4FPTA

Carbonic anhydrase ii in complex with ethyl (2z,4r)-2-(sulfamoylimino)-1,3-thiazolidine-4-carboxylate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title High resolution crystal structures of Carbonic Anhydrase II in complex with novel sulfamide binders
rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2012-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4fptA00
5EH8A 4QK1A 3V5GA 3M04A 1UGGA 1F2WA 2GD8A 3P55A 4QTLA 4HEYA 5JGTB 1LG5A 1G4OA 1CRAA 1G54A 3EFTA 4Q6DA 3N2PA 5E28A 5FLTA 4Q7WA 2WEHA 3RYZA 1I9NA 2ILIA 1IF8A 4UOVA 1I9OA 4YXOA 4FIKA 4TWMA 5L3OA 4YWPA 1AM6A 1CCSA 1KOPA 5HPJA 3MWOA 1IF9A 2FOSA 4PXXA 1BZMA 1TG3A 3RJ7A 4HBAA 4DZ7A 4QK2A 5DRSA 1URTA 4M2UA 5FLPA 5EKMA 5BRVA 1YO0A 4Q6EA 4YXUA 5DOGA 1RJ6A 4E3DA 2FOUA 1CAZA 3FFPX 3TVOX 3S97A 4KNMA 3SAXA 2HOCA 1CCTA 3V3JA 4XIXA 1FR7A 1DCBA 4CQ0A 4ZWYA 2NNGA 5JQTA 5FNJA 5G03A 1G3ZA 1I9QA 3V2JA 3Q31A 3T5ZA 3M5EA 1CINA 4FPTA 3TVNX 4BF1A 4QSIA 4XFWA 5EH7A 4KUVA 1EOUA 1TEUX 3JXFA 3P4VA 5E2NA 5FDIA 5DSIA 5AMDA 1TTMA 3BL0A 3DVCA 4Q0LA 4WUPA 1FSRA 4TWLA 1H9QA 1KWRA 1OQ5A 3S73B 4KNIA 3M2YA 5G0CA 4LHIA 4QK3A 1CIMA 1YO1A 3KLDB 1T9NA 3M2XA 1KOQA 5DSPA 9CA2A 1Z97A 4QIYA 3MHOA 5FLRA 3N3JA 4KV0A 3HKQA 4QSAA 1ZGEA 1CA2A 2GEHA 3FW3A 1IF5A 1YDAA 3EFIA 1CAMA 1XQ0A 3K2FA 3P44A 4N16A 3DCWA 3D93A 1CVDA 4CNXA 4L5VA 5FNKA 4LU3A 5G01A 1CZMA 3V3FA 3L14A 4FU5A 5CACA 1V9IC 4KP5A 4Q09A 3M3XA 4R5BA 3B4FA 5J8ZA 6CA2A 3M67A 5BYIA 4ILXA 3V3HB 5JG5B 3V2MA 5E5RA 5SZ4A 3RGEA 3RZ5A 4E5QA 3IGPA 5L6KA 4ZX0A 4ZWZA 1YDDA 3D9ZA 4QJMA 2ZNCA 1I8ZA 4DZ9A 4COQA 4Q83A 3M5TA 2Q1QA 5DVXA 5JDVB 5SZ7A 3M2ZA 5SZ6A 4Q8YA 3T82A 5C8IA 2NXRA 4R5AA 4M2RA 3DD8A 5SZ3A 5JEPB 2NWYA 3R16A 4K0SA 1XPZA 1I9MA 1ZGFA 2WEJA 1BCDA 1RZAA 5JEGB 4QJPA 1G46A 4C3TA 1Z93A 4BCWA 2CBAA 5BRUA 1I91A 4ZWIA 2HD6A 2NWZA 3OKVA 4BF6A 4JSSA 3SBIA 2WD3A 4R59A 3MNKA 2FOQA 5DOHA 4Q7VA 5JESB 1A42A 1ZSCA 4LP6A 4E3GA 1FSNA 2FNKA 1OKMA 1G53A 3DAZA 2CA2A 3RZ1B 2HNCA 3KOKA 5EHVA 3U47A 4HT2A 3DC9A 3BL1A 5DSMA 12CAA 4CACA 4RUYA 3F8EA 4YYTA 5CA2A 2FMGA 4QSJA 3KOIA 7CA2A 2NMXA 4JSZA 2WEGA 2CABA 