3RLDA

Crystal structure of the y7i mutant of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGIGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Kinetic and crystallographic studies of the role of tyrosine 7 in the active site of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3rldA00
3FE4A 1DMXA 1AZMA 1FLJA 5FNHA 3R17B 5JEGB 3M67A 3PJJA 1CCUA 3M14A 4DZ7A 1CA2A 2FMZA 2QOAA 1ZNCA 1ZGFA 2NWPA 1YDDA 5JDVB 1HEDA 2HNCA 1RZDA 1I9NA 3DBUA 3MMFA 4MDGA 1HEAA 4WL4A 5FL5A 2NWOA 4RUYA 1OKMA 2CBEA 4Q7VA 1URTA 4KAPA 3P4VA 4HT2A 1YO1A 1FQRA 3K2FA 4Q87A 5E2RA 5SZ3A 2NNVA 4R5AA 3M2ZA 1CCSA 1KWRA 3HKNA 1YDCA 4ZX0A 1CAYA 4KNNA 5DSQA 1CANA 3V3GB 3D92A 1YDBA 4N16A 2OSMA 2NN7A 4M2UA 4MLTA 1XEGA 4QJWA 1CNKA 1XPZA 4XIXA 4K1QA 4QK3A 2IT4A 4UOVA 5BNLA 4QJMA 3S76A 1HCBA 3NJ9A 1OQ5A 4XFWA 4IWZA 2NN1A 3S72B 5SZ1A 1UGFA 3M2NA 5AMLA 3V3FA 5JGTB 1HEBA 4E3FA 5EOIA 3UYNA 4Q07A 1HUGA 1ZFKA 3MZCA 1CAMA 4FPTA 5FDIA 1TEQX 5EKHA 1YO2A 3KOIA 5G01A 3BL1A 3DAZA 4YGKA 3S73B 1G3ZA 2CBAA 4TWMA 1I91A 2FOQA 4QSIA 4RFCA 2X7TA 2Q1BA 1FQLA 3MHMA 4LU3A 5SZ4A 2CA2A 1UGGA 1G54A 4X5SA 3S9TA 1F2WA 3V5GA 5BYIA 4FU5A 3TVOX 5FDCA 3DD8A 3M96A 5DOGA 2VVAX 5EH5A 3M1JA 3F8EA 2FNMA 3K34A 3OIMA 3K7KA 4K0ZA 1IF8A 4KUYA 3N3JA 1IF9A 1I90A 5FNIA 1RZCA 1TTMA 5EKJA 5FLSA 4GL1X 3RZ8A 3IEOA 3N4BA 3U45X 3DCCA 4E3HA 2NWZA 1Y7WA 4FIKA 5FNMA 2HKKA 2HD6A 4ZAOA 1KWQA 1IF4A 3JXHC 2NXRA 3RGEA 3S77B 5SZ5A 3M04A 3OY0A 1CALA 2W2JA 5JEHB 3MWOA 1UGCA 5BRVA 4E3GA 4TWLA 5G03A 5IPZA 5DRSA 1UGDA 5CA2A 5SZ6A 1CZMA 5DSPA 2HL4A 1CAZA 1KEQA 2HOCA 3M98A 3HKQA 5LMDA 4PXXA 4Q7PA 4YYTA 3OYQA 4ITPA 1ZSBA 4COQA 1FQMA 3S74B 4G0CA 5EHWA 5JEPB 4Q90A 4MTYA 4QTLA 4Z1NA 3NB5A 5DOHA 2NNOA 4Q9YA 4JSWA 1IF7A 3D9ZA 3V3HB 4CQ0A 12CAA 3D0NA 2ILIA 5BRUA 3UYQA 4M2VA 1AVNA 2WD2A 2WEOA 3VBDA 3SAPA 4QY3A 4ZWYA 3EFTA 3M2YA 3RYVB 5G0CA 4Y0JA 4QSJA 1BNTA 9CA2A 3KLDB 4XZ5A 3EFIA 3MHOA 1TH9A 4YGFA 3Q31A 1YDAA 3CA2A 5J8ZA 2CBDA 1HECA 1G53A 3HKTA 4RN4A 3M1KA 5DSNA 4HBAA 1FSNA 3N2PA 4QJXA 4MDMA 5FNGA 3MDZA 1FSQA 3V7XA 4K0SA 3DA2A 