3RYVB

Carbonic anhydrase complexed with n-ethyl-4-sulfamoylbenzamide
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGGHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the "hydrophobic wall" of carbonic anhydrase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 74
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3ryvB00
1YO0A 4XZ5A 1YO2A 1OKNA 4FPTA 1CAMA 4JSZA 1HCAA 1I9LA 4YGFA 4Q09A 3HFPA 3MMFA 1ZSCA 4YHAA 1YDDA 5FNGA 3M5SA 1XPZA 5EH5A 3M2ZA 3M1WA 4QSBA 4YX4A 1HUGA 5JG3B 3RZ1B 2ILIA 1TTMA 4MO8A 5JEPB 5DSQA 5DSOA 3JXHC 4ZX1A 1BV3A 4G7AA 3D92A 4YXIA 1URTA 4LU3A 1I8ZA 1AZMA 2HL4A 3RYVB 3N2PA 2VVBX 5FLTA 4Q87A 3FE4A 1V9IC 4QJOA 1G0EA 5E5RA 5E2NA 3V2JA 2NMXA 4Q7VA 1G1DA 1HEAA 1EOUA 3OYSA 4FVOA 1CNXA 4R59A 1CANA 1CVBA 1KOQA 2AX2A 5FDIA 5EH8A 3DVCA 4IWZA 2WEGA 3V2MA 3U3AX 5FLOA 4CQ0A 4RFCA 5J8ZA 4QJ0A 3S76A 1FQLA 1G3ZA 1OQ5A 3DCWA 3JXFA 3TMJA 5EOIA 3ML2A 2F14A 3M98A 4KNJA 4WR7A 5C8IA 5A6HA 2CABA 4Q83A 1CNIA 1OKMA 5FL6A 1TG9A 3P44A 4Q49A 5JEGB 2Q1BA 4KP5A 2AW1A 5IPZA 1CVAA 3U7CA 3V3HB 3IBIA 5E2RA 3MHLA 1Z9YA 4KNMA 4XFWA 5L3OA 3S77B 3SAXA 3RZ8A 2X7UA 4KNNA 3VBDA 5E2MA 3KOIA 1CRAA 1ZSBA 2FMGA 1I9MA 5DSIA 3L14A 3DA2A 4FL7A 3B1BA 1CA2A 1HUHA 4QK3A 1G6VA 4QJWA 4RN4A 2POUA 5JG5B 3DD8A 1RZBA 4Q99A 4RUYA 3M1KA 4QSJA 3UYQA 3RZ5A 1RZAA 2CBEA 3MHIA 5DSMA 5FNHA 2NNGA 4KUVA 4YWPA 8CA2A 1CAZA 3U45X 3S74B 3MHOA 1UGDA 3BL0A 1A42A 3D0NA 4ILXA 3KIGA 5E2KA 3F8EA 4CA2A 3V7XA 3W6HA 4MDGA 3P3HA 3T5ZA 3HS4A 4HF3A 3KOKA 3EFIA 3RYYA 1FQMA 1H9QA 3P58A 1T9NA 2FOUA 5SZ1A 3TVNX 2EU3A 1CNWA 4WUPA 1CINA 3P5AA 5SZ4A 3MNHA 3M1JA 1RZCA 3BETA 3R16A 4Q08A 3MZCA 3DCCA 3MNJA 4K0ZA 1FSQA 3U47A 3V3GB 4TWMA 3P3JA 4QJMA 1TE3X 4E3GA 3MNAA 5JDVB 3S73B 4ITPA 1ZH9A 3OYQA 4JS6A 5FNMA 5DSKA 2HOCA 1BCDA 3CZVA 3JXGA 4L5WA 2H15A 2HFWA 3HKTA 4Q8ZA 3M1QA 2FOSA 2CBCA 5G0BA 3M2NA 2ZNCA 3CYUA 2FOVA 4KAPA 4K0TA 4N0XB 1FR7A 4Z1JA 4E3FA 4Q6DA 5AMLA 3OIKA 4WW8A 2FOQA 4Y0JA 2NXSA 4PXXA 3BL1A 4ZX0A 1AVNA 4KV0A 4YYTA 3T5UA 4YXUA 5CACA 1I9QA 1LG6A 3C7PA 1FSRA 3CAJA 3KWAA 3D9ZA 4Q06A 