3MNJA

Human carbonic anhydrase ii mutant k170e
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTEGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and kinetic study of the extended active site for proton transfer in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Proton transport
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3mnjA00
4RUXA 1JV0A 2HL4A 2ZNCA 3S8XA 3LXEA 4QSAA 1DCBA 5EHEA 1IF9A 1IF5A 2HOCA 1CA3A 3M2ZA 1I9QA 3M1KA 4QSBA 4C3TA 3UYNA 1CNKA 2FOUA 3D92A 5FLQA 1CNGA 1UGDA 4N16A 4ZX0A 3PYKA 2NNOA 5CJFA 3M2XA 4Q8YA 4JS6A 3P5LA 3RYXB 3HLJA 3IBLA 5HPJA 3TMJA 5E5UA 4YVYA 4RIVA 4MO8A 2VVAX 3C7PA 1TEQX 2QOAA 3K7KA 5SZ3A 3U3AX 3CYUA 3M04A 3S78B 4FL7A 1OKLA 1DCAA 3MNAA 1V9EA 3MHMA 4L5UA 5FNLA 1OKNA 3N2PA 3KIGA 1CVCA 4LHIA 1OKMA 2NWYA 4YGJA 4KNNA 3IAIA 5FDIA 5L6KA 3M67A 1CAMA 2OSMA 4Y0JA 1UGGA 4E49A 5JDVB 3KKXA 1YO0A 1BZMA 2NN1A 1CAKA 1CNBA 2CBDA 4WUQA 4YXIA 1CNYA 1CAZA 4MDMA 1KWQA 1TTMA 4Q99A 3U45X 3V3IB 3OKVA 3DA2A 1CVEA 5FNJA 5DSJA 3EFTA 4M2WA 5FL6A 1FR4A 1HCAA 2HKKA 3MHOA 3T5UA 4Z1NA 4RUZA 1UGFA 2IT4A 1LG6A 3RG4A 3V5GA 1I9MA 4Q8XA 1HEBA 1Z93A 1BNNA 4Q6EA 5JQTA 4HBAA 5BRUA 3T82A 3M14A 3M5TA 4HT0A 4PYXA 4R5BA 5E5RA 3RG3A 4QK2A 4KUWA 3U47A 5AMLA 3FFPX 3F7BA 1CNCA 3ML2A 5FL4A 5J8ZA 4KP8A 3IGPA 4QSIA 1CNHA 1F2WA 1RZCA 5DSKA 3BL1A 1CCTA 1CCUA 3JXGA 1YDDA 4QTLA 7CA2A 2WEGA 3MNJA 1FQNA 2CBBA 3KOKA 2CABA 4PZHA 1IF4A 5DSLA 4E5QA 6CA2A 4Z1EA 1FQLA 3IBIA 3P5AA 2W2JA 1LZVA 4HU1A 4LU3A 3D93A 5SZ6A 2QP6A 4QK3A 3KONA 3DVBA 4KAPA 4PYYA 5G0CA 4YXOA 2FNKA 3DD8A 1TG3A 3P4VA 3R16A 4Q7SA 4Q83A 5CLUA 5SZ7A 3N0NA 1URTA 4BF6A 3DAZA 4ZX1A 3V2JA 2HD6A 3DVDA 1JD0A 3M1JA 4E9OX 2OSFA 4JSAA 4QY3A 3KLDB 4XE1A 2NNSA 1FQMA 5JG3B 1G4JA 1JCZA 2NXTA 3MHIA 5CA2A 1ZNCA 4ITOA 3SAPA 2FMZA 3TVNX 3DCCA 3KOIA 3S76A 1MUAA 4FIKA 5JGSB 4YGLA 4YGKA 3MNUA 4K13A 5A25A 4Q7PA 4RN4A 4Z1JA 1UGCA 4XFWA 4HEZA 4WW8A 4Q7VA 4XIWA 1YDCA 3SBHA 1G54A 1TG9A 4WL4A 3MHCA 1TE3X 4K0TA 1CNXA 4BCWA 3BL0A 3RGEA 2FMGA 2WEJA 4Q07A 2POWA 4KNIA 4QJMA 4QIZA 3S97A 3NJ9A 3V7XA 1CNJA 5EHVA 4Q8ZA 