4KNMA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 2-chloro-4-{[(4,6-dimethylpyrimidin-2-yl)sulfanyl]acetyl}benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
LSWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Benzenesulfonamides with pyrimidine moiety as inhibitors of human carbonic anhydrases I, II, VI, VII, XII, and XIII
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4knmA00
4M2VA 1BNMA 2OSFA 1LUGA 1JV0A 1CNHA 3MHMA 1CILA 4KUYA 1RZDA 4JSWA 4YGLA 3UYNA 2X7UA 1CAIA 3OKUA 3V3GB 5DSLA 2NMXA 1LG6A 1THKA 4YGNA 1LGDA 3HKUA 4X5SA 5FNHA 3M14A 1Z93A 5G0BA 3V2JA 4E3HA 1RJ6A 3N2PA 4LU3A 1KWQA 1OKNA 1FQNA 3M5SA 4IWZA 3CAJA 1FQRA 4Q06A 4PZHA 4QIZA 3RZ0B 5BYIA 1HUHA 2VVAX 5E2KA 3M5TA 4E5QA 4HT2A 3RZ5A 4L5WA 3HKQA 3DC3A 4KV0A 4QEFA 5JEPB 4G0CA 1G4OA 5JGSB 1G0EA 2POVA 4M2RA 4WW6A 4KNMA 4JS6A 4Q7WA 4TWLA 4ETQC 1CNBA 2ZNCA 1I9LA 1BN1A 4Q99A 4M2WA 3VBDA 6CA2A 5L6KA 1CNYA 2NWOA 3M2XA 4KP8A 3GZ0A 2HFWA 2CBDA 1IF8A 5EHEA 4BF1A 2HKKA 3MHCA 4PQ7A 2QP6A 4KP5A 4Y0JA 2QOAA 4KAPA 4R59A 1I9NA 5SZ0A 1I9OA 1BV3A 4UOVA 3DBUA 1UGDA 3F7BA 1CIMA 1CNKA 4ZX1A 1V9IC 3Q31A 3OILA 2W2JA 3M40A 1AZMA 4IDRX 5SZ1A 5BRUA 2OSMA 3B4FA 4QJPA 4BF6A 1CNCA 1RZCA 4HEYA 3W6IA 3ML2A 4Q8ZA 3RYXB 3HLJA 4Q09A 4Q90A 5FNIA 2O4ZA 3N4BA 3RG3A 5JEGB 4MLTA 2X7SA 4QJOA 3S75B 5CA2A 3KS3A 4KNIA 3FE4A 4TWMA 4QJWA 3FFPX 1BNNA 1DCBA 5DSJA 3BL0A 1FR7A 5A25A 3SBHA 3S71B 3QYKA 4QSAA 5AMGA 4N16A 5FLQA 1RZEA 3KLDB 4Z1NA 3MHIA 1AVNA 4E3GA 3S9TA 3TMJA 5DOGA 1ZSBA 4KUWA 1YO2A 4HBAA 4RUXA 1TEQX 4MTYA 2AX2A 3MNJA 1HUGA 1CVAA 2POWA 3U45X 3OY0A 3MNUA 5FLRA 5E28A 4MDLA 1CVHA 5JGTB 1CVFA 2EU3A 1CAZA 1CCSA 1MUAA 1JCZA 3P55A 3P58A 2NNSA 3RZ1B 1ZFQA 3MYQA 4RH2A 3V3JA 1ZGFA 4MO8A 4XFWA 5SZ5A 3MHLA 3S8XA 5EH7A 4MDMA 3UYQA 3M96A 4XE1A 5EKJA 4YGFA 4R5BA 3IGPA 1CCTA 1HECA 3D93A 5JG3B 3D9ZA 1UGCA 3PYKA 3LXEA 3MNKA 1CAOA 3KKXA 1EOUA 