5SZ6A 4HEWA 4Q81A 5CJFA 1RJ5A 4LP6A 4QJXA 4K0SA 3DC9A 3EFTA 5JESB 3RLDA 5CLUA 2OSFA 5L6KA 2GD8A 5FDCA 4M2VA 1ZSAA 3P5LA 4WL4A 3P55A 3RG3A 3IAIA 2ABEA 4HEYA 3T84A 4L5UA 4ZAOA 3HKQA 5G0CA 5HPJA 4WW6A 3MDZA 4CNRA 1I91A 3KNEA 3N4BA 4MDLA 4RUZA 1BN4A 1YDAA 2HD6A 2QOAA 5FNIA 1RAYA 3UYNA 1CNBA 3NB5A 5DOHA 2FNNA 4QK2A 1Z93A 1CVFA 4RIUA 5BRVA 4Q90A 3PYKA 4HT0A 3GZ0A 1CNGA 1IF6A 1J9WA 1XEVA 2WD3A 3M5EA 2FNKA 1XEGA 3IBUA 2FOYA 3MHCA 2HNCA 1CZMA 2POWA 3IBLA 2EZ7A 4QIYA 1BZMA 1JV0A 1MOOA 4Q7PA 4QIZA 3B4FA 2WEJA 4CNXA 1KEQA 1KWQA 1CAJA 4UOVA 4E4AA 6CA2A 1H4NA 1CRMA 1FLJA 4CNWA 5SZ0A 4PQ7A 1LGDA 2NXRA 3HLJA 4XIXA 1G52A 2NN7A 1FR4A 1CCUA 3T83A 1BNMA 3DVDA 1BNQA 4Z0QA 4TWLA 3OKUA 4K13A 3QYKA 3RZ7A 1UGAA 4C3TA 1I90A 3S71B 4Z1EA 1LZVA 3SAPA 4E3DA 3SBIA 3S8XA 1TG3A 2GEHA 5EHVA 5EKMA 4LHIA 5FL4A 4GL1X 1KWRA 2NNOA 5DSNA 1BNUA 3FW3A 3M40A 5G03A 2NWOA 3S9TA 2QP6A 4QK1A 2OSMA 2CA2A 4BF6A 3NJ9A 1HEDA 3DD0A 4XE1A 3DCSA 3V5GA 3ML5A 1G45A 2CBAA 5DSJA 2HKKA 1IF5A 5EH7A 1CAHA 4YGKA 4Z1KA 1G4JA 4Z1NA 2CBBA 1IF8A 1CVCA 1DCBA 4ITOA 1RJ6A 1ZFKA 3K7KA 4KUYA 3IGPA 3IEOA 1BNWA 5G01A 4PYYA 2W2JA 5JQ0A 5BRUA 2NWPA 4DZ7A 1IF7A 5FNLA 3FFPX 4Q8XA 1FQNA 5LMDA 1LG5A 4XIWA 1I9PA 4QY3A 2NN1A 1CALA 3RGEA 1G0FA 3KLDB 4Q8YA 7CA2A 4YGNA 2Q1QA 1CAOA 1CNJA 1DMYA 4JSAA 3M3XA 3MNIA 1CNCA 4HU1A 3DBUA 1DMXA 4QEFA 5DSPA 3S97A 5DRSA 4Q9YA 5EHEA 5FLQA 1MUAA 4HBAA 2NXTA 3HKUA 4FIKA 4WUQA 2WD2A 2O4ZA 1G48A 2FW4A 3DV7A 1OKLA 1THKA 1TEQX 2NWYA 1CCSA 3MNKA 4JSSA 5JEHB 2NNVA 5EKHA 3V3IB 2FNMA 1TB0X 3NI5A 3S72B 2POVA 3K34A 1IF9A 3OY0A 5EHWA 3F7BA 5E5UA 2CBDA 4MLTA 4QSAA 5DSRA 3M2XA 3S75B 1CCTA 4YXOA 1ZNCA 4ZWZA 4Q78A 1IF4A 4Q07A 1CNYA 4COQA 5JGTB 5EIJA 3LXEA 1Z97A 4G0CA 4M2WA 3Q31A 4Q6EA 4FU5A 2H4NA 4Q7WA 3M5TA 4QTLA 4CNVA 2WEOA 4CACA 4IDRX 4RH2A 1UGFA 3SBHA 2Q38A 1G4OA 4E5QA 3P4VA 3M96A 5JQTA 4ETQC 1LUGA 3DAZA 1BN3A 4RUXA 5AMDA 2FMZA 1YDBA 4Q0LA 1UGEA 4ZWXA 3RJ7A 4BF1A 1BN1A 1ZGEA 9CA2A 3D8WA 1CILA 4N16A 4YGLA 4E49A 1I9OA 4HT2A 3PO6A 2VVAX 3RYXB 3T82A 1CAIA 3D93A 5FL5A 5CA2A 4R5BA 2X7SA 1RAZA 4R5AA 3MNUA 