3P44A 2FOQA 2AX2A 5DSNA 5BRVA 3S9TA 1TEUX 4ITPA 1KEQA 3S73B 3RYJB 5SZ1A 1YDAA 4Q09A 2F14A 1TBTX 3S74B 3W6IA 1XPZA 3CA2A 4QJWA 3GZ0A 1CZMA 3UYQA 5SZ2A 4K0SA 5FNKA 3V3HB 1CAOA 2X7SA 2Q38A 4K0ZA 5G03A 3S77B 5BYIA 4Z0QA 3RYVB 1ZH9A 4LP6A 5DOHA 1CVAA 9CA2A 5E28A 5JEGB 3CZVA 4QJOA 4CNWA 1G3ZA 3T83A 3U7CA 1BNWA 1T9NA 2CBCA 3M96A 3RZ7A 4Q81A 4YYTA 1ZFQA 4M2VA 4E3FA 3M5SA 3P55A 3V3FA 2EU3A 5IPZA 5FLPA 5AMGA 3MWOA 4E3HA 1CCSA 1I8ZA 4QIYA 1FR7A 1HEDA 1FLJA 3P3HA 3JXHC 1Z97A 2FOVA 2H4NA 5JG5B 1RZAA 3DV7A 3L14A 4CQ0A 5E2SA 3F8EA 4K1QA 4FVOA 4QJPA 2Q1QA 4WR7A 4RIUA 2WD2A 1RZBA 1HECA 3PO6A 1H4NA 5EIJA 2CA2A 3D8WA 3NB5A 3RZ5A 3TVOX 1J9WA 4KNJA 1KWRA 3SBIA 3SAXA 4HF3A 4Z1KA 3DCSA 5E2RA 4GL1X 3OKUA 2WEHA 3DCWA 1BICA 4MTYA 1CAJA 3HKUA 1TH9A 4Q6DA 1XEGA 4Q78A 1UGEA 4YXUA 1G0EA 1BNQA 2HFWA 4KUYA 1CNWA 4Q49A 5DSRA 5EH7A 1YO1A 5DSOA 4QK1A 3RZ8A 5DSIA 4R5AA 1BN3A 1CAIA 3M98A 5L3OA 3Q31A 1UGAA 5DSMA 4Q0LA 5AMDA 1CVHA 3P3JA 4M2UA 3HKTA 4CACA 5FNIA 3NI5A 5SZ0A 4ZWIA 4WUPA 1AZMA 3IBNA 4CNVA 3MNIA 3RYYA 1G0FA 3K34A 2WD3A 1V9IC 2POUA 1CRAA 1G53A 3OYSA 4Q87A 1IF8A 1ZSAA 2NWZA 3OIKA 1BN4A 5EZTX 5FDCA 3M1WA 5JEPB 4KP5A 3V2MA 2NXRA 4ZWZA 1XEVA 4RUYA 3KS3A 4MLXA 4QJXA 3OIMA 3MDZA 1I91A 1Z9YA 1A42A 2FW4A 1BN1A 3HKQA 1BCDA 5E2KA 4KV0A 5DSQA 5G01A 12CAA 3DVCA 3RZ1B 4HEYA 2ILIA 5JGTB 4PXXA 2NXSA 4E4AA 3M1QA 1FSNA 4IWZA 1KOPA 4FU5A 5FNHA 1BNTA 8CA2A 1IF6A 3HFPA 3P58A 4JSSA 1EOUA 1LUGA 4RH2A 1I90A 4L5WA 5FL5A 1HCBA 1I9OA 4MDGA 3MNKA 5DVXA 2NNGA 2Q1BA 4E3DA 5JEHB 3M5EA 1BNMA 4JSWA 5CACA 3OY0A 1Y7WA 3HKNA 4MDLA 5FLSA 3W6HA 3S71B 3RJ7A 4Q06A 4Q9YA 2NWOA 1IF7A 4TWMA 4X5SA 3V3JA 1THKA 4M2RA 5EHWA 4ETQC 5G0BA 1RAZA 2NMXA 4YWPA 3ZNCA 1H9QA 3DC9A 1G52A 5JQ0A 3MYQA 1CANA 1YDBA 4ZWYA 1CVBA 2POVA 1CALA 2FOYA 5DRSA 4YHAA 4QJ0A 1MOOA 3ML5A 3S72B 1H9NA 1HUGA 3EFIA 3MMFA 4KUVA 1CA2A 1DMYA 3IEOA 4DZ9A 1G4OA 2X7TA 1CRMA 3MZCA 5E2MA 4QSJA 2EU2A 5E2NA 4DZ7A 3PJJA 4TWLA 1CAHA 5EH5A 3HS4A 3F7UA 3DBUA 3MHLA 1ZE8A 4JSZA 4PQ7A 3DD0A 1BNVA 3K2FA 3M2YA 4ZAOA 3MNHA 1BV3A 3R17B 3FW3A 3JXFA 3ZP9A 4YGNA 1I9NA 