3M98A

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with 5-(1h-benzimidazol-1-ylacetyl)-2-chlorobenzenesulfonamide
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme II with 5-(1H-benzimidazol-1-ylacetyl)-2-chlorobenzenesulfonamide
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase
total genus 74
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3m98A00
2POVA 4CNRA 1UGAA 1AVNA 1CVBA 3RYYA 3P3HA 1DMXA 5SZ4A 1CNWA 4QEFA 1G52A 1XEGA 1DMYA 1I9MA 2NNVA 5SZ1A 4QSAA 4Q87A 1J9WA 4E9OX 3MDZA 3S8XA 3DD0A 2H15A 4L5UA 4KNIA 3OIMA 4KUVA 5E28A 5JEHB 1HEBA 1BNQA 1XPZA 3IBUA 3RZ7A 1BNWA 4CQ0A 5AMLA 3MNHA 1ZFQA 4HU1A 4M2RA 2NXTA 2NXRA 1G3ZA 3U47A 5JGTB 4ITOA 1RZCA 3NI5A 4QK2A 4QSIA 2FOVA 1CAJA 3EFIA 3HKNA 1BNTA 3DVCA 3HKQA 3DBUA 3DVDA 1CILA 4DZ9A 4E3GA 5E5RA 1LZVA 5EHVA 3RZ8A 5DVXA 4YXUA 5FNJA 3V3GB 9CA2A 1G46A 3K7KA 1LUGA 3KWAA 1G48A 1BNMA 2X7SA 1BN4A 3OKUA 3HFPA 4RIVA 1ZGEA 5L6KA 3DCCA 3V3HB 1TB0X 1I90A 3R16A 2HD6A 1BNVA 4Q8YA 3M2XA 4M2VA 4Q90A 1RAYA 2POUA 3UYQA 4WW6A 1G45A 3K2FA 5JEPB 4YGJA 1BCDA 4Q78A 1I91A 5DSMA 4ZWIA 3MNKA 5FNMA 4RH2A 1YDBA 3OYQA 4R59A 1HUHA 3GZ0A 5SZ0A 3DV7A 3K34A 4XZ5A 4YVYA 1I9QA 4TWMA 3RYVB 3QYKA 3NB5A 5FDCA 1ZSBA 4XFWA 5E5UA 3BL1A 4FVOA 1RJ6A 2AW1A 5A25A 1CNKA 3MHIA 3MNUA 3M2ZA 1H9NA 3MMFA 2NNOA 4QJMA 1I9PA 4ILXA 3M3XA 4YGKA 1T9NA 2CBAA 1HVAA 4ETQC 1ZSCA 3DAZA 3M1QA 3V2MA 3KONA 5CACA 3M98A 3MYQA 1G0FA 2IT4A 1Y7WA 1CRAA 5BNLA 1G0EA 5DOGA 5G03A 1CNXA 5BRVA 3IBLA 1XQ0A 2WEJA 2FNNA 4RUYA 4L5WA 1HUGA 4JS6A 2OSFA 3M96A 4XE1A 5LMDA 3HKTA 2FOUA 4WUPA 3HS4A 1CVEA 1HCAA 1FSQA 5L3OA 3SAXA 4L5VA 5EHWA 1FLJA 3DC9A 3N4BA 5CA2A 8CA2A 1I9OA 1RAZA 1UGEA 4K0SA 4QJOA 1TEUX 4RIUA 4K13A 4Q81A 5E2MA 3RZ5A 4Q7VA 4MDGA 3CAJA 3S77B 4FVNA 3B1BA 4FRCA 4LP6A 3ML5A 6CA2A 5EOIA 4HT0A 2FMGA 1RJ5A 4IWZA 5FLPA 1MOOA 5EKHA 3S75B 5JG5B 4KP8A 4QJPA 2HNCA 2O4ZA 3T5ZA 4Z1JA 3IGPA 5JQTA 1CANA 3ML2A 1CAHA 2CA2A 3T84A 3MWOA 2NN7A 5BRUA 3SBIA 3OKVA 4CNXA 3M14A 3RZ0B 4QSJA 3OYSA 2X7TA 5FLTA 1TEQX 2CBBA 1YO1A 5DSRA 2EU2A 5CLUA 4R5BA 3HKUA 4RFCA 5FLRA 4QY3A 4M2UA 5SZ5A 1HECA 