3RYXB

Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the hydrophobic wall of carbonic anhydrase
Total Genus 74

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H1 (13-18)EMPTY3H2 (21-24)TIV10 (241-244)AH1 (131-135)TIV3 (25-28)O1 (204-206)TIV11 (251-254)S1 (32-33)S8 (108-109)TI2 (34-37)S2 (39-40)TI4 (41-44)S6 (78-82)S3 (46-50)TIV6 (75-78)TI5 (51-54)S10 (116-124)S5 (66-70)S4 (56-61)3H5 (164-166)AH3 (220-227)TIV4 (62-65)TIV5 (72-75)S7 (87-97)TVIII1 (98-101)TI6 (100-103)TIV7 (105-108)S9 (112-113)S13 (191-196)TIV8 (108-111)S11 (141-150)TI7 (137-140)TVIa1 (200-203)S14 (207-212)3H6 (181-184)AH2 (158-163)TII2 (233-236)TII1 (169-172)S12 (172-178)TIV9 (176-179)S15 (216-218)TIV2 (18-21)3H3 (125-128)3H4 (155-157)TI1 (8-11)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the "hydrophobic wall" of carbonic anhydrase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3ryxB00
4ZWIA 1ZNCA 4K0TA 3D0NA 3HS4A 4Q81A 5FNKA 3D9ZA 3MDZA 3SAXA 2CA2A 4FIKA 4QJOA 1BNUA 3RZ8A 4CA2A 4Q8XA 4ZAOA 1HEDA 5JEHB 5FLOA 1XQ0A 3S75B 1DMYA 1KWRA 1UGCA 4Q87A 2QP6A 2QOAA 2ABEA 2VVAX 5EHWA 2EZ7A 1I9NA 4QSAA 2FNNA 2GD8A 4FRCA 5BNLA 3OIMA 5E28A 2IT4A 1RZCA 2NN1A 4Q8YA 1CNWA 5JQTA 2HKKA 4WUPA 2AX2A 2FOSA 3CYUA 3RG4A 3P55A 5JDVB 1JD0A 3S9TA 1ZFQA 3IBNA 3V3FA 1CAHA 4ILXA 5JGTB 1IF5A 5FNGA 3DCCA 4Q09A 1CNYA 1THKA 3NJ9A 3U47A 1I9PA 3F8EA 3RJ7A 3MZCA 2Q1QA 2CBCA 6CA2A 4WUQA 4HT2A 3R17B 5BYIA 1H9NA 1UGBA 4YGNA 3KS3A 3U3AX 5JG5B 1LZVA 3M1QA 5JQ0A 3JXGA 4E3FA 3NB5A 2NWZA 2NXRA 5FLQA 1HECA 1FSQA 1BICA 2NN7A 5DSOA 4TWMA 1CCUA 1FQNA 3GZ0A 1Z97A 4KUYA 1Y7WA 4HEZA 4CNRA 2NNOA 2GEHA 3V2MA 1CCTA 1CZMA 2CBBA 3S78B 1XEVA 2FOUA 5EKJA 2NXSA 3ML5A 5SZ2A 1BN4A 3DD8A 3S76A 1RZEA 5FNHA 1CVAA 5FNJA 4YYTA 3D93A 3S8XA 4TWLA 4KUWA 1G52A 3W6IA 1HEBA 3MHIA 2FW4A 4QK3A 3MNAA 4Q7VA 4LP6A 2HFWA 5JG3B 3DCWA 2CBAA 1CINA 5AMLA 12CAA 1TB0X 3S74B 1JV0A 4MLXA 1LG6A 1I90A 1CVDA 4L5VA 1CAIA 2WEOA 3OYSA 3P58A 4Q8ZA 4GL1X 4CQ0A 4YWPA 3IBIA 3M2ZA 4E3DA 3KOKA 3OILA 5CJFA 4MDLA 3M98A 2POVA 4YXOA 4KV0A 1CAZA 4RUXA 2FOVA 5FLPA 3T82A 4YX4A 3P5AA 3DVBA 4MLTA 4YGFA 2WD3A 1TBTX 2FNMA 3MNHA 1CVBA 5SZ0A 4Q7WA 5DSPA 1LG5A 3M2NA 4HU1A 3F7UA 5EZTX 3TMJA 4QSJA 1I91A 5AMGA 4Z1NA 3CAJA 1CIMA 3KOIA 