3RZ5A

Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the hydrophobic wall of carbonic anhydrase
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the "hydrophobic wall" of carbonic anhydrase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3rz5A00
5DSNA 4E3FA 4KNNA 4Q8YA 5FDIA 4QEFA 1UGGA 5AMGA 4Q7WA 3DVCA 3T84A 3TMJA 3M04A 5CA2A 5DSQA 3BETA 2EZ7A 3FFPX 1LUGA 4YXOA 3OILA 3N0NA 5CJFA 1RZAA 1ZFKA 2HL4A 3P5AA 3W6HA 2OSFA 4YGJA 4E9OX 3MNIA 3K2FA 4GL1X 1CNKA 5EH5A 4YWPA 1OKLA 3D8WA 4RUXA 5JGTB 5SZ3A 4YXIA 4M2VA 3S74B 5JG3B 1TEQX 4M2RA 3MYQA 1ZGEA 1RAYA 3M2YA 1HUHA 1CINA 5L6KA 4Q08A 4RIVA 1BNNA 4RIUA 5JQ0A 3RZ5A 5FLTA 4ILXA 4QSBA 1KWRA 4JSSA 5DOGA 5A6HA 3F4XA 2FNNA 3T83A 2X7SA 2NN1A 3U3AX 2FOQA 3DV7A 5G03A 5A25A 1G4JA 4LU3A 1CVBA 4QJMA 3RG3A 1J9WA 1XEGA 3M2ZA 1ZFQA 4Q7SA 2WEGA 4Z1EA 3V3GB 1FQLA 4WR7A 1URTA 4WUPA 4PYXA 5BRVA 2ILIA 4MTYA 4TWLA 3BL0A 3NJ9A 4FPTA 4MLTA 1EOUA 4FIKA 2FOSA 1XQ0A 5FDCA 5EH8A 2Q1BA 1CNXA 4RH2A 4KP8A 1RAZA 5EHEA 1CAZA 1FSQA 5JEGB 1KOPA 1FR7A 1F2WA 1G48A 3S72B 1G52A 4KUWA 5JDVB 5FNKA 5DSMA 4Q0LA 3MHOA 3S76A 4YGLA 5SZ0A 3CYUA 3FW3A 4YHAA 2WD3A 3K34A 4YYTA 2H15A 2X7TA 3HKQA 4ZX0A 1TE3X 1CZMA 2NXSA 4KNJA 4XE1A 3RYJB 4BCWA 1CVHA 1CVFA 3DCWA 2QP6A 5CACA 1HEBA 5SZ2A 4KNMA 1TG3A 6CA2A 4Q7VA 1OKNA 4HEZA 1CNWA 1CRMA 4KUVA 3RYZA 4HT2A 2FMGA 1G4OA 1CAJA 3T82A 1BCDA 3DD8A 3KOKA 4Q9YA 4ZWZA 2NWPA 4ZWYA 1CILA 1CNYA 4R59A 5SZ1A 3S71B 1AVNA 2CBEA 4E3GA 1LGDA 3HS4A 3IGPA 4Q6DA 5FNJA 3M98A 4E5QA 2X7UA 5G0BA 4QSJA 2Q38A 1IF9A 3KKXA 3T5ZA 1ZSBA 3MNKA 3FE4A 5SZ4A 12CAA 4Z1JA 4BF1A 1Y7WA 4R5AA 4CA2A 4KNIA 1DCAA 5EKMA 3D92A 4PZHA 4QK1A 4YXUA 3V5GA 4ZX1A 4PXXA 1G54A 3F8EA 5CLUA 4L5UA 5DSPA 2QOAA 3N3JA 4ITOA 4QSIA 1G1DA 5JESB 5E5UA 3LXEA 4HT0A 5DSRA 4CNXA 4YGKA 1Z93A 3EFTA 1FQRA 2IT4A 1CANA 1IF5A 3K7KA 4N0XB 1CVDA 3DCCA 4FVNA 1YDDA 4FU5A 3M3XA 5EH7A 5HPJA 3RZ7A 1BN3A 1BNTA 3M2XA 5DSOA 5FNLA 5G01A 5J8ZA 4QJXA 4HF3A 1RZEA 5EHWA 4QIYA 5AMDA 1UGEA 2NXRA 3M1WA 5SZ5A 1LG5A 5FLQA 4JSZA 1CVCA 1ZSCA 4E3HA 1BNQA 4YX4A 3RYVB 1IF8A 