3P44 | Genus

Total Genus 73

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	73
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__484198764424517__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__484198764424517__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3p44/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__484198764424517__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"484198764424517","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3p44/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__484198764424517__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	Protein crystal structures with ferrocene and ruthenocene-based enzyme inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	73
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2010-10-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	3p44A00

1T9NA 3CAJA 1OKMA 4TWMA 2HFWA 3NI5A 4PQ7A 1HCAA 4RFDA 4DZ7A 4QSAA 5JG5B 3S8XA 3F4XA 1CVAA 2NWPA 5FDIA 2NNOA 1I8ZA 4YGLA 5FLSA 4RIVA 4MTYA 3M3XA 3OKUA 1RJ5A 1OQ5A 3DCSA 3IBIA 5E28A 4ZX1A 4KV0A 4CQ0A 1CNYA 5HPJA 4PYXA 4R59A 3FFPX 3T84A 3KLDB 4BF6A 3K7KA 4QIYA 3MHOA 1TH9A 1RZAA 4BF1A 5FLPA 4MO8A 3DCWA 3PYKA 3UYQA 1FR4A 5G0CA 4M2UA 4Z1NA 3V5GA 1IF7A 4N0XB 3M5TA 2X7UA 5SZ5A 4Q83A 2WEHA 4PYYA 2WEJA 1UGBA 3EFTA 5FNIA 1KEQA 1BNQA 1DCBA 1OKLA 1I91A 1FQNA 1UGGA 4RUYA 2ILIA 1Z97A 1ZGFA 1BN4A 2FOYA 3VBDA 1G46A 4WL4A 3ZNCA 3L14A 1AZMA 1HEBA 3DVDA 4HT2A 1YDDA 2VVBX 4MDGA 4E4AA 3U45X 5FL5A 3U3AX 7CA2A 1XEVA 4KNNA 2HKKA 5FLQA 4Z1JA 3S97A 1YO1A 5SZ3A 4Q0LA 4Q7SA 3TVNX 3DV7A 4HEWA 1BNVA 5JEGB 5EIJA 4YX4A 3HS4A 3M40A 3V3IB 4Q8ZA 5EKHA 5FL6A 1Z93A 1CINA 1I9PA 4RUXA 1CVDA 3RZ7A 3KKXA 3BETA 3RZ8A 1IF6A 4X5SA 2QO8A 1DMXA 1OKNA 3IAIA 4DZ9A 3CZVA 1CAKA 3HKNA 5FLOA 1H4NA 5JEHB 4K0ZA 1RAZA 1TEQX 1IF5A 3RZ0B 4KUYA 4WUPA 3KS3A 2WD3A 5SZ6A 5SZ4A 1CNHA 1CNWA 1HEAA 1YDBA 4RUZA 4M2VA 1CCTA 5DSOA 1I9QA 4QJ0A 4Q07A 3S71B 1UGFA 5DSRA 4C3TA 2NWOA 3K34A 2Q1BA 1I9MA 