5A6HA 4CNVA 1XEVA 3IBNA 4JSSA 1I9LA 3VBDA 5G0BA 3R17B 3S78B 3P5AA 1CAZA 1TE3X 1V9IC 1LG5A 2FNMA 3MHCA 4HEZA 4M2WA 4Q8ZA 4YHAA 4E3FA 1FQNA 3P44A 4FL7A 4E3HA 4HT2A 4YXOA 1BN1A 4YGFA 1CNYA 1CALA 5FLOA 3V3JA 1DCAA 4Q99A 5FLSA 1UGDA 4Z1NA 3M1KA 2QOAA 3KS3A 1G54A 1ZE8A 3MHMA 1TG3A 4ZWXA 4R5AA 1CRMA 1HEAA 5AMDA 3V3FA 3LXEA 5FLQA 2HKKA 1CA3A 4HEWA 3M2YA 4XIXA 1H4NA 1RZDA 1YDCA 2WEGA 1HCBA 1V9EA 4G0CA 1CAMA 1CVHA 4Q9YA 4QJ0A 1IF9A 4CA2A 1CCSA 3P4VA 4Q09A 4JSZA 1CCUA 3T5UA 4TWLA 1CAIA 1TTMA 1LG6A 5DSPA 3W6HA 4MDMA 4K0ZA 5DSKA 4HEYA 5DSNA 2NWYA 4Q49A 3U3AX 5JESB 4LU3A 2VVBX 3N0NA 3OIKA 3RZ1B 5JEGB 3M1JA 4YGNA 2NWOA 1UGGA 1CCTA 3DVBA 4WL4A 1CVFA 1IF7A 1FQRA 2ILIA 1CZMA 3RGEA 2CBDA 3SBHA 4HBAA 3KOIA 4KP5A 3D93A 4RN4A 1TBTX 2Q1BA 3S71B 5CJFA 5EH5A 3M40A 5E2NA 4Y0JA 3U45X 1KEQA 4WUQA 4BCWA 7CA2A 5EIJA 1CNGA 1FR7A 4KNNA 4KUYA 4Q6EA 1KOQA 2ABEA 4MTYA 1CNBA 1F2WA 2Q1QA 5JG3B 5IPZA 1CAOA 3B4FA 5EH7A 3KOKA 3D0NA 3KKXA 3MNIA 2NNGA 3ZNCA 3JXHC 1FQLA 5FNIA 1IF6A 4Q7SA 2W2JA 3S74B 3T85A 2ZNCA 4Q7PA 3RYXB 4N0XB 3MHLA 3C7PA 4QJWA 1CA2A 5E2SA 2EU3A 1YO0A 2CBEA 4QIZA 3RJ7A 5FL5A 3Q31A 4Q07A 3M5TA 2HFWA 4QTLA 4YYTA 5FNKA 2WEHA 4KV0A 5EHEA 2HL4A 3S72B 3MNAA 3TVNX 4QSBA 3FFPX 1JCZA 1CAKA 2NN1A 3PYKA 1G1DA 4XIWA 1ZNCA 3FW3A 1G4OA 3TVOX 5JDVB 1URTA 3S97A 3P3JA 1DCBA 4MDLA 4MLXA 5FNHA 1IF5A 2FOYA 3CA2A 3IBIA 2NXSA 2OSMA 4BF6A 4E3DA 4Q0LA 1BV3A 4FU5A 3RYJB 1HEDA 4QK3A 4ITPA 2WD3A 1G6VA 4ZX0A 3V2JA 4QIYA 3D8WA 3U7CA 1AZMA 2WEOA 3NJ9A 4PXXA 5SZ7A 4WW8A 4Q83A 1BZMA 1KWRA 1UGBA 3DD8A 1BNUA 1CIMA 4C3TA 1OKNA 2QO8A 3N3JA 3S9TA 4K0TA 3V7XA 5EZTX 5JGSB 1UGFA 5DSIA 3P55A 2CBCA 3KIGA 2FOQA 3UYNA 4E4AA 4GL1X 3F8EA 4QK1A 5FL4A 3W6IA 4Z1KA 2VVAX 2GD8A 5DSOA 1RZBA 3S76A 4WR7A 4Q8XA 5AMGA 3T82A 1KWQA 1CVCA 3HLJA 3M5SA 3V3IB 2EZ7A 3F7BA 1I8ZA 3TMJA 4G7AA 4RFDA 5EH8A 1UGCA 2AX2A 3CZVA 3MNJA 4PQ7A 1OKMA 1Z97A 1CNJA 3OILA 4Q06A 4Q08A 4Z1EA 1BN3A 1FSRA 4PZHA 5SZ3A 1CINA 4MLTA 5SZ6A 1BICA 3P58A 5BRWA 1CNIA 1IF4A 3F4XA 4JSWA 1THKA 2FNKA 3OY0A 4MO8A 5DSLA 2X7UA 5FL6A 3JXGA 4FIKA 5DRSA 5HPJA 2NMXA 4IDRX 2FOSA 4YXIA 1LGDA 