3MHCA

Crystal structure of human cabonic anhydrase ii in adduct with an adamantyl analogue of acetazolamide in a novel hydrophobic binding pocket
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Carbonic anhydrase inhibitors. The X-ray crystal structure of human isoform II in adduct with an adamantyl analogue of acetazolamide resides in a less utilized binding pocket than most hydrophobic inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 79
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3mhcA00
3M2YA 1LUGA 2WD3A 3MHLA 4Q07A 1Z9YA 3KKXA 4KNMA 5BYIA 1TE3X 1J9WA 1FLJA 3RZ7A 4Q8YA 1YO0A 3KNEA 5EOIA 3RZ5A 1UGCA 1UGDA 5JGTB 1G3ZA 3M2NA 2Q1QA 1HUGA 2AW1A 5FNMA 3TVNX 3S8XA 3KOIA 1BZMA 3DC3A 3PO6A 4Q9YA 3ML5A 4YXIA 1CA3A 1DCAA 1Y7WA 4HU1A 1RZBA 4Q81A 5L6KA 2FOYA 5FLRA 5SZ5A 1HEAA 4QIZA 4IDRX 4QJOA 5FDIA 3RZ8A 1HVAA 3D92A 5DSPA 3V5GA 1TG3A 3M1QA 1KOPA 5DSRA 4CNWA 2H15A 4KNJA 2CBEA 3FE4A 1YDCA 2NNSA 3S72B 1CVCA 4QJWA 1OQ5A 1ZH9A 1TEQX 3MNHA 1JD0A 1CNBA 2FMGA 3EFTA 1FQRA 1CNJA 3RZ1B 3V3JA 3JXFA 2HD6A 3V2JA 4E5QA 1IF7A 1I91A 1BNUA 4FRCA 1UGAA 3PYKA 4DZ9A 3MNJA 1ZSBA 5BRUA 1Z93A 4E9OX 4XIXA 4QSJA 3M40A 3MNIA 5G0CA 4YX4A 3MHOA 3BL0A 3M98A 3F4XA 4YHAA 1CNWA 1CNYA 2NN7A 3RYXB 4WW6A 4QTLA 5DSIA 2POWA 5G03A 2NWOA 3RJ7A 4BF6A 1A42A 2EZ7A 2HNCA 4M2WA 1CNKA 4M2UA 5L3OA 3IGPA 1CVEA 1RZCA 1XPZA 3T85A 3IBIA 3N3JA 1H4NA 3P5AA 5AMGA 2POUA 4JSSA 3MNKA 4MO8A 1ZGEA 1ZSAA 4QK2A 4ITOA 4Z1KA 3S97A 1HEDA 4QK1A 1CZMA 1DCBA 1G48A 4RUZA 3V3HB 3TVOX 3OY0A 3S77B 4PZHA 1HCAA 3HFPA 4JS6A 4YXUA 3HKTA 1G0EA 3IBNA 1H9NA 2NNVA 5DSMA 1AM6A 5E2MA 3B4FA 5DSKA 1IF4A 1I9OA 1RZDA 3BETA 4YGJA 3GZ0A 1G53A 3OKUA 3N4BA 1XQ0A 1FSNA 2QOAA 2NXTA 5SZ6A 5EHEA 1IF5A 3M1WA 5IPZA 3RYYA 4YVYA 4Q78A 3IBUA 3RYJB 8CA2A 3K7KA 4L5UA 1DMXA 5DOGA 5DSQA 5JEGB 5FLPA 2OSMA 5E5UA 2CBAA 3IEOA 1CAOA 3CAJA 3RG4A 3KWAA 3EFIA 1BCDA 4TWLA 5FL4A 1CIMA 1BNVA 2WEHA 2NWPA 4G0CA 4QIYA 3FFPX 1CRMA 5DOHA 1YO2A 5FNHA 3MNAA 5DSLA 3S9TA 3M2XA 3RZ0B 4Q08A 4PXXA 4Q8XA 1BNWA 2AX2A 5CACA 4XFWA 5DRSA 4ZWIA 2EU3A 3TMJA 1YDBA 1HECA 1CVFA 2HL4A 3P3HA 2CABA 2FOUA 3V7XA 1TG9A 