3N3JA

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii in complex with a benzenesulfonamide inhibitor
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Selective hydrophobic pocket binding observed within the carbonic anhydrase II active site accommodate different 4-substituted-ureido-benzenesulfonamides and correlate to inhibitor potency.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 72
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3n3jA00
3QYKA 1A42A 1TG9A 2CBBA 3DV7A 5FNMA 4KNNA 3BL1A 4QJMA 5JGSB 2NWOA 5FLOA 3JXHC 4TWMA 4WW6A 1CAOA 1CCSA 4MDMA 5DSLA 5EKMA 3TVNX 4M2RA 1JV0A 4ITPA 4HEZA 3M1KA 1HCBA 2FW4A 3M3XA 5AMDA 4COQA 1Z93A 5C8IA 3F7UA 3M40A 4MDLA 2AW1A 3OYQA 4MLXA 3U7CA 1J9WA 3OIMA 3IGPA 3W6IA 1HEAA 2NNSA 3P58A 3DVDA 4HEWA 5EOIA 3RG4A 3RZ1B 1RZAA 4KUWA 5E2NA 4KNMA 4Y0JA 3CYUA 3F8EA 2QP6A 3PJJA 3M14A 4ILXA 5BRWA 4KNIA 3P55A 4Q7PA 1LUGA 2NWPA 3MHLA 1CNJA 4Q7SA 1RAZA 1MOOA 1BNVA 2HD6A 1BN1A 4YGJA 5EKHA 3T84A 3P3HA 5BYIA 1RJ5A 5G0BA 3V2MA 3OYSA 5FL5A 2FOQA 3D93A 3HFPA 4HF3A 4R5BA 3MHIA 4FVOA 3FW3A 3NI5A 1ZSBA 4ZWXA 4Q06A 4M2VA 4MDGA 4YVYA 5G01A 4Z1JA 1OKNA 4LP6A 1OKMA 3M2XA 2NXRA 4YGFA 4HU1A 3MNAA 3M04A 3BL0A 5L6KA 4MLTA 4UOVA 3VBDA 5JQTA 1XQ0A 3M1WA 1LZVA 4WW8A 2CBDA 4KUVA 1FQNA 2CABA 1G54A 4JSZA 4FU5A 4HT0A 5SZ1A 2CBAA 4K1QA 1I9OA 3M2ZA 4RIUA 3V3GB 4CNWA 1G0EA 2EU2A 3CA2A 5DSKA 3PYKA 3OIKA 4WL4A 1TEUX 5JEPB 3RYJB 4Q87A 3D9ZA 2CA2A 5FL6A 1UGBA 5EZTX 5IPZA 1F2WA 5AMLA 4RUZA 5EH5A 5CLUA 5FLPA 1G53A 5DOHA 1TBTX 4FPTA 1CVHA 1THKA 3HKTA 5FDIA 4RFCA 4BCWA 2HOCA 3MHOA 3RLDA 4ITOA 4ZX1A 2ABEA 3C7PA 1YDBA 1CVEA 4QJXA 4M2WA 4Q09A 4Q8ZA 1CA3A 5E2MA 3T85A 3B4FA 5E5UA 3OY0A 3T83A 1EOUA 1I90A 3EFIA 5SZ3A 1G4OA 1URTA 1FSQA 4CQ0A 3MHMA 4FIKA 3K7KA 3KS3A 3KWAA 5JG3B 3M98A 1ZNCA 3NB5A 1CRAA 5FNGA 5J8ZA 1YDDA 4Q49A 1RJ6A 1I91A 4QJWA 3OKVA 1IF9A 1UGGA 1CIMA 4Q07A 4YX4A 1BZMA 3FFPX 1Z97A 5FLSA 3KIGA 4Q6DA 5DSPA 1AM6A 3DC9A 3OILA 5E2RA 8CA2A 5DSMA 4LHIA 2ILIA 1AZMA 1UGAA 3DVCA 3M5TA 1BCDA 2HNCA 4PYYA 2FNKA 4Q99A 5BRVA 4E3HA 5JEHB 3MNIA 2X7UA 3V3IB 4Z1NA 1CILA 1OQ5A 1BN3A 