3N0N | Genus

Total Genus 77

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	77
Knots found	KnotProt 2.0: K +3₁
sequence length	258
structure length	258
Chain Sequence	HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__285570099763486__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__285570099763486__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3n0n/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__285570099763486__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"285570099763486","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3n0n/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__285570099763486__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	Selective hydrophobic pocket binding observed within the carbonic anhydrase II active site accommodate different 4-substituted-ureido-benzenesulfonamides and correlate to inhibitor potency. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	77
structure length	258
sequence length	258
other databases	KnotProt 2.0: K +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2010-05-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	3n0nA00

8CA2A 4ZX0A 3M3XA 1CNKA 5DSMA 5EKJA 3L14A 5A6HA 3RLDA 4ZWXA 3U3AX 1EOUA 1UGGA 1CINA 4UOVA 1BN1A 4KNJA 1A42A 3S78B 1CALA 4Q7WA 1H9QA 4KAPA 3N4BA 3M1WA 3KNEA 5SZ2A 1I8ZA 4QJPA 5DSKA 1F2WA 5DOHA 3M2ZA 3K34A 4ILXA 1CNGA 5DSLA 1IF7A 3Q31A 4LHIA 4YGLA 5EHVA 4L5UA 2FOQA 2VVAX 4K13A 4CNWA 4HEWA 5FDIA 1ZH9A 1CAYA 1G0FA 3DV7A 3RZ1B 3M40A 4QSBA 2CBCA 1CCUA 3EFTA 3KOIA 3T5UA 3S75B 3T85A 3TVOX 4CQ0A 2AX2A 3RYJB 4ITOA 2FOYA 2AW1A 3S74B 1IF4A 1HEDA 3DBUA 1CNIA 4Q09A 2O4ZA 1G54A 5A25A 4Q8ZA 3N2PA 7CA2A 2WD2A 4RUZA 3S73B 2CBEA 3S77B 5EOIA 3M14A 3V5GA 3R17B 3JXGA 3M96A 2POUA 4IDRX 3IBNA 1OKMA 4Q8YA 4X5SA 4PXXA 6CA2A 2QOAA 3KOKA 4HF3A 4YGNA 3F8EA 3V2MA 1IF5A 1HEAA 1UGDA 4QK2A 3U47A 4XE1A 2NNGA 1CRAA 4M2UA 4XIXA 4WW8A 5EKMA 5JQTA 1CVHA 3M98A 1KWRA 2NXRA 5FNIA 5JDVB 3PO6A 4MDMA 2WEHA 4QJWA 4Q7SA 5FLSA 3K7KA 3HFPA 2FOUA 4YHAA 3DD8A 4Q6EA 4CA2A 3C7PA 1I9NA 1CNXA 2H4NA 3EFIA 5CA2A 5SZ6A 1KOPA 4WR7A 1G6VA 4WUPA 1CNJA 1BN4A 1CAIA 1YO0A 4Y0JA 4JSWA 3V3IB 4E3HA 1FR7A 3M2NA 4Q9YA 2FW4A 3P3HA 4HEZA 1CVDA 5E2NA 1KEQA 5EH8A 4YVYA 1ZE8A 3UYNA 1LG5A 3UYQA 5FNKA 1BICA 4Q78A 3B1BA 4QSAA 4R59A 3RZ8A 