3M2ZA

Fragment tethered to carbonic anhydrase ii h64c mutant
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGCAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Fragment screening on Carbonic Anydrase II via Tethering approach
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3m2zA00
5AMGA 1BNVA 2WEGA 4ZWIA 1TTMA 1J9WA 3R17B 4Y0JA 3KLDB 4M2RA 5FLOA 4E4AA 1CCUA 3TVOX 2WEHA 4ITPA 1G3ZA 2CBAA 4KNIA 4YGKA 3S77B 1CALA 4KP8A 4QK1A 5FNLA 3RYJB 1CNBA 3EFTA 4RUYA 5G0CA 1CNGA 3L14A 3TVNX 3S9TA 1OKMA 2POUA 3P3HA 5JGTB 1CVFA 4G7AA 4JS6A 3MHIA 3R16A 4MDGA 5JG3B 3KOIA 1FSNA 3M40A 4WL4A 3MHOA 2GEHA 3DAZA 2WD2A 4FU5A 5DSQA 1LG5A 1ZSAA 4XIXA 5FNJA 1DMYA 3D0NA 1CNJA 1CAOA 1IF4A 5BNLA 1XEVA 3MWOA 1BNUA 2NWYA 1YO2A 2H4NA 1ZGEA 4K1QA 2CBCA 1RJ6A 4Q0LA 2HOCA 5G01A 1DMXA 4IWZA 1CNYA 2HKKA 3MNHA 3V3GB 3UYNA 3ZP9A 2FW4A 4QK2A 1YDBA 1I9MA 5E2NA 2IT4A 4YXUA 3M04A 4LU3A 3N3JA 3RZ5A 1CCTA 5EH5A 5DSNA 4QJPA 3B4FA 4MLTA 1TE3X 4FRCA 5SZ7A 3OY0A 1I91A 3FW3A 2W2JA 4CNWA 4Q78A 5FL5A 4HT0A 3M1QA 3S78B 1JV0A 1EOUA 3M5TA 1BNNA 3HKTA 4QJXA 3M1WA 1G0FA 5E28A 1RZAA 5DSMA 1I8ZA 4MDLA 3KONA 5EOIA 2X7TA 5L3OA 1UGEA 2EZ7A 5FLQA 3N2PA 1CVEA 1RZDA 4CACA 5BRUA 1KEQA 1H9QA 1HUHA 3D92A 3DCCA 3M5EA 1CNCA 1CCSA 3IEOA 4QK3A 4E3HA 1T9NA 1IF7A 2ILIA 5DRSA 5FLRA 5FL6A 5DOHA 3SBHA 3OKVA 1ZFQA 1CNIA 3K7KA 3IGPA 4BCWA 4KP5A 3MHMA 2OSFA 5SZ5A 1CAJA 4ZWYA 4WUPA 3P58A 4K0ZA 3DBUA 3KIGA 3SBIA 5BYIA 4Q7SA 4R59A 1UGFA 4Q09A 1CAZA 1I9QA 4FVOA 3B1BA 3DC3A 4Q99A 3V2JA 3HFPA 5E2RA 4YX4A 4RFDA 3VBDA 3PO6A 3ZNCA 3RLDA 1Z9YA 5FLTA 3SAXA 1CNXA 3MZCA 3M2YA 4YVYA 3RGEA 1ZGFA 2NWPA 3JXGA 3N4BA 2X7SA 4PQ7A 4M2UA 3Q31A 1RZBA 5E5RA 1BCDA 2FOYA 1ZH9A 4ETQC 3NI5A 2Q1BA 2QOAA 4Q87A 4WW8A 3U47A 2NWOA 3MHLA 5JEPB 3QYKA 4KUWA 4LHIA 1FQLA 2EU3A 5FLSA 1HVAA 3RYVB 1HUGA 5CJFA 3KOKA 3RYZA 5C8IA 5DSJA 4ZAOA 1CVBA 1G46A 1H9NA 4ZWZA 1AZMA 1I9PA 1H4NA 3W6HA 3F7UA 4ZX0A 1YO1A 3TMJA 2WD3A 4CNVA 5G03A 5J8ZA 1G52A 2POWA 3M3XA 1FSQA 1TEQX 3DVDA 1TEUX 1V9IC 4KNMA 3D93A 3MMFA 1IF9A 1G0EA 5JQTA 5BRWA 1YDDA 3HKQA 1HEAA 2NMXA 