3IBLA 4RFDA 3L14A 4IWZA 5EKJA 5SZ3A 4CNRA 1T9NA 3KOKA 3DV7A 3KONA 4ETQC 4QJ0A 3D9ZA 3T5UA 5CJFA 2HFWA 1I9LA 3HKNA 1FR7A 1IF8A 4MLXA 4CA2A 1RJ5A 2GD8A 4E4AA 5A25A 2WEJA 5E5RA 2FNMA 4G7AA 3DCSA 1G4JA 4XZ5A 5JDVB 2ABEA 1FQNA 5EKMA 4FU5A 2X7TA 1CNXA 1G46A 4KNIA 4ZX0A 2WD2A 1JV0A 3RGEA 3DVDA 4CNVA 4PYXA 5SZ1A 3SAPA 3F8EA 4KUWA 1JCZA 3SBHA 1HEBA 5FL6A 1THKA 3P44A 5JESB 5JQTA 3D93A 1KOQA 4K0ZA 1RZAA 4Q06A 1HUHA 4Z1NA 4Q0LA 3NI5A 1LG6A 4ZWZA 4UOVA 1CCUA 3K34A 4QJXA 4FPTA 4YGKA 1TB0X 4HF3A 4KNNA 5SZ0A 1FR4A 3T84A 5EH7A 3MDZA 3HKUA 3FW3A 1ZSCA 1LGDA 3V3FA 5JEPB 1I9QA 3OKVA 4Q6DA 3DD0A 4TWMA 4FL7A 4QJMA 4YXOA 1KWQA 3M5EA 4HBAA 3RYVB 3DBUA 3MHIA 3R16A 2F14A 5FLOA 5EHWA 2QP6A 5JQ0A 2VVBX 3V2MA 2X7UA 4WUQA 3M96A 1XEGA 2WEOA 3UYNA 1CINA 1FQLA 4K1QA 2GEHA 5SZ7A 1G54A 3M5SA 3U3AX 1V9IC 2CA2A 3SAXA 1MOOA 1BNNA 2FOVA 3K2FA 4COQA 1UGBA 4E3HA 4Y0JA 3VBDA 12CAA 5BNLA 1V9EA 5SZ2A 4R5AA 2FOSA 3MZCA 4CACA 1YDDA 4Q7PA 4KUVA 1G1DA 1CVBA 3DVBA 4K0TA 4RIUA 3S73B 4KV0A 3M1KA 4QSAA 3DAZA 3M2ZA 4RN4A 3C7PA 1F2WA 1G0FA 5JG3B 3NJ9A 3OILA 5E2KA 2EU2A 2NWYA 5JG5B 4Z1JA 4R5BA 4MTYA 1I90A 5EH8A 1CAJA 1URTA 1ZFQA 3DCWA 4JSWA 5FNGA 1CNIA 1OKLA 4RH2A 4HT0A 4WW8A 1LZVA 5FLTA 3N2PA 3QYKA 1CANA 5AMDA 3ZNCA 2Q1BA 4RUXA 4LP6A 3M1JA 5DSOA 2NXSA 4QY3A 1UGFA 3M67A 3KLDB 4PQ7A 5BRVA 1CVAA 3RG3A 5DVXA 5HPJA 4WR7A 4QSBA 1HCBA 2CBBA 3D0NA 4BCWA 1OKMA 2ILIA 1BNTA 4LHIA 3MHCA 4QK3A 3SBIA 4QEFA 3DCCA 1I8ZA 5E28A 4XIWA 3RLDA 1FSRA 3T83A 1CALA 5FNJA 1RZEA 3MMFA 2FMZA 1LG5A 1BICA 4Q90A 5FLSA 4Q83A 3R17B 1FQMA 4M2VA 5C8IA 1CRAA 3HS4A 3NB5A 4MDGA 4ZAOA 4BF1A 1ZFKA 4HT2A 4K0SA 4ILXA 1AZMA 2WEGA 1CILA 1OKNA 4R59A 1ZE8A 3RYZA 4X5SA 1RAYA 4RUYA 4YGFA 5DSNA 1BN1A 1BV3A 4E3GA 3BL1A 3IAIA 3PJJA 5JEHB 4MDLA 4CNXA 1UGEA 5G0BA 3MYQA 1CAYA 6CA2A 1YO1A 2HKKA 1CAMA 1Z97A 1I9MA 4E49A 1CAZA 4Q99A 2CBDA 3M3XA 1CVHA 4MDMA 3HLJA 5FLQA 3DD8A 4E3DA 5EKHA 1CCSA 4L5VA 5FNKA 5EH5A 5FNLA 1BNQA 3JXHC 4Q7WA 3B1BA 2X7SA 3P55A 3U47A 3P58A 2NWZA 1CAHA 1MUAA 4FIKA 3HKQA 3M14A 3DA2A 4MLTA 4YGLA 4XE1A 2VVAX 4DZ7A 3F7BA 1I9NA 2NMXA 3F7UA 2QO8A 4QSIA 1CA2A 3UYQA 1I9PA 5DSJA 3U7CA 4YGNA 