3OKVA 4JSZA 4CNXA 1JD0A 1T9NA 4QK3A 3TVNX 1I9PA 7CA2A 1YO0A 4Z0QA 3DD0A 3KIGA 1KWRA 3S77B 3HFPA 5FL5A 2FOQA 3F4XA 3K2FA 1TBTX 3M67A 5L3OA 4FIKA 3EFTA 3IBUA 4E9OX 1CA2A 1G45A 1UGBA 5E5UA 1YDCA 3MWOA 1FLJA 1V9EA 4K0ZA 4C3TA 4Q83A 2FMGA 4FPTA 4ITOA 3KOKA 3EFIA 1CAHA 1OKLA 5FDCA 3K7KA 1CNWA 3C7PA 3P5AA 3MDZA 1FSQA 1G4JA 2WEOA 3P3JA 2HD6A 4E4AA 2HL4A 3S78B 3IBNA 5JG5B 5FLSA 3BETA 3RLDA 2POUA 2FNKA 4CACA 3M2NA 2WD3A 3KNEA 4FRCA 5LMDA 1BNUA 1Z9YA 4JSAA 5C8IA 4ILXA 1ZE8A 3M3XA 5AMLA 1KEQA 4RIVA 1HCAA 1DMXA 3N0NA 4Q87A 3T5ZA 3RZ7A 3OYSA 4Q49A 3RYZA 2ABEA 1TH9A 3DCSA 4E49A 1BCDA 2CBAA 5FDIA 3CA2A 3V2MA 1KOQA 3K34A 1URTA 2FNMA 2FOYA 1YO1A 2NXSA 5E5RA 1FQMA 2NXRA 1YDDA 3S74B 1TG3A 3M1JA 4QSIA 3ZNCA 1ZH9A 5CJFA 5A6HA 4WUQA 3MNHA 3NB5A 3ML5A 2GEHA 4YWPA 3T82A 2NN7A 1RAZA 1DMYA 1G53A 1CINA 3MZCA 5BNLA 3RZ8A 4QK1A 1RJ5A 4CNWA 4RUZA 1G48A 4QSJA 1XPZA 4RFCA 3DVBA 3HKNA 3V3HB 1I9MA 3FW3A 2FNNA 3RG4A 1YDAA 3M98A 12CAA 2NNVA 2WEJA 3T83A 4COQA 1IF6A 1CAYA 2QO8A 5HPJA 1CVBA 2CABA 1YDBA 4Q78A 3MMFA 3DVDA 4QJMA 1H9NA 4RUYA 1BNQA 3V3FA 3DCCA 4XIXA 3RJ7A 4QY3A 5DVXA 5SZ3A 4KNJA 1G52A 3D92A 1BNTA 4Q7PA 5FLOA 5EH8A 5DSQA 2FMZA 4HU1A 2HNCA 2Q1BA 2VVBX 3P4VA 4QJXA 4Z1EA 3U7CA 4MDGA 1TB0X 4E3DA 4QSBA 1CNIA 1CZMA 1CNXA 2EU2A 1HEDA 2Q1QA 4LP6A 3RYYA 3HS4A 4CQ0A 1IF9A 1ZSAA 5SZ4A 2WD2A 4L5VA 4Z1JA 5EHWA 4ZWZA 4ZWXA 5SZ6A 4HEWA 5FNMA 3U47A 3T84A 3U3AX 2X7TA 5JQTA 5FLPA 3KONA 4XIWA 5CLUA 1XEGA 3P5LA 1OKMA 2CBEA 1CRAA 2NNGA 1G3ZA 5JQ0A 2GD8A 4QJ0A 5FL4A 5FLTA 1UGAA 3R17B 2WEHA 3BL1A 3IBLA 3CYUA 3L14A 5JEHB 5G03A 2FOUA 3V7XA 1IF4A 4ZWYA 3IBIA 3KOIA 1FQLA 1TE3X 2WEGA 1BZMA 3V5GA 3NI5A 3DC9A 4CNRA 3OIMA 5BRWA 3V3IB 2FOSA 1BN3A 1CANA 3D8WA 1CNGA 1RZBA 5SZ7A 1CA3A 5EH5A 5DSIA 1BICA 4K13A 1ZGEA 3DA2A 4Q08A 3S76A 3SAPA 3DD8A 4YXUA 4YX4A 4Q7VA 4QK2A 1CVCA 4GL1X 5DRSA 1IF5A 4Q7SA 4Q6EA 2Q38A 1UGEA 1LG5A 2ILIA 1I8ZA 