3MYQ | Genus

Total Genus 77

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	77
Knots found	KnotProt 2.0: K +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__046580091441712__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__046580091441712__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3myq/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__046580091441712__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"046580091441712","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3myq/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__046580091441712__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	Indapamide-like benzenesulfonamides as inhibitors of carbonic anhydrases I, II, VII, and XIII. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	77
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: K +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2010-05-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	3myqA00

3IAIA 1XQ0A 2FNKA 3HLJA 3RZ5A 1RZAA 5E28A 3HS4A 3SAXA 4WUQA 5EIJA 3RG4A 1IF7A 5SZ6A 3D9ZA 1OKMA 4ZX1A 3HFPA 3M98A 4ZAOA 5EHVA 4KUYA 1ZFKA 4K0ZA 4WW8A 5L3OA 4HT2A 4N0XB 3FE4A 3R17B 4IWZA 5JEGB 4QIYA 3CA2A 3KNEA 3V2JA 5E5RA 3JXHC 6CA2A 4Y0JA 5FLOA 5FLSA 3D93A 4FRCA 4Q87A 5BRWA 3MNHA 4LHIA 4FPTA 4RUZA 5G03A 2NWOA 2FMZA 3M5SA 2POVA 1XEGA 3V7XA 3DD0A 3MNIA 4KV0A 4M2VA 2CBDA 4QSJA 1ZSBA 4Q49A 5EKJA 4KP5A 3IBUA 3T82A 7CA2A 5EOIA 3M2NA 1CNIA 2NNGA 3BL1A 2NXSA 3IBLA 3MHOA 4QSIA 1I90A 4WW6A 3M1QA 3RYYA 9CA2A 2CBBA 4HT0A 3ML2A 1ZSCA 2FNNA 4Q83A 1BN4A 3KLDB 3RYXB 4QJOA 4DZ9A 2POWA 1TG9A 3MMFA 5JGTB 1BNMA 4JSSA 5DSPA 3V2MA 5CACA 3DCWA 4YYTA 4XE1A 3MNUA 3DC3A 3RZ7A 1UGGA 3N4BA 4QK3A 4CNVA 3T85A 4MO8A 5DSLA 1RZEA 3UYQA 1H9QA 3TVOX 1TH9A 3DVDA 1G52A 3P55A 2WEJA 2WD3A 3M1WA 1Z9YA 2CBEA 3PJJA 1CCTA 2HL4A 1FQRA 2Q1BA 3JXGA 4YHAA 5DSNA 5FLRA 3RGEA 3MNJA 3P5AA 5A25A 3L14A 3SAPA 4G7AA 1BZMA 4PYXA 3KONA 3M1JA 5EZTX 2GD8A 1FSRA 4M2UA 3MHIA 1HVAA 4YXIA 3P5LA 2OSMA 3P3HA 1RJ6A 3S74B 4JSWA 4QJXA 1FSNA 1TEQX 4R59A 4CNXA 1CAKA 1FSQA 2EU2A 2WEGA 2IT4A 1A42A 3U7CA 4QEFA 4CNRA 1JCZA 1IF4A 3BETA 4PYYA 5FNLA 5FNGA 5G0CA 3M5TA 4KP8A 1CRAA 4YXUA 5EH5A 1RJ5A 4Q7VA 5FNMA 4Q7SA 3R16A 2EU3A 4XZ5A 4YVYA 3IBIA 