5A25A 1BCDA 1UGEA 4RN4A 1CNKA 1T9NA 1I9QA 1KOQA 2W2JA 4RUZA 3CZVA 3KNEA 4ZWZA 4DZ7A 3RYVB 1TG3A 3HKTA 5E2MA 3RZ7A 3MHLA 1RAYA 4HF3A 4QEFA 4JSZA 3T85A 3RYZA 3V3HB 1CNHA 2F14A 4IWZA 1FR7A 1YDAA 3LXEA 4PXXA 4YXUA 3MNKA 8CA2A 2WEHA 4PYXA 1CAYA 3V3GB 1CVEA 1YDCA 1FSRA 1H4NA 5DSNA 1IF8A 4Y0JA 1CCSA 1HEAA 5DSKA 2Q1BA 1DCBA 2X7TA 5SZ6A 2NWOA 1JCZA 3MNIA 4X5SA 4QK1A 4CNWA 3B1BA 4FL7A 5CA2A 1CNJA 5SZ1A 3RZ5A 4Q9YA 5E5UA 3IBUA 1CA2A 1Z9YA 2WEJA 3M2XA 1G54A 4E5QA 4BF1A 1RAZA 4R5AA 1EOUA 4PQ7A 1OQ5A 3S97A 1J9WA 3MWOA 3TVNX 5EHEA 3UYNA 1ZH9A 4KNIA 3DD0A 4MTYA 1HCAA 4CACA 3TVOX 3V7XA 2X7UA 5FNIA 3IEOA 1RJ5A 4FVNA 3M1WA 1I9OA 4M2VA 1MOOA 4Q6EA 1FLJA 4ITPA 4HBAA 3RGEA 3EFIA 4PZHA 4QJMA 1I9LA 4QJWA 4FVOA 1TEQX 1DMXA 1I9MA 3MHMA 1CVFA 1G48A 1YO1A 3RZ0B 3M5TA 1ZSCA 5EOIA 1FQLA 3N2PA 4QIZA 3NI5A 4ITOA 3VBDA 4WW8A 3F4XA 4RIVA 2AW1A 1CA3A 4WL4A 3SBIA 3MHCA 1V9IC 2H15A 3S77B 4CNXA 4Q7SA 3OY0A 3CA2A 1ZSAA 3M1KA 3P5LA 3KONA 4XIXA 3FFPX 3KIGA 2NNSA 3UYQA 1G4OA 3M96A 2NNVA 3IBLA 4QTLA 2EU2A 1BNVA 1IF9A 3K7KA 1YO0A 5E5RA 3B4FA 3V3IB 2NXTA 3MNJA 2VVBX 3HKQA 3P3JA 1BNQA 4Z1JA 3N0NA 5DOGA 5J8ZA 4BCWA 1IF4A 2NNGA 1YDBA 1CNIA 1BNWA 3U7CA 4YGKA 1G0EA 4YHAA 2Q38A 3S73B 1Z93A 3EFTA 3DVCA 4Q49A 3U45X 4JS6A 5FLRA 2NMXA 4KNMA 1CAMA 5SZ4A 3S71B 2CABA 1HCBA 4E9OX 1FQRA 3K34A 2HOCA 3M5SA 1YO2A 3P44A 4MDGA 4KNNA 3ML2A 3DBUA 1ZGEA 4Q08A 3V3JA 1UGAA 1V9EA 2NWYA 1CALA 1BN1A 2OSMA 5EHVA 3HLJA 4E3GA 1ZSBA 1UGDA 5BRWA 3OYQA 1RZAA 4R5BA 3V2JA 1BNNA 4K0SA 3BETA 5FLTA 1HUHA 3KWAA 3S72B 1DCAA 1TTMA 5BRVA 4JSWA 4N16A 5SZ7A 1G53A 4Q83A 1CANA 3JXFA 5JESB 3HKNA 4ZWYA 1ZFKA 3D92A 1IF6A 2FOYA 1FQMA 1HUGA 5EH8A 2POWA 2FMZA 5SZ3A 5E2NA 4E3HA 4Q99A 2HD6A 1CILA 4QJ0A 3MHOA 3PO6A 1CNXA 4Q6DA 4M2UA 4PYYA 4R59A 5DSIA 1G0FA 3MNUA 3FE4A 4WR7A 3KKXA 4HT0A 1CAOA 5G03A 4Z0QA 2HNCA 2OSFA 3RYXB 5JGSB 2ZNCA 3T5ZA 4DZ9A 4RFDA 2NWPA 4K1QA 1F2WA 1BNTA 3JXHC 5IPZA 1KOPA 1CNBA 4M2WA 3IAIA 4K0ZA 4N0XB 4YGLA 4KP8A 3BL0A 1URTA 5EKHA 4YXIA 4RFCA 5C8IA 3OKUA 1TG9A 2WD2A 5E2SA 4C3TA 4BF6A 4MDMA 5LMDA 3Q31A 1LUGA 3PJJA 3RLDA 4XIWA 4Q90A 4YGJA 5FNMA 5DSJA 1CAKA 5FDIA 3R16A 4Z1EA 4FPTA 4Q0LA 4RH2A 4HEYA 1CRMA 4KUVA 1BZMA 4MO8A 1KWQA 1I8ZA 3HFPA 1RZBA 3DC3A 4UOVA 1TEUX 5FL5A 4E49A 4LU3A 3BL1A 3P3HA 4XE1A 