4GL1X

Structure of h64a/n62l/n67l human carbonic anhydrase ii triple mutant
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNLGAAFLVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Hydrophobicity and low pKa impact catalytic efficiency of Human Carbonic Anhydrases
rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2012-08-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4gl1X00
3P3JA 1ZH9A 4L5UA 2FOVA 2VVAX 1CA2A 1CNIA 1HUGA 3MHMA 4K0ZA 4RIUA 2AW1A 1CRMA 4MDGA 4E9OX 5JQTA 1G54A 4HT0A 1CINA 3ZP9A 4Q90A 4FRCA 4TWLA 2NXTA 1BNWA 3C7PA 1FQRA 4MLTA 5DSPA 3P5LA 1UGBA 2Q1QA 2W2JA 5A25A 4BCWA 3TMJA 3RYYA 3DA2A 1TBTX 4WR7A 3DAZA 3HKNA 2CBDA 4IDRX 1HEDA 3IGPA 4UOVA 1URTA 2OSMA 2CBBA 1KOPA 4Q07A 3PYKA 4BF1A 1RJ5A 4CQ0A 4CACA 5DSRA 5EOIA 3MDZA 5EH5A 5CACA 1IF5A 4YGKA 4Q8XA 2OSFA 3ZNCA 4HT2A 1Z9YA 3IAIA 1MOOA 5J8ZA 1CZMA 1BNNA 1CILA 4ZWZA 1G48A 2F14A 4ZX1A 4Z1NA 4MO8A 1UGAA 2VVBX 4LU3A 2QO8A 2H15A 3V3IB 4HEWA 1CIMA 5FNMA 3M1QA 2CBEA 3MHIA 3OYQA 5AMDA 3CAJA 2WEHA 4Q6DA 1YDDA 4X5SA 4YGNA 1CNXA 5DRSA 4Z1KA 3KNEA 4FPTA 1ZGEA 2FOYA 3HFPA 1HEAA 5LMDA 4MDLA 3S78B 3F8EA 1XPZA 4QK3A 1IF8A 1XEGA 3P3HA 3CA2A 3N4BA 4KNIA 1HCAA 2NWPA 1G4OA 1YO0A 1CAIA 3MNIA 5DSQA 1RZAA 2FNKA 3RG4A 3S76A 3S73B 3U3AX 3DCSA 4QSBA 2GEHA 3F4XA 5FL4A 5JGSB 4XIXA 1TEQX 3DD0A 3M1KA 5EKJA 5FLTA 1CAJA 5CLUA 2FOSA 2X7SA 1ZFKA 4KUVA 1THKA 1TG3A 4Q09A 5FL6A 3HS4A 4KAPA 2ILIA 1I9LA 1CAMA 3DVCA 4E3GA 4KP5A 4E4AA 4Q9YA 3U7CA 3S97A 1G0FA 2POUA 4YGJA 3SBHA 1YDCA 4KP8A 5L3OA 3M96A 3S8XA 3D8WA 3NI5A 4BF6A 4CNWA 3RZ8A 4N16A 3DVDA 4YXOA 2GD8A 3IBLA 3KWAA 3R16A 4M2RA 3M98A 4Q81A 1I9NA 4WL4A 1ZFQA 3B1BA 3HKUA 3OY0A 3RJ7A 1CCUA 3N3JA 4Z0QA 4FL7A 3S77B 1HUHA 3D93A 4K13A 1LG5A 4ZWYA 4YXUA 5AMLA 1ZSBA 1ZE8A 9CA2A 1F2WA 1OKNA 3OIKA 5BRVA 12CAA 3M2NA 4IWZA 3T84A 4C3TA 3Q31A 1H4NA 1UGDA 2FMZA 3DC9A 4MLXA 4JSAA 5G0CA 5EIJA 5E5UA 1JD0A 1G4JA 1YDBA 4QJXA 4ZX0A 4R5AA 5FLSA 3F7BA 5FDCA 1G46A 2ZNCA 4LP6A 5E2NA 4CNXA 3RLDA 2FOUA 3K34A 5EHWA 3RZ1B 3D0NA 1FQMA 1CAKA 4QY3A 5FLRA 1DMYA 1IF9A 1TTMA 1ZGFA 3T5UA 4QJPA 1I9OA 3OKUA 2FNMA 4Q06A 