3F7UA 4BF6A 1G52A 4ZX1A 2FOVA 3S8XA 1BN3A 5E2NA 4C3TA 4HEWA 4XE1A 1AM6A 5FLOA 1CAJA 3M5EA 3V3JA 3C7PA 1RAYA 4XIWA 3MNAA 1TBTX 4KNIA 4QJPA 5E2SA 5L6KA 3HS4A 4YVYA 5JG3B 4BF1A 2ABEA 2GEHA 1CINA 1CNIA 3W6IA 5DSOA 1CVBA 1CNHA 3SBHA 1CVHA 3NI5A 4E9OX 5DSIA 5CACA 3RG4A 2NXTA 2CBBA 4ZWIA 3S75B 1CVAA 5C8IA 5SZ7A 2OSFA 3V2MA 5EIJA 1BN1A 4Q7SA 3T82A 1IF6A 3V2JA 4Z1EA 5E5UA 4HF3A 5AMDA 3B1BA 1KOPA 3T84A 4RUZA 2POUA 1CVFA 4QJOA 3DV7A 4Q99A 1BN4A 2FOYA 2NNSA 4BCWA 3M1WA 4CACA 1BV3A 1YO0A 2O4ZA 4K13A 1UGBA 4WUQA 1CVDA 3IBNA 1TE3X 5EHEA 1BNWA 4YXIA 3RZ7A 3DD0A 4QK2A 5FNLA 3TVNX 1BNMA 1ZSAA 3IBUA 3P58A 3DVDA 3DVBA 3MNHA 3P5LA 4JSZA 2H4NA 1CAOA 1BCDA 4Z1KA 4M2WA 3RLDA 2X7UA 1V9IC 3DCWA 1LG6A 4CNRA 1LZVA 3DC9A 4WR7A 1G0FA 4Q6DA 3KWAA 3ZNCA 1CAIA 4ITOA 1DCBA 4L5VA 4Q06A 3DCSA 3KIGA 1T9NA 4WW8A 5FL4A 3KS3A 4L5WA 5E2KA 3DC3A 3RG3A 2EU3A 2WEJA 4LP6A 1G4OA 3CYUA 3MNIA 4Q7WA 4YGNA 1Z9YA 1EOUA 3MNKA 1HUHA 1CVEA 4FRCA 4KV0A 4CNVA 5E2MA 1CNGA 1LUGA 4ETQC 4RH2A 5FL6A 1MOOA 5DSJA 2NMXA 1CNWA 1H9QA 3QYKA 1BNQA 3M1QA 4CA2A 4QSAA 2FW4A 2F14A 2HFWA 3MHIA 5DSKA 1ZGEA 2H15A 3BL0A 5EHVA 5JG5B 4QEFA 5DSRA 3GZ0A 4JS6A 1CAHA 1I9QA 3T5ZA 1FSRA 4E3DA 4Q8ZA 4Z1JA 1OKLA 4Q08A 2FOUA 1J9WA 3KONA 5DSMA 2QO8A 1ZFQA 4K0TA 1UGAA 3LXEA 4KNJA 1LG5A 2FNNA 4Q09A 3KNEA 3CAJA 4Q6EA 2NXSA 4Q49A 4Q78A 3F4XA 3HFPA 3P55A 4PQ7A 4RIUA 3BETA 3MYQA 3RZ1B 5EZTX 4QSBA 5FLRA 3D8WA 3TMJA 4Q8YA 2Q1QA 4QK1A 5FNKA 3SAXA 3F7BA 4ZWXA 2POVA 3PO6A 1BNUA 3OKUA 4KUVA 3P3JA 2FNKA 1IF5A 3JXGA 5FLQA 1JV0A 4G7AA 4Q0LA 3M5TA 1XEVA 1CAKA 1CNCA 1CNYA 1CCTA 1CILA 2EZ7A 4QIYA 1I9PA 4RFDA 2EU2A 4QJ0A 2CABA 4KP8A 1RZEA 4IDRX 3W6HA 4PZHA 2X7SA 2CBCA 5FLPA 3FFPX 4FVNA 1HVAA 4JSAA 3RYJB 4WUPA 5FLTA 4HU1A 1G4JA 4Q81A 1FR4A 3KKXA 3V3IB 5A25A 4DZ9A 1I8ZA 5DVXA 3ML5A 3MNUA 1Z97A 1CNXA 3FW3A 4Q8XA 1G6VA 3RYYA 1DCAA 1CVCA 4KNMA 3ZP9A 3U3AX 5A6HA 4ZWZA 1CA3A 3OILA 4RUXA 3U47A 4E5QA 4YX4A 4M2RA 3RYXB 1LGDA 2FOSA 3S78B 5SZ2A 2WEHA 1OKNA 4Q83A 1BNVA 3M40A 5L3OA 2ZNCA 5SZ0A 5CLUA 1XQ0A 4RIVA 4N0XB 4HEZA 5AMGA 2POWA 4MDLA 