3N0N | Genus

Total Genus 77

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	77
Knots found	KnotProt 2.0: K +3₁
sequence length	258
structure length	258
Chain Sequence	HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__6343832086531376__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__6343832086531376__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3n0n/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__6343832086531376__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"6343832086531376","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3n0n/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__6343832086531376__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Selective hydrophobic pocket binding observed within the carbonic anhydrase II active site accommodate different 4-substituted-ureido-benzenesulfonamides and correlate to inhibitor potency. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	77
structure length	258
sequence length	258
other databases	KnotProt 2.0: K +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2010-05-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	3n0nA00

4Q7VA 4CQ0A 1UGEA 3S71B 3DVBA 3P55A 3DVDA 4Y0JA 1G0EA 1G53A 4Q0LA 1TG3A 3MNIA 2FMZA 1CAHA 4Q9YA 5JG3B 1G4JA 4PYXA 2FNNA 5EOIA 1CVBA 3HKUA 3V3GB 4L5UA 1ZNCA 2CBDA 3RJ7A 1RZBA 2NNGA 4KNNA 2HOCA 3OKUA 5FNGA 1IF4A 5EIJA 3M1WA 4QJXA 2WD2A 5AMGA 4COQA 2FMGA 4FIKA 2NNOA 2X7UA 2WD3A 1BV3A 4DZ9A 4LU3A 3M96A 4JSWA 1TE3X 4QEFA 3SAXA 5FLOA 4YGJA 1I9MA 3OKVA 3P44A 1CVEA 1Z97A 3N3JA 1CA2A 4Q6EA 2POUA 5EH7A 4G0CA 4BF6A 4QTLA 1OQ5A 1CAKA 3P3JA 3S75B 1ZE8A 1CAZA 4HF3A 3RYXB 1LG6A 1RZEA 4MDMA 1MUAA 4MO8A 1BNVA 1CA3A 4JS6A 5FNHA 3GZ0A 5J8ZA 4CNVA 3M5SA 2QP6A 3C7PA 3KLDB 2HL4A 4Q83A 5DSMA 3V5GA 3JXGA 5BRWA 4YWPA 3KOKA 1RJ6A 4YX4A 4YYTA 2NXSA 5L6KA 5EH5A 1CIMA 5DSLA 5DSIA 5SZ0A 1HVAA 3M14A 1YDCA 1FQMA 4MLXA 5FLRA 1CNYA 1H9NA 2NN1A 5SZ1A 4R59A 1CNJA 4YGKA 1ZGFA 3UYNA 5CA2A 1OKLA 4Q99A 2VVAX 3RLDA 1KEQA 4YXOA 2EZ7A 1RAZA 1DMYA 4Z1EA 