2CABA 2WEJA 1ZSCA 4DZ7A 4JSAA 1HCAA 2NWOA 1HCBA 2OSMA 4HT0A 3DCSA 3S8XA 4Q81A 1KWQA 1CAHA 4N16A 5AMGA 4N0XB 1RZDA 5E2MA 1CNWA 1RZAA 4MTYA 5BRWA 1I91A 3RG4A 4E4AA 3TVNX 1TH9A 2FMGA 3BL0A 5E5RA 1H9NA 4RFCA 3DCCA 5G0CA 1I9OA 3RGEA 4QJMA 4FVNA 3DCWA 4FRCA 4MLXA 1V9IC 4R5AA 4RN4A 1CNHA 3RYVB 5SZ0A 3R16A 3S72B 1LG6A 5FDCA 4C3TA 3IEOA 4FIKA 4LP6A 5EKHA 1AVNA 2CA2A 1TB0X 2NNVA 1G3ZA 3DA2A 3MHIA 2FMZA 4KNMA 4KNIA 4RIUA 2POVA 4R5BA 1LUGA 1CVFA 1ZGEA 4GL1X 5JEPB 3JXHC 2POWA 1CAZA 4HEYA 2CBAA 4QIYA 1CNCA 1G45A 4MO8A 2FOVA 5CLUA 3M2XA 1XEGA 3MDZA 3V2JA 4RUXA 1ZNCA 2ZNCA 3MNJA 4TWMA 1FSNA 1AM6A 1DCAA 1RJ6A 1J9WA 4KNNA 4Q99A 1MOOA 3IAIA 3OKUA 4YGKA 5DOGA 3SBHA 2NNOA 5DRSA 2NN1A 1BNVA 2GEHA 3RZ0B 4PYXA 1RJ5A 5L6KA 3M04A 4FL7A 4QJ0A 4Z1KA 1I9PA 3DC9A 4RH2A 4Q90A 1G1DA 4KUYA 3P5LA 4ZAOA 1BNQA 2Q38A 3LXEA 1I90A 4JSSA 3QYKA 4MLTA 2HOCA 4Q7VA 1XEVA 1G4JA 3M5TA 5EHWA 4COQA 1FLJA 4QTLA 1YO1A 4MDLA 3RJ7A 4QSIA 1TG9A 1UGBA 1RZCA 3MZCA 4Q7PA 4QJXA 1IF8A 3N0NA 5FLRA 5SZ5A 4QIZA 3FE4A 4ZWIA 3MHOA 3N3JA 1ZSAA 3NJ9A 4K0TA 2NNSA 1RAZA 1BNNA 5FL4A 3MNAA 1CILA 1CIMA 1FQRA 3HKUA 3T84A 1YDAA 1G53A 2X7SA 3OYSA 2IT4A 4RFDA 4WL4A 4Q49A 1IF6A 1ZFKA 1CZMA 2HL4A 3SBIA 3DVBA 1Z93A 3RYXB 1CCSA 3MMFA 1HVAA 4TWLA 5DVXA 5LMDA 1T9NA 3T83A 1YDBA 2WD3A 3SAPA 5JG3B 3U45X 3D92A 4YGFA 3MWOA 1JD0A 3KWAA 3VBDA 1RZBA 3V3GB 3HLJA 3ML5A 4CNRA 4M2RA 1V9EA 4QY3A 3W6IA 1FQLA 3M5EA 1CVEA 5FNLA 1FQNA 2NN7A 4QJOA 3RZ5A 3F4XA 4QSJA 5HPJA 4M2WA 4JS6A 2ILIA 3OKVA 4PQ7A 5JEHB 2W2JA 1Z97A 2NXTA 4L5WA 4L5VA 5BRVA 3TMJA 1YO2A 1CNYA 3V7XA 1G46A 5DSRA 3HKTA 3B4FA 3IBLA 3P58A 1HUGA 4RIVA 12CAA 3MNUA 5FLTA 4ETQC 5FNMA 2X7TA 5SZ4A 3D0NA 5JESB 2EU2A 3D9ZA 4KUWA 3OY0A 3JXFA 3NI5A 3FW3A 4K0SA 4HBAA 1BNMA 3K2FA 4K1QA 1CVBA 5FNHA 1Y7WA 1LGDA 1G48A 4FU5A 1CNBA 1DMYA 3MNIA 3MHCA 2CBBA 3P4VA 5FLQA 1CAKA 3S71B 3M1JA 3NB5A 4FVOA 5DSJA 4BCWA 4QK1A 3CYUA 1FR4A 1URTA 5E2RA 1H4NA 2FNKA 4Q87A 5AMDA 5G01A 1CVCA 4WW6A 1UGCA 3V3FA 3M2YA 4E9OX 3DAZA 2F14A 1CANA 3GZ0A 3IBUA 1TEUX 1FSQA 1FQMA 2EU3A 3DVDA 4QK3A 1FSRA 3MHMA 5JGTB 4ZWYA 1CAMA 3SAXA 3PJJA 5FNJA 3HS4A 4ZWZA 3P3JA 1CCTA 2QO8A 2HNCA 4HT2A 3KS3A 1Z9YA 4KV0A 3OILA 5DSPA 3V3HB 4XIWA 4ZX1A 3T5ZA 9CA2A 1ZGFA 3P44A 5JEGB 1CA3A 2HKKA 5BNLA 5DSQA 3DVCA 4FPTA 3W6HA 3RG3A 4Z1NA 4E3GA 1I9MA 1I9LA 1BNUA 2WEGA 5EIJA 2GD8A 1CVAA 3F7BA 