4HT0 | Genus

Total Genus 77

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	77
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__456193504420052__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__456193504420052__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4ht0/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__456193504420052__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"456193504420052","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4ht0/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__456193504420052__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	4-Substituted-2,3,5,6-tetrafluorobenzenesulfonamides as inhibitors of carbonic anhydrases I, II, VII, XII, and XIII. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	77
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2012-10-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	4ht0A00

2NNOA 4M2RA 1CVDA 2CBEA 3DC9A 3HKUA 4ETQC 8CA2A 3P3HA 2POWA 1V9EA 3HKTA 3M2ZA 3SAPA 1LG5A 4ZX0A 1CAZA 3P5LA 4BF6A 2NN1A 1HCAA 1TEQX 3K2FA 4DZ7A 2QOAA 4G0CA 4KP8A 1CNCA 5FLPA 3CZVA 4KNMA 2X7SA 3W6IA 1UGGA 1F2WA 1I9LA 2IT4A 1G1DA 1KOQA 2HNCA 4DZ9A 1HCBA 3MNJA 1YO0A 1HEDA 5EHWA 5FNKA 4K0ZA 1HEBA 2AW1A 3P55A 1BNMA 3ZP9A 3M2XA 3D9ZA 3OIMA 1CNJA 1LZVA 1J9WA 1CNGA 3T83A 4JS6A 4E3GA 3IEOA 1XQ0A 1CAIA 2NWOA 3OY0A 3S75B 1IF5A 3K7KA 4E9OX 1FQLA 1CIMA 1FSQA 5DSLA 3RLDA 4C3TA 3L14A 2NNGA 4L5WA 5DOGA 5E2NA 1G48A 5EZTX 5A25A 3IBLA 4JSWA 1V9IC 2FNNA 2CBAA 3S74B 3KOIA 3D92A 3M5EA 1CINA 3JXGA 1ZSAA 4Q49A 4XIXA 3OKUA 1CA3A 1ZSBA 2POVA 3DVCA 1BN4A 3RGEA 4Q99A 1YDCA 5DSKA 5SZ0A 3UYNA 1YDDA 1AZMA 3P5AA 5FLQA 4CNRA 2EU2A 3N0NA 5FDIA 1I9NA 1ZGFA 3MHCA 2WD2A 2FOUA 2W2JA 3C7PA 4ZWXA 1IF8A 3S71B 5BRWA 3B4FA 4Z1KA 1LG6A 3MHOA 5SZ5A 2ABEA 5SZ1A 4ITOA 2X7UA 4QSJA 5A6HA 1FQRA 5EIJA 3S77B 5BNLA 2WEHA 1BCDA 3HFPA 4YGLA 3T84A 4CNWA 4HEWA 4KP5A 4M2WA 4G7AA 3HKNA 1THKA 4Z1EA 3M67A 3V2MA 4QSBA 3DA2A 3D0NA 4PQ7A 2FMZA 5DSRA 3PO6A 3KKXA 1UGCA 2HD6A 