4E3HA

Nucleophile recognition as an alternative inhibition mode for benzoic acid based carbonic anhydrase inhibitors
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Nucleophile recognition as an alternative inhibition mode for benzoic acid based carbonic anhydrase inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2012-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4e3hA00
4E3FA 1CNXA 3D93A 5CJFA 3NJ9A 5E5UA 3V5GA 3IAIA 5G03A 5SZ4A 4QJ0A 2QOAA 4UOVA 5DVXA 3S97A 3IBUA 3MZCA 4FPTA 4HEYA 5FNKA 3M98A 4CNVA 3N0NA 3EFIA 4QJOA 1YDAA 5FNGA 4XIWA 3DVCA 2NN7A 5FLQA 2W2JA 2NXTA 5DSJA 2WEOA 3D8WA 3RYVB 3KLDB 2NNSA 4Z0QA 2NWYA 3DVBA 5EOIA 3M1WA 1G52A 1G0EA 4ITPA 3MDZA 5DOGA 2NNVA 3RYJB 4KP8A 4HEZA 4YVYA 5DSMA 1CAZA 4M2UA 5FNLA 2FMZA 4LHIA 1THKA 3KWAA 1CVCA 1TEQX 1FLJA 1UGBA 4Z1JA 1Z9YA 3DC9A 1G0FA 4CNXA 4N16A 1RZCA 3V3HB 5EKHA 5J8ZA 3DCWA 1I9LA 2HL4A 3RLDA 4RIVA 2NXSA 1URTA 3UYQA 4Q07A 1LG5A 1DCBA 3MNUA 1RJ6A 3M96A 1CVBA 1LG6A 4KNMA 1I8ZA 1BCDA 4BCWA 3HKNA 1CAOA 5JGTB 1BNMA 2NWZA 1CILA 3JXGA 6CA2A 1UGEA 1DMYA 4C3TA 5DOHA 3P4VA 4TWMA 4QEFA 4QTLA 4Q99A 1TBTX 4KUWA 3NB5A 5SZ1A 3T85A 5L3OA 2Q1BA 3D9ZA 4PQ7A 1OKMA 1IF9A 4GL1X 3KOIA 1JV0A 3D92A 2X7TA 3MHMA 3F8EA 5JEHB 2F14A 1Z97A 5JQTA 4DZ7A 1FQMA 5DSNA 1RZBA 4K13A 5BRUA 4E3GA 4Q09A 4TWLA 3L14A 4FRCA 3M14A 1TG9A 1CVDA 3MNIA 4KNNA 4XIXA 4M2RA 1CAKA 1G48A 3TMJA 1CNIA 1UGFA 2HD6A 3PYKA 3P58A 1OKNA 4Q6DA 1TG3A 3S9TA 1ZFQA 1BNQA 5SZ3A 3CAJA 1AM6A 2OSFA 4KV0A 4E9OX 1AVNA 5JG5B 3T84A 2CABA 2POUA 4ITOA 4QJPA 4ZX0A 3BETA 1TEUX 2FOVA 4MTYA 3S72B 12CAA 5E28A 3DA2A 1CNBA 3F7UA 3OILA 3T5ZA 1IF5A 1V9IC 1TE3X 4QK3A 3S75B 5FNIA 1HECA 2WD3A 5HPJA 1CNKA 3Q31A 5BRVA 3HLJA 3M40A 3TVOX 3IEOA 4QY3A 4KNIA 4FVNA 1KWQA 3MNAA 2FNKA 4ZWYA 2O4ZA 1HUHA 2FOYA 5DSIA 4YXIA 3MWOA 3P3HA 1TB0X 5AMDA 5FDIA 4Q7SA 3DC3A 3UYNA 5FLSA 1G45A 4G7AA 3RYYA 3KONA 1RAYA 3IGPA 1CA3A 1TTMA 3N2PA 3F4XA 4WL4A 3S8XA 4G0CA 3LXEA 5FLPA 4Q78A 1RAZA 1BZMA 2CBCA 2WEHA 3OYQA 4Q90A 4PXXA 1FSRA 5JQ0A 1HCBA 1KOQA 1ZNCA 2FOQA 5E2RA 3TVNX 4CNRA 3V7XA 3FFPX 4HBAA 3PJJA 