3SBH | Genus

Total Genus 78

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	78
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	259
structure length	259
Chain Sequence	SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__6313038076690294__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__6313038076690294__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/3sbh/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__6313038076690294__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"6313038076690294","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/3sbh/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__6313038076690294__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Design of [(2-pyrimidinylthio)acetyl]benzenesulfonamides as inhibitors of human carbonic anhydrases. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	78
structure length	259
sequence length	259
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2011-06-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	3sbhA00

1FQNA 1BV3A 4XE1A 5IPZA 4QK1A 5SZ5A 2ZNCA 1CVFA 1CNCA 1LZVA 1G54A 4Z1NA 1CAJA 4Q99A 4Q0LA 4Q78A 3FE4A 1CAMA 2NN7A 5CACA 4PYXA 3FW3A 1CAHA 1ZFQA 1BCDA 3DBUA 1UGCA 3PJJA 4Q9YA 4K0ZA 3P5AA 4WW8A 3IBUA 1IF7A 2F14A 3KWAA 4JSWA 1CRMA 3BL0A 5BRVA 3RJ7A 1BNMA 3MNKA 1H9QA 4CNVA 1G0EA 3M1KA 3HFPA 1ZNCA 4E3HA 3D92A 5EOIA 5EKHA 3P55A 5DSLA 1CVCA 2AX2A 3VBDA 2OSFA 5E2SA 5DOGA 4FL7A 5FLQA 4YX4A 3L14A 3IBLA 1CA3A 3F4XA 4Z1JA 4LHIA 4YGLA 3V5GA 3IBIA 3R16A 3M1QA 4JSSA 3V3IB 3M98A 1I9LA 3M2ZA 4E49A 3HKQA 3MMFA 5E5UA 3F8EA 4YVYA 3S71B 3DCCA 2EZ7A 3N2PA 2POVA 3JXGA 3T5ZA 1KOQA 1YDDA 3P4VA 4XIXA 5E2KA 1RAYA 5G0BA 3M3XA 1AZMA 4RIVA 1CNKA 3MNAA 5JQTA 1CVAA 1MUAA 4IDRX 5FNJA 4FU5A 1CAKA 1MOOA 1G6VA 1DMYA 3M5EA 3BL1A 3W6HA 4ILXA 2FOSA 1LGDA 1HECA 1G52A 1CA2A 2HL4A 3MDZA 2ILIA 4Q08A 3M2XA 2H15A 1DCBA 2FOYA 3MHIA 4Y0JA 3S9TA 1I9MA 3D93A 4Q07A 1CNGA 1IF8A 3CAJA 2X7TA 5FNMA 2VVBX 1I90A 1THKA 4YGKA 3MHMA 7CA2A 1BN1A 1CNJA 3CA2A 