3OIL | Genus

Total Genus 77

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	77
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__665793121978554__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__665793121978554__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3oil/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__665793121978554__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"665793121978554","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3oil/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__665793121978554__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	Characterization of Carbonic Anhydrase Isozyme Specific Inhibition by Sulfamated 2-Ethylestra Compounds rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	77
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2010-08-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	3oilA00

4XZ5A 1G46A 5SZ6A 3F4XA 2AW1A 1I90A 2HKKA 2Q38A 2HL4A 4HU1A 3N4BA 4RIUA 2GEHA 3OIMA 4Q99A 4QK2A 5HPJA 4E49A 2CBDA 4MDGA 1ZNCA 4XIWA 4PXXA 3MHIA 5DVXA 2X7UA 5L3OA 5FNMA 4BF1A 3ZNCA 1JCZA 1Z93A 3KONA 3P5AA 5DRSA 4KAPA 5L6KA 4ZWIA 5G03A 1CAYA 4E9OX 3KS3A 4Z1JA 5DOGA 1YDDA 4YX4A 1BNTA 2FW4A 3P3JA 1THKA 3HS4A 3P4VA 3GZ0A 1H9NA 3RG3A 1DCAA 5DSNA 3S9TA 1BICA 1HVAA 4CACA 3V3FA 4KNJA 1I91A 4YGLA 4YXUA 3M5SA 1HEBA 1UGEA 2ILIA 3ZP9A 4FU5A 4M2VA 3DVBA 5E2KA 3RGEA 1FQLA 2FMGA 4R5AA 3W6HA 5JDVB 2FOSA 5DSJA 1KEQA 4M2RA 3B4FA 4Z1EA 3RLDA 4JSZA 1CAJA 3HKQA 3OY0A 1G53A 3KWAA 2HOCA 1Z9YA 4CNWA 5SZ4A 1FQRA 3KIGA 1A42A 1CAKA 4WUQA 3N3JA 1HCBA 3S75B 3C7PA 4QJPA 5BRVA 1TEQX 3U3AX 2POWA 1EOUA 5E2NA 7CA2A 3M96A 5DSOA 3OILA 3MNHA 3T85A 4Z0QA 1G0FA 4K0SA 4FRCA 1F2WA 2ZNCA 1I9PA 5JESB 3DC3A 1CA3A 2FOYA 3FW3A 3OYSA 4RH2A 4Q0LA 1CILA 2NXSA 2CBBA 3OKVA 3DAZA 4JSWA 3M1QA 3CAJA 3M1WA 4IWZA 3KKXA 4ZWXA 5EH7A 5EHVA 4QJ0A 5FLRA 4JS6A 3DA2A 2AX2A 4KNMA 1IF7A 1CRMA 4Q7VA 2HNCA 1BZMA 5DSMA 1CAIA 4Q7SA 5AMLA 3RZ0B 2EU3A 4BCWA 4MLXA 1G54A 1HECA 3M14A 