4JSZA 3M5SA 4QSBA 3HKNA 4CA2A 3GZ0A 3CZVA 4WR7A 1DCBA 2CBDA 1CILA 1LUGA 3NJ9A 3OYSA 4XZ5A 4Q83A 8CA2A 4XFWA 5SZ1A 3RG3A 2NN1A 2Q1QA 1OKNA 4L5UA 4R5BA 1Z93A 3RZ8A 3CAJA 4Q81A 1IF8A 5IPZA 4YGNA 4QY3A 1TB0X 3DC9A 1LZVA 1HCBA 3M96A 3JXFA 3DV7A 1YDCA 4HBAA 3SAPA 3U7CA 3RYYA 1UGBA 5FNGA 5FNKA 1OQ5A 2AX2A 5JG5B 1MUAA 1FLJA 1THKA 2FOSA 4WW6A 4BF6A 2AW1A 3MHCA 1KWQA 4KV0A 3IAIA 1I9NA 3MNKA 4K0SA 4XE1A 2NNOA 5EHVA 3S73B 3U3AX 1I9OA 4RIUA 3T84A 1ZE8A 4Q6EA 12CAA 2O4ZA 1KWRA 2FMZA 1F2WA 1TG3A 3LXEA 1CVHA 5EH7A 3U45X 1G45A 2ZNCA 1FSRA 1CAHA 5JEGB 4JSSA 2CABA 4QIZA 4JSAA 4RIVA 3ML5A 6CA2A 2NNSA 1RAZA 3OIMA 3KKXA 4Q9YA 4KNNA 1CANA 1CA2A 1CNHA 4Q06A 5FL4A 1CVAA 4HU1A 2NXRA 2FOUA 5DSLA 1OKLA 2WEJA 4Q49A 4DZ9A 1FQNA 1G54A 3T5ZA 4FVNA 4Z1JA 4COQA 4E5QA 5EKHA 2CBBA 3D8WA 3M67A 3PJJA 2H15A 5EKJA 3OYQA 1V9EA 2OSMA 5DSRA 3DD0A 1BNMA 1HEDA 2POVA 4KAPA 4KNJA 2VVAX 5DOGA 4YYTA 3IBUA 4Q8YA 1CINA 1FQRA 3F4XA 1XPZA 5CLUA 5LMDA 3ML2A 5EHWA 4Q90A 3K34A 2FOVA 4Q08A 1CZMA 1I9LA 1RZCA 3MNJA 1I90A 5AMDA 4RH2A 1ZSBA 1ZSCA 3DD8A 3EFIA 4FPTA 1TG9A 1CRAA 1FQMA 1FR4A 4JSWA 4UOVA 1BN3A 2HD6A 5EIJA 3CA2A 4ITOA 1CA3A 3CYUA 5EHEA 3F7BA 3MDZA 4PYYA 3K2FA 1FR7A 3T5UA 3IBNA 3KWAA 3FE4A 3HLJA 4QSIA 3P5AA 3P4VA 4FIKA 3KS3A 3M2ZA 3BL0A 3MNIA 3V2MA 4C3TA 1BN4A 3S97A 5E2MA 4WUQA 5DVXA 4Q7WA 2FNKA 1DCAA 4Z0QA 1G6VA 4RFCA 3P44A 1IF6A 4QJ0A 4XIWA 1AM6A 3V7XA 4MLXA 4QTLA 3V3FA 1BNWA 5FNHA 3MNUA 3S71B 4K0TA 5DSKA 3P55A 3S72B 5HPJA 4HEYA 2WEOA 4QSAA 5SZ6A 1CAYA 5JDVB 2CA2A 1KOQA 3BL1A 4KUYA 5SZ0A 4KUVA 3V3HB 5FDIA 4HEWA 2CBEA 3V3IB 4QSJA 1A42A 1BZMA 4E3DA 4YXOA 1TH9A 1UGGA 4Q6DA 3T82A 3OILA 4TWMA 3IBLA 3S76A 5DSIA 4E3FA 1CVDA 4Q7VA 1LG6A 4HT2A 1Y7WA 3S74B 3FFPX 4Q7PA 4N16A 2ABEA 4G0CA 1UGAA 4E9OX 3F8EA 4YXIA 3P3JA 4IDRX 3OKUA 5L6KA 1CAKA 4YGLA 2VVBX 1RJ5A 3PYKA 4E49A 1AVNA 5JQ0A 2QO8A 3P5LA 4QIYA 1HEBA 1IF5A 4YHAA 3W6IA 9CA2A 1G48A 4FL7A 2NNGA 4GL1X 3S75B 1BNQA 1CAIA 1BN1A 3M1KA 5SZ2A 1YO0A 3MYQA 1G53A 4Z1KA 4Q8XA 4ILXA 2NN7A 5G0BA 5CA2A 3RYXB 1XQ0A 4PXXA 3UYQA 1YDAA 2HFWA 5A6HA 2HL4A 1G1DA 4QEFA 