4BF6 | Genus

Total Genus 76

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	76
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__055097533406303__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__055097533406303__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4bf6/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__055097533406303__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"055097533406303","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4bf6/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__055097533406303__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	5-Substituted-(1,2,3-Triazol-4-Yl)Thiophene-2-Sulfonamides Strongly Inhibit Human Carbonic Anhydrases I, II, Ix and Xii: Solution and X-Ray Crystallographic Studies. pubmed doi rcsb
molecule keywords	CARBONIC ANHYDRASE 2
molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
total genus	76
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2013-03-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	4bf6A00

4K1QA 3RZ5A 3S9TA 1CVDA 3VBDA 4QJWA 3MHMA 3MYQA 4YXOA 4YWPA 5FDCA 3M2NA 1Z9YA 1YDBA 3P5AA 1ZFKA 5L6KA 3B4FA 3MNHA 3M1WA 4RUYA 3ZNCA 1RZDA 4ETQC 2AW1A 1G52A 1CNKA 1CNHA 1FQRA 5DSPA 3RZ1B 5AMLA 1CAOA 3JXGA 1TH9A 4FU5A 3NB5A 3T83A 1G1DA 4FVOA 5FNLA 3D9ZA 4Q78A 4WR7A 4E49A 2X7UA 3V2MA 1ZGEA 3M04A 3V3GB 1CRAA 2VVAX 1ZGFA 4UOVA 1G45A 1HVAA 5BRUA 4TWLA 1LG5A 3HKTA 2NWPA 1HEAA 2CBAA 1J9WA 1UGGA 1TG9A 2H15A 3UYNA 4YGJA 2QOAA 5C8IA 4N0XB 3LXEA 1TB0X 2FOUA 4IWZA 2NNSA 3F8EA 5SZ0A 4ITPA 3N0NA 5EHVA 5EKMA 4R5AA 3M3XA 2OSFA 1I9OA 4MLXA 4ZAOA 5FNJA 3D92A 3DCSA 3IEOA 4HBAA 5CJFA 5JQTA 4RFDA 1CNGA 1CVEA 4RFCA 4E4AA 5CACA 4MDMA 3IBLA 4E5QA 1YDAA 3QYKA 1KWQA 5FLRA 5DOHA 4K13A 3M5EA 2Q1QA 3B1BA 5E5UA 3RYVB 4QTLA 1LUGA 1G0FA 3HLJA 3P5LA 5DSRA 3EFTA 1KEQA 4G0CA 3MNIA 2CBEA 4PYXA 1RZCA 4LP6A 3F7UA 1AZMA 3RJ7A 1Y7WA 4CNWA 5E2SA 1HUGA 1ZFQA 3C7PA 3KOIA 1BNVA 1CNCA 4R59A 2IT4A 3NJ9A 1XQ0A 4JSAA 1BN4A 4FVNA 1CAKA 2POWA 4WW8A 5SZ3A 