3RGEA

Crystal structure of the w5h mutant of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Structure and catalysis by carbonic anhydrase II: role of active-site tryptophan 5.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3rgeA00
1LZVA 1EOUA 2CBCA 2FW4A 2GEHA 4DZ7A 3TVNX 4TWLA 5E5UA 5BRUA 4GL1X 3SBIA 3S8XA 1G6VA 4FU5A 1CA3A 3UYQA 3M40A 1YDBA 3HS4A 4JSAA 1KOPA 2NWZA 3OIMA 1UGGA 1BN3A 4KUWA 4YXIA 4L5WA 4Q81A 1V9EA 1BNTA 3CA2A 1UGAA 3NI5A 3W6HA 5E2KA 4ZAOA 4Q90A 4WL4A 1YDAA 4FVNA 3IAIA 3RLDA 2FMZA 3DV7A 3SAPA 2HKKA 2Q1QA 4CNXA 3DD0A 4QTLA 2ZNCA 4KP5A 4KNMA 5AMDA 2W2JA 3MNAA 3M14A 1G45A 5DSIA 1CVBA 4CQ0A 4XIXA 1CNHA 3N3JA 2POVA 3D9ZA 1TH9A 2NMXA 3TVOX 2NXSA 1CVCA 4QIYA 5L3OA 1G46A 5DSKA 1CALA 1CRAA 2NNSA 1CNIA 3K7KA 3RYZA 4Q7VA 4MDMA 1RJ5A 3DVDA 5FLTA 3ML2A 1CNBA 4HEZA 5CLUA 3U7CA 1BNNA 4QSIA 4R59A 1CILA 3T83A 2CABA 3P3HA 3DVCA 3KIGA 1ZFQA 3M1WA 1RAYA 1RJ6A 1I9MA 2FOYA 4QK1A 3DCSA 1ZGEA 3FW3A 3V3HB 3U3AX 4KAPA 1G53A 5FLRA 1BICA 3DC9A 4Z1NA 3KKXA 1CIMA 3MHLA 5FLSA 4CNRA 4Q0LA 3N4BA 1CNCA 1CA2A 5FL6A 5BRWA 3T84A 4K0TA 4KV0A 4MDLA 5FDIA 1BNVA 3M96A 3P4VA 1TBTX 3OIKA 3GZ0A 1YO1A 4X5SA 4KNNA 4YVYA 4DZ9A 4M2VA 1BNUA 5J8ZA 1OKLA 3IBLA 4HBAA 5AMGA 2FNMA 3D93A 4WW6A 1CAMA 2FNNA 1LGDA 3DAZA 4COQA 1H9QA 3V2MA 4RIVA 4Q87A 3IBUA 1LUGA 2CBAA 5EH5A 4Q07A 4ITPA 1FQMA 5DOHA 3HKQA 3KOIA 3S77B 4MLTA 3R17B 2F14A 1IF8A 3RGEA 4HF3A 3R16A 2NNVA 4Q7PA 3S9TA 1T9NA 1JV0A 1IF4A 5JEGB 4QJXA 4QJMA 5EH7A 5DSNA 4Z1KA 1IF6A 4MDGA 3HKUA 5BYIA 5EHWA 4RUZA 3EFIA 4K13A 3OY0A 5G01A 3KONA 3V3IB 3NJ9A 3KNEA 5FNHA 3C7PA 3RYYA 4Q08A 5JEHB 4E9OX 1CVEA 4Q06A 1DMXA 4JSSA 2OSMA 3MNIA 5E2SA 1RAZA 3S71B 4YGJA 1HCAA 3P58A 2HFWA 1G48A 3RYJB 3V3JA 1TG3A 1THKA 2OSFA 4C3TA 2FNKA 2Q38A 1BNQA 3M2ZA 1CAIA 2H15A 4PYXA 1RZEA 5DOGA 1YDDA 3IBNA 1DCBA 4HU1A 3OKUA 3OYSA 4KP8A 5L6KA 4HT0A 5G0BA 1CAJA 12CAA 1FSRA 3NB5A 2QOAA 1CNJA 4Z1EA 3OKVA 4KNIA 5DSOA 2WD3A 3T5ZA 1I9LA 3ZNCA 3FFPX 2POWA 3T85A 5DSQA 4PYYA 2NNOA 5EHEA 4YGNA 1ZSCA 4Q6DA 1CAYA 1CVDA 1I9NA 