1CNJA 2FOUA 1AVNA 3CZVA 3DVCA 3KOKA 4N16A 3M5TA 4BF6A 4UOVA 1KOQA 3S72B 1CNBA 5CLUA 4Q7WA 1CZMA 4Z1NA 2HD6A 5DOHA 1CANA 4YGFA 5FLOA 3KOIA 4JSSA 1OKMA 3M2NA 1ZFQA 1YDBA 2NWYA 4KUVA 2Q1QA 3DBUA 3S74B 3L14A 1FR7A 4L5VA 4RUXA 1YO2A 4FIKA 1G4OA 4RUYA 1OKLA 4YWPA 3K2FA 2NXTA 4KNIA 2VVBX 4QSBA 4Q9YA 1T9NA 4CNVA 1XQ0A 2WEHA 1AM6A 1TE3X 3T5UA 5CACA 1UGDA 2OSMA 1I9MA 1UGCA 4FL7A 1OQ5A 4K0ZA 2NN1A 1KWQA 1ZSAA 4MLTA 3V3GB 3OYQA 3PYKA 3M04A 4KP5A 1OKNA 2F14A 3N2PA 4HEZA 1CVCA 4RN4A 4Y0JA 3TVNX 3SBHA 3S8XA 3MHOA 5FNIA 3R16A 2X7SA 1LZVA 5SZ2A 5EKHA 1CAOA 2NNSA 4PQ7A 3IAIA 4WL4A 5FL6A 3R17B 4ZWYA 5FLPA 1KWRA 1H9QA 3S76A 3M2ZA 3U45X 3P55A 5E2MA 5FL5A 1CVFA 1BNNA 1JV0A 12CAA 3S71B 5EZTX 1BCDA 1UGFA 1CNYA 3D92A 1CCSA 1G0EA 1HEDA 1I9OA 4LHIA 5SZ0A 4Q8ZA 3V2MA 2NWZA 3MNKA 4YVYA 5BRWA 3HLJA 3DD0A 1DMYA 2WD3A 3IBIA 4COQA 1G4JA 4Q87A 1H4NA 1RJ6A 2NWPA 2WEOA 4Q83A 1FQNA 1UGGA 5DSRA 5EKMA 4ZX0A 5SZ7A 4N0XB 4HEWA 4PYXA 3F7UA 3MMFA 4ZAOA 1CAMA 3B1BA 3F8EA 3MNJA 1ZH9A 4K1QA 3HKNA 4GL1X 4Q08A 1LG5A 1ZGFA 4QEFA 1CCTA 2CBAA 4QJMA 5SZ1A 3DD8A 1RZEA 3D8WA 2POVA 4YGNA 3P58A 1CVHA 5FLSA 1IF5A 3IBLA 4RIVA 5FL4A 5EH5A 1CVAA 1CNHA 2FOVA 3HKUA 3CA2A 3UYQA 1IF6A 4YGJA 4Z1KA 1YO0A 5EH8A 2QO8A 2WD2A 1BN1A 3TVOX 3MDZA 5FNJA 4YXOA 3V3HB 1ZSBA 2H4NA 3V3IB 1LGDA 3T5ZA 1RJ5A 2CBEA 1AZMA 4L5WA 1HUGA 5DSPA 3RYVB 4MTYA 3D93A 5JEGB 3DV7A 3V2JA 3FE4A 4E3HA 2NNGA 3T82A 4Q6EA 1XEVA 4RFDA 1DMXA 3PO6A 4LU3A 5EKJA 4KP8A 4KUYA 5EOIA 5BNLA 1CNWA 3BL1A 4MDMA 3EFTA 3SAPA 1IF9A 8CA2A 1HEAA 5DSQA 4CQ0A 2FNMA 4E3DA 4KUWA 4ITOA 4X5SA 4JSAA 4WR7A 5FNLA 3MYQA 5EIJA 4TWLA 1BN3A 3M1KA 2EZ7A 1BN4A 2WEJA 4ETQC 5DSIA 3KLDB 5SZ5A 2NMXA 1CINA 5FNGA 3JXHC 3IGPA 3M2YA 4ZWZA 2CABA 4WW6A 1I9NA 5IPZA 2CA2A 1BNVA 3IBNA 1ZE8A 1CIMA 1IF8A 4Q8XA 2FMZA 4M2UA 5FLQA 1CVEA 3N0NA 4KV0A 1TB0X 4MO8A 2NNVA 5EHWA 3V3JA 4CNRA 3M98A 1CNCA 3SBIA 3HKTA 4QY3A 5G0CA 5FLTA 1UGBA 3F7BA 5JEHB 6CA2A 3T84A 5JGSB 4QJXA 3EFIA 1DCBA 1TTMA 5DSKA 4ILXA 3M67A 2FOQA 1G48A 3BETA 3VBDA 4XE1A 1CCUA 1FR4A 