3HKQA 3T82A 1UGBA 1CNBA 4X5SA 3JXHC 4ZAOA 1RZCA 5G0CA 2F14A 3DC3A 4HEYA 4Q8ZA 1XPZA 1CNKA 4YGLA 2CBAA 3MMFA 1FQNA 4E3GA 3N4BA 4KNMA 1BNTA 5FNMA 9CA2A 5DSKA 1DCBA 3T85A 3OYSA 2Q1QA 1JV0A 1ZFQA 1HUGA 3RGEA 4E3HA 1AVNA 2AX2A 4WL4A 3DA2A 1H9QA 4Q8YA 1KWQA 1IF8A 3RYVB 1IF6A 4CA2A 1UGFA 3HKTA 3P5LA 2WEJA 1ZSAA 4E3FA 7CA2A 5HPJA 4M2VA 3K2FA 3UYQA 5JG5B 1FR4A 5FDCA 1HEDA 4QJMA 4Q8XA 1BCDA 3OIMA 2Q38A 2OSMA 3KNEA 1Y7WA 4R5AA 3OIKA 4TWLA 2EU3A 3HKNA 4RH2A 2FOUA 1BNUA 2AW1A 1ZH9A 1H4NA 1CNWA 5FNIA 1HCBA 1I9PA 4Q08A 3SBIA 4ETQC 1I90A 1I9OA 4KP8A 5G01A 4YGFA 3D93A 4QSJA 3S72B 1TTMA 3PO6A 4RUYA 3CA2A 4K13A 5EH8A 1YO1A 3KOIA 4C3TA 5EHWA 1ZSBA 4Q81A 4QIYA 2CA2A 3V3FA 2NWZA 3P58A 1CVDA 4RUXA 3ML5A 1UGCA 5FL6A 5JGSB 3S76A 2HFWA 2NMXA 3IBIA 4WUQA 1G6VA 2CBBA 5SZ4A 4XIXA 1CAJA 4TWMA 4Q7WA 1CAMA 2FOVA 1XEVA 3TMJA 5E2RA 3IBNA 4RFCA 4FRCA 4FVNA 4HEWA 2FOSA 4ZX0A 1THKA 1YDAA 1FSRA 1UGAA 3F7BA 1KWRA 3T5UA 3S9TA 3V3JA 3D9ZA 1DMXA 3IBLA 12CAA 1CVCA 3TVNX 4DZ7A 1I8ZA 5DSNA 3W6IA 2WEOA 1CRAA 4FU5A 1XQ0A 4WR7A 5FL5A 1KOQA 3S8XA 5DSQA 1JD0A 4BF1A 1I9QA 2ILIA 2W2JA 3MNHA 4Q09A 1OKMA 3L14A 1CRMA 3M3XA 5FDIA 3SBHA 3S74B 1CCSA 4FVOA 4Q6DA 5G0BA 2EU2A 3MHMA 3DD8A 4Z1NA 3DCCA 1IF5A 3M67A 3DCWA 4XIWA 1KOPA 4ZX1A 3KS3A 4N16A 3V2JA 1EOUA 2ABEA 1ZFKA 2GEHA 3U7CA 2FOQA 1G45A 1FLJA 4RIVA 3RYYA 3QYKA 4QK1A 3NI5A 5G03A 4Q78A 3R16A 5JEPB 3RYZA 4ITPA 1TEQX 1RAYA 1CAIA 4YXIA 1OKNA 4MDLA 4CNWA 2HKKA 3M5EA 1CAOA 3D0NA 3W6HA 3CAJA 5L3OA 3HS4A 5SZ2A 3IGPA 1A42A 4KAPA 1CINA 3D92A 4QSAA 3MHCA 1UGDA 1HCAA 4KNJA 4QK2A 3N0NA 1HUHA 4WUPA 5JESB 3MHIA 1RZAA 1UGGA 1IF7A 5BRUA 3FFPX 3B4FA 2NXTA 4HT2A 4K0TA 4QJPA 1BNNA 5BRVA 4MTYA 1F2WA 1HECA 3HFPA 3M2NA 4HEZA 4M2WA 5E2KA 3R17B 3BETA 4PQ7A 3SAPA 3LXEA 5SZ3A 5CLUA 2WEHA 3KKXA 1BZMA 1CNHA 3EFIA 5FNKA 2NNSA 3F7UA 4YVYA 1JCZA 5FLSA 3OILA 1CVHA 3RZ8A 4HT0A 5E28A 4IWZA 4WW6A 3S77B 5DOGA 4E49A 5SZ6A 4MDGA 1AM6A 1YO2A 3OY0A 3V3HB 4PXXA 5EKHA 5EHVA 3CZVA 4QSIA 4M2UA 1TBTX 3MNUA 2NN7A 4G7AA 2QOAA 3P5AA 4Q87A 1G54A 3V2MA 5DSPA 3M1JA 3NB5A 3RZ5A 4Q90A 4R5BA 3NJ9A 