1I90A 3RYJB 1FR4A 4X5SA 5FNGA 1CILA 1CNIA 1CAJA 3DCSA 1FLJA 1DCAA 1XEGA 3OYSA 1CANA 3DVBA 3N4BA 3PYKA 3DC3A 4IDRX 3F4XA 2H4NA 1TE3X 2WEOA 1BNUA 4Z1EA 2VVAX 3HKUA 3DBUA 5CLUA 1JCZA 3NJ9A 4HEZA 4MDGA 2HKKA 3F7UA 3MNJA 3P3JA 4Q99A 4L5WA 4YGNA 4XE1A 1J9WA 3OIKA 1I9PA 3M14A 5DSQA 2FNMA 4CNWA 2CBBA 1H9NA 1CVHA 2WD2A 3HS4A 4RH2A 3V3IB 5FNLA 3QYKA 2CBDA 3CYUA 2FOYA 1CNWA 1G1DA 4KUYA 3ML5A 3R17B 1DMYA 3JXGA 2NNVA 1CVBA 1G45A 4ITPA 1G0FA 5JGSB 3MYQA 3ZNCA 4QJOA 4Q49A 1HUGA 1CVEA 1HVAA 3GZ0A 2OSMA 1LUGA 1ZFKA 4G7AA 4MLTA 5FL6A 1THKA 4HF3A 4PYYA 1HEAA 5E2KA 2NNOA 3MHCA 5SZ5A 5DSRA 4Q7SA 1CNXA 4MLXA 1BN3A 1RZEA 2W2JA 1CVFA 4RUZA 2NXSA 4E3HA 1CNJA 3IBUA 3W6IA 4Q81A 3ML2A 3DV7A 3P5LA 1FQLA 2POUA 4HU1A 1CAKA 4JSWA 2EZ7A 5FL4A 1MOOA 1AZMA 5G0BA 2QO8A 1RAYA 3KONA 1HCAA 1CNGA 4Q07A 1YDCA 3RYVB 4Y0JA 3MNUA 1CVAA 3CAJA 5A6HA 8CA2A 4Q08A 2Q1BA 1HUHA 4N0XB 4MTYA 1XEVA 3S72B 4Z1NA 3UYQA 1RAZA 3OY0A 1BN4A 3RG4A 1CNBA 4RUXA 3S8XA 1IF6A 4WL4A 5DSOA 4E3FA 1OKLA 4WR7A 5AMLA 4QJWA 1BICA 3MDZA 3D92A 1KEQA 3KIGA 3T85A 3U3AX 4MO8A 1UGDA 3KWAA 1BNWA 4KNNA 4CNVA 5EH5A 1LGDA 4E49A 3IAIA 4QSBA 3T84A 3MMFA 1DMXA 2HFWA 5FLSA 3DCCA 3CZVA 1ZFQA 1FQNA 5SZ0A 1G6VA 2FMZA 4KUWA 3KS3A 2X7TA 3IBLA 2FW4A 3DD0A 4WUQA 1V9EA 3S77B 1FSQA 1CAHA 2POWA 1Y7WA 4YGKA 5FDCA 4ZWXA 4QEFA 1RZCA 3DA2A 2HL4A 5JEHB 3MNIA 3M5SA 3NB5A 2X7SA 4K13A 3HFPA 1TBTX 4Q06A 5CJFA 4Q87A 1OKNA 1Z9YA 3M1KA 5SZ2A 3W6HA 1CAOA 2NN1A 5JQ0A 3TMJA 3KKXA 3OILA 1AVNA 1CAIA 3MHLA 1JD0A 3HLJA 4ZAOA 3OKUA 4Q90A 3M1WA 5FL5A 2Q38A 3DVDA 5FNMA 2NNSA 5DSLA 5E5UA 2FOVA 1CAYA 2IT4A 1UGEA 4YHAA 2EU3A 4QY3A 3BETA 3S71B 3MZCA 5A25A 1UGFA 4K0TA 3HKNA 3IBIA 4RN4A 2O4ZA 1G52A 2AX2A 3NI5A 5FLQA 4CA2A 3T5UA 3M2NA 3M1JA 1FQRA 1BV3A 1JV0A 4Q78A 4KNJA 3D0NA 3K34A 3OYQA 4Z0QA 5EKJA 3RZ8A 3RG3A 5EHWA 3SBHA 4G0CA 1ZSAA 3PO6A 3RZ7A 4MDMA 2QP6A 3M96A 4JS6A 3RYYA 3IEOA 3B1BA 4FL7A 1BNMA 3S9TA 3F7BA 3PJJA 3HKTA 1G4JA 1TG9A 3SAPA 1HEBA 5DSNA 1YO2A 4CNRA 4XIWA 1CNHA 5BRWA 1ZE8A 3RYXB 1CA3A 1RZDA 4YX4A 5DSKA 1BN1A 4FRCA 5SZ1A 3D8WA 3RZ0B 2FNNA 3K7KA 4YGFA 4GL1X 3M40A 3V3GB 1HEDA 4XZ5A 