4QIYA 3NB5A 5DSQA 1CNBA 1ZFQA 2FOSA 2CBBA 3MNUA 4TWLA 4GL1X 3U47A 4KNJA 3M2YA 4MDMA 1XEGA 1BNTA 4QJXA 1MUAA 1RZCA 2NXTA 6CA2A 2FOYA 5FNJA 1CVBA 3P3JA 5EKMA 5FNLA 1BZMA 4PYXA 1G4JA 3F7BA 3M5SA 4M2VA 5LMDA 5SZ4A 1ZSCA 3KNEA 3EFIA 5JG3B 1H9QA 1Z93A 3DAZA 3QYKA 4PZHA 4RFCA 4HBAA 1CAYA 2FOVA 4JSSA 5FLTA 1RZAA 4Q7VA 1IF9A 4UOVA 4KUVA 1ZNCA 2NNSA 3MHMA 5E5UA 4FVOA 5G01A 3KONA 5BYIA 1BN3A 1OKLA 1CALA 5DSMA 2VVAX 3JXFA 4Q7SA 4E3HA 4Q9YA 2AX2A 4ZWZA 4MLXA 2NXRA 2NWPA 1RZEA 1TEUX 2NNVA 4L5UA 4YXIA 3T85A 3MMFA 3DVBA 1CANA 3S97A 3V5GA 1Y7WA 4QJOA 5G0CA 1IF6A 1G45A 1CRAA 3V3IB 5SZ7A 3ML5A 2Q38A 3DVDA 4RUYA 4K0SA 1UGAA 4HEZA 1A42A 1JD0A 1BNQA 5FDCA 4YHAA 3OILA 1UGDA 3D93A 3JXHC 1BN1A 5FLOA 1CRMA 1ZE8A 5E28A 3V7XA 4Q06A 1CAMA 5CJFA 4QEFA 3F7UA 3OYSA 1OKMA 3W6HA 3S8XA 5CACA 4QJ0A 1HVAA 1JCZA 3RYXB 1CILA 1BNVA 4XE1A 4KV0A 3N2PA 3Q31A 5SZ2A 5EH7A 1Z97A 3NI5A 1CVAA 4QJPA 4RN4A 3P4VA 3MDZA 1G54A 2WEOA 2POUA 3RZ1B 4WR7A 3RJ7A 1G0FA 3MNAA 4N16A 1I90A 3S72B 3DCCA 4QK1A 5FLSA 1OKNA 4YGKA 4Q7WA 5IPZA 3LXEA 3DC3A 2CA2A 3V2JA 4BCWA 3D8WA 3IAIA 1CNXA 4QY3A 4WUPA 5DRSA 3ML2A 4Q09A 1CNIA 5FLRA 5EKJA 4LP6A 3RZ8A 1KWRA 2NN7A 5HPJA 2EU3A 2NWZA 5C8IA 3M1KA 2EZ7A 3MHLA 1CCUA 1YO1A 3NJ9A 1G4OA 1G53A 5AMGA 3V3GB 3DD0A 1CNYA 2CBDA 1G3ZA 4RIVA 4XFWA 4E5QA 4Z1NA 1FR4A 3TVOX 5DSJA 4HT0A 1LUGA 2VVBX 3MWOA 3F4XA 5DSOA 5E2KA 3BETA 5FNGA 5SZ6A 4BF1A 3S78B 4MO8A 2QO8A 3HLJA 1DCAA 9CA2A 1HUGA 3RZ7A 1I91A 1CAOA 4HT2A 1TBTX 4HEYA 1HUHA 2F14A 2ZNCA 3F8EA 4XZ5A 1UGEA 3SAXA 1ZH9A 3TMJA 1JV0A 3R17B 2WEGA 5CLUA 1I9MA 3EFTA 1I9QA 3KWAA 4R59A 4KUYA 3RG4A 4CNVA 3OYQA 4E4AA 3KIGA 12CAA 1HECA 3MYQA 1H9NA 1ZFKA 3MZCA 1FSNA 1G46A 3KLDB 4Q08A 3SBIA 4QJMA 1BNUA 3GZ0A 4YXUA 4IWZA 2WD3A 2H4NA 2GD8A 1AVNA 2FNMA 2X7TA 1BV3A 2O4ZA 4RUXA 1BNWA 1CVHA 5JG5B 4IDRX 3M40A 4QSAA 4Q0LA 4E3FA 4MDLA 1IF7A 3FE4A 3M2NA 5EHEA 4ZAOA 5BRUA 3T5UA 4CA2A 3S73B 3V3JA 1CVCA 5DOHA 5FNHA 1MOOA 1RZBA 3IGPA 3CAJA 4Z1JA 2HKKA 5JQTA 1RJ6A 1TG9A 3CYUA 2GEHA 3HS4A 1BNNA 1HEAA 4Q81A 5EKHA 4LU3A 3KS3A 3S76A 