4K0SA 4E5QA 5CJFA 3RZ7A 2NWPA 1TG9A 1FQRA 1ZSCA 3DV7A 3P3HA 5JDVB 3RG4A 1HEBA 1G3ZA 3DAZA 2IT4A 3T84A 1IF9A 1TB0X 5FNLA 4RIUA 3MNKA 3K34A 4GL1X 2GD8A 1CALA 4QJ0A 3ZP9A 3S73B 5EHEA 5BNLA 1CANA 3RYJB 5IPZA 2POVA 5DSRA 5FLPA 1CNIA 4QY3A 5A25A 2POWA 1BNWA 3VBDA 2FW4A 5DVXA 3KONA 3FW3A 3IBUA 2Q1BA 4WW8A 2VVBX 3D8WA 4BCWA 1YDDA 3MDZA 2NXRA 3HLJA 3ML2A 3M5TA 2CBCA 3DVCA 3TVOX 5DRSA 1HEAA 5FL4A 3MYQA 4IDRX 5FLQA 1BN1A 4Z1KA 1CNXA 3MNAA 1BN4A 2H4NA 4CNRA 1LZVA 4ZWZA 3OYQA 5E2NA 3M1QA 1BN3A 4Z1JA 4PZHA 3MNJA 3M98A 3PYKA 3RZ0B 4M2RA 1I9LA 1CZMA 2FOYA 2H15A 4YGNA 1I9NA 3PJJA 1V9IC 3U45X 1FSNA 1BNQA 1XEGA 2WEGA 3M04A 1CCTA 3BL1A 2HNCA 3DC9A 4LHIA 4JSAA 3IEOA 4JSZA 4MLTA 1Z93A 3RZ1B 4QJOA 3EFTA 8CA2A 4PYYA 3U47A 4ILXA 4L5VA 1LG5A 1LUGA 2FNKA 4QIZA 3S97A 1RJ5A 4E3DA 3IAIA 3DCSA 1RZDA 5E2MA 1CVFA 5LMDA 2NNVA 5DSJA 3M1KA 5JEHB 4RUZA 4Q49A 1MOOA 4Q7PA 4L5WA 1DCAA 3F8EA 5DOHA 5CACA 4FL7A 4CNXA 5AMDA 3DD0A 5SZ5A 5E5UA 4QSBA 1T9NA 2CABA 2HD6A 1CNGA 5EZTX 3N2PA 1G46A 2ZNCA 5FNJA 1CNCA 5SZ7A 3FE4A 3P4VA 4QK3A 1CVAA 1FSQA 2OSFA 4YXUA 1J9WA 4KUVA 3RG3A 2CBEA 4QJWA 3T5ZA 4RN4A 3T83A 1Z9YA 4N0XB 3Q31A 1V9EA 1TH9A 1CCUA 2X7SA 1ZGEA 3M40A 5E2SA 1LGDA 3M2YA 1G0FA 1YDBA 5EKJA 4Q7SA 3K7KA 4ZWYA 3MZCA 4HU1A 3V7XA 4XZ5A 5EKMA 3S78B 3BL0A 1AZMA 2QO8A 1G52A 4CACA 4E9OX 4Q06A 1CAYA 4K0ZA 4KUWA 4ZWXA 6CA2A 4RFDA 3B1BA 3V3IB 5JQTA 1I91A 4E4AA 4ITOA 3MHLA 1G1DA 1CILA 3ZNCA 1YO0A 1BNMA 3F4XA 4XFWA 4XE1A 4KUYA 1FQLA 3MWOA 2NWOA 5JEGB 2NWYA 3KIGA 1G4OA 1TEUX 4FPTA 4UOVA 3M2XA 5FLTA 4ZWIA 5JGTB 2X7TA 3CYUA 3DBUA 4LP6A 5C8IA 1BICA 1G48A 5DSOA 4Q07A 5E5RA 3KWAA 1FR7A 4YHAA 3JXFA 5A6HA 4HBAA 2FNMA 4KNIA 5JQ0A 4Z0QA 4JSSA 5BYIA 2O4ZA 4KV0A 4K1QA 3U3AX 3MHOA 3M2ZA 5AMLA 1URTA 4KP5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4Q7V A;  4CQ0 A;  1UGE A;  3S71 B;  3DVB A;  3P55 A;  3DVD A;  4Y0J A;  1G0E A;  1G53 A;  4Q0L A;  1TG3 A;  3MNI A;  2FMZ A;  1CAH A;  4Q9Y A;  5JG3 B;  1G4J A;  4PYX A;  2FNN A;  5EOI A;  1CVB A;  3HKU A;  3V3G B;  4L5U A;  1ZNC A;  2CBD A;  3RJ7 A;  1RZB