3V5GA

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii in complex with the 4-sulfamido-benzenesulfonamide inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Development of potent carbonic anhydrase inhibitors incorporating both sulfonamide and sulfamide groups.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3v5gA00
2X7SA 3OIMA 1HUHA 4YGJA 5LMDA 3MNHA 1V9EA 3U45X 1AM6A 2FMGA 4KP5A 5DSNA 1FQMA 4YXUA 3IGPA 1ZNCA 5J8ZA 3NB5A 4JSSA 3DVDA 4Y0JA 1CAKA 3D9ZA 2FOQA 3RZ0B 4JSAA 4KUWA 3OKVA 1CAYA 4FPTA 4JSWA 5EH5A 1KEQA 1CVCA 2NNSA 4KUVA 1CVFA 1YO1A 3F4XA 4QTLA 4LU3A 2POUA 4PXXA 2NNVA 2IT4A 4ZAOA 1URTA 3FE4A 4QJ0A 3RYJB 2AW1A 2FOVA 3K2FA 5BNLA 2NN1A 3CA2A 4MDGA 4RH2A 3U7CA 3DD0A 1BNQA 5SZ1A 4HEWA 2NNGA 4HEYA 4YXIA 5JEPB 1CNKA 3K7KA 3MHIA 1H9QA 3OYQA 1BCDA 1OKNA 1FLJA 4R5AA 3F7UA 1Z9YA 3LXEA 5C8IA 5SZ0A 3IBLA 5HPJA 4E3GA 1TBTX 1BNNA 3DBUA 4YGFA 3ML5A 4FVOA 1J9WA 3OILA 4Q90A 4QY3A 4YVYA 3P4VA 5FLOA 1G46A 4N16A 3SAPA 4E3DA 1CCSA 3UYNA 2H15A 1OKMA 3HKTA 3HS4A 3MHLA 3T84A 4KV0A 3P3HA 3MNJA 4YGLA 5E2MA 3B4FA 5EOIA 4XFWA 1CNYA 1CCTA 5DSPA 5CJFA 4QSJA 3TVOX 7CA2A 2NXTA 2FNMA 4XZ5A 3M2NA 3L14A 1JCZA 3KOIA 4KUYA 5FNJA 5BRUA 1CIMA 3KIGA 2POWA 4Q83A 4Q8XA 1UGDA 4HBAA 3VBDA 3IBUA 3D0NA 3S97A 1CRMA 3MHCA 4HEZA 3M14A 5JESB 1Z93A 1TEUX 2EZ7A 2Q38A 3OY0A 3DCCA 1DMXA 3EFTA 3JXFA 4Q49A 1CCUA 4MO8A 4RN4A 1CNHA 1ZGEA 1CNJA 4E9OX 2FMZA 1CRAA 3SAXA 1CVDA 5EHWA 1BN3A 1IF9A 5L6KA 1THKA 5EH8A 2Q1BA 1CNWA 2NWYA 4Z1KA 1ZSBA 1FQNA 5G03A 3CZVA 4QSAA 1RAYA 5AMDA 1FSQA 4R5BA 4Q0LA 2CBDA 5DSJA 1KOQA 5FNKA 1LG6A 1ZFQA 5DSLA 1CZMA 3V3FA 2QP6A 4Q7VA 3IBNA 1OQ5A 1TH9A 4E4AA 4RIUA 3T82A 1CNBA 5JDVB 4QJXA 2VVBX 2EU2A 3IBIA 5FDIA 2WD3A 5DSRA 1CNXA 5CLUA 4L5VA 3KS3A 4XIWA 2OSFA 4ITOA 4BF1A 4ZWYA 4KNMA 4QJOA 2Q1QA 3M96A 1FR7A 3RYYA 1G53A 4CNRA 3M98A 1I8ZA 3HKQA 3RYVB 1A42A 3P55A 4YX4A 3RYXB 4ZWZA 4WR7A 5EHVA 5E2KA 2NWZA 3S8XA 3P5AA 1DCAA 4COQA 5E5UA 5E5RA 4FU5A 1I9MA 4ITPA 1IF6A 4MDLA 2CA2A 1HUGA 1CNIA 1CILA 1MUAA 5SZ7A 4WUPA 5DRSA 4Z1JA 3BETA 5EHEA 4FIKA 3CYUA 5BRWA 