3P4VA 1G45A 4Q99A 3DVDA 2WEJA 3M5EA 5DSJA 2CBDA 3V3IB 3OY0A 2CBAA 5AMLA 3HLJA 1I9MA 3RZ0B 3RZ8A 1KEQA 1CCSA 9CA2A 3HKNA 4LP6A 1MUAA 2FOUA 4Y0JA 1FSRA 1BN4A 1UGDA 4K0TA 4MLXA 1UGAA 1I9OA 4M2WA 1CCUA 4X5SA 3RZ1B 3RG4A 5FLPA 2GEHA 3TVNX 1CA2A 3F7BA 1Z97A 4Q7PA 3ML5A 2NNSA 3M1KA 4G0CA 3M1JA 5LMDA 2VVBX 3M67A 4JSAA 3KIGA 3MNAA 4Z0QA 3P55A 2HOCA 3T5UA 1G6VA 1G0EA 1A42A 2CBCA 1JCZA 3MNHA 3M5SA 4Q87A 4PYYA 1CVEA 3KWAA 3S78B 1H9NA 4FRCA 3DA2A 4QJWA 3RGEA 3KNEA 4RN4A 3N4BA 2NNOA 4Q81A 4QY3A 2NMXA 2FNMA 4M2UA 2FOVA 5SZ6A 4KUYA 1CAYA 2CBBA 1HCBA 2HFWA 1CCTA 4L5WA 3DVBA 3Q31A 4K1QA 5DVXA 5FLSA 5EIJA 3S8XA 3V7XA 3ML2A 4MDLA 4Q06A 4CNRA 5BYIA 1HVAA 3VBDA 4Q09A 1CAIA 4WW6A 1CNGA 3RLDA 2NN7A 3QYKA 3PO6A 1THKA 3S9TA 3BL1A 4ZAOA 2AX2A 5FNHA 1HEDA 3MHMA 1I90A 4MDMA 4RFDA 3TVOX 1YO2A 2W2JA 1G46A 3M5TA 3M2NA 2OSMA 3NB5A 1LZVA 3M14A 1CAOA 3MMFA 3OKUA 4DZ9A 4QTLA 5EZTX 1ZGFA 4Q83A 2NXTA 5BRUA 1BNVA 4UOVA 5FNGA 3SBIA 3W6IA 4QIZA 5EKHA 1H4NA 1HEAA 4YVYA 3CZVA 4MO8A 1XEVA 1IF7A 3U7CA 3D9ZA 2F14A 4E4AA 5IPZA 3P3JA 2ZNCA 3UYNA 2WD2A 3CA2A 3R16A 3HFPA 3DC9A 3P44A 4FL7A 4IDRX 2WEHA 1AZMA 5C8IA 4CNVA 3UYQA 1V9EA 3SAPA 4ZWXA 4Q49A 2EU3A 3IBLA 4HEWA 3IEOA 2Q1QA 1TH9A 5EOIA 3JXFA 1LG6A 3S97A 1CAMA 3U47A 3P5LA 1CIMA 4R5BA 3S75B 1OQ5A 5JQTA 2FMZA 3RYXB 4RFCA 1BN1A 3OYSA 3B4FA 3PJJA 4L5VA 1I91A 1ZE8A 4QJPA 4XFWA 3SBHA 1RZDA 1CVAA 1DCBA 1KOQA 1UGCA 1AM6A 1CNIA 4E3DA 1YDBA 2POWA 1OKMA 4HEYA 4YGNA 4CNWA 4C3TA 3DC3A 3KOIA 4TWMA 1BV3A 5SZ7A 3PYKA 1MOOA 1BNUA 1UGFA 3OIKA 1I9QA 2POVA 1FR4A 4ZWIA 1IF4A 1ZNCA 3M40A 4Q78A 5FLRA 5DSLA 1FLJA 1RZBA 3MWOA 3IBIA 5JEHB 3KLDB 2CABA 2NWZA 4PQ7A 5EHVA 2ABEA 1CNHA 5EKJA 1CNBA 4JSWA 3DBUA 1RJ6A 4FVOA 4LHIA 4K0ZA 4XIWA 3V2JA 3HKTA 2HNCA 4Z1NA 4XIXA 1CALA 3DCSA 5BRWA 1KWQA 4Q90A 3D93A 3SAXA 1CNCA 2NWYA 3JXHC 5E5RA 4WL4A 4QK3A 1CA3A 4BF6A 3GZ0A 3OKVA 5DOHA 1FSNA 1JD0A 1HCAA 1BICA 1HECA 3T85A 2AW1A 4KP5A 4JS6A 1YDAA 1IF6A 4Q6EA 3DD0A 3S73B 5L3OA 5FL5A 5DRSA 4ETQC 5DSIA 3D0NA 4MDGA 5E2NA 2FOYA 5E28A 4Q8ZA 4G7AA 3R17B 4N16A 5E2MA 1TB0X 3U45X 