3T82A 4IWZA 4CNXA 3OYQA 1YDDA 1KOQA 5EH5A 2FNNA 3CAJA 3MNHA 4YGJA 1BV3A 5G0BA 4E3FA 5IPZA 2NWYA 2EZ7A 1G52A 3OIMA 4G7AA 2Q1QA 5CJFA 1AZMA 1TBTX 1I9QA 4Z0QA 3KLDB 4Z1JA 5J8ZA 4DZ9A 5JQ0A 3D93A 3KIGA 5C8IA 4PYYA 5FLPA 3IGPA 3P5AA 5DSIA 4YXUA 1G0EA 3KKXA 5EHEA 5FL6A 2QP6A 1CAOA 4E5QA 5JGSB 5E5UA 2FOSA 3D8WA 5FLOA 3S76A 2NXSA 4QEFA 5E2SA 1TE3X 4KP5A 3RZ7A 5EZTX 3M67A 4BF6A 4YWPA 2OSFA 4K0ZA 3OIKA 4Q6DA 1TTMA 5AMLA 3S97A 5BYIA 1BNTA 4BF1A 1YDCA 4KUVA 1UGAA 4CACA 1THKA 3DD0A 1BNWA 4YYTA 1HUHA 3ML2A 4XZ5A 2CBDA 3HKQA 4ITPA 5G03A 4LU3A 2VVBX 3PYKA 4WUQA 2ABEA 4E3DA 3S9TA 3DC3A 2NWZA 4E49A 3HKNA 2FNMA 4G0CA 3RYYA 1BCDA 2HFWA 2HD6A 4XFWA 4YXOA 1HEBA 1HECA 3BETA 3F7UA 3M1KA 1UGFA 5E2KA 2Q1BA 4Z1EA 5E28A 1JCZA 5JG5B 3MYQA 4Q08A 4YX4A 5CACA 1DMXA 3CA2A 3P55A 3RYZA 1OKNA 1TEQX 4M2VA 5SZ1A 5SZ7A 1LZVA 3KONA 4Q07A 3M1QA 4PZHA 3ZP9A 1XPZA 3M5SA 1CAJA 2NWPA 1UGEA 1ZFQA 4Q83A 5DSNA 5DSOA 3IBIA 1OQ5A 1IF9A 1TG3A 1XQ0A 3BL1A 5FL5A 3CZVA 5FNGA 1G4OA 3FFPX 4MDGA 1OKLA 1BZMA 4KP8A 5L3OA 5BRUA 2WEOA 3V3JA 1CRMA 3MNKA 5SZ3A 4YXIA 4RUYA 3ZNCA 1BN3A 1CA2A 2NMXA 2X7UA 4Q8XA 4Q0LA 2H15A 4HU1A 4JSZA 1RZEA 4Q06A 1JV0A 5EH7A 1MUAA 1ZSBA 1DCBA 1RAYA 3U7CA 4CNVA 3MHLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 8CA2 A;  4ZX0 A;  3M3X A;  1CNK A;  5DSM A;  5EKJ A;  3L14 A;  5A6H A;  3RLD A;  4ZWX A;  3U3A X;  1EOU A;  1UGG A;  1CIN A;  4UOV A;  1BN1 A;  4KNJ A;  1A42 A;  3S78 B;  1CAL A;  4Q7W A;  1H9Q A;  4KAP A;  3N4B A;  3M1W A;  3KNE A;  5SZ2 A;  1I8Z A;  4QJP A;  5DSK A;  1F2W A;  5DOH A;  3M2Z A;  3K34 A;  4ILX A;  1CNG A;  5DSL A;  1IF7 A;  3Q31 A;  4LHI A;  4YGL A;  5EHV A;  4L5U A;  2FOQ A;  2VVA X;  4K13 A;  4CNW A;  4HEW A;  5FDI A;  1ZH9 A;  1CAY A;  1G0F A;  3DV7 A;  3RZ1 B;  3M40 A;  4QSB A;  2CBC A;  1CCU A;  3EFT A;  3KOI A;  3T5U A;  3S75 B;  3T85 A;  3TVO X;  4CQ0 A;  2AX2 A;  3RYJ B;  4ITO A;  2FOY A;  2AW1 A;  3S74 B;  1IF4 A;  1HED A;  3DBU A;  1CNI A;  4Q09 A;  2O4Z A;  1G54 A;  5A25 A;  4Q8Z A;  3N2P A;  7CA2 A;  2WD2 A;  4RUZ A;  3S73 B;  2CBE A;  3S77 B;  5EOI A;  3M14 A;  3V5G A;  3R17 B;  3JXG A;  3M96 A;  2POU A;  4IDR X;  3IBN A;  1OKM A;  4Q8Y A;  4X5S A;  4PXX A;  6CA2 A;  2QOA A;  3KOK A;  4HF3 A;  4YGN A;  3F8E A;  3V2M A;  1IF5 A;  1HEA A;  1UGD A;  4QK2 A;  3U47 A;  4XE1 A;  2NNG A;  