1G4OA 1LUGA 5FL6A 4CNVA 4PQ7A 3F8EA 5EKJA 2NMXA 4ZX0A 5FNMA 4K0ZA 4WW8A 1G54A 1TE3X 3M04A 3M1KA 1G1DA 1FQRA 1UGBA 1AZMA 3IEOA 1BZMA 2FOSA 4RFDA 1KOPA 3U3AX 3ZNCA 4HT2A 2NWPA 4G0CA 4YHAA 4Q06A 3MNKA 4RFCA 3TMJA 5L3OA 3V7XA 3MNAA 1TTMA 4X5SA 1YO2A 4Q7PA 5A6HA 1RZCA 2FOYA 2OSMA 4Q7WA 2GD8A 4K1QA 4LP6A 3T83A 2ZNCA 5AMLA 4ZX1A 3DD8A 4ILXA 3B1BA 4K0TA 9CA2A 1CAMA 1OKLA 1CAIA 2CBEA 1YDDA 4Q8YA 3DA2A 4KNIA 3K34A 4MLTA 1CVEA 2FOUA 5IPZA 1BNMA 3M1QA 4XIXA 3SBHA 3D8WA 4N0XB 3DCWA 5SZ4A 1I9LA 3OYSA 3KNEA 4R59A 1RZEA 5DOHA 2ABEA 4M2RA 1ZSAA 2CABA 4Q09A 4JS6A 3OIKA 1T9NA 3P44A 3KWAA 4WUQA 1JV0A 4L5UA 5DOGA 4MLXA 2H4NA 2AX2A 4CA2A 4E49A 1FSNA 3DV7A 5CA2A 3PJJA 5SZ2A 4MDMA 2HFWA 3RG4A 1CVBA 4QEFA 1ZE8A 4QJMA 1XEGA 3SBIA 4BF6A 3RG3A 1CINA 1G4JA 5JQTA 1ZH9A 5FNGA 2NNOA 3MYQA 5JEGB 1CA3A 3KONA 3M2ZA 3D93A 5SZ5A 4QIZA 3C7PA 3R16A 4TWLA 4ZWXA 4QK3A 3S72B 3T85A 3V5GA 2FW4A 5SZ3A 4Q7SA 4L5WA 1EOUA 5FL4A 1HECA 1CVHA 4KP8A 4WW6A 1CANA 3R17B 3M5TA 1CA2A 4DZ7A 4C3TA 3DVBA 4FVNA 1I9OA 3HKUA 3V3HB 4GL1X 3S9TA 4LHIA 3KKXA 2EU3A 4QJWA 1F2WA 1BNUA 2ILIA 4YGKA 3MHOA 1UGAA 3MMFA 3JXGA 1LGDA 5AMGA 3V3JA 1AVNA 4CNXA 3NJ9A 3FFPX 1CAOA 3RZ7A 2GEHA 1HEAA 6CA2A 3V2JA 1TEQX 3QYKA 5SZ6A 1UGEA 4Z0QA 4PYYA 2WEGA 3PO6A 5BRVA 1YDBA 2VVAX 5G0CA 2HKKA 3RYZA 3RGEA 2W2JA 4JSZA 3S77B 1G6VA 3UYQA 5CACA 2NXSA 3P3JA 3MNUA 3M40A 4G7AA 4Q8ZA 1YO0A 2HL4A 1UGCA 5FNIA 1JD0A 1MOOA 1G3ZA 2NN7A 5JEHB 5DSIA 5FLRA 3P58A 3V2MA 4QSBA 3W6HA 2X7UA 3T5ZA 3DAZA 4HT0A 1CNGA 1BNTA 4M2VA 4MTYA 1RZBA 1H9NA 3BL1A 1RJ5A 3MHMA 1I9PA 4Q87A 1I9NA 1I90A 3F7BA 4YWPA 4E3FA 4Z1NA 3N0NA 5FNLA 1HCBA 4YGNA 1BNVA 1G48A 4YXOA 3KLDB 3M3XA 5EZTX 4Q08A 5DSOA 3U47A 1ZGFA 4RIVA 4Q99A 5E2RA 1FQLA 5FDCA 3S73B 8CA2A 3S74B 3KOKA 1FSRA 1BNWA 5JG3B 3D92A 3DVCA 4FL7A 2WEHA 4ETQC 5JGSB 1HVAA 2WEOA 2NXRA 4Z1EA 2CBCA 4RUYA 3S78B 3BL0A 3M2XA 3RZ5A 4CACA 4XE1A 1CALA 2FNKA 4YYTA 4KNJA 4UOVA 5EIJA 2X7TA 5EH7A 3M5SA 1V9IC 1CVAA 1DCBA 3PYKA 2WEJA 4Q6DA 1CAZA 1XEVA 3FW3A 1RAZA 1YDCA 2F14A 2HOCA 1IF8A 4QJPA 3TVNX 4TWMA 4KAPA 5FLSA 1DMYA 3HLJA 