3RZ5A

Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the hydrophobic wall of carbonic anhydrase
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the "hydrophobic wall" of carbonic anhydrase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3rz5A00
2FNMA 5FL5A 3RJ7A 5DSRA 2Q38A 1LG5A 4R59A 4C3TA 4BF6A 2NNSA 3P4VA 4ZAOA 4XFWA 5FLSA 1YO0A 1CAKA 4DZ7A 3NJ9A 3MNIA 1UGCA 3M2XA 4Q8YA 1KOQA 1CALA 3D0NA 3HKUA 1CVHA 2Q1QA 3M3XA 3CAJA 2HOCA 3HS4A 2EZ7A 5FDCA 2H4NA 3V2JA 1G0EA 2NXRA 1CNIA 1Z97A 3S9TA 5CA2A 5JG5B 4Q9YA 3RZ8A 3OKVA 3KLDB 3S76A 5SZ1A 3M1QA 5E2NA 4XIXA 4FVNA 1RAYA 5A25A 4HEYA 4L5WA 4X5SA 4Z0QA 5IPZA 4Q83A 3MNHA 4R5AA 4Y0JA 3N0NA 1HUHA 1AM6A 4K0SA 5DSJA 3ZP9A 1ZFQA 3RZ5A 4QK2A 4ILXA 4ZWIA 2WEHA 3M40A 3T85A 1HECA 3IBIA 4RFCA 4Q0LA 2CBBA 1JD0A 4KV0A 1TH9A 3HLJA 1UGEA 3OIMA 4CQ0A 1G46A 1HEDA 3DVDA 2F14A 4Z1EA 4RFDA 2ILIA 1FLJA 1CNKA 2NWOA 4FIKA 2WD3A 5EZTX 3L14A 3M98A 5FLRA 5FLQA 3T82A 1V9EA 1FQNA 3MNJA 5FNHA 1CVBA 4MLXA 1I9OA 3NI5A 1RZDA 12CAA 3S73B 4RN4A 2FOSA 5FLTA 4LU3A 5FNLA 1IF8A 3SAPA 2FOYA 3RZ0B 1CA2A 1XEGA 1CNWA 4HT2A 4BF1A 1UGFA 4QSAA 3T84A 1LZVA 5E28A 2FNKA 1OKLA 3B1BA 4ITPA 4HBAA 1XPZA 3W6HA 1ZFKA 3MWOA 2WD2A 1KEQA 1UGAA 4IDRX 5BRUA 4YGKA 4K0TA 4KAPA 5JDVB 3M2ZA 3M1JA 1TEUX 3CA2A 3BL1A 3Q31A 3MHOA 1TB0X 3P58A 2POWA 4QJOA 2NXSA 5EHVA 3V3IB 3M04A 4KUVA 3LXEA 1I9NA 3RGEA 4WUQA 3JXHC 4QTLA 1KWQA 4HEZA 3DBUA 5JEGB 4L5VA 2GEHA 3P5AA 3DC9A 3K7KA 5E5RA 1YDCA 3U3AX 4R5BA 5EIJA 1BNVA 4Q8ZA 5FNJA 5DSQA 1HEBA 3S75B 5DVXA 2CABA 5E2MA 2VVAX 2GD8A 2NN7A 2NWYA 1IF9A 4Q6EA 5SZ4A 5FNGA 2NNGA 1YO2A 3CYUA 3DC3A 2FNNA 3P3JA 3SBIA 2HNCA 3FE4A 4YGLA 2NMXA 4QJMA 4JSWA 3V5GA 2CA2A 3EFTA 5G0BA 5G01A 1ZSBA 2NWZA 1CVCA 4CA2A 4TWMA 3PO6A 1MOOA 3C7PA 3RYVB 5JEPB 4FPTA 4PXXA 1ZGEA 4RUZA 4Q90A 1RJ5A 1TEQX 3P3HA 1G54A 4GL1X 4Z1NA 1HUGA 1CAIA 5EOIA 4K0ZA 3K34A 3MNKA 3JXGA 5DOHA 4QSIA 1IF5A 1G45A 4ZX1A 1CRMA 4YGFA 1G4JA 2QO8A 3KIGA 3KKXA 4E5QA 1CNHA 4YVYA 3IGPA 1G4OA 4LHIA 2EU3A 3M5EA 3OYQA 1FQMA 4HF3A 4WR7A 2OSFA 2POUA 