3RYYA 3K7KA 5E2RA 4YXIA 1IF6A 4QIYA 4FIKA 4JS6A 1CAHA 1YDDA 4QIZA 2WEOA 1TE3X 3N3JA 1CVAA 1UGCA 1JV0A 4QJMA 1BNNA 3CYUA 1RAZA 4RUXA 3OYSA 1IF9A 3PYKA 5E2NA 3D8WA 5EH5A 3MWOA 4PZHA 4ITOA 2CBDA 5EOIA 4PYYA 3M1KA 3CZVA 2FNKA 2NN1A 3S8XA 1T9NA 1LGDA 1BV3A 4XFWA 3P55A 4M2UA 1UGAA 4ZX1A 4K0ZA 1IF5A 3S72B 3DAZA 1URTA 1XEVA 3IBIA 3PO6A 2O4ZA 3F4XA 5A6HA 2ZNCA 3RZ0B 4K0SA 5FNGA 1CVHA 1RZEA 1TEQX 3CA2A 1FQMA 2CBCA 2HL4A 1LZVA 1I9PA 1FR4A 4Q90A 4Z1JA 3MNJA 3HKUA 5BRWA 3OYQA 4Q9YA 4QSBA 1ZSCA 4X5SA 3MMFA 4Z1KA 2QP6A 3T85A 3ML2A 5AMGA 1CCTA 3DCCA 3JXFA 2FW4A 4HU1A 4CA2A 3ZP9A 2CABA 3P44A 3HFPA 1I9NA 2WD2A 1CNWA 3RYJB 4YX4A 3K34A 3M5TA 3MHLA 5DSNA 4CNXA 4N16A 1G4JA 2FMGA 3EFIA 3V3IB 4ZWYA 5SZ7A 3RG4A 4Z1NA 3SBHA 1G3ZA 4WUQA 4Q09A 2AX2A 5A25A 7CA2A 1UGFA 2WEHA 5JGTB 1G6VA 1IF7A 5JDVB 2OSMA 3PJJA 4KUYA 1DMXA 1UGEA 3OKUA 3MNAA 4ILXA 4LHIA 4Q8YA 3DCWA 3S71B 3T82A 5JEGB 1CANA 4FL7A 4LU3A 1AM6A 1HCBA 1HECA 1CINA 1ZH9A 3M2YA 3MHCA 1HEDA 4QJPA 5DSJA 5E28A 1JD0A 1A42A 1Z97A 2POVA 3DVCA 1LG6A 1BN1A 1G53A 5FNKA 12CAA 4L5UA 5SZ4A 4HT2A 6CA2A 4HEZA 1BCDA 3CAJA 5JEHB 5JESB 1IF4A 2Q1BA 1CRMA 4KP5A 3N4BA 4QK3A 4ZWIA 4WUPA 2EU3A 1HEBA 4TWMA 4WW6A 4DZ9A 2FOVA 4RIUA 4QSAA 4YYTA 2WD3A 1G54A 3P3JA 2HOCA 2HD6A 1CA3A 2NWYA 3RGEA 4E3GA 4QSJA 1IF8A 4CQ0A 1CIMA 4KNMA 2CBBA 5G01A 3RYZA 4Q8ZA 3S77B 4L5WA 3MHOA 5E2KA 5AMDA 1DCAA 4Y0JA 5DSLA 5JG3B 4CNRA 3M2XA 5SZ5A 1XEGA 1H4NA 3KLDB 4XIWA 3IGPA 5EKHA 1HUHA 1UGBA 4HEYA 3F7BA 1CAZA 3FE4A 2F14A 3TVOX 4FRCA 2POUA 1CNXA 5JQ0A 1UGDA 4Q08A 2FOQA 3KONA 4KUWA 1FR7A 2GD8A 4GL1X 3T5ZA 4YVYA 5DVXA 3U45X 5SZ1A 1OKMA 2NNOA 1I90A 1Z93A 3S78B 5EH8A 3HKNA 1BZMA 1BNQA 2NMXA 3DD8A 5E5RA 3S75B 5G03A 4HEWA 1ZSAA 4JSSA 5EHWA 3JXHC 1FQNA 2FOSA 4JSWA 3BL0A 5FNHA 1FSQA 4E9OX 5CA2A 2EZ7A 3R17B 1ZSBA 5BRVA 3N2PA 5EHEA 3MZCA 2ABEA 5DSOA 3M1JA 5DRSA 3V5GA 4L5VA 1CALA 3S74B 5FNIA 3MNKA 4YHAA 4Q06A 3KS3A 4RN4A 1BNTA 3D0NA 4HT0A 3M67A 4KV0A 4M2WA 4WL4A 1CNJA 3ML5A 1YO0A 2NXSA 3DD0A 3RYXB 2HFWA 2NNVA 4Z1EA 5L3OA 3K2FA 2NXRA 3MHIA 4XZ5A 5SZ2A 