3DD0A 3TMJA 1JV0A 1YDBA 5SZ2A 4QEFA 4JS6A 5JEHB 2WD3A 3S78B 4YGNA 4Q8ZA 4QIZA 4R5AA 4YXUA 5FLOA 4YWPA 4RH2A 2O4ZA 1AM6A 5DSPA 2NNVA 4QJXA 4LP6A 1LG5A 4E5QA 1FQRA 1UGBA 5DSOA 3M5TA 2POWA 2X7UA 4M2UA 4HT2A 1FR4A 3OY0A 5EH7A 2FMGA 4CACA 3P3HA 3KS3A 5BYIA 1I9NA 1J9WA 3OIKA 5BRUA 2OSMA 4Q7VA 4HF3A 4WL4A 5JG5B 1XPZA 4ETQC 5DSKA 3U45X 3DC9A 4E3DA 1ZSAA 3M04A 5DSQA 4N16A 3NJ9A 5FNIA 1CILA 2CBDA 2WEJA 5E28A 4KUVA 3T83A 5AMLA 5J8ZA 3MNHA 4K13A 5SZ7A 4GL1X 3M40A 4K0SA 5JEGB 3RZ7A 9CA2A 4KP8A 1CAOA 4Q06A 4Q90A 1H9NA 3D9ZA 5DSRA 5JEPB 3D8WA 4FIKA 3DCWA 3TVNX 2FOVA 5SZ1A 1ZGFA 2NMXA 5L6KA 1HVAA 2QO8A 4QK3A 1BZMA 3V3HB 2HD6A 1FSNA 1HCBA 5A6HA 3RZ0B 1Z93A 3KOKA 4HBAA 1CNIA 3U3AX 4WUPA 2EU2A 5EKMA 4CNXA 1TTMA 2CBEA 2NXRA 4L5WA 1RZEA 3K2FA 5DSJA 1I9PA 4WUQA 1CIMA 1RZAA 2CBCA 3OKVA 4QJPA 4ZX1A 3RZ5A 1DCAA 3KOIA 3RYJB 5CLUA 5EH8A 5LMDA 5SZ3A 8CA2A 3ML5A 3LXEA 1CAZA 5C8IA 4WR7A 1Y7WA 2W2JA 3MNIA 3HLJA 4Q7PA 4QK2A 5FNKA 4R5BA 1TB0X 1CNWA 4ITOA 4K1QA 1RJ5A 1XEVA 1CINA 4KUWA 1IF5A 5FDCA 1CVHA 4YXIA 1CCSA 4E3FA 3RLDA 3DVBA 3OYQA 3Q31A 1BNVA 1BICA 5JGSB 3MHCA 4KNMA 1G4JA 1IF6A 1LUGA 3NB5A 1UGDA 2CBAA 1JD0A 3OILA 3U47A 3K34A 1G4OA 4Z1KA 2AW1A 3OYSA 4ZWXA 2VVAX 3N0NA 5EIJA 4HEYA 1ZFKA 4MO8A 4E9OX 2FW4A 5FLTA 5FNGA 3RG3A 4G0CA 3TVOX 3F7UA 3KIGA 4HEZA 3S75B 2WEGA 3OKUA 1TEQX 3MHLA 2NXTA 1OKNA 2HOCA 1ZE8A 4RFCA 1CNBA 3R17B 1G48A 1UGFA 4L5VA 3V7XA 4HT0A 4MDLA 3DVDA 2GD8A 1TG3A 5EZTX 1CAYA 4MLXA 4KAPA 5JESB 5DSIA 4KP5A 1G46A 1IF4A 4MDMA 4FPTA 4YGJA 4FVNA 4BF1A 4M2WA 3RYXB 2FMZA 4E4AA 4PXXA 4DZ7A 3M67A 5JQ0A 1TG9A 4HU1A 4RUYA 4R59A 4RN4A 1CRAA 1I9QA 1AVNA 3D0NA 4ZWIA 3V2MA 3RYYA 2X7SA 5G01A 4RUZA 4QSJA 5FLRA 1CANA 1OQ5A 3RZ1B 3HKNA 4BCWA 3KLDB 4RIUA 1TEUX 3GZ0A 4JSZA 3N3JA 3PO6A 4L5UA 5E2RA 4Q87A 2CABA 5AMDA 5SZ4A 1JCZA 5EHWA 1KOPA 1RZCA 3MYQA 1KWRA 4Q6DA 3UYQA 3EFIA 2Q1BA 3OIMA 3FFPX 6CA2A 2NN1A 3MZCA 4COQA 1CNXA 2Q1QA 1ZSCA 2FNNA 4DZ9A 1G53A 1BNQA 1CVEA 1RJ6A 3NI5A 3S76A 1CCTA 1I9OA 4QJMA 4PYYA 4ZAOA 1UGEA 4FRCA 2FOUA 1OKMA 1BN3A 3M1JA 3B1BA 5G0CA 3C7PA 