1BNVA 1CVEA 3M1JA 1DCAA 4KNJA 4QIYA 3M67A 3OKUA 4Q8YA 5DSRA 4KAPA 3DBUA 1HUGA 1FSNA 4Q7WA 4YXOA 5E2KA 4CNWA 4RFDA 2POWA 2HOCA 1I91A 5JEPB 4HT2A 3S76A 1XEVA 1CIMA 1G6VA 3B1BA 1H9NA 4MO8A 5JG3B 2AW1A 1BN3A 1UGAA 3W6IA 3T5UA 1CAJA 4MDMA 5EHEA 3RG3A 1RZEA 3RYXB 1FR4A 5FLRA 4Q08A 4Q7VA 5AMLA 1F2WA 3M2YA 1G3ZA 4QK1A 2NWOA 1IF4A 2ZNCA 1CVHA 5EH8A 3RZ0B 3S77B 3V3FA 2NWPA 1CRMA 3PO6A 4M2WA 1YDDA 1XEGA 2FOSA 4RUZA 4ILXA 4Y0JA 1JCZA 4JSWA 5E2MA 3T82A 1BNTA 1UGCA 4JSAA 1YO1A 1FSQA 1CA2A 3OIMA 3SAXA 3MHLA 3MHIA 1IF8A 4MLXA 1HEDA 4IDRX 2ABEA 5JESB 4HT0A 5DSQA 1LUGA 4E3HA 4YGLA 2H4NA 4KUYA 5FL6A 1DMXA 4YWPA 4WW8A 3HKTA 2QP6A 4Q8ZA 5BNLA 5FNHA 4PYXA 3GZ0A 4QJWA 3S71B 1FQNA 3V3JA 1G54A 4FU5A 2CA2A 4DZ9A 3JXHC 3V3IB 4RN4A 3RJ7A 1H4NA 2H15A 4JSZA 1OQ5A 4YGNA 3HFPA 4Q81A 4R5BA 5FNJA 4E4AA 4Q06A 4CQ0A 4QSAA 4CA2A 1IF7A 3BL1A 5BYIA 4MDLA 5EHVA 4XZ5A 3VBDA 1ZFKA 2NNGA 9CA2A 2ILIA 1KWRA 4RUYA 4E5QA 4KUVA 3DD0A 1RJ5A 4Q49A 4QSBA 1CANA 3IBLA 4JS6A 4RFCA 2HKKA 3M1KA 2EU2A 1BNUA 5E2SA 1KOPA 1OKLA 4YXUA 2EU3A 4KP5A 4E3DA 3SAPA 5A25A 4Q8XA 3ML5A 5G01A 5EKJA 1G46A 4QJXA 4LU3A 1XQ0A 2OSMA 3N4BA 1YO2A 4K0TA 3OYSA 1ZE8A 2CBEA 4BF1A 5LMDA 3M5TA 5EH7A 3RZ8A 3RZ7A 1CNHA 3DD8A 3R17B 3MYQA 4RIUA 1G1DA 2CBBA 3MHCA 1ZSAA 5L6KA 3KIGA 1IF6A 1ZGFA 1HEBA 1I9MA 2NXRA 3RZ5A 3JXFA 1XPZA 3MMFA 4Q87A 5E2NA 5EH5A 4ZWZA 4YX4A 1Z93A 1LGDA 2FW4A 4XE1A 5EKMA 4QJMA 1CVAA 5EHWA 2AX2A 3M04A 4WR7A 1I90A 3SBHA 1CALA 1HEAA 1YO0A 3R16A 3IBIA 4QIZA 3OKVA 3CZVA 1BV3A 3W6HA 1ZSBA 4K0ZA 4RUXA 2WEJA 1HCAA 4HEWA 2WEGA 2X7SA 4FL7A 3KKXA 3KNEA 4Q83A 5DSKA 3F7BA 2EZ7A 5BRWA 4MLTA 3RZ1B 3M2XA 5DRSA 1CCSA 2NMXA 3MHOA 3K7KA 2HNCA 3N3JA 1FQLA 4YYTA 1CVFA 2GD8A 1CNYA 4COQA 8CA2A 4QSIA 1YDCA 3RGEA 5E5RA 1I9OA 3FE4A 3M5EA 4K0SA 1CCUA 4Q7PA 1CNCA 2FNNA 4HF3A 1ZSCA 4YGFA 3S74B 3B4FA 4RH2A 2HFWA 1I9NA 2Q38A 5EIJA 3S78B 2NN1A 1V9EA 3V2MA 2WD2A 4ZWIA 4Z1KA 2Q1QA 4E49A 1FQRA 3P3JA 3DVDA 5FNMA 1I9QA 3OIKA 1HVAA 4YGJA 4Z1EA 1LZVA 5A6HA 5FL5A 3BL0A 3CYUA 4N0XB 4WW6A 1BN1A 5FDCA 3ML2A 3U7CA 1Y7WA 4FIKA 2NNOA 3U3AX 1A42A 4LP6A 4ETQC 2CBAA 