2O4ZA 3KOKA 3ZNCA 4YGNA 4L5VA 4DZ7A 1CNYA 1G0FA 5CA2A 3RLDA 1CA2A 1ZFQA 4K0TA 3B4FA 4TWMA 1KOPA 4MDLA 4CACA 3DD8A 5JQ0A 3MNKA 3MHMA 1TG3A 4E49A 2FOYA 2Q1QA 4E3HA 2NWPA 4Q7WA 4YWPA 4R5BA 1HCBA 3CYUA 3W6HA 4Q90A 5AMDA 12CAA 4HBAA 5E2SA 3M14A 3UYNA 1FLJA 5EHEA 2NXRA 4KUWA 5FLTA 4XFWA 2ZNCA 5E2MA 3V3GB 4PZHA 1CANA 2HOCA 3DVCA 2NXTA 4K0SA 2X7SA 5AMGA 5LMDA 5JEHB 5DVXA 3FW3A 1ZGEA 1CNKA 2NN7A 4Z1KA 4Q8XA 1FQLA 4QIZA 4RN4A 1UGAA 3GZ0A 1HEAA 1JD0A 3P4VA 5E2RA 4FVOA 1YDBA 1YDDA 1G46A 3EFTA 2VVAX 3NI5A 4TWLA 3IBNA 3T5UA 3U3AX 1CVEA 1TEUX 1XPZA 2ABEA 3P44A 1CIMA 1DCAA 4RH2A 5IPZA 3MHCA 5DSMA 4Q7PA 5JEPB 1BN3A 1BNWA 1T9NA 5FNJA 5SZ4A 5BYIA 5CJFA 2X7UA 1BNTA 3DVBA 4L5WA 4WL4A 4E4AA 3MZCA 4X5SA 5EHWA 1DMXA 1YDAA 1Z93A 1F2WA 4HF3A 3P58A 2FOVA 4Q8ZA 4QSBA 1H4NA 1CAOA 2FOUA 4ILXA 2AX2A 3V3IB 3MYQA 2POUA 1RZDA 4FU5A 3D0NA 4Q81A 4PXXA 4R5AA 3DCCA 1H9NA 4RIUA 1FR7A 1G48A 1CNJA 4BF1A 5JG5B 5FL6A 3N3JA 2CA2A 1FR4A 4ETQC 3K2FA 3NJ9A 1RAYA 5FNHA 5EH8A 5JESB 1UGFA 1UGCA 4QY3A 1CAMA 3B1BA 1G4OA 4HU1A 5SZ3A 3HKNA 1AZMA 3ML5A 5FNIA 4YGLA 1BN1A 4QJPA 2Q38A 4RFDA 2VVBX 4ZWZA 3NB5A 1G53A 4KUVA 3S75B 1IF8A 3OKUA 4FL7A 4HEYA 2CBAA 1I9OA 4K1QA 1LUGA 3OYQA 1DMYA 4E9OX 4Q0LA 3SBHA 4Z1NA 1CNXA 1ZGFA 5DOHA 3F7BA 1EOUA 4HEZA 4Z1EA 5J8ZA 4RUXA 3D8WA 1CNGA 1CVBA 2EZ7A 3F4XA 1HCAA 3DC9A 1LG5A 3N0NA 4Q8YA 1YO2A 4IDRX 3S76A 1Y7WA 4UOVA 1YDCA 3RYZA 4KAPA 4Q6EA 3V3FA 5L6KA 3N2PA 2NNVA 3RYJB 4L5UA 2FMGA 1IF9A 3KS3A 3T83A 5EKMA 5EH7A 3P3JA 5DSIA 3TVNX 1MOOA 1BNNA 1ZNCA 1URTA 2F14A 3RYVB 1G6VA 4KNMA 4RUYA 4LP6A 4MDMA 3DAZA 3T5ZA 5DSQA 3M2YA 2FNMA 1CZMA 3S8XA 1CNBA 1I91A 2HD6A 5FDIA 4E5QA 1BICA 3IEOA 1TE3X 3EFIA 5DRSA 5BRVA 1KWQA 3K7KA 2WEOA 3RZ8A 4YGKA 5JQTA 4Z0QA 2ILIA 1G1DA 3M1KA 1G45A 4Q08A 4QJMA 4QTLA 4YGJA 3Q31A 4FVNA 2HKKA 4CQ0A 4ITOA 2NWYA 1LG6A 1CRMA 3LXEA 1AVNA 5DOGA 3KKXA 3RZ1B 1AM6A 4GL1X 4LU3A 3DA2A 4QSAA 2NWZA 3OY0A 5G0BA 4ZWIA 1ZE8A 3S97A 4Q07A 1HEBA 3OIMA 4M2WA 2CBCA 4YGFA 3KIGA 3S77B 4ZX0A 2W2JA 5SZ1A 4Z1JA 1KOQA 1G3ZA 4YXOA 2WEHA 3DCSA 1CNHA 1HEDA 1I9NA 1I9PA 2H4NA 4WR7A 1Z97A 1CAYA 1RZCA 5DSRA 3CZVA 4ZWYA 3D92A 5E2KA 4Q78A 3M2ZA 4Q9YA 3M04A 1CAJA 1HUGA 2HFWA 3KWAA 4FIKA 4MLXA 3T84A 4Q09A 2H15A 4Q06A 4RFCA 4WUPA 1CVCA 3ZP9A 4QJWA 1KWRA 1CVHA 1ZSAA 1ZH9A 4KNIA 2X7TA 