A;  2NNG A;  4KNN A;  2HOC A;  3OKU A;  5FNG A;  1IF4 A;  5EIJ A;  3M1W A;  4QJX A;  2WD2 A;  5AMG A;  4COQ A;  2FMG A;  4FIK A;  2NNO A;  2X7U A;  2WD3 A;  1BV3 A;  4DZ9 A;  4LU3 A;  3M96 A;  4JSW A;  1TE3 X;  4QEF A;  3SAX A;  5FLO A;  4YGJ A;  1I9M A;  3OKV A;  3P44 A;  1CVE A;  1Z97 A;  3N3J A;  1CA2 A;  4Q6E A;  2POU A;  5EH7 A;  4G0C A;  4BF6 A;  4QTL A;  1OQ5 A;  1CAK A;  3P3J A;  3S75 B;  1ZE8 A;  1CAZ A;  4HF3 A;  3RYX B;  1LG6 A;  1RZE A;  4MDM A;  1MUA A;  4MO8 A;  1BNV A;  1CA3 A;  4JS6 A;  5FNH A;  3GZ0 A;  5J8Z A;  4CNV A;  3M5S A;  2QP6 A;  3C7P A;  3KLD B;  2HL4 A;  4Q83 A;  5DSM A;  3V5G A;  3JXG A;  5BRW A;  4YWP A;  3KOK A;  1RJ6 A;  4YX4 A;  4YYT A;  2NXS A;  5L6K A;  5EH5 A;  1CIM A;  5DSL A;  5DSI A;  5SZ0 A;  1HVA A;  3M14 A;  1YDC A;  1FQM A;  4MLX A;  5FLR A;  1CNY A;  1H9N A;  2NN1 A;  5SZ1 A;  4R59 A;  1CNJ A;  4YGK A;  1ZGF A;  3UYN A;  5CA2 A;  1OKL A;  4Q99 A;  2VVA X;  3RLD A;  1KEQ A;  4YXO A;  2EZ7 A;  1RAZ A;  1DMY A;  4Z1E A;  3HKQ A;  3T82 A;  1UGB A;  1CNB A;  4X5S A;  3JXH C;  4ZAO A;  1RZC A;  5G0C A;  2F14 A;  3DC3 A;  4HEY A;  4Q8Z A;  1XPZ A;  1CNK A;  4YGL A;  2CBA A;  3MMF A;  1FQN A;  4E3G A;  3N4B A;  4KNM A;  1BNT A;  5FNM A;  9CA2 A;  5DSK A;  1DCB A;  3T85 A;  3OYS A;  2Q1Q A;  1JV0 A;  1ZFQ A;  1HUG A;  3RGE A;  4E3H A;  1AVN A;  2AX2 A;  4WL4 A;  3DA2 A;  1H9Q A;  4Q8Y A;  1KWQ A;  1IF8 A;  3RYV B;  1IF6 A;  4CA2 A;  1UGF A;  3HKT A;  3P5L A;  2WEJ A;  1ZSA A;  4E3F A;  7CA2 A;  5HPJ A;  4M2V A;  3K2F A;  3UYQ A;  5JG5 B;  1FR4 A;  5FDC A;  1HED A;  4QJM A;  4Q8X A;  1BCD A;  3OIM A;  2Q38 A;  2OSM A;  3KNE A;  1Y7W A;  4R5A A;  3OIK A;  4TWL A;  2EU3 A;  3HKN A;  4RH2 A;  2FOU A;  1BNU A;  2AW1 A;  1ZH9 A;  1H4N A;  1CNW A;  5FNI A;  1HCB A;  1I9P A;  4Q08 A;  3SBI A;  4ETQ C;  1I90 A;  1I9O A;  4KP8 A;  5G01 A;  4YGF A;  3D93 A;  4QSJ A;  3S72 B;  1TTM A;  3PO6 A;  4RUY A;  3CA2 A;  4K13 A;  5EH8 A;  1YO1 A;  3KOI A;  4C3T A;  5EHW A;  1ZSB A;  4Q81 A;  4QIY A;  2CA2 A;  3V3F A;  2NWZ A;  