4IWZA 1FLJA 5L3OA 3N4BA 3W6IA 4FVOA 5EHVA 5FNHA 4UOVA 3T84A 4MDGA 2FOQA 3JXFA 4ZX0A 3ZP9A 5HPJA 1ZSBA 2EU3A 1CNYA 3T85A 3DC3A 1I91A 4KNIA 4QSIA 3T5UA 4Z0QA 1A42A 4JSAA 1HEDA 3P5LA 4MLTA 4KUYA 4E3GA 1H4NA 1CAIA 1G3ZA 4QJOA 3MNJA 3M14A 1EOUA 3MWOA 3BETA 3P3JA 3PYKA 4Q8XA 3DVCA 3S72B 4BF6A 3P58A 4Q7WA 1HUGA 4Q49A 4QSAA 3M96A 5G03A 1YO2A 4QY3A 3KNEA 4Q6EA 1IF9A 5BNLA 4PQ7A 2FNKA 2WEHA 4HEWA 1CZMA 4QSBA 3V3FA 1G0FA 3KONA 3S77B 4X5SA 2QOAA 3DAZA 2CBBA 5FL5A 2NNGA 1HUHA 1ZGEA 1KEQA 4PZHA 1FSQA 4QJ0A 4LU3A 1RZDA 2NNSA 3RGEA 3RZ8A 1HEAA 1G45A 3ML2A 4CNWA 1FR7A 4YXOA 1RAZA 1HCAA 5DSNA 5E2NA 3DA2A 4CQ0A 1YDCA 4QTLA 4Q09A 2WEOA 3RYVB 3UYNA 5FLPA 2CA2A 2HNCA 1BNUA 4MTYA 3DD8A 4KNNA 4Q7SA 2QP6A 2HKKA 5CA2A 1CNHA 5DSMA 1TH9A 5DRSA 1V9IC 4YGFA 3IAIA 3MHOA 4XZ5A 4RFDA 4KV0A 1YDAA 1UGGA 3V3GB 5EH5A 1OKLA 3S97A 1BNTA 1FQLA 5JDVB 3SAXA 1XQ0A 2NXSA 2NWZA 5FLSA 2NWPA 2POUA 3V3JA 3SAPA 5JGTB 4C3TA 1URTA 1CVBA 5E5RA 3HKTA 4QJWA 4M2RA 1YO0A 1CCUA 1FQMA 1CVDA 3B4FA 4ITPA 2NWYA 4M2VA 4WW6A 4QIYA 1BNNA 2WD2A 1UGAA 4XFWA 1T9NA 1KWQA 1FSRA 1RZBA 2NWOA 3SBHA 5FNLA 3P44A 3K7KA 3M1WA 3S8XA 3EFTA 4KNJA 1LG6A 4Q83A 2GEHA 5DVXA 3RYZA 4TWMA 4Q81A 3T82A 3KKXA 3F7BA 1F2WA 1ZH9A 5FDIA 2ABEA 2HFWA 3CZVA 5SZ6A 3HKUA 3RG4A 12CAA 1HEBA 4RUXA 5DOHA 4ZWYA 4YHAA 4XIWA 3M2NA 3S74B 4ZWZA 3QYKA 3DCSA 5FL4A 2IT4A 3ZNCA 3S73B 4CNRA 5CJFA 2H4NA 3DV7A 5EKJA 3JXHC 2FNMA 3IBNA 1YO1A 4YYTA 1BN4A 2NNOA 3M2YA 5A25A 1DMXA 4Z1EA 5E2MA 3IEOA 3V2JA 5EHEA 3U7CA 4Q8YA 4G7AA 3SBIA 1G1DA 1CALA 5BRWA 3MNUA 3IGPA 4TWLA 1XEGA 3HS4A 3M5SA 1TBTX 4CA2A 1I8ZA 1TE3X 4K0TA 3CYUA 5AMGA 4N0XB 5SZ0A 1V9EA 1Z9YA 5FL6A 1BNWA 1Z97A 2Q38A 5JG3B
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1FQN A;  1BV3 A;  4XE1 A;  5IPZ A;  4QK1 A;  5SZ5 A;  2ZNC A;  1CVF A;  1CNC A;  1LZV A;  1G54 A;  4Z1N A;  1CAJ A;  4Q99 A;  4Q0L A;  4Q78 A;  3FE4 A;  1CAM A;  2NN7 A;  5CAC A;  4PYX A;  3FW3 A;  1CAH A;  1ZFQ A;  1BCD A;  3DBU A;  1UGC A;  3PJJ A;  4Q9Y A;  4K0Z A;  3P5A A;  4WW8 A;  3IBU A;  1IF7 A;  2F14 