3MHLA 3CYUA 4YYTA 3HFPA 3IEOA 1I9LA 4Q8YA 5FNKA 1CVDA 1FSRA 2W2JA 4E4AA 3K7KA 1TG3A 1TG9A 4WUPA 4DZ7A 3MZCA 3LXEA 3T83A 4Q7PA 3DCCA 4QSAA 1CAZA 3KNEA 3S97A 3W6IA 3S77B 1RZBA 3MNIA 3DCWA 3DC9A 1HCAA 3RZ5A 3TMJA 2NNOA 4Q07A 3QYKA 5E2SA 5JQTA 1J9WA 5EHEA 3M1JA 3V7XA 1XEGA 1G3ZA 3M40A 4PZHA 4QK1A 3RYZA 1ZFKA 4HT0A 5AMDA 1V9EA 3IBUA 5E2RA 4Q49A 1CA2A 4Q6DA 3OKUA 4Q78A 4KNNA 3RJ7A 4DZ9A 4M2WA 2FNKA 4QTLA 2QOAA 5FNHA 1BNUA 5E5UA 5E28A 4FVNA 3DVDA 2POUA 4E3FA 4XIXA 2Q1BA 1MOOA 3DCSA 3K34A 2X7TA 1CNKA 1KOPA 1CNGA 3MHMA 1G1DA 2NXRA 4ZX1A 2H15A 3NI5A 5FDCA 4E5QA 4XFWA 3Q31A 2GD8A 3RG4A 2VVAX 2CBCA 4MDLA 1XPZA 3RYYA 4QJWA 1CNXA 3UYNA 1LUGA 3FFPX 1IF4A 1RZAA 4HEYA 5AMGA 5JEPB 3S78B 1CAHA 1JD0A 1FSQA 4IDRX 1CNIA 3P3HA 1TH9A 1BNMA 1HUHA 4R59A 3BL0A 1MUAA 5G0BA 1G45A 4E3GA 2EU2A 3RZ1B 5A25A 3MWOA 4R5BA 4TWMA 4LP6A 4WW8A 3SAXA 5G01A 3MNAA 4Q06A 1I8ZA 4FPTA 3RZ7A 4K13A 4Q81A 1RAZA 5CJFA 3V5GA 3NB5A 2QP6A 4QSJA 5JQ0A 1BNQA 5FDIA 4QJOA 3U7CA 1FSNA 4FVOA 1Z97A 1LG6A 4C3TA 1G52A 3ML5A 4ITPA 1G6VA 1FLJA 1UGAA 2ABEA 3D0NA 3ML2A 4G0CA 2IT4A 2OSFA 5CA2A 3PJJA 9CA2A 4Q09A 1Y7WA 3P5LA 4QK3A 4QIYA 5LMDA 5E5RA 1BNWA 4YHAA 5J8ZA 4YXIA 3M5EA 2O4ZA 4RUZA 5C8IA 5JGTB 4RFCA 5BRUA 5JG5B 3D9ZA 4HT2A 1YDAA 2FNNA 4CNXA 4Q90A 5SZ3A 1I9QA 1YO1A 3RYJB 2NWOA 5JG3B 3MHCA 3RZ8A 3S73B 4QIZA 4K0TA 1CALA 4HBAA 5BYIA 4QSIA 3JXGA 5DSLA 2NN7A 4YGKA 1RZCA 1RAYA 3RYXB 1FQMA 1CVBA 1YDCA 4PYYA 3M3XA 1ZGEA 5A6HA 1TBTX 1URTA 3JXFA 4G7AA 1V9IC 2WEGA 2HFWA 3OIKA 3MNUA 3P44A 1TEUX 1ZSCA 1CRAA 3M2XA 4HF3A 4L5UA 3NJ9A 3U47A 4CA2A 1RZDA 1BV3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4XZ5 A;  1G46 A;  5SZ6 A;  3F4X A;  2AW1 A;  1I90 A;  2HKK A;  2Q38 A;  2HL4 A;  4HU1 A;  3N4B A;  4RIU A;  2GEH A;  3OIM A;  4Q99 A;  4QK2 A;  5HPJ A;  4E49 A;  2CBD A;  4MDG A;  1ZNC A;  4XIW A;  4PXX A;  3MHI A;  5DVX A;  2X7U A;  5L3O A;  5FNM A;  4BF1 A;  3ZNC A;  1JCZ A;  1Z93 A;  3KON A;  3P5A A;  5DRS A;  4KAP A;  5L6K A;  4ZWI A;  5G03 A;  1CAY A;  4E9O