1FR7A 1XPZA 1YO1A 2POWA 3DA2A 2HFWA 3SAXA 3S72B 4L5UA 4XZ5A 4Q90A 5DSRA 2X7TA 3DVBA 4R5AA 4G7AA 1CALA 4PQ7A 3EFTA 3D92A 3S73B 1KOQA 4Q7WA 3P44A 1CCTA 4JSSA 1BNMA 3P4VA 4CACA 4N16A 2O4ZA 3V3HB 5EKJA 4QSAA 3IBUA 7CA2A 1CRMA 1BNTA 1BNQA 1G1DA 3SBHA 1OKLA 4KP5A 3FE4A 3UYQA 1IF5A 4KAPA 3N4BA 1UGCA 2H15A 1FQMA 1HUHA 2NNGA 3PO6A 1Z9YA 4QK2A 1ZFKA 2Q1QA 5FL4A 3DC3A 4YGNA 3V3FA 3HLJA 1G48A 3HS4A 3DCSA 5EH8A 5A6HA 4K0ZA 3U3AX 1I9NA 1RZEA 5DOGA 5DSIA 4K0TA 5FNKA 1CZMA 1CAYA 3U47A 3V3JA 5SZ4A 5EH7A 1LG5A 1JD0A 3KONA 3ML2A 2VVBX 4RFDA 5JGTB 1CNHA 1DMYA 2EU3A 2W2JA 3HKQA 1H9NA 1RZDA 2FOYA 5L3OA 1G3ZA 5AMGA 2FOVA 1DMXA 3HKNA 1BN4A 3D8WA 5FNLA 3RGEA 2OSFA 4E3FA 1CNKA 5CACA 5EHVA 4L5WA 3MZCA 4Q81A 4Q78A 3T5UA 2Q38A 1TG3A 3F4XA 3R16A 4K0SA 1CNYA 1IF8A 3ZP9A 1HCAA 5E5RA 3S75B 1FQLA 3D0NA 4XIXA 1CVBA 4IDRX 4Q7VA 3Q31A 3S77B 4KV0A 4Q83A 4XE1A 1HVAA 1RZBA 5SZ2A 3K34A 5LMDA 1FSRA 4JSAA 3B1BA 5DSJA 1CAZA 5SZ5A 1TH9A 1IF4A 2H4NA 1ZE8A 1IF6A 5HPJA 2X7SA 4MTYA 2WEHA 3S74B 4HBAA 5E2SA 2CBEA 2POVA 4YXOA 4BF6A 1CVFA 2WEJA 1HUGA 2CBCA 1CCUA 3P5AA 3RZ8A 3UYNA 4RUYA 4WUQA 1G46A 1CVAA 1I9MA 2FOSA 4N0XB 5DSQA 4QJPA 2WD3A 2HKKA 4RN4A 1ZFQA 5SZ7A 1DCBA 1HEBA 1IF7A 2OSMA 3S97A 2NXSA 4FL7A 1CAKA 1YDAA 4QIZA 4HEYA 2NN7A 5EHWA 3K2FA 3MNJA 3RG3A 3V5GA 1BNUA 1BV3A 1YO0A 4KNJA 5E2KA 1ZH9A 1KOPA 1ZGFA 1BNWA 3R17B 4M2UA 5A25A 1RAYA 5FLRA 3DCCA 3S78B 1CAMA 1ZSCA 4GL1X 3F7BA 4QEFA 2QO8A 3P3JA 3TMJA 4L5VA 5FNIA 1UGDA 3SAPA 3JXFA 3M5EA 1MUAA 3U45X 4TWLA 3JXGA 3MMFA 2WEOA 1CNWA 4JSWA 1DCAA 4HT2A 4DZ7A 3TVOX 1UGEA 1YDCA 4YWPA 4MO8A 4FVNA 3CZVA 3MYQA 1V9IC 2NN1A 4WR7A 4QSIA 5EHEA 4C3TA 3CAJA 4RH2A 3IAIA 3MNKA 1I9LA 5FNJA 4Q8YA 1CA2A 5E28A 4BF1A 2NXTA 4ZWZA 1CNIA 4QK3A 1UGFA 4YHAA 5DRSA 2Q1BA 3KNEA 6CA2A 4RUXA 2QOAA 1TTMA 3RYZA 3W6HA 1I9QA 4IWZA 4KUYA 1TEQX 3DBUA 4JS6A 3DCWA 1CAIA 5FLTA 4ZWIA 1G52A 1G45A 4CNRA 5JQ0A 1CAJA 4QIYA 3RYYA 4PXXA 3IEOA 9CA2A 3DD8A 1CAHA 2ZNCA 1CNGA 3GZ0A 5EIJA 3OKUA 1H9QA 1CNXA 1CVDA 1FLJA 4QJOA 4QJ0A 4YGKA 3T5ZA 2EZ7A 3RZ0B 1V9EA 5FNHA 4ZWYA 3KKXA 5JESB 1FSNA 4RIVA 4Q8XA 3M96A 2HL4A 3RZ5A 3MWOA 4ZX0A 5G03A 