3M5SA

Carbonic anhydrase ii mutant h64c in complex with carbonate
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGCAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mutational study on Carbonic Anhydrase II
rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3m5sA00
2IT4A 3RYYA 1CNJA 4FVNA 3S77B 5JEGB 1G53A 2NXSA 5EOIA 2X7SA 1UGBA 1ZFQA 4PQ7A 3BL0A 4WW8A 3CAJA 1FR4A 3M3XA 3MHIA 1J9WA 4JSWA 3Q31A 3D93A 2FOQA 4X5SA 5DSRA 3TMJA 2Q1QA 3V7XA 1YDDA 1G1DA 1ZGEA 3MNAA 5JGSB 4LP6A 1HUHA 5BNLA 4Q81A 3U47A 4R59A 1YO2A 4CNRA 2AW1A 3DD0A 4HBAA 1CNGA 4YGNA 1IF5A 5DSKA 3M5TA 1G4JA 5SZ6A 1BNUA 5FNGA 4M2VA 4HEYA 2HL4A 5E5UA 3SBHA 1G54A 3IBUA 3R16A 1DCAA 5EKHA 1IF7A 3M96A 1CNIA 5HPJA 7CA2A 1JCZA 4K0TA 1TEUX 1UGAA 1BN3A 1CAMA 3T83A 1CVAA 2Q38A 4Q7SA 1I9LA 5LMDA 1CNWA 3EFIA 3PYKA 3T82A 2ABEA 4HEWA 2FNMA 2W2JA 2CA2A 1HUGA 1LG6A 1YO0A 4R5BA 5JESB 1UGDA 4Q8YA 5SZ7A 2POWA 2H15A 3M2YA 3TVNX 1CIMA 5E2NA 4QSJA 1F2WA 1MUAA 1XPZA 1XEVA 1BNMA 1OKMA 4ITPA 4FVOA 4QJXA 5E2MA 1ZH9A 1HEAA 1CNHA 2QO8A 1CVDA 2HNCA 3DAZA 3OIKA 3V2MA 5EH8A 2NNGA 3B1BA 3PO6A 1CAJA 4E4AA 3S75B 3U45X 1TTMA 5DSMA 5FNLA 1OKNA 1HEBA 4MLTA 3S97A 4E3GA 4KNIA 1ZSCA 5DSPA 3RYJB 3M5EA 5JQTA 4QTLA 4ZX1A 3DV7A 3MNIA 4Q8XA 3R17B 5DSQA 1XQ0A 3T85A 2GD8A 1RAZA 1CA3A 1FQRA 2NXRA 4RFDA 3T5ZA 5FLTA 1LGDA 4CNWA 3DC9A 4KV0A 1YDCA 1KEQA 5E5RA 4KNMA 2HKKA 3UYQA 3MHLA 1ZNCA 4JSSA 5BRUA 4KP8A 5E2KA 3S71B 4Q83A 5E2RA 4HU1A 1HECA 4Q09A 1LG5A 1RJ6A 4QK1A 2X7UA 1RZAA 3KOKA 1I8ZA 3M2ZA 4CNXA 1HVAA 3MNUA 1FSRA 3RZ7A 5SZ0A 2CABA 3V3JA 5JGTB 3ZNCA 1CRMA 3K7KA 1KOQA 4Z0QA 1KOPA 4QJMA 6CA2A 4YXIA 2QOAA 5DSNA 4KUWA 4YXUA 5EH5A 1CAYA 5FNIA 4JSZA 4Q6DA 3RYXB 1TH9A 1CNKA 1V9IC 3RG3A 5SZ4A 3F7UA 2NWZA 4MDMA 4MO8A 3OYSA 4RUYA 4ITOA 3SAPA 4JS6A 1Z97A 1I9MA 4ZWYA 4RIVA 3DA2A 1TB0X 3T5UA 1UGCA 1FQNA 5FLRA 3U3AX 5DOHA 1KWQA 2EZ7A 5JDVB 3HS4A 3M98A 4HEZA 2ILIA 5A6HA 3S74B 4WUPA 1BCDA 1ZFKA 3LXEA 4G0CA 1RZEA 4UOVA 4YHAA 2ZNCA 4Z1JA 3V3GB 1THKA 5FDIA 4KNNA 4YX4A 2OSFA 1G48A 3CA2A 3P5LA 1H4NA 1BNQA 3DCWA 