3P58 A;  1CVD A;  4RUX A;  3ML5 A;  1UGC A;  5FL6 A;  5JGS B;  3S76 A;  2HFW A;  2NMX A;  3IBI A;  4WUQ A;  1G6V A;  2CBB A;  5SZ4 A;  4XIX A;  1CAJ A;  4TWM A;  4Q7W A;  1CAM A;  2FOV A;  1XEV A;  3TMJ A;  5E2R A;  3IBN A;  4RFC A;  4FRC A;  4FVN A;  4HEW A;  2FOS A;  4ZX0 A;  1THK A;  1YDA A;  1FSR A;  1UGA A;  3F7B A;  1KWR A;  3T5U A;  3S9T A;  3V3J A;  3D9Z A;  1DMX A;  3IBL A;  12CA A;  1CVC A;  3TVN X;  4DZ7 A;  1I8Z A;  5DSN A;  3W6I A;  2WEO A;  1CRA A;  4FU5 A;  1XQ0 A;  4WR7 A;  5FL5 A;  1KOQ A;  3S8X A;  5DSQ A;  1JD0 A;  4BF1 A;  1I9Q A;  2ILI A;  2W2J A;  3MNH A;  4Q09 A;  1OKM A;  3L14 A;  1CRM A;  3M3X A;  5FDI A;  3SBH A;  3S74 B;  1CCS A;  4FVO A;  4Q6D A;  5G0B A;  2EU2 A;  3MHM A;  3DD8 A;  4Z1N A;  3DCC A;  1IF5 A;  3M67 A;  3DCW A;  4XIW A;  1KOP A;  4ZX1 A;  3KS3 A;  4N16 A;  3V2J A;  1EOU A;  2ABE A;  1ZFK A;  2GEH A;  3U7C A;  2FOQ A;  1G45 A;  1FLJ A;  4RIV A;  3RYY A;  3QYK A;  4QK1 A;  3NI5 A;  5G03 A;  4Q78 A;  3R16 A;  5JEP B;  3RYZ A;  4ITP A;  1TEQ X;  1RAY A;  1CAI A;  4YXI A;  1OKN A;  4MDL A;  4CNW A;  2HKK A;  3M5E A;  1CAO A;  3D0N A;  3W6H A;  3CAJ A;  5L3O A;  3HS4 A;  5SZ2 A;  3IGP A;  1A42 A;  4KAP A;  1CIN A;  3D92 A;  4QSA A;  3MHC A;  1UGD A;  1HCA A;  4KNJ A;  4QK2 A;  3N0N A;  1HUH A;  4WUP A;  5JES B;  3MHI A;  1RZA A;  1UGG A;  1IF7 A;  5BRU A;  3FFP X;  3B4F A;  2NXT A;  4HT2 A;  4K0T A;  4QJP A;  1BNN A;  5BRV A;  4MTY A;  1F2W A;  1HEC A;  3HFP A;  3M2N A;  4HEZ A;  4M2W A;  5E2K A;  3R17 B;  3BET A;  4PQ7 A;  3SAP A;  3LXE A;  5SZ3 A;  5CLU A;  2WEH A;  3KKX A;  1BZM A;  1CNH A;  3EFI A;  5FNK A;  2NNS A;  3F7U A;  4YVY A;  1JCZ A;  5FLS A;  3OIL A;  1CVH A;  3RZ8 A;  4HT0 A;  5E28 A;  4IWZ A;  4WW6 A;  3S77 B;  5DOG A;  4E49 A;  5SZ6 A;  4MDG A;  1AM6 A;  1YO2 A;  3OY0 A;  3V3H B;  4PXX A;  5EKH A;  5EHV A;  3CZV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3N0NA

Total Genus

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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