1G3ZA 1BNWA 4KUYA 4FIKA 4RFDA 3KWAA 4YGFA 4E4AA 2AW1A 1CVAA 5FDCA 4RIUA 4Y0JA 3M2NA 3MHCA 4Q09A 1RZCA 1UGDA 3S73B 5FNGA 5FNKA 4QSAA 3V3GB 1BZMA 3K2FA 1CCUA 5JEPB 3SBHA 1H4NA 2AX2A 3M1JA 5E2RA 1YO2A 1IF5A 5SZ1A 3HFPA 5JQTA 4Q9YA 1HEAA 4XE1A 3RJ7A 3IBIA 4PQ7A 4QK3A 1OKMA 2FOQA 3FE4A 5JGSB 1A42A 5SZ4A 4RUXA 3KS3A 1HCBA 1TTMA 1V9IC 4R5BA 1CVHA 5EKJA 1F2WA 3M5EA 3MNJA 3DBUA 3MNUA 1RZBA 5SZ3A 4QEFA 4YGLA 3F4XA 4CNVA 1UGBA 5HPJA 1FSQA 3DCCA 4HEYA 3VBDA 1AVNA 1ZNCA 4M2RA 1BCDA 3U47A 2Q1BA 3MYQA 1TEQX 4Q6EA 5DSRA 3RZ8A 3M5TA 3MHOA 5BNLA 1TG9A 1AM6A 4N0XB 4M2WA 5SZ6A 1TB0X 5FLPA 1BN4A 1KEQA 4KNJA 4Z0QA 4L5VA 3JXHC 3MWOA 3S76A 5EHVA 5IPZA 4ITOA 4ETQC 3ML5A 3DC3A 5JG3B 2WEOA 3DVBA 2QO8A 4Q8ZA 3MDZA 3RZ1B 5DVXA 4YXUA 1YDCA 2ABEA 3P3JA 4ZWXA 4E3FA 4LHIA 3RYXB 3M1KA 3RYVB 2FMGA 3HLJA 4BF6A 5FNJA 4QJOA 3MHIA 4RN4A 3PYKA 3M1QA 1FLJA 1HUHA 3F7UA 4QY3A 1URTA 5SZ7A 2H4NA 2CBEA 1CNGA 3S75B 4QJWA 3CYUA 1RZAA 1LG6A 5FL4A 5A25A 1I90A 3CAJA 3RG4A 5CA2A 2QP6A 1FSNA 5DSMA 1G0FA 1CNYA 3P5AA 2HD6A 4LP6A 3P55A 3BL1A 3Q31A 3UYNA 1HEDA 4Q7SA 1CCSA 4JS6A 3M98A 1CNKA 2NWYA 4L5UA 5E2MA 4WW8A 4K1QA 4XZ5A 4Q83A 4QK2A 2HOCA 1Z97A 1ZGFA 2X7SA 4YYTA 1BV3A 1G52A 1KWQA 1OKNA 1CANA 1ZE8A 2X7TA 5SZ5A 3M04A 4K0SA 3N0NA 4QJ0A 4PZHA 1J9WA 5CACA 4ZWYA 3D8WA 1Z93A 3RZ0B 5A6HA 4ZWIA 5FNMA 4WUPA 3KOKA 1I8ZA 2ILIA 5G0CA 4JSZA 1ZSBA 3IGPA 4HT2A 4MLXA 5DSJA 4JSWA 3P5LA 1FQLA 3V5GA 3QYKA 1HUGA 3TMJA 4M2UA 5FNLA 2O4ZA 2FOVA 3LXEA 1UGCA 4FPTA 5DSLA 5LMDA 4Q49A 3KLDB 3M5SA 3B4FA 4FRCA 5JG5B 5FNIA 4E3HA 3MNKA 1G1DA 5EOIA 3MNHA 3EFTA 1CAHA 4G0CA 3W6IA 2VVBX 5EIJA 4CNWA 3V7XA 1MUAA 1DMYA 5G03A 1CINA 2FOUA 1CAOA 1CNWA 3HKTA 3OILA 3IEOA 4PXXA 6CA2A 1CVFA 2FOSA 1LG5A 3MHMA 5SZ0A 5CJFA 4Z1JA 4ZX0A 3S72B 2EU2A 5EH8A 4E3DA 4CACA 2NWOA 5BRVA 1YO0A 4E5QA 5JGTB 1CRMA 1Z9YA 1ZFKA 5EKHA 5JESB 2HNCA 4G7AA 1TEUX 4R5AA 4QIZA 5FL5A 1KOQA 3DD8A 3N2PA 1CAZA 4K0ZA 5JQ0A 3JXFA 5SZ2A 3DCWA 4TWMA 4Q99A 2X7UA 2NXTA 3S78B 2WEJA 2WEGA 1UGFA 3U45X 3BL0A 3PJJA 8CA2A 2POUA 1DCAA 3M2YA 1XPZA 