2POWA 1BZMA 5EHVA 5EH5A 4R5BA 5DSKA 4G7AA 4XZ5A 4HU1A 3V3HB 1MUAA 3RZ1B 3KOKA 3MWOA 2X7SA 3M5EA 1G48A 2HL4A 3MHLA 3ML2A 1ZNCA 5JEPB 5EHWA 3MNJA 1CNXA 4Q7PA 2CBDA 1CA2A 1CIMA 5G01A 1CVFA 1XPZA 3S73B 4YWPA 3MHMA 1AM6A 1CRMA 1JD0A 3DD0A 1DMYA 5DVXA 4PZHA 5EH8A 1UGCA 3P44A 5EHEA 2FOQA 5SZ0A 4WR7A 2ABEA 4L5VA 4FVNA 1RAYA 1I9NA 3M04A 5G0BA 5AMGA 3K2FA 2NMXA 4JSWA 3IEOA 3KIGA 5AMDA 3LXEA 5E5UA 1UGAA 1EOUA 5EZTX 3S9TA 3V3FA 3MNUA 3N3JA 1JV0A 3M2ZA 3MNAA 5JGSB 3P58A 4KUWA 4YGJA 3RGEA 3NB5A 1ZE8A 3MNIA 1RJ6A 3DBUA 4CACA 1CAIA 1DCAA 3N0NA 5E2NA 3D93A 1HVAA 3OYSA 1FSRA 3IGPA 5DSPA 3OILA 1CAYA 3V2JA 1RZEA 4HEYA 1IF4A 1KOQA 1BNUA 1UGEA 4KNIA 3T83A 4QSIA 2O4ZA 1Y7WA 3M1JA 1ZSAA 1G4JA 1G0FA 2W2JA 2WEGA 4LHIA 4WW8A 1BNTA 3IBNA 2HNCA 2AW1A 1UGDA 4QK1A 1TBTX 3DA2A 3D9ZA 4CNWA 1FR7A 1I90A 4K0TA 4M2RA 5G03A 1KWRA 3RYJB 3P5LA 1FQRA 5CA2A 2NNSA 2FNNA 1IF8A 3M98A 3OYQA 4Q8YA 5BRUA 1ZFQA 4HEZA 4QTLA 4M2WA 4RIUA 2OSFA 2IT4A 3GZ0A 2ZNCA 3PJJA 2EU3A 4CA2A 3SBHA 1CCUA 1HEDA 4Q7VA 4QSBA 3DVBA 4KNJA 1G45A 4RFCA 5DSNA 1CCSA 1FQLA 4XIXA 8CA2A 4LU3A 3T85A 4FVOA 1CILA 4JSAA 3M2XA 4CNVA 4E3GA 4YGNA 2QP6A 4CNXA 2NN1A 1V9IC 3JXHC 5SZ7A 1BICA 4Q7WA 5DOHA 3KOIA 2QOAA 3RG3A 4MDLA 4Q09A 2NWYA 3C7PA 4IDRX 3RYVB 1G4OA 1ZSBA 1BCDA 3F7BA 4Q8XA 4XE1A 5FNLA 2FNMA 1URTA 4BCWA 1F2WA 3DD8A 3P5AA 3F8EA 4E3DA 4N16A 2H15A 5FNKA 2EZ7A 4ZX0A 4KP5A 2CA2A 1XQ0A 4ZWIA 4ZAOA 2FOVA 3TMJA 3KWAA 4XFWA 3RYYA 1FLJA 5DSMA 1JCZA 1LG5A 5L6KA 1YDAA 3P4VA 2POUA 4FIKA 1LG6A 2HOCA 1TE3X 2Q1QA 1TG3A 1CNBA 5L3OA 1CVBA 1CNCA 3S72B 1CNIA 5FDCA 1HUGA 1G52A 3EFIA 4ZWXA 3UYNA 2WEOA 5EKJA 1CRAA 1CA3A 4YGFA 5A6HA 4Q6EA 3BL0A 3JXFA 3M1KA 12CAA 2Q38A 1CALA 3OKVA 9CA2A 4FU5A 3IBUA 1BNWA 4FL7A 2CBCA 3N2PA 3RJ7A 4KUVA 4YXUA 4E9OX 4QK2A 3D92A 1CVHA 1CZMA 4QJOA 5E2SA 2VVAX 4K1QA 3MNKA 2WD2A 3RLDA 3W6HA 4IWZA 2FNKA 5SZ2A 4E3HA 2NN7A 5E2KA 3D8WA 5EH7A 5LMDA 3M96A 4JSZA 4MDMA 4TWLA 2FOSA 5FNJA 4HT0A 3JXGA 3V7XA 3HLJA 4YHAA 1CAHA 4L5UA 4Q81A 4YYTA 1V9EA 1CNJA 4WUQA 4Q6DA 3ZP9A 