4QK1A 5DSJA 4N16A 3TMJA 4E3FA 4XIXA 3S73B 1TTMA 3S78B 1V9IC 1HECA 1RZBA 1CALA 5JGSB 5SZ7A 1UGDA 3PO6A 4MTYA 3M96A 2NN1A 3RG3A 1DCBA 4JS6A 1YO1A 1BCDA 1CILA 3QYKA 1G4JA 3F7UA 3K34A 5SZ0A 4ITPA 5FL5A 3F8EA 3BL0A 4RIVA 1XEVA 5SZ2A 3M67A 4MLTA 3KOIA 1CNWA 1CINA 1I9LA 5AMLA 1CA3A 1BNQA 4G0CA 2FOSA 4HEWA 5E2NA 1UGBA 4JSAA 4CA2A 1THKA 2NMXA 4PQ7A 3V3JA 1J9WA 1BNVA 4COQA 2QP6A 4YX4A 5BRUA 1CVAA 5FL4A 1TB0X 4QK2A 1YO0A 3OYSA 3M40A 3MDZA 1CVDA 1KEQA 4Q6DA 3MWOA 2WD2A 2FOQA 4Q99A 3C7PA 3MNAA 3FFPX 3V5GA 3DBUA 4JSZA 1CCUA 1G0EA 1OQ5A 3IGPA 3HKQA 5A6HA 3M3XA 4KNNA 2AW1A 1LZVA 1I9MA 1HUHA 2CABA 4QJ0A 1OKNA 4K13A 5FNKA 5FDCA 1MUAA 5E5UA 3OKVA 1CNCA 4ZWXA 5BNLA 5JDVB 1I8ZA 4BF6A 1I9QA 3HKUA 1V9EA 3OILA 5DSKA 5C8IA 3RJ7A 5CLUA 1UGEA 1CVFA 1IF6A 2OSFA 3V3HB 1CAIA 3JXFA 3S72B 3RZ0B 3S71B 4KNJA 4E3GA 1BV3A 4XIWA 8CA2A 5EKHA 5SZ5A 3PYKA 3M2XA 1CCSA 2NNOA 1CAHA 5FLQA 3U47A 4BCWA 1CAZA 1FQNA 1BNUA 1G54A 1LGDA 2HNCA 3OIKA 5G01A 4C3TA 1TBTX 3W6IA 2QOAA 1JV0A 1RAZA 5DSOA 2QO8A 3SBIA 3CAJA 4MDGA 5JG3B 3U45X 3VBDA 5FLPA 4M2RA 1FQMA 2NNSA 1OKLA 3M5EA 5HPJA 4CNWA 2GEHA 1IF5A 3S9TA 3HKTA 2FW4A 3MHLA 3DV7A 4E3DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3IAI A;  1XQ0 A;  2FNK A;  3HLJ A;  3RZ5 A;  1RZA A;  5E28 A;  3HS4 A;  3SAX A;  4WUQ A;  5EIJ A;  3RG4 A;  1IF7 A;  5SZ6 A;  3D9Z A;  1OKM A;  4ZX1 A;  3HFP A;  3M98 A;  4ZAO A;  5EHV A;  4KUY A;  1ZFK A;  4K0Z A;  4WW8 A;  5L3O A;  4HT2 A;  4N0X B;  3FE4 A;  3R17 B;  4IWZ A;  5JEG B;  4QIY A;  3CA2 A;  3KNE A;  3V2J A;  5E5R A;  3JXH C;  6CA2 A;  4Y0J A;  5FLO A;  5FLS A;  3D93 A;  4FRC A;  4Q87 A;  5BRW A;  3MNH A;  4LHI A;  4FPT A;  4RUZ A;  5G03 A;  2NWO A;  2FMZ A;  3M5S A;  2POV A;  1XEG A;  3V7X A;  3DD0 A;  3MNI A;  4KV0 A;  4M2V A;  2CBD A;  4QSJ A;  1ZSB A;  4Q49 A;  5EKJ A;  4KP5 A;  3IBU A;  3T82 A;  7CA2 A;  5EOI A;  3M2N A;  1CNI A;  2NNG A;  3BL1 A;  2NXS A;  3IBL A;  3MHO A;  4QSI A;  1I90 A;  4WW6 A;  3M1Q A;  3RYY A;  9CA2 A;  2CBB A;  4HT0 A;  3ML2 A;  1ZSC A;  2FNN A;  4Q83 A;  1BN4 A;  3KLD B;  3RYX B;  4QJO A;  4DZ9 A;  2POW A;  1TG9 A;  3MMF A;  5JGT B;  1BNM A;  4JSS A;  5DSP A;  3V2M A;  5CAC A;  3DCW A;  4YYT A;  4XE1 A;  3MNU A;  3DC3 A;  3RZ7 A;  1UGG A;  3N4B A;  4QK3 A;  