4Q07A 4ZX1A 1G4OA 3HKUA 2FOQA 5AMLA 1CNKA 3OIKA 5FNIA 1MOOA 4YGFA 5DSOA 5A25A 2Q38A 3S8XA 3M1JA 4PZHA 4YWPA 4BF1A 5E5UA 4Q8ZA 1BICA 1HECA 1URTA 4CNXA 5SZ4A 1G4JA 4CQ0A 5JESB 4Z1EA 3M2NA 4CNRA 3M98A 2FNMA 2GD8A 1JD0A 2NXSA 2NXTA 2FMGA 5JEHB 4X5SA 1JCZA 4HEZA 1ZFKA 1CRMA 4MDMA 4TWLA 4ZWXA 4Z1NA 4HF3A 5JGSB 3KNEA 4R5AA 5BRVA 4K13A 2F14A 1KOPA 2NWZA 4RUXA 4PYXA 3N0NA 4MO8A 2EU2A 4QJWA 4QJMA 1CAMA 1TBTX 4YGJA 4DZ7A 3RZ7A 4RUZA 3T83A 4N0XB 4RN4A 2HNCA 3DA2A 3HS4A 3JXHC 1RZEA 1BNTA 4M2VA 3BETA 1CIMA 3M2XA 3M14A 4LP6A 3DVBA 1LGDA 4L5WA 1CNWA 1XEGA 3RJ7A 2QP6A 4E3GA 3NB5A 1HCAA 4M2WA 3RG4A 3DVCA 5FDCA 1UGCA 2X7UA 1RAYA 7CA2A 3D9ZA 3MNAA 4MTYA 5SZ3A 5DSPA 2NNVA 3RZ1B 2FNNA 4L5VA 5FLPA 5EZTX 4QJOA 3IBIA 3V5GA 5EH8A 5FNMA 1CVCA 1ZNCA 3C7PA 5EKMA 5E2SA 3RZ0B 5CACA 5E2KA 3V3JA 1BV3A 3DCWA 1Z97A 1UGDA 3T85A 3DCSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5AMG A;  1BNV A;  2WEG A;  4ZWI A;  1TTM A;  1J9W A;  3R17 B;  4Y0J A;  3KLD B;  4M2R A;  5FLO A;  4E4A A;  1CCU A;  3TVO X;  2WEH A;  4ITP A;  1G3Z A;  2CBA A;  4KNI A;  4YGK A;  3S77 B;  1CAL A;  4KP8 A;  4QK1 A;  5FNL A;  3RYJ B;  1CNB A;  3EFT A;  4RUY A;  5G0C A;  1CNG A;  3L14 A;  3TVN X;  3S9T A;  1OKM A;  2POU A;  3P3H A;  5JGT B;  1CVF A;  4G7A A;  4JS6 A;  3MHI A;  3R16 A;  4MDG A;  5JG3 B;  3KOI A;  1FSN A;  3M40 A;  4WL4 A;  3MHO A;  2GEH A;  3DAZ A;  2WD2 A;  4FU5 A;  5DSQ A;  1LG5 A;  1ZSA A;  4XIX A;  5FNJ A;  1DMY A;  3D0N A;  1CNJ A;  1CAO A;  1IF4 A;  5BNL A;  1XEV A;  3MWO A;  1BNU A;  2NWY A;  1YO2 A;  2H4N A;  1ZGE A;  4K1Q A;  2CBC A;  1RJ6 A;  4Q0L A;  2HOC A;  5G01 A;  1DMX A;  4IWZ A;  1CNY A;  2HKK A;  3MNH A;  3V3G B;  3UYN A;  3ZP9 A;  2FW4 A;  4QK2 A;  1YDB A;  1I9M A;  5E2N A;  2IT4 A;  4YXU A;  3M04 A;  4LU3 A;  3N3J A;  3RZ5 A;  1CCT A;  5EH5 A;  5DSN A;  4QJP A;  3B4F A;  4MLT A;  1TE3 X;  4FRC A;  5SZ7 A;  3OY0 A;  1I91 A;  3FW3 A;  2W2J A;  4CNW A;  4Q78 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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