1CRA A;  4M2U A;  4XIX A;  4WW8 A;  5EKM A;  5JQT A;  1CVH A;  3M98 A;  1KWR A;  2NXR A;  5FNI A;  5JDV B;  3PO6 A;  4MDM A;  2WEH A;  4QJW A;  4Q7S A;  5FLS A;  3K7K A;  3HFP A;  2FOU A;  4YHA A;  3DD8 A;  4Q6E A;  4CA2 A;  3C7P A;  1I9N A;  1CNX A;  2H4N A;  3EFI A;  5CA2 A;  5SZ6 A;  1KOP A;  4WR7 A;  1G6V A;  4WUP A;  1CNJ A;  1BN4 A;  1CAI A;  1YO0 A;  4Y0J A;  4JSW A;  3V3I B;  4E3H A;  1FR7 A;  3M2N A;  4Q9Y A;  2FW4 A;  3P3H A;  4HEZ A;  1CVD A;  5E2N A;  1KEQ A;  5EH8 A;  4YVY A;  1ZE8 A;  3UYN A;  1LG5 A;  3UYQ A;  5FNK A;  1BIC A;  4Q78 A;  3B1B A;  4QSA A;  4R59 A;  3RZ8 A;  2CAB A;  2WEJ A;  1ZSC A;  4DZ7 A;  4JSA A;  1HCA A;  2NWO A;  1HCB A;  2OSM A;  4HT0 A;  3DCS A;  3S8X A;  4Q81 A;  1KWQ A;  1CAH A;  4N16 A;  5AMG A;  4N0X B;  1RZD A;  5E2M A;  1CNW A;  1RZA A;  4MTY A;  5BRW A;  1I91 A;  3RG4 A;  4E4A A;  3TVN X;  1TH9 A;  2FMG A;  3BL0 A;  5E5R A;  1H9N A;  4RFC A;  3DCC A;  5G0C A;  1I9O A;  3RGE A;  4QJM A;  4FVN A;  3DCW A;  4FRC A;  4MLX A;  1V9I C; 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 1IF8 A;  3N0N A;  5FLR A;  5SZ5 A;  4QIZ A;  3FE4 A;  4ZWI A;  3MHO A;  3N3J A;  1ZSA A;  3NJ9 A;  4K0T A;  2NNS A;  1RAZ A;  1BNN A;  5FL4 A;  3MNA A;  1CIL A;  1CIM A;  1FQR A;  3HKU A;  3T84 A;  1YDA A;  1G53 A;  2X7S A;  3OYS A;  2IT4 A;  4RFD A;  4WL4 A;  4Q49 A;  1IF6 A;  1ZFK A;  1CZM A;  2HL4 A;  3SBI A;  3DVB A;  1Z93 A;  3RYX B;  1CCS A;  3MMF A;  1HVA A;  4TWL A;  5DVX A;  5LMD A;  1T9N A;  3T83 A;  1YDB A;  2WD3 A;  3SAP A;  5JG3 B;  3U45 X;  3D92 A;  4YGF A;  3MWO A;  1JD0 A;  3KWA A;  3VBD A;  1RZB A;  3V3G B;  3HLJ A;  3ML5 A;  4CNR A;  4M2R A;  1V9E A;  4QY3 A;  3W6I A;  1FQL A;  3M5E A;  1CVE A;  5FNL A;  1FQN A;  2NN7 A;  4QJO A;  3RZ5 A;  3F4X A;  4QSJ A;  5HPJ A;  4M2W A;  4JS6 A;  2ILI A;  3OKV A;  4PQ7 A;  5JEH B;  2W2J A;  1Z97 A;  2NXT A;  4L5W A;  4L5V A;  5BRV A;  3TMJ A;  1YO2 A;  1CNY A;  3V7X A;  1G46 A;  5DSR A;  3HKT A;  3B4F A;  3IBL A;  3P58 A;  1HUG A;  4RIV A;  12CA A;  3MNU A;  5FLT A;  4ETQ C;  5FNM A;  2X7T A;  5SZ4 A;  3D0N A;  5JES B;  2EU2 A;  3D9Z A; 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3N0NA

Total Genus

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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