3CA2A 4ITPA 4JSAA 1ZGFA 1G52A 4K13A 4Q6EA 3T5ZA 1TBTX 5EZTX 3KIGA 1FSQA 1KEQA 4HEWA 5CLUA 4Q09A 1CAIA 4C3TA 2ZNCA 5LMDA 1H9QA 3W6IA 4HEZA 2FOQA 3ZP9A 3DC9A 3MHMA 5E2NA 4RFCA 4WL4A 4ZX1A 4KUYA 1AVNA 3OIKA 2O4ZA 3OYQA 1TH9A 5SZ4A 3S75B 5BRWA 2POVA 1UGGA 4Z0QA 1G4OA 4RIVA 3S74B 3ML2A 4HEYA 2NNOA 4N0XB 2CBCA 4KAPA 4Q87A 2W2JA 2HOCA 4FVNA 4KP8A 4Q49A 5G01A 2FNKA 1BN3A 5EHVA 3LXEA 2FNNA 2IT4A 5CA2A 1RAZA 2H4NA 1G45A 4E3FA 1CNGA 2NXRA 3P5LA 1CVDA 3OIMA 3W6HA 4Q8ZA 4QJPA 3CYUA 3N0NA 4M2RA 5AMLA 4ZWYA 4Z1EA 3V3IB 1BN4A 1CCTA 1TEUX 1BNMA 4L5WA 2Q38A 7CA2A 5J8ZA 3S78B 3Q31A 4ZWXA 1DMYA 2NN1A 1KWRA 3D8WA 3M04A 3V3GB 1CAKA 1G6VA 5JGSB 3KS3A 4Q7VA 5FDCA 3U45X 5EIJA 3OYSA 4YYTA 4JSZA 4N16A 1CNCA 2FW4A 2NNGA 3CZVA 1ZNCA 4Q7SA 3T82A 2OSFA 4WUPA 3MNUA 1TTMA 3P4VA 4LU3A 4KP5A 5FL5A 1EOUA 3JXGA 3S76A 4FVOA 4GL1X 4CQ0A 3MWOA 1CNHA 4PYYA 3S71B 3M5TA 5E2SA 1IF9A 9CA2A 3P3JA 1YDAA 1IF6A 1RJ6A 3DVCA 4YWPA 5E2RA 5A6HA 1XEVA 5FNIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3M2Y A;  1LUG A;  2WD3 A;  3MHL A;  4Q07 A;  1Z9Y A;  3KKX A;  4KNM A;  5BYI A;  1TE3 X;  1J9W A;  1FLJ A;  3RZ7 A;  4Q8Y A;  1YO0 A;  3KNE A;  5EOI A;  3RZ5 A;  1UGC A;  1UGD A;  5JGT B;  1G3Z A;  3M2N A;  2Q1Q A;  1HUG A;  2AW1 A;  5FNM A;  3TVN X;  3S8X A;  3KOI A;  1BZM A;  3DC3 A;  3PO6 A;  4Q9Y A;  3ML5 A;  4YXI A;  1CA3 A;  1DCA A;  1Y7W A;  4HU1 A;  1RZB A;  4Q81 A;  5L6K A;  2FOY A;  5FLR A;  5SZ5 A;  1HEA A;  4QIZ A;  4IDR X;  4QJO A;  5FDI A;  3RZ8 A;  1HVA A;  3D92 A;  5DSP A;  3V5G A;  1TG3 A;  3M1Q A;  1KOP A;  5DSR A;  4CNW A;  2H15 A;  4KNJ A;  2CBE A;  3FE4 A;  1YDC A;  2NNS A;  3S72 B;  1CVC A;  4QJW A;  1OQ5 A;  1ZH9 A;  1TEQ X;  3MNH A;  1JD0 A;  1CNB A;  2FMG A;  3EFT A;  1FQR A;  1CNJ A;  3RZ1 B;  3V3J A;  3JXF A;  2HD6 A;  3V2J A;  4E5Q A;  1IF7 A;  1I91 A;  1BNU A;  4FRC A;  1UGA A;  3PYK A;  4DZ9 A;  3MNJ A;  1ZSB A;  5BRU A;  1Z93 A;  4E9O X;  4XIX A;  4QSJ A;  3M40 A;  3MNI A;  5G0C A;  4YX4 A;  3MHO A;  3BL0 A;  3M98 A;  3F4X A;  4YHA A;  1CNW A;  1CNY A;  2NN7 A; 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