1DMYA 5FLSA 3S76A 3P4VA 3T84A 1CCSA 5J8ZA 4IDRX 1BICA 4PXXA 5DSKA 3IBUA 1FQLA 3MNUA 5IPZA 2FMZA 3SAPA 3OKVA 4QJ0A 4HF3A 1RJ6A 3M96A 4MLTA 4DZ7A 3M14A 4KNIA 3RZ7A 4RIVA 2ILIA 1CNIA 4YGNA 3DV7A 3KNEA 1RZBA 1CVCA 1OQ5A 4RH2A 4Q0LA 5FDIA 3TMJA 4QEFA 4XIXA 2X7SA 3UYQA 4FPTA 5E2MA 1EOUA 3M5SA 3DA2A 1BNUA 5EKJA 3HS4A 3IAIA 4MDLA 1KOPA 2FNNA 1CAIA 3S97A 1I9LA 5FL4A 4KP8A 1V9EA 5SZ6A 3U7CA 4Z0QA 5BYIA 3M98A 4CACA 4KUVA 3T5UA 4YGKA 3RG3A 3L14A 4Q7WA 3IBNA 5JGSB 1CAYA 5HPJA 4BF1A 1G4OA 4MO8A 5FLPA 2Q38A 2NXTA 1BNWA 2WEGA 4KAPA 4MTYA 1CA2A 1H9NA 5EIJA 8CA2A 1I9MA 5FLQA 4ZX0A 2NN7A 1FSNA 3M2ZA 4COQA 3OIMA 1MOOA 3HKQA 3BL1A 3M40A 2NWOA 5EH7A 4E3DA 5DSIA 5FL5A 1RJ5A 4ZWXA 2EU2A 4QK2A 4ZWZA 2CA2A 1TEUX 4Q7VA 1CZMA 2HKKA 5BNLA 1CNYA 1CAJA 3DBUA 4E3HA 5EZTX 4Q87A 3GZ0A 4Q7PA 1TG3A 3W6HA 5FNMA 4Q6EA 5FLOA 5CLUA 4RUZA 1YO1A 4Q8XA 3U47A 3V3HB 4QJOA 5DSMA 3P3HA 3KKXA 1RAYA 3D93A 3RZ8A 3U3AX 1FSRA 4YGLA 5G0BA 2VVBX 1HCAA 4Q81A 2H4NA 1YO2A 3BETA 1V9IC 3Q31A 1AVNA 4KNNA 4XE1A 1I9QA 3DC3A 4QK1A 1BNMA 2QO8A 3FW3A 4QJXA 3OILA 5G0CA 2NWZA 3KOKA 1DCBA 5JG5B 1KOQA 1CNBA 3SBIA 2GEHA 3FFPX 4Q7SA 1OKNA 4M2VA 4Q6DA 1TTMA 4R5BA 3DC9A 3DVBA 2NNGA 3KIGA 1TBTX 2FOYA 1KWRA 4PQ7A 4YGFA 5DOGA 4Q99A 4CNVA 4Q49A 3RLDA 4BF6A 1I8ZA 3SAXA 5JEPB 3P58A 4QSIA 2HNCA 4JSZA 4QY3A 9CA2A 3NI5A 1CAMA 5FL6A 5LMDA 4K0TA 3DVDA 5DSQA 3V3FA 3M1QA 2FNMA 5FLTA 1RZAA 3MDZA 1ZE8A 4C3TA 1CVFA 1JCZA 4MDGA 1G48A 4M2RA 3R16A 3TVNX 1F2WA 1G0EA 4Q07A 2WEJA 1BN3A 3V2JA 1I91A 1YDCA 1CVBA 1THKA 2X7TA 1OKLA 4KNJA 4BCWA 4Q83A 3OIKA 1ZNCA 4YXUA 3V7XA 1G46A 4G7AA 3W6IA 4E3FA 3V3JA 1XPZA 1CCUA 3S73B 3KWAA 1H9QA 1FLJA 3OY0A 2W2JA 1MUAA 1CILA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4K1Q A;  3RZ5 A;  3S9T A;  1CVD A;  3VBD A;  4QJW A;  3MHM A;  3MYQ A;  4YXO A;  4YWP A;  5FDC A;  3M2N A;  1Z9Y A;  1YDB A;  3P5A A;  1ZFK A;  5L6K A;  3B4F A;  3MNH A;  3M1W A;  4RUY A;  3ZNC A;  1RZD A;  4ETQ C;  2AW1 A;  1G52 A;  1CNK A;  1CNH A;  1FQR A;  5DSP A;  3RZ1 B;  5AML A;  1CAO A;  3JXG A;  