1BN1A 5AMLA 3HKUA 3DC3A 2POVA 3FW3A 4MLTA 4COQA 5CJFA 1KOPA 3MHCA 3MMFA 3HFPA 4Z1EA 3S75B 1ZFKA 4QK3A 3V2MA 1CVCA 4Z1KA 5C8IA 1MOOA 5CLUA 4JSSA 5E2MA 4E3FA 3MDZA 4G0CA 4QIZA 5SZ1A 3S74B 2H4NA 2EU2A 1ZGEA 1ZH9A 5DSQA 1CAOA 3PO6A 3V3JA 3N4BA 1RZDA 3HKTA 2GD8A 3DC9A 4ITOA 4Q06A 4QJMA 5DSLA 3SBIA 4ITPA 4E5QA 1CNGA 4QJPA 1AVNA 2NNVA 1FSNA 1IF9A 1FQMA 1I9LA 4QJXA 3ML5A 1HUHA 3MYQA 3R16A 3DAZA 5E5RA 5JG3B 5BRWA 1CNKA 4K0SA 5JGTB 4HBAA 1BV3A 1CAJA 4KP8A 6CA2A 3OIMA 3IBLA 3M2YA 1YO0A 2FW4A 1XEGA 4Z0QA 3M5SA 2CBBA 5DOGA 3S78B 3QYKA 4R5AA 4MLXA 1YO2A 3HKQA 4Q87A 4Q99A 1LGDA 3D0NA 5BRVA 3F7UA 1LZVA 5BYIA 2OSMA 4YXOA 5DSIA 2HD6A 1I9OA 2FOUA 4UOVA 1Z9YA 4YXIA 1G0EA 1RZBA 4QEFA 1H9NA 5FNGA 1TB0X 3FE4A 5CACA 4GL1X 3RZ5A 4KNMA 3OY0A 3MZCA 3R17B 5FNMA 3M14A 3B1BA 3S76A 1RZCA 2F14A 5DRSA 1J9WA 3KNEA 3T5ZA 3V3GB 1HECA 5DSJA 3U7CA 1CAMA 4YGKA 1BNMA 1YDCA 4ILXA 4Q08A 4ETQC 1LUGA 1G3ZA 3U47A 5EOIA 3W6IA 4Y0JA 4Q49A 4KAPA 4Q90A 3DCCA 4QJWA 2FMZA 3DVCA 5JDVB 4FPTA 5EKMA 1G6VA 5BNLA 1TEUX 2FMGA 5FLTA 4K13A 3M1WA 4XIWA 3P3JA 1G54A 2NXRA 5FNHA 1FSQA 1TTMA 3CA2A 3NJ9A 2X7TA 5FLRA 4LP6A 3SAPA 4FRCA 3CYUA 5JQ0A 1KWQA 3BL1A 5IPZA 1BNNA 1CAZA 1ZSCA 4ZWZA 3S77B 4QY3A 3Q31A 1BN3A 3M1QA 3RYXB 1G53A 3MHIA 5A25A 2NXTA 5FL4A 5J8ZA 3M67A 3RG4A 4CNRA 3SAXA 3RYZA 4PXXA 2CBEA 1THKA 2NXSA 4QSJA 2NNGA 3MNHA 3TVOX 1TG9A 5JQTA 4Q78A 3P3HA 4WW6A 5JESB 4RH2A 2CABA 1A42A 2GEHA 4E49A 3KONA 3B4FA 5E2RA 2AX2A 3P55A 4ZWYA 1H9QA 4Q9YA 2CBAA 3OIKA 3T82A 4RN4A 4JS6A 4YVYA 1CANA 1CVEA 4HF3A 3M2NA 1G1DA 1HCBA 2NWZA 4L5WA 3T5UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1T9N A;  3CAJ A;  1OKM A;  4TWM A;  2HFW A;  3NI5 A;  4PQ7 A;  1HCA A;  4RFD A;  4DZ7 A;  4QSA A;  5JG5 B;  3S8X A;  3F4X A;  1CVA A;  2NWP A;  5FDI A;  2NNO A;  1I8Z A;  4YGL A;  5FLS A;  4RIV A;  4MTY A;  3M3X A;  3OKU A;  1RJ5 A;  1OQ5 A;  3DCS A;  3IBI A;  5E28 A;  4ZX1 A;  4KV0 A;  4CQ0 A;  1CNY A;  5HPJ A;  4PYX A;  4R59 A;  3FFP X;  3T84 A;  3KLD B;  4BF6 A;  3K7K