4YVYA 4YGJA 4L5UA 5LMDA 4RFDA 1BNNA 3MHMA 3KNEA 2NXTA 4Q8ZA 4FVOA 3MNAA 2NWPA 2H15A 1HECA 4FVNA 5EZTX 3S78B 1IF4A 5EIJA 3P58A 2QOAA 1CRMA 4PYXA 1TB0X 1TEQX 3P3HA 1BNQA 1CNYA 2NN7A 1LG6A 2CBCA 3C7PA 3S76A 3P5AA 4RFCA 1KWQA 3RLDA 2ABEA 5E2MA 5FNHA 3MNHA 4ZX1A 1UGCA 2NWOA 1G0EA 4YXIA 1RZBA 4Q7PA 5AMGA 3U45X 5EKHA 3MHIA 3ZP9A 1IF7A 1CNCA 5FNIA 4JSAA 5IPZA 3CA2A 4PZHA 5EHEA 4QJ0A 1YDBA 2OSFA 1ZH9A 1ZSBA 4IWZA 4QJXA 5EOIA 3S74B 1UGAA 3S75B 4Q8XA 2X7UA 1FQMA 3V7XA 4M2WA 3LXEA 5BNLA 3IBNA 4Z1JA 4ETQC 1CALA 1BNVA 1TH9A 4E4AA 4HT0A 2F14A 3OIMA 3UYNA 4MDLA 1RJ5A 3T83A 4HEWA 4RIUA 1CNKA 3JXHC 1CVCA 4ITOA 4KAPA 1G48A 1HCBA 2CBEA 1BNTA 1UGBA 3M98A 4M2VA 4PQ7A 4Q9YA 5E2SA 4Z1KA 3M1QA 2EU2A 1CCUA 4K1QA 5JG3B 1MUAA 5E2RA 3FE4A 3VBDA 5FLOA 4K0ZA 4RIVA 5DSJA 3N0NA 1H4NA 4KP8A 4YGLA 4WW6A 4E9OX 1ZNCA 4QIZA 1LZVA 4WW8A 3U7CA 1I9LA 2VVBX 2AW1A 2POVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5EH8 A;  4QK1 A;  3V5G A;  3M04 A;  1UGG A;  1F2W A;  2GD8 A;  3P55 A;  4QTL A;  4HEY A;  5JGT B;  1LG5 A;  1G4O A;  1CRA A;  1G54 A;  3EFT A;  4Q6D A;  3N2P A;  5E28 A;  5FLT A;  4Q7W A;  2WEH A;  3RYZ A;  1I9N A;  2ILI A;  1IF8 A;  4UOV A;  1I9O A;  4YXO A;  4FIK A;  4TWM A;  5L3O A;  4YWP A;  1AM6 A;  1CCS A;  1KOP A;  5HPJ A;  3MWO A;  1IF9 A;  2FOS A;  4PXX A;  1BZM A;  1TG3 A;  3RJ7 A;  4HBA A;  4DZ7 A;  4QK2 A;  5DRS A;  1URT A;  4M2U A;  5FLP A;  5EKM A;  5BRV A;  1YO0 A;  4Q6E A;  4YXU A;  5DOG A;  1RJ6 A;  4E3D A;  2FOU A;  1CAZ A;  3FFP X;  3TVO X;  3S97 A;  4KNM A;  3SAX A;  2HOC A;  1CCT A;  3V3J A;  4XIX A;  1FR7 A;  1DCB A;  4CQ0 A;  4ZWY A;  2NNG A;  5JQT A;  5FNJ A;  5G03 A;  1G3Z A;  1I9Q A;  3V2J A;  3Q31 A;  3T5Z A;  3M5E A;  1CIN A;  4FPT A;  3TVN X;  4BF1 A;  4QSI A;  4XFW A;  5EH7 A;  4KUV A;  1EOU A;  1TEU X;  3JXF A;  3P4V A;  5E2N A;  5FDI A;  5DSI A;  5AMD A;  1TTM A;  3BL0 A;  3DVC A;  4Q0L A;  4WUP A;  1FSR A;  4TWL A;  1H9Q A;  1KWR A;  1OQ5 A;  3S73 B;  4KNI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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