1UGEA 4PXXA 5DOHA 3LXEA 1DMXA 5SZ0A 1H9QA 2Q1BA 2CABA 1Y7WA 3M04A 3U45X 1BICA 1LZVA 4YXIA 4WW8A 5FNIA 3V3FA 1CNWA 1BNQA 4E49A 3OIMA 5EZTX 4PQ7A 1BNMA 2EZ7A 3SAPA 1OKLA 1BZMA 3L14A 4QSJA 2HKKA 4K1QA 3PO6A 4YVYA 4DZ7A 4DZ9A 4YGFA 3V3HB 3MZCA 4QIZA 3RZ0B 2HNCA 1BN3A 3UYNA 1CVCA 4QK1A 2QOAA 4RN4A 4ITOA 4PYXA 1HECA 1LUGA 3T5ZA 5L6KA 4FVNA 5EKMA 3V2JA 1TB0X 3DD8A 1XEVA 5FDIA 2ABEA 4RFCA 3V5GA 5BYIA 3CYUA 4QJWA 5SZ6A 2NWYA 4KNMA 4WUQA 1BV3A 5CA2A 3W6HA 1FR7A 1A42A 5FNJA 5AMGA 4JSSA 1G52A 2CA2A 1AM6A 4R59A 5SZ7A 3T83A 1FLJA 3EFIA 1BCDA 3HLJA 3KS3A 1YDAA 3V7XA 4COQA 3UYQA 4QK2A 5FLQA 3P44A 4WW6A 5DSLA 2O4ZA 3RZ5A 1JCZA 3ML5A 3JXFA 4KUYA 3S74B 3IBUA 4Q7WA 1MUAA 1AVNA 4M2UA 1CRAA 3IBNA 4KNJA 3JXHC 4G0CA 1CNCA 2EU3A 4LHIA 4GL1X 1KEQA 4HBAA 4Q49A 4L5VA 5FNGA 5BNLA 3OILA 5EKHA 4ZAOA 1CVHA 3BL1A 1JV0A 3SBIA 4RUZA 1YO2A 5DSMA 5HPJA 3DVBA 5FLOA 3DCWA 3QYKA 3TVOX 4YX4A 3OYSA 2NNGA 2WD2A 1DCAA 4MTYA 5SZ2A 6CA2A 1I9QA 3M2XA 3M5EA 4ILXA 4ETQC 1KWQA 1Z93A 4XFWA 3M40A 4R5BA 1CVDA 2FOQA 3KOIA 4RUXA 3DBUA 2POVA 1I90A 4HEZA 2NNSA 1RAZA 3RYJB 3M5TA 4QJOA 3MYQA 5FNLA 1FSQA 2HL4A 2NN7A 3D9ZA 3RYZA 5JG3B 3NB5A 4E3FA 1BNUA 5JGTB 4Q08A 1I8ZA 4RFDA 3IBIA 3JXGA 3KIGA 5E2SA 4XIWA 3V3GB 5FLPA 1CA3A 4Y0JA 4ZWIA 3P55A 3MWOA 3W6IA 1OQ5A 3FE4A 5FNKA 5CJFA 2WEOA 1G1DA 4CNRA 3MHCA 4YYTA 1ZSAA 1CALA 5JG5B 3MNJA 3V2MA 1FSNA 3MMFA 2EU2A 3M2ZA 4QJ0A 1KWRA 1CNHA 4E3DA 5E2RA 5BRWA 3F7UA 4YHAA 4QSIA 1LG6A 2NWZA 3IEOA 4XZ5A 1T9NA 1EOUA 4Q8ZA 2CBCA 3M1WA 5JDVB 5A6HA 4PYYA 4PZHA 5C8IA 3VBDA 1G3ZA 1CNJA 1I9PA 3NJ9A 3N2PA 5EH8A 4KNNA 4K0TA 3MNHA 4RH2A 8CA2A 5SZ4A 1BN1A 2FMGA 1G45A 2NXSA 1BNVA 1RZBA 2WEGA 1CVFA 2WD3A 4JS6A 4Q7SA 5DVXA 3MNAA 1FQNA 3RGEA 3OKVA 3HKTA 5G01A 5G0BA 1OKMA 4QSAA 2FNNA 1G6VA 3KONA 2NN1A 3S71B 1FQLA 5SZ3A 4RIVA 7CA2A 1IF4A 2AX2A 3CZVA 3MHOA 3BETA 2NWOA 4K0SA 4WUPA 5SZ5A 2CBAA 4TWMA 4YWPA 3RG3A 3R17B 1XQ0A 4RUYA 3K2FA 3DC3A 1LGDA 3MNKA 4HEYA 4M2VA 5JESB 1UGFA 4M2WA 2NMXA 5JEHB 2NNVA 2WEJA 1RZDA 5JEGB 5DSNA 3N0NA 1CNKA 4JSWA 1G53A 3M67A 3PJJA 5JEPB 1CANA 5SZ1A 1TE3X 1V9EA 1RJ6A 4KUWA 4FU5A 2HD6A 3RYVB 