2NWOA 4M2WA 3RZ1B 4Q81A 1Y7WA 5E2SA 3RZ8A 3P5LA 1BN1A 1CAHA 1G0FA 2HD6A 3ML2A 5G01A 3IAIA 5G0BA 5DSKA 4QSIA 3N3JA 1CAJA 3W6IA 5EKHA 4QK1A 3MZCA 2CBAA 5JG5B 5BYIA 4Q07A 2QO8A 5A25A 5FNHA 1BN4A 1UGGA 4K0SA 4BCWA 1RZAA 4FRCA 1I91A 3M1WA 4HF3A 4RUZA 4CQ0A 2HNCA 4K13A 1UGFA 1I9QA 1TG9A 1LZVA 1HEBA 1IF5A 4PYXA 5E2NA 4RUXA 4CNWA 3M1JA 4IWZA 1G52A 3HFPA 3RLDA 4Q78A 5E28A 5FLQA 4HU1A 1BV3A 1KWRA 5DSMA 2QOAA 5DSQA 3DC3A 3M5EA 4M2UA 1BICA 4QK2A 2CBBA 5FLPA 2WD2A 1FR4A 1LG5A 4PZHA 3V3GB 3ZP9A 3DC9A 3MWOA 4Q9YA 1TG3A 1HEDA 3NI5A 3GZ0A 1CNCA 4KNNA 4QIYA 3MNIA 1TB0X 5JGTB 3EFIA 1KWQA 3HKNA 1ZFKA 1G45A 1IF4A 3JXHC 4E5QA 3DCSA 5DVXA 1XPZA 1Z97A 1RZDA 3CAJA 5FL5A 5JQ0A 2POVA 4DZ9A 5EKMA 2O4ZA 5FLTA 1YDAA 4ZWIA 3OKUA 4Q6EA 3S75B 12CAA 3S71B 3RJ7A 4IDRX 4E3HA 1ZSCA 1IF7A 3S76A 1XQ0A 3V3IB 3M67A 1G0EA 1RJ6A 2FNNA 3MDZA 1H4NA 3N2PA 3M2YA 3T5UA 1HCAA 3Q31A 4WL4A 3N4BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2X7S A;  3OIM A;  1HUH A;  4YGJ A;  5LMD A;  3MNH A;  1V9E A;  3U45 X;  1AM6 A;  2FMG A;  4KP5 A;  5DSN A;  1FQM A;  4YXU A;  3IGP A;  1ZNC A;  5J8Z A;  3NB5 A;  4JSS A;  3DVD A;  4Y0J A;  1CAK A;  3D9Z A;  2FOQ A;  3RZ0 B;  4JSA A;  4KUW A;  3OKV A;  1CAY A;  4FPT A;  4JSW A;  5EH5 A;  1KEQ A;  1CVC A;  2NNS A;  4KUV A;  1CVF A;  1YO1 A;  3F4X A;  4QTL A;  4LU3 A;  2POU A;  4PXX A;  2NNV A;  2IT4 A;  4ZAO A;  1URT A;  3FE4 A;  4QJ0 A;  3RYJ B;  2AW1 A;  2FOV A;  3K2F A;  5BNL A;  2NN1 A;  3CA2 A;  4MDG A;  4RH2 A;  3U7C A;  3DD0 A;  1BNQ A;  5SZ1 A;  4HEW A;  2NNG A;  4HEY A;  4YXI A;  5JEP B;  1CNK A;  3K7K A;  3MHI A;  1H9Q A;  3OYQ A;  1BCD A;  1OKN A;  1FLJ A;  4R5A A;  3F7U A;  1Z9Y A;  3LXE A;  5C8I A;  5SZ0 A;  3IBL A;  5HPJ A;  4E3G A;  1TBT X;  1BNN A;  3DBU A;  4YGF A;  3ML5 A;  4FVO A;  1J9W A;  3OIL A;  4Q90 A;  4QY3 A;  4YVY A;  3P4V A;  5FLO A;  1G46 A;  4N16 A;  3SAP A;  4E3D A;  1CCS A;  3UYN A;  2H15 A;  1OKM A;  3HKT A;  3HS4 A;  3MHL A;  3T84 A;  4KV0 A;  3P3H A;  3MNJ A; 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