4WW6A 4ZWYA 4RUZA 5EOIA 4K13A 1G6VA 3M5TA 7CA2A 2HOCA 3KOKA 4ZWIA 4CACA 5DSNA 1FQNA 5G03A 1CAKA 4Q90A 3FW3A 3R16A 4YVYA 4YYTA 2QP6A 1KOPA 4KNNA 4Q6EA 4Y0JA 3N3JA 3T5ZA 2FOQA 4YGNA 3M98A 1URTA 3RZ5A 1BICA 3DBUA 4FL7A 2H15A 4RIUA 5DSPA 5JEHB 2OSFA 3DCSA 3VBDA 4WUQA 3UYQA 4RFDA 1CAJA 4JSAA 4YXOA 5JEPB 4L5VA 4Q7PA 4TWMA 5AMDA 1CCSA 1FQMA 2OSMA 5G0BA 3M1WA 5EHVA 4X5SA 4FIKA 5AMLA 3S9TA 3IBNA 4MTYA 4QSIA 3P58A 4FRCA 5E2MA 3N4BA 4Q83A 1FR7A 3RG3A 3T82A 1RJ5A 1DCBA 4Q6DA 1RZDA 4KUWA 3MHIA 3U45X 2ILIA 5L3OA 1I8ZA 1UGBA 2CBCA 5JEGB 1XEVA 2HFWA 4Z0QA 4Q8YA 4ZX1A 3U7CA 5JGTB 4MDGA 3PJJA 4ILXA 4CQ0A 3FFPX 4FPTA 3V3HB 5CA2A 1OQ5A 3HKQA 3MNKA 5JDVB 4PXXA 5FL6A 2NMXA 4LHIA 3M1QA 3ZNCA 3M96A 4ITPA 4Q07A 5EH8A 4Q87A 4M2UA 1TTMA 5E5RA 1TE3X 3IBIA 1G0EA 1YO2A 1RAZA 1RAYA 4YX4A 3IBUA 4N0XB 1IF4A 3DD8A 3B1BA 4YGJA 5JGSB 3M3XA 4E49A 3OIKA 1YDBA 1H4NA 3BL1A 4Q78A 3SBHA 4YGFA 1AM6A 4XIWA 4FVNA 3TVNX 5FNIA 1Z9YA 5E2SA 5EH5A 4R5BA 4MLTA 1CVFA 5E2RA 5JESB 1FLJA 1TB0X 5FL4A 4WL4A 3DCWA 3RYZA 4YWPA 1CNKA 4CNXA 3RZ0B 2Q1QA 1CCTA 5DSIA 5JQ0A 1TH9A 4QIZA 1I9PA 1CNWA 1CVEA 2CABA 3PYKA 4PYYA 3M04A 1ZGEA 2NXSA 3RYVB 4Q8ZA 1DMYA 3BL0A 2NWYA 3MNIA 4K1QA 5SZ3A 1CA2A 1I9OA 3M14A 3OKVA 3U3AX 1UGFA 4E3DA 3CA2A 4COQA 4KNIA 4QTLA 4K0TA 1CAHA 2Q1BA 4JSZA 5BRVA 4HF3A 2FNKA 2WEJA 3RYYA 3MNHA 1EOUA 1FSRA 1LGDA 4QK3A 1KWQA 4QK2A 2FW4A 4Q8XA 4WW8A 1KEQA 5L6KA 5FL5A 3K34A 1XPZA 4QJWA 4KAPA 4R5AA 1CNHA 1TG3A 5FNMA 4HU1A 1G52A 4RH2A 3P44A 1DMXA 2FMGA 5J8ZA 3RYJB 3V3FA 1YDAA 2HL4A 1T9NA 3M1JA 4FU5A 5DVXA 1CZMA 3DV7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2NNO A;  4M2R A;  1CVD A;  2CBE A;  3DC9 A;  3HKU A;  4ETQ C;  8CA2 A;  3P3H A;  2POW A;  1V9E A;  3HKT A;  3M2Z A;  3SAP A;  1LG5 A;  4ZX0 A;  1CAZ A;  3P5L A;  4BF6 A;  2NN1 A;  1HCA A;  1TEQ X;  3K2F A;  4DZ7 A;  2QOA A;  4G0C A;  4KP8 A;  1CNC A;  5FLP A;  3CZV A;  4KNM A;  2X7S A;  3W6I A;  1UGG A;  1F2W A;  1I9L A;  2IT4 A;  1G1D A;  1KOQ A;  2HNC A;  4DZ9 A;  1HCB A;  3MNJ A;  1YO0 A;  1HED