44A 2WD3A 1KOPA 4ZWXA 5SZ7A 4E3HA 5CLUA 1G3ZA 1UGBA 4RFDA 3K7KA 3OYQA 4K13A 1FSNA 1RAYA 5SZ2A 1CRAA 1CCUA 5DSPA 1CVAA 1CNYA 1ZGFA 3W6HA 5FL6A 3K2FA 3B1BA 4CNVA 3V5GA 2Q1BA 3HS4A 3IAIA 4Q6DA 2Q38A 2HL4A 3UYNA 3V3HB 3SBHA 3OYSA 4E3DA 3S77B 1FR4A 1ZSAA 5JQ0A 4QK3A 4RIUA 3DA2A 4FIKA 4HEWA 1Z97A 1G45A 3BL1A 2FOQA 1A42A 5BRUA 5EHEA 2NMXA 2X7SA 3RG3A 1LGDA 1RZAA 9CA2A 4ZWZA 1CRMA 1UGGA 3HKNA 2GD8A 1CCSA 4QSAA 3MHMA 4BF6A 4KNMA 1BN1A 3V2MA 3KIGA 5L6KA 3M14A 3RGEA 4QIYA 4QJXA 3M2ZA 1RAZA 5E5RA 1CVBA 1XEVA 1LZVA 5AMLA 3M5TA 1CNWA 4Q7VA 4KNJA 3MNAA 1I9LA 5JESB 3S75B 1RZEA 5L3OA 4WW8A 3TVOX 3KWAA 3V7XA 5EIJA 4RUXA 4CNWA 3CA2A 2FOSA 1YDDA 1AVNA 5SZ5A 3P4VA 1HEBA 3M40A 4Q8XA 3RZ5A 3ML2A 1CVEA 2POVA 5FLOA 1CAIA 1I9MA 2H4NA 4Q06A 1DMXA 3RYVB 5BNLA 3RYXB 4FU5A 3T85A 1G4OA 4L5WA 4TWMA 6CA2A 2EU3A 1FLJA 4YHAA 2HOCA 3P3JA 5G0BA 1ZH9A 3MHOA 1OKLA 3S8XA 4K0TA 2NXRA 4E9OX 1ZFQA 5DSQA 4PYXA 3D9ZA 5DSLA 3OIMA 1IF9A 2FMZA 5DRSA 4HT2A 5FLRA 1I91A 4RH2A 2NWZA 4CQ0A 1HCBA 1HCAA 5BRVA 1JD0A 1JCZA 1CNJA 3K34A 3HKQA 3F7UA 3IBIA 1LG6A 5FNLA 3KONA 4Q81A 1I8ZA 1TH9A 3DAZA 3HLJA 1G54A 4ZWYA 5CACA 4XFWA 1CNGA 3RYJB 5SZ0A 1TB0X 2NWOA 1IF7A 1JV0A 3W6IA 1ZNCA 3V3FA 4YXIA 4MLXA 3U7CA 1YDCA 4YWPA 3JXHC 3U3AX 3T5ZA 3D92A 3IGPA 4N0XB 3KOKA 1V9IC 5A6HA 5FLPA 5AMGA 3SAXA 3EFTA 4GL1X 1I90A 2NNVA 3U45X 1RZDA 2HKKA 3N4BA 3IBUA 3FW3A 3M5SA 4PXXA 4PZHA 3NI5A 2FOUA 1FR7A 3M2NA 5DOHA 4E3GA 5E28A 1IF4A 3M1JA 4FPTA 2NNOA 3DV7A 1CNIA 2NNGA 3R16A 4FVOA 1HUGA 1UGEA 3N2PA 2QOAA 5FLQA 3S97A 3RZ7A 4Z0QA 4K0ZA 1CALA 3L14A 2FOVA 4K0SA 1YDBA 3KKXA 3P5AA 5DOGA 5JEPB 1RZBA 3RJ7A 4QSIA 2NWYA 4RUYA 5E2SA 4ILXA 3V3GB 5EZTX 1XPZA 1CAJA 3T82A 3PO6A 1V9EA 4Q78A 3C7PA 3HKTA 4QSJA 2CBDA 3MNUA 4L5VA 1DCBA 4E5QA 2Q1QA 2CBBA 4QTLA 5E2MA 3U47A 1FQNA 3OILA 1CA3A 5EKJA 8CA2A 2ILIA 3M96A 4YGJA 3OKUA 1TBTX 3SBIA 4LHIA 1MOOA 3OIKA 2ZNCA 3KNEA 3IBLA 4KNNA 4JSZA 5FL5A 3DCWA 5BYIA 4KUWA 3S76A 4Q0LA 4YX4A 2NNSA 1CILA 3M98A 3R17B 4Z1KA 1EOUA 4WL4A 2X7TA 3NJ9A 4Q7WA 3FFPX 3CZVA 4BCWA 3F7BA 1BN4A 1HEDA 3M5EA 3DVBA 4WR7A 5E2KA 2FMGA 3ZNCA 2EZ7A 3DVCA 4CA2A 4ZX1A 1CA2A 1HVAA 1DMYA 1G6VA 3PYKA 4QJ0A 5FL4A 3MWOA 4ZWIA 3MHLA 4BF1A 5LMDA 4Q07A 4ITPA 5E2RA 4G7AA 1FSQA 4CNRA 3BL0A 2NXTA 4E4AA 1RJ6A 2O4ZA 3RZ0B 3CYUA 3P5LA 4MDLA 2CBCA 2AW1A 3M1KA 4QJWA 1H9QA 1T9NA 1BV3A 1Z93A 4QK2A 4YXOA 5IPZA 4QY3A 2CA2A 2X7UA 3DCSA 2HD6A 5SZ4A 1URTA 1BCDA 4YGNA 1BNVA 5JG5B 4M2RA 4KNIA 2ABEA 3S73B 2FNMA 1HUHA 1FSRA 3HFPA 4JSWA 4XIXA 3S71B 4XE1A 4KAPA 5FNIA 4YGLA 1Y7WA 1THKA 5EHWA 1YO2A 2CBAA 5G01A 