4CNV A;  3T85 A;  4MO8 A;  5DSL A;  1RZE A;  3UYQ A;  1H9Q A;  3TVO X;  1TH9 A;  3DVD A;  1G52 A;  3P55 A;  2WEJ A;  2WD3 A;  3M1W A;  1Z9Y A;  2CBE A;  3PJJ A;  1CCT A;  2HL4 A;  1FQR A;  2Q1B A;  3JXG A;  4YHA A;  5DSN A;  5FLR A;  3RGE A;  3MNJ A;  3P5A A;  5A25 A;  3L14 A;  3SAP A;  4G7A A;  1BZM A;  4PYX A;  3KON A;  3M1J A;  5EZT X;  2GD8 A;  1FSR A;  4M2U A;  3MHI A;  1HVA A;  4YXI A;  3P5L A;  2OSM A;  3P3H A;  1RJ6 A;  3S74 B;  4JSW A;  4QJX A;  1FSN A;  1TEQ X;  4R59 A;  4CNX A;  1CAK A;  1FSQ A;  2EU2 A;  2WEG A;  2IT4 A;  1A42 A;  3U7C A;  4QEF A;  4CNR A;  1JCZ A;  1IF4 A;  3BET A;  4PYY A;  5FNL A;  5FNG A;  5G0C A;  3M5T A;  4KP8 A;  1CRA A;  4YXU A;  5EH5 A;  1RJ5 A;  4Q7V A;  5FNM A;  4Q7S A;  3R16 A;  2EU3 A;  4XZ5 A;  4YVY A;  3IBI A;  2O4Z A;  3KOK A;  3ZNC A;  4YGN A;  4L5V A;  4DZ7 A;  1CNY A;  1G0F A;  5CA2 A;  3RLD A;  1CA2 A;  1ZFQ A;  4K0T A;  3B4F A;  4TWM A;  1KOP A;  4MDL A;  4CAC A;  3DD8 A;  5JQ0 A;  3MNK A;  3MHM A;  1TG3 A;  4E49 A;  2FOY A;  2Q1Q A; 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 4R5A A;  3DCC A;  1H9N A;  4RIU A;  1FR7 A;  1G48 A;  1CNJ A;  4BF1 A;  5JG5 B;  5FL6 A;  3N3J A;  2CA2 A;  1FR4 A;  4ETQ C;  3K2F A;  3NJ9 A;  1RAY A;  5FNH A;  5EH8 A;  5JES B;  1UGF A;  1UGC A;  4QY3 A;  1CAM A;  3B1B A;  1G4O A;  4HU1 A;  5SZ3 A;  3HKN A;  1AZM A;  3ML5 A;  5FNI A;  4YGL A;  1BN1 A;  4QJP A;  2Q38 A;  4RFD A;  2VVB X;  4ZWZ A;  3NB5 A;  1G53 A;  4KUV A;  3S75 B;  1IF8 A;  3OKU A;  4FL7 A;  4HEY A;  2CBA A;  1I9O A;  4K1Q A;  1LUG A;  3OYQ A;  1DMY A;  4E9O X;  4Q0L A;  3SBH A;  4Z1N A;  1CNX A;  1ZGF A;  5DOH A;  3F7B A;  1EOU A;  4HEZ A;  4Z1E A;  5J8Z A;  4RUX A;  3D8W A;  1CNG A;  1CVB A;  2EZ7 A;  3F4X A;  1HCA A;  3DC9 A;  1LG5 A;  3N0N A;  4Q8Y A;  1YO2 A;  4IDR X;  3S76 A;  1Y7W A;  4UOV A;  1YDC A;  3RYZ A;  4KAP A;  4Q6E A;  3V3F A;  5L6K A;  3N2P A;  2NNV A;  3RYJ B;  4L5U A;  2FMG A;  1IF9 A;  3KS3 A;  3T83 A;  5EKM A;  5EH7 A;  3P3J A;  5DSI A;  3TVN X;  1MOO A;  1BNN A;  1ZNC A;  1URT A;  2F14 A;  3RYV B;  1G6V A;  4KNM A;  4RUY A;  4LP6 A;  4MDM A;  3DAZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3MYQA

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