3KOKA 4YXUA 1ZSCA 3SBIA 5BRWA 3RZ5A 4HEYA 3IBLA 3T83A 4CNWA 1BZMA 3CZVA 2Q38A 3OIKA 3RYZA 3IBIA 4MLXA 1MUAA 3ML2A 4KP5A 1CNBA 1FQNA 3B4FA 1G1DA 1I9MA 4QIZA 1BICA 2GD8A 5EH7A 1Z93A 1RJ5A 1JD0A 4FL7A 2NNGA 3D93A 1CRAA 1ZH9A 1BNNA 4MO8A 1UGEA 5E5RA 1G46A 4YWPA 1G0EA 4L5UA 1RJ6A 1RZAA 1TG3A 3M3XA 3M5SA 5G0BA 3U7CA 4WW6A 3S71B 5HPJA 5JGSB 1ZE8A 3OKVA 8CA2A 1JCZA 3MHLA 4FVOA 4R5BA 6CA2A 2NWYA 1RAZA 4YHAA 1THKA 4KUWA 5DSLA 2QP6A 1CRMA 5EH8A 2WEGA 3RJ7A 4E49A 1G45A 3L14A 3IAIA 2AW1A 7CA2A 5EKMA 4LHIA 1A42A 4ILXA 2WD3A 3OYSA 4CNXA 4YGJA 4YXOA 1I9OA 3T5UA 4PYYA 3HLJA 1TG9A 1I9LA 1TB0X 3HKUA 3MHCA 3S97A 3P5AA 5FNJA 3PYKA 3JXFA 1HCAA 5E28A 1CNJA 5JQTA 1V9EA 5JESB 3T85A 4E4AA 3P3HA 1RZBA 1H9NA 4HT0A 4JSSA 4YGLA 3RZ0B 3R16A 1DMYA 3N0NA 5CJFA 3DVCA 1KOQA 1G48A 3IGPA 2AX2A 1H4NA 5JQ0A 3M2XA 4Z0QA 4PYXA 4R59A 3MNJA 1TEUX 3P44A 1FR7A 1CIMA 2VVBX 2FMGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FE4 A;  1DMX A;  1AZM A;  1FLJ A;  5FNH A;  3R17 B;  5JEG B;  3M67 A;  3PJJ A;  1CCU A;  3M14 A;  4DZ7 A;  1CA2 A;  2FMZ A;  2QOA A;  1ZNC A;  1ZGF A;  2NWP A;  1YDD A;  5JDV B;  1HED A;  2HNC A;  1RZD A;  1I9N A;  3DBU A;  3MMF A;  4MDG A;  1HEA A;  4WL4 A;  5FL5 A;  2NWO A;  4RUY A;  1OKM A;  2CBE A;  4Q7V A;  1URT A;  4KAP A;  3P4V A;  4HT2 A;  1YO1 A;  1FQR A;  3K2F A;  4Q87 A;  5E2R A;  5SZ3 A;  2NNV A;  4R5A A;  3M2Z A;  1CCS A;  1KWR A;  3HKN A;  1YDC A;  4ZX0 A;  1CAY A;  4KNN A;  5DSQ A;  1CAN A;  3V3G B;  3D92 A;  1YDB A;  4N16 A;  2OSM A;  2NN7 A;  4M2U A;  4MLT A;  1XEG A;  4QJW A;  1CNK A;  1XPZ A;  4XIX A;  4K1Q A;  4QK3 A;  2IT4 A;  4UOV A;  5BNL A;  4QJM A;  3S76 A;  1HCB A;  3NJ9 A;  1OQ5 A;  4XFW A;  4IWZ A;  2NN1 A;  3S72 B;  5SZ1 A;  1UGF A;  3M2N A;  5AML A;  3V3F A;  5JGT B;  1HEB A;  4E3F A;  5EOI A;  3UYN A;  4Q07 A;  1HUG A;  1ZFK A;  3MZC A;  1CAM A;  4FPT A;  5FDI A;  1TEQ X;  5EKH A;  1YO2 A;  3KOI A;  5G01 A;  3BL1 A;  3DAZ A;  4YGK A;  3S73 B;  1G3Z A;  2CBA A; 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