2FNNA 2AX2A 4M2WA 3KS3A 3TVNX 1UGAA 2W2JA 3F4XA 4WUPA 4MDMA 4WUQA 2FOYA 4Q9YA 4Q99A 1H4NA 4N16A 2FNKA 2QP6A 1CZMA 4Q83A 3F8EA 3T84A 1XQ0A 1XEGA 4WW6A 1BNQA 4Q7SA 3UYQA 2OSFA 1G4JA 4ZX0A 4QJMA 4IWZA 1CNCA 1G0EA 1TG9A 3T5UA 3FE4A 4HBAA 3DD8A 3MNKA 1CAMA 5C8IA 1MUAA 3DC9A 1CAHA 2VVBX 4Q08A 3RZ8A 3DBUA 2OSMA 2NXSA 2GEHA 3MHIA 3NB5A 1CAOA 4KP8A 3SAPA 1LUGA 1IF5A 5DSKA 3RZ1B 3DCCA 3MHCA 4HT0A 4Q90A 1CAZA 5JGTB 2WEOA 4HF3A 5FLSA 4ZAOA 3EFIA 1FQRA 1I9NA 3V3JA 3QYKA 4E49A 1OKNA 1G53A 5AMDA 3KLDB 1BNWA 1G0FA 5EH5A 4RN4A 4YXUA 5E2NA 1CINA 3DD0A 1IF8A 4X5SA 4XZ5A 2POWA 1G46A 4COQA 5DSJA 5HPJA 1H9NA 1CNXA 3LXEA 5SZ1A 5JQTA 4QIZA 4QSBA 4Q6EA 4Y0JA 3N3JA 4L5UA 5FNJA 3M67A 5CA2A 4HEZA 1UGCA 1Z9YA 1TEUX 2NN1A 3PJJA 2VVAX 4YYTA 2QO8A 2HNCA 4JSAA 4K1QA 5EH7A 4DZ7A 5CJFA 3IEOA 1HEAA 3MNIA 1YO0A 1G48A 1DCAA 5FDCA 2WEGA 1ZSBA 5EH8A 1KEQA 3MNHA 1CVCA 5EOIA 5BRWA 4R5AA 4FL7A 4M2VA 4RIVA 1LG5A 1CAYA 5FNHA 5G03A 3JXFA 1YO1A 4JSSA 4Q09A 1CNKA 2NWPA 4TWLA 4MLTA 2NN7A 3MZCA 4Z1NA 3P58A 1RZCA 1BN3A 4YGKA 2FW4A 4MO8A 3MNJA 4KV0A 4IDRX 4Q7PA 1KWQA 3GZ0A 4FRCA 5A25A 5JEGB 5E5UA 3D0NA 2F14A 1ZSCA 1CNHA 3MMFA 4LP6A 4PQ7A 4R5BA 4PYYA 1AZMA 5DSIA 5DVXA 3S74B 1UGDA 3IBNA 4YVYA 7CA2A 4M2UA 5EHVA 5SZ6A 3KOIA 1BNTA 4Z1EA 2WD2A 3S78B 2WEHA 3V2JA 3S9TA 1CVFA 1OKMA 3MDZA 1CCTA 4YGFA 1I9PA 3VBDA 1RJ5A 1OQ5A 1IF6A 4ETQC 4KUVA 1ZGEA 2EU2A 5DSOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4E3F A;  4Q49 A;  3OKV A;  5DSM A;  3ML5 A;  4CAC A;  3RG4 A;  4FVN A;  12CA A;  4QK1 A;  4JS6 A;  2HFW A;  1I9Q A;  4QEF A;  3RYZ A;  1TG3 A;  3DVD A;  5FNK A;  4LU3 A;  3B4F A;  1UGF A;  4MDG A;  5J8Z A;  1CNB A;  2IT4 A;  5JG3 B;  5G0C A;  1BZM A;  3S72 B;  5DSN A;  1ZFK A;  5EKH A;  4Q87 A;  1CVD A;  3DC3 A;  3HKU A;  4MTY A;  5FDI A;  3N0N A;  4DZ9 A;  3P55 A;  4RFC A;  1TTM A;  3MYQ A;  4Q8Y A;  5EKM A;  5SZ3 A;  2CBE A;  1CAN A;  3V3I B;  5FNG A;  3M04 A;  4XIW A;  4CNX A;  2H15 A;  3CAJ A;  1YDA A;  5DSR A;  3TMJ A;  2CAB A;  3M1Q A;  5FLT A;  3ZP9 A;  5FNM A;  1J9W A;  4KP5 A;  4Q8Z A;  1G52 A;  3RLD A;  1BNN A;  1TE3 X;  1ZE8 A;  4QJO A;  1BNU A;  3RYY A;  1BIC A;  1CIM A;  5JDV B;  3JXG A;  3P3H A;  4HU1 A;  5JEH B;  3M2X A;  1KWR A;  3M1W A;  2WEJ A;  3M2Y A;  4QJP A;  2POU A;  4R59 A;  1HEC A;  1CVH A;  1AM6 A;  1KOQ A;  4RUZ A;  1CAK A;  1I9O A;  4C3T A;  3BET A;  1G1D A;  1FQM A;  4HEY A;  4UOV A;  3M3X A;  3D8W A;  3T83 A;  3Q31 A;  1FQL A;  3OY0 A;  4ITO A;  1BNM A;  4G0C A; 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