1TE3X 5FLOA 1CCTA 1HVAA 1JCZA 3F7BA 4RFCA 1RZDA 3M2XA 5C8IA 2CA2A 1G4OA 1UGEA 2NN7A 2CBDA 2NN1A 1FR4A 4MTYA 1HECA 2CBBA 4QSBA 5E2NA 3M3XA 3SAXA 3V3FA 3S74B 1FR7A 1MOOA 4IDRX 4ZWZA 1BN1A 3CZVA 4BCWA 3DA2A 4UOVA 5EKMA 1IF9A 3JXGA 5JDVB 1CAKA 5EZTX 4CA2A 4LU3A 5FLQA 3S97A 4WR7A 4ZX1A 4E3GA 2VVAX 7CA2A 4ILXA 1FQRA 4QJPA 1JD0A 2WEHA 3T82A 4FL7A 4YGKA 1G4JA 1OQ5A 4XFWA 1AZMA 4N16A 4KUVA 3ZP9A 1Y7WA 4XIWA 3MMFA 4Q8YA 2NWPA 4RUYA 3RZ7A 1FQNA 4Q8XA 1HEBA 1G54A 1XEVA 4WUQA 2GD8A 2NXRA 5E5RA 1H9NA 4YHAA 3RZ5A 3P44A 4IWZA 1BNMA 4MO8A 4FVOA 3T5UA 2EU3A 1CZMA 1I9OA 2EZ7A 4Q7WA 9CA2A 3D0NA 3OYQA 4YXOA 3M67A 1I9QA 4Q78A 3D92A 4BF1A 5DSPA 2WD2A 3L14A 3BETA 3V2JA 1XQ0A 3RG3A 1IF7A 4YWPA 3B1BA 4QSJA 5E28A 4E49A 1I91A 5DRSA 2IT4A 5AMLA 2NNGA 3HKNA 4YX4A 1CNXA 1ZSAA 3PO6A 1XEGA 1ZH9A 3MZCA 3K34A 4HEWA 1I9PA 3F8EA 1G0EA 1KWRA 4RH2A 2HL4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LZV A;  1EOU A;  2CBC A;  2FW4 A;  2GEH A;  4DZ7 A;  3TVN X;  4TWL A;  5E5U A;  5BRU A;  4GL1 X;  3SBI A;  3S8X A;  1G6V A;  4FU5 A;  1CA3 A;  3UYQ A;  3M40 A;  1YDB A;  3HS4 A;  4JSA A;  1KOP A;  2NWZ A;  3OIM A;  1UGG A;  1BN3 A;  4KUW A;  4YXI A;  4L5W A;  4Q81 A;  1V9E A;  1BNT A;  3CA2 A;  1UGA A;  3NI5 A;  3W6H A;  5E2K A;  4ZAO A;  4Q90 A;  4WL4 A;  1YDA A;  4FVN A;  3IAI A;  3RLD A;  2FMZ A;  3DV7 A;  3SAP A;  2HKK A;  2Q1Q A;  4CNX A;  3DD0 A;  4QTL A;  2ZNC A;  4KP5 A;  4KNM A;  5AMD A;  2W2J A;  3MNA A;  3M14 A;  1G45 A;  5DSI A;  1CVB A;  4CQ0 A;  4XIX A;  1CNH A;  3N3J A;  2POV A;  3D9Z A;  1TH9 A;  2NMX A;  3TVO X;  2NXS A;  1CVC A;  4QIY A;  5L3O A;  1G46 A;  5DSK A;  1CAL A;  1CRA A;  2NNS A;  1CNI A;  3K7K A;  3RYZ A;  4Q7V A;  4MDM A;  1RJ5 A;  3DVD A;  5FLT A;  3ML2 A;  1CNB A;  4HEZ A;  5CLU A;  3U7C A;  1BNN A;  4QSI A;  4R59 A;  1CIL A;  3T83 A;  2CAB A;  3P3H A;  3DVC A;  3KIG A;  1ZFQ A;  3M1W A;  1RAY A;  1RJ6 A;  1I9M A;  2FOY A;  4QK1 A;  3DCS A;  1ZGE A;  3FW3 A; 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