1TH9 A;  4FU5 A;  3NB5 A;  3T83 A;  1G1D A;  4FVO A;  5FNL A;  3D9Z A;  4Q78 A;  4WR7 A;  4E49 A;  2X7U A;  3V2M A;  1ZGE A;  3M04 A;  3V3G B;  1CRA A;  2VVA X;  1ZGF A;  4UOV A;  1G45 A;  1HVA A;  5BRU A;  4TWL A;  1LG5 A;  3HKT A;  2NWP A;  1HEA A;  2CBA A;  1J9W A;  1UGG A;  1TG9 A;  2H15 A;  3UYN A;  4YGJ A;  2QOA A;  5C8I A;  4N0X B;  3LXE A;  1TB0 X;  2FOU A;  4IWZ A;  2NNS A;  3F8E A;  5SZ0 A;  4ITP A;  3N0N A;  5EHV A;  5EKM A;  4R5A A;  3M3X A;  2OSF A;  1I9O A;  4MLX A;  4ZAO A;  5FNJ A;  3D92 A;  3DCS A;  3IEO A;  4HBA A;  5CJF A;  5JQT A;  4RFD A;  1CNG A;  1CVE A;  4RFC A;  4E4A A;  5CAC A;  4MDM A;  3IBL A;  4E5Q A;  1YDA A;  3QYK A;  1KWQ A;  5FLR A;  5DOH A;  4K13 A;  3M5E A;  2Q1Q A;  3B1B A;  5E5U A;  3RYV B;  4QTL A;  1LUG A;  1G0F A;  3HLJ A;  3P5L A;  5DSR A;  3EFT A;  1KEQ A;  4G0C A;  3MNI A;  2CBE A;  4PYX A;  1RZC A;  4LP6 A;  3F7U A;  1AZM A;  3RJ7 A;  1Y7W A;  4CNW A;  5E2S A;  1HUG A;  1ZFQ A;  3C7P A;  3KOI A;  1BNV A;  1CNC A;  4R59 A;  2IT4 A;  3NJ9 A;  1XQ0 A;  4JSA A;  1BN4 A;  4FVN A;  1CAK A;  2POW A;  4WW8 A;  5SZ3 A;  3RYY A;  3K7K A;  5E2R A;  4YXI A;  1IF6 A;  4QIY A;  4FIK A;  4JS6 A;  1CAH A;  1YDD A;  4QIZ A;  2WEO A;  1TE3 X;  3N3J A;  1CVA A;  1UGC A;  1JV0 A;  4QJM A;  1BNN A;  3CYU A;  1RAZ A;  4RUX A;  3OYS A;  1IF9 A;  3PYK A;  5E2N A;  3D8W A;  5EH5 A;  3MWO A;  4PZH A;  4ITO A;  2CBD A;  5EOI A;  4PYY A;  3M1K A;  3CZV A;  2FNK A;  2NN1 A;  3S8X A;  1T9N A;  1LGD A;  1BV3 A;  4XFW A;  3P55 A;  4M2U A;  1UGA A;  4ZX1 A;  4K0Z A;  1IF5 A;  3S72 B;  3DAZ A;  1URT A;  1XEV A;  3IBI A;  3PO6 A;  2O4Z A;  3F4X A;  5A6H A;  2ZNC A;  3RZ0 B;  4K0S A;  5FNG A;  1CVH A;  1RZE A;  1TEQ X;  3CA2 A;  1FQM A;  2CBC A;  2HL4 A;  1LZV A;  1I9P A;  1FR4 A;  4Q90 A;  4Z1J A;  3MNJ A;  3HKU A;  5BRW A;  3OYQ A;  4Q9Y A;  4QSB A;  1ZSC A;  4X5S A;  3MMF A;  4Z1K A;  2QP6 A;  3T85 A;  3ML2 A;  5AMG A;  1CCT A;  3DCC A;  3JXF A;  2FW4 A;  4HU1 A;  4CA2 A;  3ZP9 A;  2CAB A;  3P44 A;  3HFP A;  