A;  4QIY A;  3MHO A;  1TH9 A;  1RZA A;  4BF1 A;  5FLP A;  4MO8 A;  3DCW A;  3PYK A;  3UYQ A;  1FR4 A;  5G0C A;  4M2U A;  4Z1N A;  3V5G A;  1IF7 A;  4N0X B;  3M5T A;  2X7U A;  5SZ5 A;  4Q83 A;  2WEH A;  4PYY A;  2WEJ A;  1UGB A;  3EFT A;  5FNI A;  1KEQ A;  1BNQ A;  1DCB A;  1OKL A;  1I91 A;  1FQN A;  1UGG A;  4RUY A;  2ILI A;  1Z97 A;  1ZGF A;  1BN4 A;  2FOY A;  3VBD A;  1G46 A;  4WL4 A;  3ZNC A;  3L14 A;  1AZM A;  1HEB A;  3DVD A;  4HT2 A;  1YDD A;  2VVB X;  4MDG A;  4E4A A;  3U45 X;  5FL5 A;  3U3A X;  7CA2 A;  1XEV A;  4KNN A;  2HKK A;  5FLQ A;  4Z1J A;  3S97 A;  1YO1 A;  5SZ3 A;  4Q0L A;  4Q7S A;  3TVN X;  3DV7 A;  4HEW A;  1BNV A;  5JEG B;  5EIJ A;  4YX4 A;  3HS4 A;  3M40 A;  3V3I B;  4Q8Z A;  5EKH A;  5FL6 A;  1Z93 A;  1CIN A;  1I9P A;  4RUX A;  1CVD A;  3RZ7 A;  3KKX A;  3BET A;  3RZ8 A;  1IF6 A;  4X5S A;  2QO8 A;  1DMX A;  1OKN A;  3IAI A;  4DZ9 A;  3CZV A;  1CAK A;  3HKN A;  5FLO A;  1H4N A;  5JEH B;  4K0Z A;  1RAZ A;  1TEQ X;  1IF5 A;  3RZ0 B;  4KUY A;  4WUP A;  3KS3 A;  2WD3 A;  5SZ6 A;  5SZ4 A;  1CNH A;  1CNW A;  1HEA A;  1YDB A;  4RUZ A;  4M2V A;  1CCT A;  5DSO A;  1I9Q A;  4QJ0 A;  4Q07 A;  3S71 B;  1UGF A;  5DSR A;  4C3T A;  2NWO A;  3K34 A;  2Q1B A;  1I9M A;  2POW A;  1BZM A;  5EHV A;  5EH5 A;  4R5B A;  5DSK A;  4G7A A;  4XZ5 A;  4HU1 A;  3V3H B;  1MUA A;  3RZ1 B;  3KOK A;  3MWO A;  2X7S A;  3M5E A;  1G48 A;  2HL4 A;  3MHL A;  3ML2 A;  1ZNC A;  5JEP B;  5EHW A;  3MNJ A;  1CNX A;  4Q7P A;  2CBD A;  1CA2 A;  1CIM A;  5G01 A;  1CVF A;  1XPZ A;  3S73 B;  4YWP A;  3MHM A;  1AM6 A;  1CRM A;  1JD0 A;  3DD0 A;  1DMY A;  5DVX A;  4PZH A;  5EH8 A;  1UGC A;  3P44 A;  5EHE A;  2FOQ A;  5SZ0 A;  4WR7 A;  2ABE A;  4L5V A;  4FVN A;  1RAY A;  1I9N A;  3M04 A;  5G0B A;  5AMG A;  3K2F A;  2NMX A;  4JSW A;  3IEO A;  3KIG A;  5AMD A;  3LXE A;  5E5U A;  1UGA A;  1EOU A;  5EZT X;  3S9T A;  3V3F A;  3MNU A;  3N3J A;  1JV0 A;  3M2Z A;  3MNA A;  5JGS B;  3P58 A;  4KUW A;  4YGJ A;  3RGE A;  3NB5 