3T83A 4ZX0A 5DSLA 3DCSA 3C7PA 3M2YA 2O4ZA 2FOQA 5E2KA 3T5UA 1OKMA 4Q78A 2X7SA 3DA2A 4RIUA 2H4NA 3W6HA 4WW6A 2CBDA 1XEGA 1BV3A 4L5WA 3DV7A 5FL4A 4G0CA 3KLDB 3RG3A 4HEWA 3N4BA 1XPZA 7CA2A 3SAPA 1A42A 5BRUA 5DRSA 3RZ1B 1KEQA 4QY3A 5CLUA 4Q07A 2EU3A 3OIKA 5DSMA 1G4JA 4G7AA 4CNVA 5EH7A 4K13A 2FMGA 4YVYA 2WEGA 4LHIA 5DOHA 3PYKA 5FLSA 4COQA 4Q7PA 4RUYA 1UGFA 5SZ5A 1ZE8A 3IGPA 3RYYA 1AVNA 4ZWXA 3HKUA 3P4VA 4Z1KA 1AZMA 3D8WA 4ETQC 5L6KA 3ZP9A 4KP5A 5FDCA 1OKLA 4KNJA 4QK2A 1TE3X 1LGDA 5EH5A 3FW3A 4XFWA 9CA2A 1G1DA 5FNLA 5EKMA 3QYKA 4M2RA 1CVHA 5E2RA 1ZGFA 1MUAA 3M04A 3M40A 5JEPB 5AMDA 2HL4A 3F7BA 3OKVA 3M1JA 3ZNCA 1BNMA 2POUA 4XZ5A 5HPJA 4QSBA 4QSIA 3N3JA 3SBHA 3V5GA 3L14A 4QIYA 1G45A 1OKNA 1CNGA 4E4AA 1G6VA 5G0CA 1CNCA 5FL6A 3T84A 5CACA 4L5UA 4JSSA 1RZDA 5G01A 5G0BA 5DVXA 1YDDA 4ZX1A 3DAZA 1CRAA 1RJ6A 3K2FA 4QJXA 1FR4A 3MYQA 1FSNA 1CVCA 1UGGA 5DSQA 1HVAA 4IDRX 4JSAA 4KAPA 1G46A 2QO8A 3DVDA 1AM6A 2FNKA 1H9QA 1CAJA 5A6HA 2ILIA 5DSRA 3M5EA 5L3OA 2CBEA 5EIJA 4FU5A 3MMFA 3M67A 5JEGB 1IF7A 4Q06A 1G3ZA 1TH9A 3M14A 3DC9A 3RYJB 4QJPA 3M3XA 1BN3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4ZWI A;  1ZNC A;  4K0T A;  3D0N A;  3HS4 A;  4Q81 A;  5FNK A;  3D9Z A;  3MDZ A;  3SAX A;  2CA2 A;  4FIK A;  4QJO A;  1BNU A;  3RZ8 A;  4CA2 A;  4Q8X A;  4ZAO A;  1HED A;  5JEH B;  5FLO A;  1XQ0 A;  3S75 B;  1DMY A;  1KWR A;  1UGC A;  4Q87 A;  2QP6 A;  2QOA A;  2ABE A;  2VVA X;  5EHW A;  2EZ7 A;  1I9N A;  4QSA A;  2FNN A;  2GD8 A;  4FRC A;  5BNL A;  3OIM A;  5E28 A;  2IT4 A;  1RZC A;  2NN1 A;  4Q8Y A;  1CNW A;  5JQT A;  2HKK A;  4WUP A;  2AX2 A;  2FOS A;  3CYU A;  3RG4 A;  3P55 A;  5JDV B;  1JD0 A;  3S9T A;  1ZFQ A;  3IBN A;  3V3F A;  1CAH A;  4ILX A;  5JGT B;  1IF5 A;  5FNG A;  3DCC A;  4Q09 A;  1CNY A;  1THK A;  3NJ9 A;  3U47 A;  1I9P A;  3F8E A;  3RJ7 A;  3MZC A;  2Q1Q A;  2CBC A;  6CA2 A;  4WUQ A;  4HT2 A;  3R17 B;  5BYI A;  1H9N A;  1UGB A;  4YGN A;  3KS3 A;  3U3A X;  5JG5 B;  1LZV A;  3M1Q A;  5JQ0 A;  3JXG A;  4E3F A;  3NB5 A;  2NWZ A;  2NXR A;  5FLQ A;  1HEC A;  1FSQ A;  1BIC A;  2NN7 A;  5DSO A;  4TWM A;  1CCU A;  1FQN A;  3GZ0 A;  1Z97 A;  4KUY A;  1Y7W A;  4HEZ A;  4CNR A;  2NNO A; 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