A;  3KWA A;  4JSW A;  1CRM A;  3BL0 A;  5BRV A;  3RJ7 A;  1BNM A;  3MNK A;  1H9Q A;  4CNV A;  1G0E A;  3M1K A;  3HFP A;  1ZNC A;  4E3H A;  3D92 A;  5EOI A;  5EKH A;  3P55 A;  5DSL A;  1CVC A;  2AX2 A;  3VBD A;  2OSF A;  5E2S A;  5DOG A;  4FL7 A;  5FLQ A;  4YX4 A;  3L14 A;  3IBL A;  1CA3 A;  3F4X A;  4Z1J A;  4LHI A;  4YGL A;  3V5G A;  3IBI A;  3R16 A;  3M1Q A;  4JSS A;  3V3I B;  3M98 A;  1I9L A;  3M2Z A;  4E49 A;  3HKQ A;  3MMF A;  5E5U A;  3F8E A;  4YVY A;  3S71 B;  3DCC A;  2EZ7 A;  3N2P A;  2POV A;  3JXG A;  3T5Z A;  1KOQ A;  1YDD A;  3P4V A;  4XIX A;  5E2K A;  1RAY A;  5G0B A;  3M3X A;  1AZM A;  4RIV A;  1CNK A;  3MNA A;  5JQT A;  1CVA A;  1MUA A;  4IDR X;  5FNJ A;  4FU5 A;  1CAK A;  1MOO A;  1G6V A;  1DMY A;  3M5E A;  3BL1 A;  3W6H A;  4ILX A;  2FOS A;  1LGD A;  1HEC A;  1G52 A;  1CA2 A;  2HL4 A;  3MDZ A;  2ILI A;  4Q08 A;  3M2X A;  2H15 A;  1DCB A;  2FOY A;  3MHI A;  4Y0J A;  3S9T A;  1I9M A;  3D93 A;  4Q07 A;  1CNG A;  1IF8 A;  3CAJ A;  2X7T A;  5FNM A;  2VVB X;  1I90 A;  1THK A;  4YGK A;  3MHM A;  7CA2 A;  1BN1 A;  1CNJ A;  3CA2 A;  3DD0 A;  3TMJ A;  1JV0 A;  1YDB A;  5SZ2 A;  4QEF A;  4JS6 A;  5JEH B;  2WD3 A;  3S78 B;  4YGN A;  4Q8Z A;  4QIZ A;  4R5A A;  4YXU A;  5FLO A;  4YWP A;  4RH2 A;  2O4Z A;  1AM6 A;  5DSP A;  2NNV A;  4QJX A;  4LP6 A;  1LG5 A;  4E5Q A;  1FQR A;  1UGB A;  5DSO A;  3M5T A;  2POW A;  2X7U A;  4M2U A;  4HT2 A;  1FR4 A;  3OY0 A;  5EH7 A;  2FMG A;  4CAC A;  3P3H A;  3KS3 A;  5BYI A;  1I9N A;  1J9W A;  3OIK A;  5BRU A;  2OSM A;  4Q7V A;  4HF3 A;  4WL4 A;  5JG5 B;  1XPZ A;  4ETQ C;  5DSK A;  3U45 X;  3DC9 A;  4E3D A;  1ZSA A;  3M04 A;  5DSQ A;  4N16 A;  3NJ9 A;  5FNI A;  1CIL A;  2CBD A;  2WEJ A;  5E28 A;  4KUV A;  3T83 A;  5AML A;  5J8Z A;  3MNH A;  4K13 A;  5SZ7 A;  4GL1 X;  3M40 A;  4K0S A;  5JEG B;  3RZ7 A;  9CA2 A;  4KP8 A;  1CAO A;  4Q06 A;  4Q90 A;  1H9N A;  3D9Z A;  5DSR A;  5JEP B;  3D8W A;  4FIK A;  3DCW A;  3TVN X;  2FOV A;  5SZ1 A;  1ZGF A;  2NMX A;  5L6K A;  1HVA A;  2QO8 A;  4QK3 