7CA2A 5JDVB 5CA2A 1JD0A 2CBDA 2POVA 3S73B 5IPZA 3K34A 4PYYA 3V2JA 2VVBX 1RZAA 4L5UA 3CA2A 3K2FA 1ZGEA 4YGKA 1CAYA 3KOKA 3EFTA 4M2VA 3RG4A 4R5AA 2FMGA 4CACA 4JSSA 4Q6EA 4IWZA 4BF6A 1CRAA 4Q9YA 2QO8A 4L5WA 1CAIA 3ZNCA 4Z1NA 5SZ2A 3M2ZA 3MNJA 3SBIA 4WUQA 5FL4A 1CCTA 3RYZA 2IT4A 3DCCA 5FLOA 5AMGA 5DSPA 3P5LA 1G4OA 5CACA 1EOUA 1T9NA 4XFWA 3C7PA 5SZ0A 1YDBA 1CAHA 1H9QA 3HKQA 3QYKA 1G53A 3DCSA 3M1QA 5C8IA 1RZDA 5DSOA 1J9WA 4QK2A 3IBNA 4PZHA 1I9PA 5FLTA 3MNHA 5JGSB 1FR7A 4K1QA 1MOOA 1UGGA 5JEGB 5G0BA 5SZ6A 3FW3A 5EZTX 4R59A 3HKUA 1CZMA 3M2NA 3M3XA 1CINA 3P55A 5G0CA 3ZP9A 1UGDA 4L5VA 3OY0A 3HS4A 5DSLA 1ZH9A 5CLUA 4ZWXA 1AZMA 1BN4A 3D0NA 4QSJA 3MNKA 1TH9A 2VVAX 3T83A 1BNWA 4MDGA 1MUAA 3KS3A 4HU1A 4X5SA 1CNWA 1CNJA 1G4JA 3M5SA 4YHAA 1BICA 1CAMA 1CNGA 3U45X 3P44A 4ZX1A 5SZ7A 4Q0LA 4ZAOA 3V3GB 2GEHA 4WUPA 3DAZA 3U47A 4FVOA 2X7UA 1BNNA 5SZ5A 3P5AA 3DV7A 3NI5A 1KEQA 2FNMA 2FOUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4E3F A;  1CNX A;  3D93 A;  5CJF A;  3NJ9 A;  5E5U A;  3V5G A;  3IAI A;  5G03 A;  5SZ4 A;  4QJ0 A;  2QOA A;  4UOV A;  5DVX A;  3S97 A;  3IBU A;  3MZC A;  4FPT A;  4HEY A;  5FNK A;  3M98 A;  4CNV A;  3N0N A;  3EFI A;  4QJO A;  1YDA A;  5FNG A;  4XIW A;  3DVC A;  2NN7 A;  5FLQ A;  2W2J A;  2NXT A;  5DSJ A;  2WEO A;  3D8W A;  3RYV B;  3KLD B;  2NNS A;  4Z0Q A;  2NWY A;  3DVB A;  5EOI A;  3M1W A;  1G52 A;  1G0E A;  4ITP A;  3MDZ A;  5DOG A;  2NNV A;  3RYJ B;  4KP8 A;  4HEZ A;  4YVY A;  5DSM A;  1CAZ A;  4M2U A;  5FNL A;  2FMZ A;  4LHI A;  1THK A;  3KWA A;  1CVC A;  1TEQ X;  1FLJ A;  1UGB A;  4Z1J A;  1Z9Y A;  3DC9 A;  1G0F A;  4CNX A;  4N16 A;  1RZC A;  3V3H B;  5EKH A;  5J8Z A;  3DCW A;  1I9L A;  2HL4 A;  3RLD A;  4RIV A;  2NXS A;  1URT A;  3UYQ A;  4Q07 A;  1LG5 A;  1DCB A;  3MNU A;  1RJ6 A;  3M96 A;  1CVB A;  1LG6 A;  4KNM A;  1I8Z A;  1BCD A;  4BCW A;  3HKN A;  1CAO A;  5JGT B;  1BNM A;  2NWZ A;  1CIL A;  3JXG A;  6CA2 A;  1UGE A;  1DMY A;  4C3T A;  5DOH A;  3P4V A;  4TWM A;  4QEF A;  4QTL A; 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