X;  3KS3 A;  4Z1J A;  5DOG A;  1YDD A;  4YX4 A;  1BNT A;  2FW4 A;  3P3J A;  1THK A;  3HS4 A;  3P4V A;  3GZ0 A;  1H9N A;  3RG3 A;  1DCA A;  5DSN A;  3S9T A;  1BIC A;  1HVA A;  4CAC A;  3V3F A;  4KNJ A;  1I91 A;  4YGL A;  4YXU A;  3M5S A;  1HEB A;  1UGE A;  2ILI A;  3ZP9 A;  4FU5 A;  4M2V A;  3DVB A;  5E2K A;  3RGE A;  1FQL A;  2FMG A;  4R5A A;  3W6H A;  5JDV B;  2FOS A;  5DSJ A;  1KEQ A;  4M2R A;  3B4F A;  4Z1E A;  3RLD A;  4JSZ A;  1CAJ A;  3HKQ A;  3OY0 A;  1G53 A;  3KWA A;  2HOC A;  1Z9Y A;  4CNW A;  5SZ4 A;  1FQR A;  3KIG A;  1A42 A;  1CAK A;  4WUQ A;  3N3J A;  1HCB A;  3S75 B;  3C7P A;  4QJP A;  5BRV A;  1TEQ X;  3U3A X;  2POW A;  1EOU A;  5E2N A;  7CA2 A;  3M96 A;  5DSO A;  3OIL A;  3MNH A;  3T85 A;  4Z0Q A;  1G0F A;  4K0S A;  4FRC A;  1F2W A;  2ZNC A;  1I9P A;  5JES B;  3DC3 A;  1CA3 A;  2FOY A;  3FW3 A;  3OYS A;  4RH2 A;  4Q0L A;  1CIL A;  2NXS A;  2CBB A;  3OKV A;  3DAZ A;  4JSW A;  3M1Q A;  3CAJ A;  3M1W A;  4IWZ A;  3KKX A;  4ZWX A;  5EH7 A;  5EHV A;  4QJ0 A;  5FLR A;  4JS6 A;  3DA2 A;  2AX2 A;  4KNM A;  1IF7 A;  1CRM A;  4Q7V A;  2HNC A;  1BZM A;  5DSM A;  1CAI A;  4Q7S A;  5AML A;  3RZ0 B;  2EU3 A;  4BCW A;  4MLX A;  1G54 A;  1HEC A;  3M14 A;  1CNJ A;  2FOU A;  1AVN A;  3CZV A;  3DVC A;  3KOK A;  4N16 A;  3M5T A;  4BF6 A;  4UOV A;  1KOQ A;  3S72 B;  1CNB A;  5CLU A;  4Q7W A;  1CZM A;  4Z1N A;  2HD6 A;  5DOH A;  1CAN A;  4YGF A;  5FLO A;  3KOI A;  4JSS A;  1OKM A;  3M2N A;  1ZFQ A;  1YDB A;  2NWY A;  4KUV A;  2Q1Q A;  3DBU A;  3S74 B;  3L14 A;  1FR7 A;  4L5V A;  4RUX A;  1YO2 A;  4FIK A;  1G4O A;  4RUY A;  1OKL A;  4YWP A;  3K2F A;  2NXT A;  4KNI A;  2VVB X;  4QSB A;  4Q9Y A;  1T9N A;  4CNV A;  1XQ0 A;  2WEH A;  1AM6 A;  1TE3 X;  3T5U A;  5CAC A;  1UGD A;  2OSM A;  1I9M A;  1UGC A;  4FL7 A;  1OQ5 A;  4K0Z A;  2NN1 A;  1KWQ A;  1ZSA A;  4MLT A;  3V3G B;  3OYQ A;  3PYK A;  3M04 A;  4KP5 A;  1OKN A;  2F14 A;  3N2P A;  4HEZ A;  1CVC A;  4RN4 A;  4Y0J A;  3TVN X;  3SBH A;  3S8X A;  3MHO