3TVNX 3BL0A 1RZCA 4Q8YA 1FSRA 3M1JA 1YO1A 5DSOA 3KOKA 4Z1JA 4FVOA 1TEUX 5E28A 5E5RA 3KKXA 1CNBA 1RAYA 1CCTA 5DSKA 3P5AA 3FFPX 3MNUA 4Q99A 3S75B 3M3XA 4Q6EA 3S72B 4JSZA 1HVAA 1KOQA 2QP6A 3K7KA 4N0XB 4CA2A 4FIKA 2HFWA 5BRUA 4CNVA 4QIYA 4L5WA 4Z1EA 2FW4A 3FW3A 3DCCA 1J9WA 4KV0A 5EHVA 1BNTA 1HCBA 5JQ0A 1CCSA 2NNOA 4Q7VA 4Q78A 2H4NA 1TH9A 1CNYA 3P58A 5FNHA 3ML2A 4MDMA 4ZWXA 1V9IC 1CVAA 5E2MA 1HEBA 5EH7A 1UGGA 3MHLA 2Q38A 4QEFA 3KLDB 3S9TA 1CAHA 4ITPA 1IF6A 3SAXA 1TG9A 1FR4A 4HU1A 5E2KA 1ZNCA 3M2YA 2NXRA 1I91A 3HKQA 4HF3A 3RYXB 1RZEA 1AZMA 3B4FA 3RZ7A 1CVEA 4YGLA 3T85A 5DOGA 1CAZA 5IPZA 1BN4A 1CNGA 4E5QA 1I9MA 1ZSCA 4Q0LA 1G0EA 3EFTA 2X7UA 2X7TA 1H9NA 3U47A 1Z97A 3T82A 4Q83A 1IF7A 2HOCA 2POWA 4QTLA 4XE1A 1CAYA 4Q87A 3P4VA 1CAOA 4QJMA 2IT4A 5G03A 1UGCA 4G7AA 4E3HA 3D92A 5EHEA 1CVBA 5FL5A 3M5SA 3V3JA 3DV7A 3M14A 4Q7PA 5DSJA 1DCBA 5DSIA 3GZ0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P3J A;  1ZH9 A;  4L5U A;  2FOV A;  2VVA X;  1CA2 A;  1CNI A;  1HUG A;  3MHM A;  4K0Z A;  4RIU A;  2AW1 A;  1CRM A;  4MDG A;  4E9O X;  5JQT A;  1G54 A;  4HT0 A;  1CIN A;  3ZP9 A;  4Q90 A;  4FRC A;  4TWL A;  2NXT A;  1BNW A;  3C7P A;  1FQR A;  4MLT A;  5DSP A;  3P5L A;  1UGB A;  2Q1Q A;  2W2J A;  5A25 A;  4BCW A;  3TMJ A;  3RYY A;  3DA2 A;  1TBT X;  4WR7 A;  3DAZ A;  3HKN A;  2CBD A;  4IDR X;  1HED A;  3IGP A;  4UOV A;  1URT A;  2OSM A;  2CBB A;  1KOP A;  4Q07 A;  3PYK A;  4BF1 A;  1RJ5 A;  4CQ0 A;  4CAC A;  5DSR A;  5EOI A;  3MDZ A;  5EH5 A;  5CAC A;  1IF5 A;  4YGK A;  4Q8X A;  2OSF A;  3ZNC A;  4HT2 A;  1Z9Y A;  3IAI A;  1MOO A;  5J8Z A;  1CZM A;  1BNN A;  1CIL A;  4ZWZ A;  1G48 A;  2F14 A;  4ZX1 A;  4Z1N A;  4MO8 A;  1UGA A;  2VVB X;  4LU3 A;  2QO8 A;  2H15 A;  3V3I B;  4HEW A;  1CIM A;  5FNM A;  3M1Q A;  2CBE A;  3MHI A;  3OYQ A;  5AMD A;  3CAJ A;  2WEH A;  4Q6D A;  1YDD A;  4X5S A;  4YGN A;  1CNX A;  5DRS A;  4Z1K A;  3KNE A;  4FPT A;  1ZGE A;  2FOY A;  3HFP A;  1HEA A;  5LMD A;  4MDL A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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