1ZFKA 3D92A 3M5EA 5EKMA 3KNEA 2NWZA 4PYYA 1YDDA 4ZX1A 5FNGA 2H4NA 4HF3A 3EFTA 1AM6A 1FR4A 1G53A 3BETA 4Q7WA 2NNSA 4FPTA 1CNCA 2NWPA 3IEOA 3P5LA 1ZH9A 1YDAA 2CABA 5DOHA 1H9QA 1KOPA 1YO2A 1Z9YA 2F14A 1RZAA 2WD2A 3JXFA 4ZWZA 5DSQA 3MHOA 3IAIA 4Z0QA 5JQ0A 3RLDA 1ZSAA 5SZ2A 5FDIA 3KLDB 1CNHA 1FQMA 3M2NA 1OQ5A 3DCSA 4KAPA 4CACA 3RG4A 3MZCA 3SAPA 1IF8A 5C8IA 4BF1A 3M67A 3BL0A 3N2PA 3FE4A 4CNWA 3DA2A 3M04A 1TH9A 3S73B 4QJXA 4E49A 1RZEA 1Z93A 1CAYA 5E2KA 2HOCA 3CYUA 5FNLA 4RUXA 3DCWA 4YWPA 4UOVA 4ZAOA 2QP6A 1EOUA 1I9NA 2Q38A 4K1QA 4PYXA 2FW4A 2FMZA 4X5SA 4YGLA 5J8ZA 3RG3A 4YX4A 4KNMA 3V5GA 4Q6DA 3ZP9A 4ZWYA 3F7UA 5BYIA 2GEHA 1ZGFA 1TG9A 1JV0A 1FSNA 3M1WA 12CAA 3PJJA 1JD0A 3PO6A 1CVAA 2POWA 3L14A 1MUAA 4COQA 4KUWA 4N16A 4JSAA 1BNNA 4E5QA 4RUZA 5E2RA 5EKJA 3DC3A 1OKLA 3D9ZA 5G01A 5DSJA 4KNJA 5G0CA 1G4JA 4LHIA 3T83A 4DZ7A 1CVDA 3RYZA 1A42A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2POV A;  4CNR A;  1UGA A;  1AVN A;  1CVB A;  3RYY A;  3P3H A;  1DMX A;  5SZ4 A;  1CNW A;  4QEF A;  1G52 A;  1XEG A;  1DMY A;  1I9M A;  2NNV A;  5SZ1 A;  4QSA A;  4Q87 A;  1J9W A;  4E9O X;  3MDZ A;  3S8X A;  3DD0 A;  2H15 A;  4L5U A;  4KNI A;  3OIM A;  4KUV A;  5E28 A;  5JEH B;  1HEB A;  1BNQ A;  1XPZ A;  3IBU A;  3RZ7 A;  1BNW A;  4CQ0 A;  5AML A;  3MNH A;  1ZFQ A;  4HU1 A;  4M2R A;  2NXT A;  2NXR A;  1G3Z A;  3U47 A;  5JGT B;  4ITO A;  1RZC A;  3NI5 A;  4QK2 A;  4QSI A;  2FOV A;  1CAJ A;  3EFI A;  3HKN A;  1BNT A;  3DVC A;  3HKQ A;  3DBU A;  3DVD A;  1CIL A;  4DZ9 A;  4E3G A;  5E5R A;  1LZV A;  5EHV A;  3RZ8 A;  5DVX A;  4YXU A;  5FNJ A;  3V3G B;  9CA2 A;  1G46 A;  3K7K A;  1LUG A;  3KWA A;  1G48 A;  1BNM A;  2X7S A;  1BN4 A;  3OKU A;  3HFP A;  4RIV A;  1ZGE A;  5L6K A;  3DCC A;  3V3H B;  1TB0 X;  1I90 A;  3R16 A;  2HD6 A;  1BNV A;  4Q8Y A;  3M2X A;  4M2V A;  4Q90 A;  1RAY A;  2POU A;  3UYQ A;  4WW6 A;  1G45 A;  3K2F A;  5JEP B;  4YGJ A;  1BCD A;  4Q78 A;  1I91 A;  5DSM A;  4ZWI A;  3MNK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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