1ZGEA 4QEFA 1RZEA 4COQA 1AVNA 3T85A 5C8IA 1FQRA 3F4XA 4CNXA 1HVAA 5EOIA 1HEAA 4HEWA 2AW1A 3KNEA 2VVBX 1DMXA 1LG5A 4CNRA 4XZ5A 3T5ZA 5DSPA 1YO2A 5EKMA 2HNCA 3RLDA 5JESB 5EKHA 4R59A 2GEHA 1I9PA 1FSQA 4Q7WA 3RYZA 5EKJA 1CINA 3KWAA 2X7UA 4MLTA 1G1DA 1CAYA 4Q08A 4RFDA 5FNGA 3S75B 1FSRA 1RJ6A 1BNUA 5FLOA 2EZ7A 2O4ZA 2FOSA 2H15A 4FVNA 4WW6A 4N0XB 1OQ5A 3CAJA 3IBUA 5BRWA 1ZFKA 5SZ4A 3T84A 4YX4A 3D9ZA 3DC3A 2GD8A 4KNMA 2FNNA 2CBEA 4L5VA 1CVDA 3N3JA 1CIMA 2FNMA 5FLTA 5FNMA 3M2NA 3OILA 2CBAA 4Q90A 1G45A 1UGBA 2ABEA 3BETA 1G46A 4IDRX 5BNLA 4YGFA 3B1BA 1HUHA 1RAYA 4FPTA 5DOGA 4XIXA 1I9LA 1CVFA 5A6HA 1ZSBA 1LGDA 4UOVA 1G6VA 4CA2A 3V3GB 1G48A 2NNVA 4G0CA 4HT2A 1AM6A 1CILA 2NWPA 3M40A 5EH8A 4E3GA 4G7AA 3RZ0B 3D0NA 1XQ0A 4RFCA 1RJ5A 3B4FA 4FRCA 3FE4A 5LMDA 5SZ5A 4ILXA 1RZDA 2NN7A 3M3XA 4BF1A 3N4BA 5FLRA 4ZWXA 1TB0X 1ZSCA 3VBDA 1KOQA 2WEOA 3QYKA 1ZGFA 2QO8A 1CNIA 3OYQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RUX A;  1JV0 A;  2HL4 A;  2ZNC A;  3S8X A;  3LXE A;  4QSA A;  1DCB A;  5EHE A;  1IF9 A;  1IF5 A;  2HOC A;  1CA3 A;  3M2Z A;  1I9Q A;  3M1K A;  4QSB A;  4C3T A;  3UYN A;  1CNK A;  2FOU A;  3D92 A;  5FLQ A;  1CNG A;  1UGD A;  4N16 A;  4ZX0 A;  3PYK A;  2NNO A;  5CJF A;  3M2X A;  4Q8Y A;  4JS6 A;  3P5L A;  3RYX B;  3HLJ A;  3IBL A;  5HPJ A;  3TMJ A;  5E5U A;  4YVY A;  4RIV A;  4MO8 A;  2VVA X;  3C7P A;  1TEQ X;  2QOA A;  3K7K A;  5SZ3 A;  3U3A X;  3CYU A;  3M04 A;  3S78 B;  4FL7 A;  1OKL A;  1DCA A;  3MNA A;  1V9E A;  3MHM A;  4L5U A;  5FNL A;  1OKN A;  3N2P A;  3KIG A;  1CVC A;  4LHI A;  1OKM A;  2NWY A;  4YGJ A;  4KNN A;  3IAI A;  5FDI A;  5L6K A;  3M67 A;  1CAM A;  2OSM A;  4Y0J A;  1UGG A;  4E49 A;  5JDV B;  3KKX A;  1YO0 A;  1BZM A;  2NN1 A;  1CAK A;  1CNB A;  2CBD A;  4WUQ A;  4YXI A;  1CNY A;  1CAZ A;  4MDM A;  1KWQ A;  1TTM A;  4Q99 A;  3U45 X;  3V3I B;  3OKV A;  3DA2 A;  1CVE A;  5FNJ A;  5DSJ A;  3EFT A;  4M2W A;  5FL6 A;  1FR4 A;  1HCA A;  2HKK A;  3MHO A;  3T5U A;  4Z1N A;  4RUZ A; 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