1I9N A;  2WD2 A;  1CNW A;  3RYJ B;  4YX4 A;  3K34 A;  3M5T A;  3MHL A;  5DSN A;  4CNX A;  4N16 A;  1G4J A;  2FMG A;  3EFI A;  3V3I B;  4ZWY A;  5SZ7 A;  3RG4 A;  4Z1N A;  3SBH A;  1G3Z A;  4WUQ A;  4Q09 A;  2AX2 A;  5A25 A;  7CA2 A;  1UGF A;  2WEH A;  5JGT B;  1G6V A;  1IF7 A;  5JDV B;  2OSM A;  3PJJ A;  4KUY A;  1DMX A;  1UGE A;  3OKU A;  3MNA A;  4ILX A;  4LHI A;  4Q8Y A;  3DCW A;  3S71 B;  3T82 A;  5JEG B;  1CAN A;  4FL7 A;  4LU3 A;  1AM6 A;  1HCB A;  1HEC A;  1CIN A;  1ZH9 A;  3M2Y A;  3MHC A;  1HED A;  4QJP A;  5DSJ A;  5E28 A;  1JD0 A;  1A42 A;  1Z97 A;  2POV A;  3DVC A;  1LG6 A;  1BN1 A;  1G53 A;  5FNK A;  12CA A;  4L5U A;  5SZ4 A;  4HT2 A;  6CA2 A;  4HEZ A;  1BCD A;  3CAJ A;  5JEH B;  5JES B;  1IF4 A;  2Q1B A;  1CRM A;  4KP5 A;  3N4B A;  4QK3 A;  4ZWI A;  4WUP A;  2EU3 A;  1HEB A;  4TWM A;  4WW6 A;  4DZ9 A;  2FOV A;  4RIU A;  4QSA A;  4YYT A;  2WD3 A;  1G54 A;  3P3J A;  2HOC A;  2HD6 A;  1CA3 A;  2NWY A;  3RGE A;  4E3G A;  4QSJ A;  1IF8 A;  4CQ0 A;  1CIM A;  4KNM A;  2CBB A;  5G01 A;  3RYZ A;  4Q8Z A;  3S77 B;  4L5W A;  3MHO A;  5E2K A;  5AMD A;  1DCA A;  4Y0J A;  5DSL A;  5JG3 B;  4CNR A;  3M2X A;  5SZ5 A;  1XEG A;  1H4N A;  3KLD B;  4XIW A;  3IGP A;  5EKH A;  1HUH A;  1UGB A;  4HEY A;  3F7B A;  1CAZ A;  3FE4 A;  2F14 A;  3TVO X;  4FRC A;  2POU A;  1CNX A;  5JQ0 A;  1UGD A;  4Q08 A;  2FOQ A;  3KON A;  4KUW A;  1FR7 A;  2GD8 A;  4GL1 X;  3T5Z A;  4YVY A;  5DVX A;  3U45 X;  5SZ1 A;  1OKM A;  2NNO A;  1I90 A;  1Z93 A;  3S78 B;  5EH8 A;  3HKN A;  1BZM A;  1BNQ A;  2NMX A;  3DD8 A;  5E5R A;  3S75 B;  5G03 A;  4HEW A;  1ZSA A;  4JSS A;  5EHW A;  3JXH C;  1FQN A;  2FOS A;  4JSW A;  3BL0 A;  5FNH A;  1FSQ A;  4E9O X;  5CA2 A;  2EZ7 A;  3R17 B;  1ZSB A;  5BRV A;  3N2P A;  5EHE A;  3MZC A;  2ABE A;  5DSO A;  3M1J A;  5DRS A;  3V5G A;  4L5V A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4BF6A

Total Genus

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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