5SZ2A 3R17B 3KONA 1UGCA 3OIMA 3K2FA 2QO8A 4PYXA 5BRWA 3CA2A 3RYZA 3V3JA 3DVBA 3F7UA 2IT4A 4M2RA 1CVEA 3MYQA 4MTYA 3T85A 5EZTX 3IBNA 3KKXA 1XQ0A 4MDMA 1FSNA 1AM6A 4JSWA 1UGGA 4KP8A 1G53A 4HEZA 5SZ3A 12CAA 3KS3A 1YO1A 4FRCA 1CVHA 3W6IA 4KUWA 1V9EA 1CA3A 3F4XA 3S78B 4MLXA 3V3FA 1YDCA 3OKVA 1CAYA 5FLSA 5A25A 4ZWYA 5DOGA 1ZE8A 3ZNCA 3RG4A 4RFDA 3N3JA 3DC3A 1FQRA 1Y7WA 3M67A 2WEHA 4Q7SA 5BNLA 1ZFQA 5SZ5A 4QSIA 4QJPA 4M2UA 5FLRA 3MWOA 4FVNA 3HKNA 4ZWIA 1G54A 3OILA 1H9NA 4BCWA 4YVYA 1CNHA 3N0NA 4RIVA 5JGSB 5FNJA 1G46A 1TBTX 1TEUX 2EU2A 2NNSA 3ZP9A 5AMGA 1JD0A 2X7TA 1TH9A 1HVAA 4PZHA 1HEBA 1RZDA 1KOPA 1CAKA 1DCAA 2NWZA 5EKJA 5E28A 4K1QA 1BNVA 5DVXA 5FNKA 1CNKA 1HCBA 1CIMA 1F2WA 5E2SA 4L5VA 1BNNA 5DSLA 1RZEA 4DZ9A 3M2YA 1UGBA 1CVDA 4E3HA 1BNTA 3RYJB 3RZ0B 4YGJA 5SZ7A 3M04A 3M14A 4KNIA 1JCZA 4X5SA 5BYIA 1I9NA 3TVOX 5FLPA 3PJJA 1BICA 4E9OX 1ZGFA 1HECA 3MHMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YO0 A;  4XZ5 A;  1YO2 A;  1OKN A;  4FPT A;  1CAM A;  4JSZ A;  1HCA A;  1I9L A;  4YGF A;  4Q09 A;  3HFP A;  3MMF A;  1ZSC A;  4YHA A;  1YDD A;  5FNG A;  3M5S A;  1XPZ A;  5EH5 A;  3M2Z A;  3M1W A;  4QSB A;  4YX4 A;  1HUG A;  5JG3 B;  3RZ1 B;  2ILI A;  1TTM A;  4MO8 A;  5JEP B;  5DSQ A;  5DSO A;  3JXH C;  4ZX1 A;  1BV3 A;  4G7A A;  3D92 A;  4YXI A;  1URT A;  4LU3 A;  1I8Z A;  1AZM A;  2HL4 A;  3RYV B;  3N2P A;  2VVB X;  5FLT A;  4Q87 A;  3FE4 A;  1V9I C;  4QJO A;  1G0E A;  5E5R A;  5E2N A;  3V2J A;  2NMX A;  4Q7V A;  1G1D A;  1HEA A;  1EOU A;  3OYS A;  4FVO A;  1CNX A;  4R59 A;  1CAN A;  1CVB A;  1KOQ A;  2AX2 A;  5FDI A;  5EH8 A;  3DVC A;  4IWZ A;  2WEG A;  3V2M A;  3U3A X;  5FLO A;  4CQ0 A;  4RFC A;  5J8Z A;  4QJ0 A;  3S76 A;  1FQL A;  1G3Z A;  1OQ5 A;  3DCW A;  3JXF A;  3TMJ A;  5EOI A;  3ML2 A;  2F14 A;  3M98 A;  4KNJ A;  4WR7 A;  5C8I A;  5A6H A;  2CAB A;  4Q83 A;  1CNI A;  1OKM A;  5FL6 A;  1TG9 A;  3P44 A;  4Q49 A;  5JEG B;  2Q1B A;  4KP5 A;  2AW1 A;  5IPZ A;  1CVA A;  3U7C A;  3V3H B; 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