3C7PA 3P44A 1ZSBA 2H4NA 5E28A 2X7TA 4L5UA 4Q06A 4RN4A 4R5AA 5FNJA 2HFWA 1RZCA 5CA2A 3IBNA 3DVDA 4XE1A 2NWPA 1RAYA 4KP5A 1FR7A 4Q9YA 4HF3A 4FU5A 5AMLA 3N0NA 5L6KA 4RIUA 1CNXA 4Z1EA 4FIKA 3FE4A 3MNKA 4KUVA 1CNBA 1CVEA 2NNVA 3F7BA 1CNCA 4CA2A 1CCTA 4E3FA 4Q6EA 4M2UA 2WEHA 1DCBA 2HOCA 3JXFA 3RZ1B 3MYQA 2NXTA 3HKTA 3ML2A 3S76A 5BRVA 1ZGFA 4ZWXA 3BL1A 3P4VA 3M04A 4Q78A 5EHVA 3KKXA 3F4XA 3OIMA 5JEPB 3RYVB 1TE3X 3NJ9A 3V3HB 1G0FA 3F8EA 2WEGA 3BETA 5DSJA 1HEDA 1BV3A 1CRAA 1IF8A 3IBLA 3JXGA 5JQ0A 4RFCA 4ETQC 5AMDA 3QYKA 1RJ5A 1DMYA 3DVBA 5FLQA 2CBDA 1V9EA 3UYNA 2GEHA 4WW6A 4YGKA 1CZMA 2FNNA 2FOSA 2FOYA 4Q90A 1H9NA 4Q07A 3M1JA 1OKLA 3M5SA 3MDZA 4WR7A 4E49A 1G3ZA 4ILXA 3MMFA 5FLPA 5G01A 1A42A 1CA2A 1MOOA 3B4FA 4Q99A 4WL4A 5DRSA 3KNEA 3HLJA 4XZ5A 4GL1X 1CVFA 2QP6A 4QIZA 1IF4A 5DVXA 1CILA 2F14A 1UGEA 3M2XA 5J8ZA 3SBIA 4MDGA 1FSNA 4L5WA 4CQ0A 4PXXA 5FDCA 1BNTA 5L3OA 5FL4A 3MZCA 5AMGA 3RZ0B 3PJJA 3HFPA 4IDRX 4K0ZA 3DD8A 3FFPX 3M2NA 4IWZA 3IBIA 1FQLA 3HKNA 4ZAOA 4RH2A 3DCSA 1IF6A 3CYUA 3W6IA 4Q7PA 4LU3A 3L14A 4QJ0A 1HCBA 1Z93A 4M2RA 4QSAA 4BF6A 1TBTX 5BYIA 12CAA 3S78B 4XIWA 3K34A 4Q8ZA 3ZP9A 3S9TA 4Y0JA 4MLXA 4MTYA 4CNVA 1I91A 2NWOA 3TVOX 3HKUA 1BICA 4QK3A 3FW3A 1I9NA 4WUQA 4PYXA 3RZ5A 4FRCA 1CVHA 4KAPA 1G46A 3KIGA 1XEGA 1TEQX 4N16A 1CVCA 2EU3A 4YGFA 3T84A 3D92A 4BF1A 1OQ5A 1RZDA 4RUZA 3OILA 3RJ7A 2FOVA 1CAZA 1TG9A 5IPZA 2POVA 3OKVA 3M1KA 1CVBA 4YVYA 4MDLA 3OKUA 2EU2A 3MNJA 4QSBA 1CALA 3HKQA 4C3TA 2CBCA 1UGGA 4HT2A 1I9OA 1G0EA 3P3HA 5CLUA 5SZ1A 5FNHA 3SAXA 2POUA 3M1QA 3MNHA 3NI5A 1ZE8A 1BZMA 1CAOA 3NB5A 3MHOA 4K0SA 1AVNA 1CNYA 2HD6A 3V3IB 9CA2A 4E3DA 4YGLA 5EKJA 3EFTA 3P5AA 4JSAA 5EIJA 2NN7A 3U7CA 4YYTA 5FL5A 4E3HA 5SZ5A 1I9QA 4YGJA 5DOGA 1CCSA 4ZX0A 2NMXA 4COQA 3DBUA 2VVAX 5E2SA 2WD2A 5JG5B 1CANA 3MHCA 3OYQA 3M14A 1JV0A 3CZVA 3D9ZA 2FW4A 5FNKA 3N3JA 5SZ3A 1FLJA 1RZBA 3DC3A 2FMZA 4XIXA 5EH7A 5EHWA 3RG4A 4PZHA 5JG3B 4TWMA 4K13A 2OSMA 3N4BA 1ZSAA 4Q0LA 3MHMA 3RYZA 1CAKA 4TWLA 5CACA 4QJOA 3P55A 1IF9A 3KS3A 3W6HA 3V2JA 4Q7VA 4FL7A 3GZ0A 