A;  5EHW A;  5FNK A;  4K0Z A;  1HEB A;  2AW1 A;  3P55 A;  1BNM A;  3ZP9 A;  3M2X A;  3D9Z A;  3OIM A;  1CNJ A;  1LZV A;  1J9W A;  1CNG A;  3T83 A;  4JS6 A;  4E3G A;  3IEO A;  1XQ0 A;  1CAI A;  2NWO A;  3OY0 A;  3S75 B;  1IF5 A;  3K7K A;  4E9O X;  1FQL A;  1CIM A;  1FSQ A;  5DSL A;  3RLD A;  4C3T A;  3L14 A;  2NNG A;  4L5W A;  5DOG A;  5E2N A;  1G48 A;  5EZT X;  5A25 A;  3IBL A;  4JSW A;  1V9I C;  2FNN A;  2CBA A;  3S74 B;  3KOI A;  3D92 A;  3M5E A;  1CIN A;  3JXG A;  1ZSA A;  4Q49 A;  4XIX A;  3OKU A;  1CA3 A;  1ZSB A;  2POV A;  3DVC A;  1BN4 A;  3RGE A;  4Q99 A;  1YDC A;  5DSK A;  5SZ0 A;  3UYN A;  1YDD A;  1AZM A;  3P5A A;  5FLQ A;  4CNR A;  2EU2 A;  3N0N A;  5FDI A;  1I9N A;  1ZGF A;  3MHC A;  2WD2 A;  2FOU A;  2W2J A;  3C7P A;  4ZWX A;  1IF8 A;  3S71 B;  5BRW A;  3B4F A;  4Z1K A;  1LG6 A;  3MHO A;  5SZ5 A;  2ABE A;  5SZ1 A;  4ITO A;  2X7U A;  4QSJ A;  5A6H A;  1FQR A;  5EIJ A;  3S77 B;  5BNL A;  2WEH A;  1BCD A;  3HFP A;  4YGL A;  3T84 A;  4CNW A;  4HEW A;  4KP5 A;  4M2W A;  4G7A A;  3HKN A;  1THK A;  4Z1E A;  3M67 A;  3V2M A;  4QSB A;  3DA2 A;  3D0N A;  4PQ7 A;  2FMZ A;  5DSR A;  3PO6 A;  3KKX A;  1UGC A;  2HD6 A;  4QIY A;  3NB5 A;  5DSQ A;  1CNB A;  1ZFQ A;  2FOS A;  2CBB A;  3MNU A;  4TWL A;  4GL1 X;  3U47 A;  4KNJ A;  3M2Y A;  4MDM A;  1XEG A;  1BNT A;  4QJX A;  1MUA A;  1RZC A;  2NXT A;  6CA2 A;  2FOY A;  5FNJ A;  1CVB A;  3P3J A;  5EKM A;  5FNL A;  1BZM A;  4PYX A;  1G4J A;  3F7B A;  3M5S A;  4M2V A;  5LMD A;  5SZ4 A;  1ZSC A;  3KNE A;  3EFI A;  5JG3 B;  1H9Q A;  1Z93 A;  3DAZ A;  3QYK A;  4PZH A;  4RFC A;  4HBA A;  1CAY A;  2FOV A;  4JSS A;  5FLT A;  1RZA A;  4Q7V A;  1IF9 A;  4UOV A;  4KUV A;  1ZNC A;  2NNS A;  3MHM A;  5E5U A;  4FVO A;  5G01 A;  3KON A;  5BYI A;  1BN3 A;  1OKL A;  1CAL A;  5DSM A;  2VVA X;  3JXF A;  4Q7S A;  4E3H A;  4Q9Y A;  2AX2 A;  4ZWZ A;  4MLX A;  2NXR A;  2NWP A;  1RZE A;  1TEU X;  2NNV A;  4L5U A;  4YXI A;  3T85 A;  3MMF A;  3DVB A;  1CAN A;  3S97 A;  3V5G A;  1Y7W A;  4QJO