1CCTA 3M5TA 2FOQA 1CCUA 1CNXA 1G3ZA 4JSSA 1BV3A 5BRWA 5E2KA 4QJ0A 3HFPA 1Z93A 1CINA 3M5SA 4KNJA 3B4FA 3ZNCA 3PJJA 4RUXA 3MHMA 4MLTA 4YHAA 4YGNA 1BNUA 1FR4A 3N4BA 1H4NA 2X7TA 3DCWA 3F8EA 5AMDA 2POVA 4ZWYA 1V9IC 5DSOA 1OKMA 1ZSAA 3SAXA 4Z1JA 4FU5A 4BCWA 1I9MA 4PZHA 3IBNA 9CA2A 2ABEA 3JXFA 1CAHA 3MHCA 1BN1A 4QSBA 5DRSA 3VBDA 3CZVA 1CVAA 3S97A 3S72B 5L6KA 5BYIA 4Q78A 4JSZA 4L5UA 3S71B 4CNRA 2QOAA 4Q08A 2X7SA 1RJ6A 3GZ0A 4KUWA 4PYYA 2Q1BA 4WW8A 1YDBA 1AZMA 4CNWA 1Z9YA 3UYQA 4MDLA 4E3DA 4QSJA 2AX2A 4KP8A 1FSRA 1BZMA 1TG9A 3U47A 4Q99A 3D93A 4Z1KA 1JCZA 3F7BA 2FMGA 2WEGA 4WW6A 1G1DA 3KOIA 3OY0A 1MUAA 3MNAA 1RAZA 4MDMA 1CNYA 2FOVA 3M67A 4Q8XA 2WEOA 5EKMA 1G52A 1HCBA 1I90A 1G53A 2CBAA 4M2RA 2H15A 5JG3B 3RZ7A 1CNBA 1OKNA 4QIZA 2NXTA 5EKJA 4PQ7A 1XQ0A 3DCCA 1CAOA 1TBTX 1H9QA 1G6VA 5FL6A 1LG6A 4YXIA 3MNUA 3RZ1B 3DCSA 5SZ6A 1FSNA 4ETQC 4E9OX 3IBLA 4Q7VA 4G7AA 1KWRA 1CAZA 1CNGA 3OILA 3OKUA 4TWLA 5JEHB 4ZWZA 4WUPA 1IF6A 3MYQA 3DD0A 2CBCA 3DVBA 1CVFA 5LMDA 4E49A 1EOUA 5E2SA 3T83A 1I9PA 3S77B 2OSMA 3N3JA 3RG3A 5SZ0A 4Q09A 1XEVA 1BNMA 1HCAA 2WEJA 2QP6A 4YXOA 1TTMA 5EH5A 5SZ3A 3W6IA 4N16A 1IF4A 3M2YA 5L3OA 3DV7A 3R16A 1JV0A 2CBEA 4UOVA 5HPJA 1G0FA 3F7UA 5DSPA 3KOKA 4JSAA 4ITOA 5SZ2A 2NWPA 1CA3A 4QJPA 4KNMA 3UYNA 4Q7PA 3V3HB 2O4ZA 5JQ0A 1ZSCA 5EHEA 3DA2A 5EH8A 1THKA 4WL4A 1CNJA 1RZCA 1CANA 3F4XA 1YDAA 1DMXA 3EFIA 5EKHA 4N0XB 4FL7A 5BNLA 3TVOX 1FQLA 4Q7SA 1FR7A 5FNMA 3SBHA 4QJWA 2EU2A 2HKKA 1T9NA 1OQ5A 3IAIA 5FNKA 3PYKA 4ZWXA 4YXUA 1Y7WA 4K1QA 1CAMA 1UGBA 2FOUA 1IF7A 4Q07A 5FNIA 4IWZA 3HKTA 3KONA 3M1WA 4E3HA 1RZEA 5CLUA 1LGDA 3V2MA 3RYZA 4Q6DA 2AW1A 3T5UA 1LUGA 4CNVA 4YX4A 5JGSB 3KWAA 4Q49A 7CA2A 3KNEA 3QYKA 4K13A 3BL0A 5AMLA 5EHWA 4M2UA 4HU1A 3P5LA 3T5ZA 4MO8A 4XE1A 5FL4A 1I8ZA 3D9ZA 4Q81A 5DSLA 1BNTA 3DVCA 3DAZA 3FW3A 5G0CA 1DMYA 1FSQA 3V3JA 2W2JA 1G48A 4XZ5A 5DSMA 4HEWA 3MHIA 4CNXA 4PYXA 5JQTA 1DCBA 4MDGA 4G0CA 1RZAA 5FDIA 1CZMA 3V3FA 1ZGFA 3RG4A 2X7UA 5JGTB 1BNWA 4FVOA 2HFWA 5SZ7A 2NNVA 3S8XA 4YYTA 5EH7A 4Q06A 3R17B 5DSKA 3ML5A 