2FOUA 1T9NA 3M1JA 1JCZA 4QSBA 1G6VA 4YGLA 3MHCA 1RZCA 5DSNA 1YO2A 5DVXA 1CNBA 2FMZA 3L14A 4G0CA 2FNMA 12CAA 4E3GA 1HECA 3S76A 4WUPA 4E9OX 4QSJA 1G4JA 3MNUA 1KEQA 3ML5A 5FDCA 3V7XA 5JDVB 1CNCA 3IBNA 5G0CA 4QK1A 2WD2A 1XEVA 3S71B 4Z0QA 2NNVA 3HKUA 1BICA 3N2PA 1G0FA 4KP8A 3M2NA 4XFWA 2NMXA 3MNHA 3M2YA 3BETA 3IBIA 4YYTA 4FRCA 2GEHA 5FLQA 3M1QA 4DZ9A 3DD0A 1TE3X 4CA2A 1KWRA 1AVNA 4E5QA 5BNLA 2GD8A 4CNVA 3RJ7A 5JG5B 5SZ6A 4LU3A 3SBIA 3KLDB 4Q6EA 1Y7WA 3P5LA 4XIWA 2NWZA 3RYXB 2POUA 1H4NA 4E3DA 3RYVB 5JEGB 1FQRA 3ZNCA 3M5SA 4CNXA 1I9PA 2NNOA 1ZGEA 4Q08A 5BRUA 4R59A 5DSOA 4ZAOA 3S8XA 3KOKA 3V2JA 4X5SA 2NWYA 3NJ9A 1I8ZA 3T82A 1CANA 3DAZA 1HEDA 1ZSAA 3IBLA 3S9TA 4YXIA 1XEGA 1CINA 1CVCA 4Z1EA 1LG6A 1TB0X 2FNNA 2IT4A 4K13A 4PZHA 4Q0LA 2AX2A 5SZ0A 5CJFA 1BNNA 1KWQA 2VVAX 3MDZA 4Q9YA 3KOIA 3N3JA 4Z1KA 2F14A 4E4AA 4YXUA 5CA2A 1LGDA 3RZ7A 4E49A 4PYXA 4QY3A 2WEGA 4ETQC 3M67A 3N0NA 3LXEA 2FMGA 4QTLA 1FR4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3QYK A;  1A42 A;  1TG9 A;  2CBB A;  3DV7 A;  5FNM A;  4KNN A;  3BL1 A;  4QJM A;  5JGS B;  2NWO A;  5FLO A;  3JXH C;  4TWM A;  4WW6 A;  1CAO A;  1CCS A;  4MDM A;  5DSL A;  5EKM A;  3TVN X;  4M2R A;  1JV0 A;  4ITP A;  4HEZ A;  3M1K A;  1HCB A;  2FW4 A;  3M3X A;  5AMD A;  4COQ A;  1Z93 A;  5C8I A;  3F7U A;  3M40 A;  4MDL A;  2AW1 A;  3OYQ A;  4MLX A;  3U7C A;  1J9W A;  3OIM A;  3IGP A;  3W6I A;  1HEA A;  2NNS A;  3P58 A;  3DVD A;  4HEW A;  5EOI A;  3RG4 A;  3RZ1 B;  1RZA A;  4KUW A;  5E2N A;  4KNM A;  4Y0J A;  3CYU A;  3F8E A;  2QP6 A;  3PJJ A;  3M14 A;  4ILX A;  5BRW A;  4KNI A;  3P55 A;  4Q7P A;  1LUG A;  2NWP A;  3MHL A;  1CNJ A;  4Q7S A;  1RAZ A;  1MOO A;  1BNV A;  2HD6 A;  1BN1 A;  4YGJ A;  5EKH A;  3T84 A;  3P3H A;  5BYI A;  1RJ5 A;  5G0B A;  3V2M A;  3OYS A;  5FL5 A;  2FOQ A;  3D93 A;  3HFP A;  4HF3 A;  4R5B A;  3MHI A;  4FVO A;  3FW3 A;  3NI5 A;  1ZSB A;  4ZWX A;  4Q06 A;  4M2V A;  4MDG A;  4YVY A;  5G01 A;  4Z1J A;  1OKN A;  4LP6 A;  1OKM A;  3M2X A;  2NXR A;  4YGF A;  4HU1 A;  3MNA A; 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