A;  5G0C A;  1IF6 A;  1G45 A;  1CRA A;  3V3I B;  5SZ7 A;  3ML5 A;  2Q38 A;  3DVD A;  4RUY A;  4K0S A;  1UGA A;  4HEZ A;  1A42 A;  1JD0 A;  1BNQ A;  5FDC A;  4YHA A;  3OIL A;  1UGD A;  3D93 A;  3JXH C;  1BN1 A;  5FLO A;  1CRM A;  1ZE8 A;  5E28 A;  3V7X A;  4Q06 A;  1CAM A;  5CJF A;  4QEF A;  3F7U A;  3OYS A;  1OKM A;  3W6H A;  3S8X A;  5CAC A;  4QJ0 A;  1HVA A;  1JCZ A;  3RYX B;  1CIL A;  1BNV A;  4XE1 A;  4KV0 A;  3N2P A;  3Q31 A;  5SZ2 A;  5EH7 A;  1Z97 A;  3NI5 A;  1CVA A;  4QJP A;  4RN4 A;  3P4V A;  3MDZ A;  1G54 A;  2WEO A;  2POU A;  3RZ1 B;  4WR7 A;  3RJ7 A;  1G0F A;  3MNA A;  4N16 A;  1I90 A;  3S72 B;  3DCC A;  4QK1 A;  5FLS A;  1OKN A;  4YGK A;  4Q7W A;  5IPZ A;  3LXE A;  3DC3 A;  2CA2 A;  3V2J A;  4BCW A;  3D8W A;  3IAI A;  1CNX A;  4QY3 A;  4WUP A;  5DRS A;  3ML2 A;  4Q09 A;  1CNI A;  5FLR A;  5EKJ A;  4LP6 A;  3RZ8 A;  1KWR A;  2NN7 A;  5HPJ A;  2EU3 A;  2NWZ A;  5C8I A;  3M1K A;  2EZ7 A;  3MHL A;  1CCU A;  1YO1 A;  3NJ9 A;  1G4O A;  1G53 A;  5AMG A;  3V3G B;  3DD0 A;  1CNY A;  2CBD A;  1G3Z A;  4RIV A;  4XFW A;  4E5Q A;  4Z1N A;  1FR4 A;  3TVO X;  5DSJ A;  4HT0 A;  1LUG A;  2VVB X;  3MWO A;  3F4X A;  5DSO A;  5E2K A;  3BET A;  5FNG A;  5SZ6 A;  4BF1 A;  3S78 B;  4MO8 A;  2QO8 A;  3HLJ A;  1DCA A;  9CA2 A;  1HUG A;  3RZ7 A;  1I91 A;  1CAO A;  4HT2 A;  1TBT X;  4HEY A;  1HUH A;  2F14 A;  2ZNC A;  3F8E A;  4XZ5 A;  1UGE A;  3SAX A;  1ZH9 A;  3TMJ A;  1JV0 A;  3R17 B;  2WEG A;  5CLU A;  1I9M A;  3EFT A;  1I9Q A;  3KWA A;  4R59 A;  4KUY A;  3RG4 A;  4CNV A;  3OYQ A;  4E4A A;  3KIG A;  12CA A;  1HEC A;  3MYQ A;  1H9N A;  1ZFK A;  3MZC A;  1FSN A;  1G46 A;  3KLD B;  4Q08 A;  3SBI A;  4QJM A;  1BNU A;  3GZ0 A;  4YXU A;  4IWZ A;  2WD3 A;  2H4N A;  2GD8 A; 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4HT0A

Total Genus

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sequence length

structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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