A;  1ZE8 A;  3MNI A;  1RJ6 A;  3DBU A;  4CAC A;  1CAI A;  1DCA A;  3N0N A;  5E2N A;  3D93 A;  1HVA A;  3OYS A;  1FSR A;  3IGP A;  5DSP A;  3OIL A;  1CAY A;  3V2J A;  1RZE A;  4HEY A;  1IF4 A;  1KOQ A;  1BNU A;  1UGE A;  4KNI A;  3T83 A;  4QSI A;  2O4Z A;  1Y7W A;  3M1J A;  1ZSA A;  1G4J A;  1G0F A;  2W2J A;  2WEG A;  4LHI A;  4WW8 A;  1BNT A;  3IBN A;  2HNC A;  2AW1 A;  1UGD A;  4QK1 A;  1TBT X;  3DA2 A;  3D9Z A;  4CNW A;  1FR7 A;  1I90 A;  4K0T A;  4M2R A;  5G03 A;  1KWR A;  3RYJ B;  3P5L A;  1FQR A;  5CA2 A;  2NNS A;  2FNN A;  1IF8 A;  3M98 A;  3OYQ A;  4Q8Y A;  5BRU A;  1ZFQ A;  4HEZ A;  4QTL A;  4M2W A;  4RIU A;  2OSF A;  2IT4 A;  3GZ0 A;  2ZNC A;  3PJJ A;  2EU3 A;  4CA2 A;  3SBH A;  1CCU A;  1HED A;  4Q7V A;  4QSB A;  3DVB A;  4KNJ A;  1G45 A;  4RFC A;  5DSN A;  1CCS A;  1FQL A;  4XIX A;  8CA2 A;  4LU3 A;  3T85 A;  4FVO A;  1CIL A;  4JSA A;  3M2X A;  4CNV A;  4E3G A;  4YGN A;  2QP6 A;  4CNX A;  2NN1 A;  1V9I C;  3JXH C;  5SZ7 A;  1BIC A;  4Q7W A;  5DOH A;  3KOI A;  2QOA A;  3RG3 A;  4MDL A;  4Q09 A;  2NWY A;  3C7P A;  4IDR X;  3RYV B;  1G4O A;  1ZSB A;  1BCD A;  3F7B A;  4Q8X A;  4XE1 A;  5FNL A;  2FNM A;  1URT A;  4BCW A;  1F2W A;  3DD8 A;  3P5A A;  3F8E A;  4E3D A;  4N16 A;  2H15 A;  5FNK A;  2EZ7 A;  4ZX0 A;  4KP5 A;  2CA2 A;  1XQ0 A;  4ZWI A;  4ZAO A;  2FOV A;  3TMJ A;  3KWA A;  4XFW A;  3RYY A;  1FLJ A;  5DSM A;  1JCZ A;  1LG5 A;  5L6K A;  1YDA A;  3P4V A;  2POU A;  4FIK A;  1LG6 A;  2HOC A;  1TE3 X;  2Q1Q A;  1TG3 A;  1CNB A;  5L3O A;  1CVB A;  1CNC A;  3S72 B;  1CNI A;  5FDC A;  1HUG A;  1G52 A;  3EFI A;  4ZWX A;  3UYN A;  2WEO A;  5EKJ A;  1CRA A;  1CA3 A;  4YGF A;  5A6H A;  4Q6E A;  3BL0 A;  3JXF A;  3M1K A;  12CA A;  2Q38 A;  1CAL A;  3OKV A;  9CA2 A;  4FU5 A;  3IBU A;  1BNW A;  4FL7 A;  2CBC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3P44A

Total Genus

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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