1ZH9A 3RYXB 3TMJA 1CNCA 1KOPA 1H9NA 5E5UA 2ZNCA 4E4AA 1BNNA 5G03A 1DCAA 5C8IA 1BICA 2HD6A 1BCDA 1CRAA 3HKQA 5FLOA 1AVNA 1HVAA 1I9LA 1CILA 1UGDA 1RZBA 5AMGA 3S78B 3V3GB 3D8WA 4M2WA 3HKNA 1CAJA 1HEAA 4KUYA 2CBDA 2FW4A 1J9WA 1BN3A 5J8ZA 1CIMA 3V7XA 3MZCA 8CA2A 5SZ5A 4Q87A 3MDZA 4FRCA 3M14A 4LP6A 2VVBX 3MMFA 5DSNA 3TVNX 1A42A 3OYSA 1BN4A 1I9QA 4COQA 3U45X 1YO1A 4QK3A 5DSIA 4JS6A 4MTYA 3FFPX 4ZX0A 1CAYA 3RLDA 4RUYA 3N2PA 2NN1A 4KP5A 3P44A 1TE3X 5E2RA 3RYJB 3U7CA 1CCSA 4HT0A 1F2WA 4QY3A 4KNIA 3ML2A 2NNOA 5A6HA 4DZ9A 5JESB 1BNQA 1CVDA 3M1KA 3M2NA 3MHLA 1ZNCA 1URTA 5DOGA 3S74B 4M2VA 5FLPA 1UGGA 4Q7WA 1CVEA 4RIVA 1ZE8A 1YDDA 3M96A 4KNNA 4YGJA 3OIKA 5BRVA 4RIUA 3DD8A 4XIWA 4YWPA 5CACA 4QIYA 1TG3A 1FQRA 2IT4A 1I91A 3P55A 5CJFA 4QEFA 3BETA 3D92A 4CACA 4QJXA 6CA2A 4E3GA 2FMZA 4E3FA 3NB5A 4QK1A 4RH2A 3IBUA 3KS3A 2HL4A 3IEOA 3RYYA 3K2FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FNM A;  5FL5 A;  3RJ7 A;  5DSR A;  2Q38 A;  1LG5 A;  4R59 A;  4C3T A;  4BF6 A;  2NNS A;  3P4V A;  4ZAO A;  4XFW A;  5FLS A;  1YO0 A;  1CAK A;  4DZ7 A;  3NJ9 A;  3MNI A;  1UGC A;  3M2X A;  4Q8Y A;  1KOQ A;  1CAL A;  3D0N A;  3HKU A;  1CVH A;  2Q1Q A;  3M3X A;  3CAJ A;  2HOC A;  3HS4 A;  2EZ7 A;  5FDC A;  2H4N A;  3V2J A;  1G0E A;  2NXR A;  1CNI A;  1Z97 A;  3S9T A;  5CA2 A;  5JG5 B;  4Q9Y A;  3RZ8 A;  3OKV A;  3KLD B;  3S76 A;  5SZ1 A;  3M1Q A;  5E2N A;  4XIX A;  4FVN A;  1RAY A;  5A25 A;  4HEY A;  4L5W A;  4X5S A;  4Z0Q A;  5IPZ A;  4Q83 A;  3MNH A;  4R5A A;  4Y0J A;  3N0N A;  1HUH A;  1AM6 A;  4K0S A;  5DSJ A;  3ZP9 A;  1ZFQ A;  3RZ5 A;  4QK2 A;  4ILX A;  4ZWI A;  2WEH A;  3M40 A;  3T85 A;  1HEC A;  3IBI A;  4RFC A;  4Q0L A;  2CBB A;  1JD0 A;  4KV0 A;  1TH9 A;  3HLJ A;  1UGE A;  3OIM A;  4CQ0 A;  1G46 A;  1HED A;  3DVD A;  2F14 A;  4Z1E A;  4RFD A;  2ILI A;  1FLJ A;  1CNK A;  2NWO A;  4FIK A;  2WD3 A;  5EZT X;  3L14 A;  3M98 A;  5FLR A;  5FLQ A;  3T82 A;  1V9E A;  1FQN A;  3MNJ A;  5FNH A; 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