4E9OX 2Q1BA 4QK2A 4QJWA 3KWAA 4QJPA 4YXOA 1AM6A 3P3JA 1CAHA 4Q7WA 4Z1NA 3JXHC 2NNOA 3RZ8A 4QSIA 4QY3A 1G52A 1BNNA 2AX2A 1G6VA 1HCAA 1KWRA 2FNKA 3V3FA 1BNVA 4RUXA 5G0BA 3OY0A 4ZWZA 4M2WA 1URTA 1G45A 1JD0A 4N0XB 5C8IA 1BN1A 3RLDA 1TG3A 5FL6A 5A25A 4Q08A 1CINA 3P58A 2O4ZA 4G7AA 5FLSA 1T9NA 1FQMA 3M1WA 3DCCA 1I90A 3D0NA 5G03A 1CAIA 4YWPA 4E5QA 5BRWA 2NWYA 4LHIA 5DSOA 5EKMA 1YDBA 4FPTA 1FSQA 5EZTX 5SZ2A 5CJFA 4PYYA 3M67A 4CACA 3KLDB 4XFWA 1YDAA 2NN1A 4L5VA 4QEFA 8CA2A 2CBEA 3IEOA 1DMXA 1LUGA 3D8WA 3S73B 5FNMA 4QIYA 3RGEA 5G0CA 4DZ9A 4KNJA 3S72B 4Q87A 3K2FA 1H9QA 1LZVA 4KUYA 1EOUA 1Z9YA 1YO1A 2FOUA 5FLOA 2CBBA 3KONA 2WEOA 3MWOA 3IGPA 2VVBX 1G4OA 2CBAA 3IAIA 2NNSA 3ML5A 5DSLA 3KOIA 1CCUA 1AZMA 4BCWA 3DVCA 4DZ7A 1BNWA 4Q49A 3VBDA 2WD3A 1UGFA 1BN4A 5JEHB 2WEJA 4ZWIA 4K1QA 1I9PA 3V5GA 5DSIA 3S8XA 2FMGA 1Y7WA 5EHEA 3N2PA 4Z1KA 4HT0A 3M40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2IT4 A;  3RYY A;  1CNJ A;  4FVN A;  3S77 B;  5JEG B;  1G53 A;  2NXS A;  5EOI A;  2X7S A;  1UGB A;  1ZFQ A;  4PQ7 A;  3BL0 A;  4WW8 A;  3CAJ A;  1FR4 A;  3M3X A;  3MHI A;  1J9W A;  4JSW A;  3Q31 A;  3D93 A;  2FOQ A;  4X5S A;  5DSR A;  3TMJ A;  2Q1Q A;  3V7X A;  1YDD A;  1G1D A;  1ZGE A;  3MNA A;  5JGS B;  4LP6 A;  1HUH A;  5BNL A;  4Q81 A;  3U47 A;  4R59 A;  1YO2 A;  4CNR A;  2AW1 A;  3DD0 A;  4HBA A;  1CNG A;  4YGN A;  1IF5 A;  5DSK A;  3M5T A;  1G4J A;  5SZ6 A;  1BNU A;  5FNG A;  4M2V A;  4HEY A;  2HL4 A;  5E5U A;  3SBH A;  1G54 A;  3IBU A;  3R16 A;  1DCA A;  5EKH A;  1IF7 A;  3M96 A;  1CNI A;  5HPJ A;  7CA2 A;  1JCZ A;  4K0T A;  1TEU X;  1UGA A;  1BN3 A;  1CAM A;  3T83 A;  1CVA A;  2Q38 A;  4Q7S A;  1I9L A;  5LMD A;  1CNW A;  3EFI A;  3PYK A;  3T82 A;  2ABE A;  4HEW A;  2FNM A;  2W2J A;  2CA2 A;  1HUG A;  1LG6 A;  1YO0 A;  4R5B A;  5JES B;  1UGD A;  4Q8Y A;  5SZ7 A;  2POW A;  2H15 A;  3M2Y A;  3TVN X;  1CIM A;  5E2N A;  4QSJ A;  1F2W A;  1MUA A;  1XPZ A;  1XEV A;  1BNM A;  1OKM A;  4ITP A; 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