A;  5FNI A;  3R16 A;  2X7S A;  1LZV A;  5SZ2 A;  5EKH A;  1CAO A;  2NNS A;  4PQ7 A;  3IAI A;  4WL4 A;  5FL6 A;  3R17 B;  4ZWY A;  5FLP A;  1KWR A;  1H9Q A;  3S76 A;  3M2Z A;  3U45 X;  3P55 A;  5E2M A;  5FL5 A;  1CVF A;  1BNN A;  1JV0 A;  12CA A;  3S71 B;  5EZT X;  1BCD A;  1UGF A;  1CNY A;  3D92 A;  1CCS A;  1G0E A;  1HED A;  1I9O A;  4LHI A;  5SZ0 A;  4Q8Z A;  3V2M A;  2NWZ A;  3MNK A;  4YVY A;  5BRW A;  3HLJ A;  3DD0 A;  1DMY A;  2WD3 A;  3IBI A;  4COQ A;  1G4J A;  4Q87 A;  1H4N A;  1RJ6 A;  2NWP A;  2WEO A;  4Q83 A;  1FQN A;  1UGG A;  5DSR A;  5EKM A;  4ZX0 A;  5SZ7 A;  4N0X B;  4HEW A;  4PYX A;  3F7U A;  3MMF A;  4ZAO A;  1CAM A;  3B1B A;  3F8E A;  3MNJ A;  1ZH9 A;  4K1Q A;  3HKN A;  4GL1 X;  4Q08 A;  1LG5 A;  1ZGF A;  4QEF A;  1CCT A;  2CBA A;  4QJM A;  5SZ1 A;  3DD8 A;  1RZE A;  3D8W A;  2POV A;  4YGN A;  3P58 A;  1CVH A;  5FLS A;  1IF5 A;  3IBL A;  4RIV A;  5FL4 A;  5EH5 A;  1CVA A;  1CNH A;  2FOV A;  3HKU A;  3CA2 A;  3UYQ A;  1IF6 A;  4YGJ A;  4Z1K A;  1YO0 A;  5EH8 A;  2QO8 A;  2WD2 A;  1BN1 A;  3TVO X;  3MDZ A;  5FNJ A;  4YXO A;  3V3H B;  1ZSB A;  2H4N A;  3V3I B;  1LGD A;  3T5Z A;  1RJ5 A;  2CBE A;  1AZM A;  4L5W A;  1HUG A;  5DSP A;  3RYV B;  4MTY A;  3D93 A;  5JEG B;  3DV7 A;  3V2J A;  3FE4 A;  4E3H A;  2NNG A;  3T82 A;  4Q6E A;  1XEV A;  4RFD A;  1DMX A;  3PO6 A;  4LU3 A;  5EKJ A;  4KP8 A;  4KUY A;  5EOI A;  5BNL A;  1CNW A;  3BL1 A;  4MDM A;  3EFT A;  3SAP A;  1IF9 A;  8CA2 A;  1HEA A;  5DSQ A;  4CQ0 A;  2FNM A;  4E3D A;  4KUW A;  4ITO A;  4X5S A;  4JSA A;  4WR7 A;  5FNL A;  3MYQ A;  5EIJ A;  4TWL A;  1BN3 A;  3M1K A;  2EZ7 A;  1BN4 A;  2WEJ A;  4ETQ C;  5DSI A;  3KLD B;  5SZ5 A;  2NMX A;  1CIN A;  5FNG A;  3JXH C;  3IGP A;  3M2Y A;  4ZWZ A;  2CAB A;  4WW6 A;  1I9N A;  5IPZ A;  2CA2 A;  1BNV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3OILA

Total Genus

Knots found

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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