1H9QA 3OIMA 2H4NA 3ZP9A 1DMXA 1FQNA 1HUGA 1FQMA 1G53A 2CA2A 4WUQA 3MHIA 2VVAX 4K0SA 3ZNCA 1DMYA 3N2PA 1YO0A 4DZ7A 3V3FA 1CAKA 3RYYA 4HBAA 1YO1A 3KONA 4IWZA 5JEPB 1G3ZA 5JG5B 2FW4A 1Z9YA 1I9NA 3MZCA 5E2RA 4CACA 5JGSB 3B1BA 2O4ZA 4CQ0A 1RZCA 3IBNA 3MNUA 1I9PA 4KV0A 1JV0A 1I8ZA 2NWOA 4E49A 3IBUA 5E2SA 3V3JA 4Q8XA 2GD8A 3V3HB 1TEUX 5FLOA 3M96A 4RUYA 4YGFA 1I9LA 2QO8A 1RJ5A 4Z1KA 5FNMA 2NNGA 5G0CA 3M1QA 1BNMA 3MDZA 2FNKA 1YDCA 4RUZA 5BNLA 3DAZA 4Q07A 4WW8A 1TG9A 3P3HA 4XZ5A 5E2KA 3MHLA 3F7UA 1ZH9A 2HD6A 2HKKA 3CAJA 3KS3A 1V9IC 4ITPA 5DSKA 3L14A 1TBTX 3MHCA 1CRAA 5FL4A 3JXGA 1XPZA 1T9NA 4KAPA 3OYQA 3S77B 1G0FA 4QJ0A 4QJOA 4QK2A 7CA2A 1TTMA 2POUA 3C7PA 2NNVA 1ZSAA 3EFIA 3IAIA 3P58A 4K13A 3V2MA 5FNIA 2WEOA 1CAHA 1CNJA 8CA2A 3NI5A 5FL6A 1BNWA 3HKUA 4COQA 1UGBA 2EU2A 3MNJA 4HU1A 1BZMA 4QSAA 3RJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5DSN A;  4E3F A;  4KNN A;  4Q8Y A;  5FDI A;  4QEF A;  1UGG A;  5AMG A;  4Q7W A;  3DVC A;  3T84 A;  3TMJ A;  3M04 A;  5CA2 A;  5DSQ A;  3BET A;  2EZ7 A;  3FFP X;  1LUG A;  4YXO A;  3OIL A;  3N0N A;  5CJF A;  1RZA A;  1ZFK A;  2HL4 A;  3P5A A;  3W6H A;  2OSF A;  4YGJ A;  4E9O X;  3MNI A;  3K2F A;  4GL1 X;  1CNK A;  5EH5 A;  4YWP A;  1OKL A;  3D8W A;  4RUX A;  5JGT B;  5SZ3 A;  4YXI A;  4M2V A;  3S74 B;  5JG3 B;  1TEQ X;  4M2R A;  3MYQ A;  1ZGE A;  1RAY A;  3M2Y A;  1HUH A;  1CIN A;  5L6K A;  4Q08 A;  4RIV A;  1BNN A;  4RIU A;  5JQ0 A;  3RZ5 A;  5FLT A;  4ILX A;  4QSB A;  1KWR A;  4JSS A;  5DOG A;  5A6H A;  3F4X A;  2FNN A;  3T83 A;  2X7S A;  2NN1 A;  3U3A X;  2FOQ A;  3DV7 A;  5G03 A;  5A25 A;  1G4J A;  4LU3 A;  1CVB A;  4QJM A;  3RG3 A;  1J9W A;  1XEG A;  3M2Z A;  1ZFQ A;  4Q7S A;  2WEG A;  4Z1E A;  3V3G B;  1FQL A;  4WR7 A;  1URT A;  4WUP A;  4PYX A;  5BRV A;  2ILI A;  4MTY A;  4TWL A;  3BL0 A;  3NJ9 A;  4FPT A;  4MLT A;  1EOU A;  4FIK A;  2FOS A;  1XQ0 A;  5FDC A;  5EH8 A;  2Q1B A;  1CNX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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