A;  1BZM A;  3V3H B;  2HD6 A;  1FSN A;  1HCB A;  5A6H A;  3RZ0 B;  1Z93 A;  3KOK A;  4HBA A;  1CNI A;  3U3A X;  4WUP A;  2EU2 A;  5EKM A;  4CNX A;  1TTM A;  2CBE A;  2NXR A;  4L5W A;  1RZE A;  3K2F A;  5DSJ A;  1I9P A;  4WUQ A;  1CIM A;  1RZA A;  2CBC A;  3OKV A;  4QJP A;  4ZX1 A;  3RZ5 A;  1DCA A;  3KOI A;  3RYJ B;  5CLU A;  5EH8 A;  5LMD A;  5SZ3 A;  8CA2 A;  3ML5 A;  3LXE A;  1CAZ A;  5C8I A;  4WR7 A;  1Y7W A;  2W2J A;  3MNI A;  3HLJ A;  4Q7P A;  4QK2 A;  5FNK A;  4R5B A;  1TB0 X;  1CNW A;  4ITO A;  4K1Q A;  1RJ5 A;  1XEV A;  1CIN A;  4KUW A;  1IF5 A;  5FDC A;  1CVH A;  4YXI A;  1CCS A;  4E3F A;  3RLD A;  3DVB A;  3OYQ A;  3Q31 A;  1BNV A;  1BIC A;  5JGS B;  3MHC A;  4KNM A;  1G4J A;  1IF6 A;  1LUG A;  3NB5 A;  1UGD A;  2CBA A;  1JD0 A;  3OIL A;  3U47 A;  3K34 A;  1G4O A;  4Z1K A;  2AW1 A;  3OYS A;  4ZWX A;  2VVA X;  3N0N A;  5EIJ A;  4HEY A;  1ZFK A;  4MO8 A;  4E9O X;  2FW4 A;  5FLT A;  5FNG A;  3RG3 A;  4G0C A;  3TVO X;  3F7U A;  3KIG A;  4HEZ A;  3S75 B;  2WEG A;  3OKU A;  1TEQ X;  3MHL A;  2NXT A;  1OKN A;  2HOC A;  1ZE8 A;  4RFC A;  1CNB A;  3R17 B;  1G48 A;  1UGF A;  4L5V A;  3V7X A;  4HT0 A;  4MDL A;  3DVD A;  2GD8 A;  1TG3 A;  5EZT X;  1CAY A;  4MLX A;  4KAP A;  5JES B;  5DSI A;  4KP5 A;  1G46 A;  1IF4 A;  4MDM A;  4FPT A;  4YGJ A;  4FVN A;  4BF1 A;  4M2W A;  3RYX B;  2FMZ A;  4E4A A;  4PXX A;  4DZ7 A;  3M67 A;  5JQ0 A;  1TG9 A;  4HU1 A;  4RUY A;  4R59 A;  4RN4 A;  1CRA A;  1I9Q A;  1AVN A;  3D0N A;  4ZWI A;  3V2M A;  3RYY A;  2X7S A;  5G01 A;  4RUZ A;  4QSJ A;  5FLR A;  1CAN A;  1OQ5 A;  3RZ1 B;  3HKN A;  4BCW A;  3KLD B;  4RIU A;  1TEU X;  3GZ0 A;  4JSZ A;  3N3J A;  3PO6 A;  4L5U A;  5E2R A;  4Q87 A;  2CAB A;  5AMD A;  5SZ4 A;  1JCZ A;  5EHW A;  1KOP A;  1RZC A;  3MYQ A;  1KWR A;  4Q6D A;  3UYQ A;  3EFI A;  2Q1B A;  3OIM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3SBHA

Total Genus

Knots found

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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