4R5AA 4PYYA 3S72B 1I90A 5IPZA 1RZAA 3M1QA 1CVEA 1I9QA 3T85A 5CACA 1G6VA 1ZFKA 2NN1A 5FNKA 3N3JA 2HOCA 4HT0A 5G0CA 8CA2A 4FVNA 9CA2A 1UGFA 3F8EA 4Q8XA 4ZWIA 2H4NA 3PO6A 5BRVA 3OYQA 5E2MA 1LZVA 3CZVA 1Y7WA 2NWZA 5DSKA 3P3HA 5JESB 3IAIA 2IT4A 5JDVB 3RYVB 1TEUX 4Q81A 2AW1A 1FSNA 1I91A 3P44A 5FNGA 3M1KA 3OIKA 3DCWA 1G0FA 1XQ0A 3RGEA 4DZ7A 1Z97A 3S97A 4CNVA 3DAZA 4KNNA 5E2NA 5FNJA 3M2ZA 5SZ2A 5G01A 3M04A 4HEZA 4K0TA 2FW4A 3M2YA 4Q6DA 1G54A 1HEBA 3DVCA 1RAYA 1H4NA 3T5UA 3TVOX 4ZAOA 2FOVA 4XZ5A 4Q07A 4M2UA 3M1WA 1DCAA 3JXHC 2NWYA 4MLXA 5EKHA 1FSRA 4HF3A 4RN4A 1BNWA 4CA2A 3MHOA 4FL7A 5FNLA 3JXFA 3PJJA 1HEAA 5DSOA 3B1BA 1UGGA 4Z1KA 2F14A 4JSSA 4BCWA 1A42A 5DSPA 4LHIA 5EZTX 4ZX0A 4FU5A 4QTLA 2NXTA 1F2WA 4KUVA 1HCBA 4N0XB 4YXIA 1MOOA 4RIUA 5EKMA 5EIJA 4E3FA 3JXGA 1HVAA 3KWAA 2NWPA 4YGJA 2H15A 4PXXA 3M5EA 4Q9YA 1ZSCA 5FL6A 4Q8YA 4FVOA 1H9QA 4PYXA 4WUPA 3MNIA 4DZ9A 1G46A 1TTMA 3F7UA 1CALA 1CNJA 3HKTA 4YVYA 5EOIA 1IF7A 1CRMA 3NJ9A 1G1DA 3S73B 4Q0LA 3ZP9A 1CAMA 1AM6A 1CVDA 4YYTA 3DV7A 3IEOA 2NNOA 1BNVA 3W6HA 1FR4A 4L5UA 4WW8A 1TG9A 3R16A 2CA2A 4ITPA 5DOHA 5E2SA 3SAXA 4WL4A 5DSRA 1CAJA 3SBIA 4G7AA 5DSMA 1J9WA 4RFDA 5AMDA 5EHVA 1XEVA 1CAKA 1CCUA 4YGKA 1OQ5A 4K1QA 1KOPA 4K0SA 2EZ7A 2CBCA 3RYJB 2CBBA 5E2RA 3MNAA 5J8ZA 3D0NA 4QIYA 4YHAA 4YXOA 5DSNA 1ZNCA 1BN4A 4WR7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M2V A;  1BNM A;  2OSF A;  1LUG A;  1JV0 A;  1CNH A;  3MHM A;  1CIL A;  4KUY A;  1RZD A;  4JSW A;  4YGL A;  3UYN A;  2X7U A;  1CAI A;  3OKU A;  3V3G B;  5DSL A;  2NMX A;  1LG6 A;  1THK A;  4YGN A;  1LGD A;  3HKU A;  4X5S A;  5FNH A;  3M14 A;  1Z93 A;  5G0B A;  3V2J A;  4E3H A;  1RJ6 A;  3N2P A;  4LU3 A;  1KWQ A;  1OKN A;  1FQN A;  3M5S A;  4IWZ A;  3CAJ A;  1FQR A;  4Q06 A;  4PZH A;  4QIZ A;  3RZ0 B;  5BYI A;  1HUH A;  2VVA X;  5E2K A;  3M5T A;  4E5Q A;  4HT2 A;  3RZ5 A;  4L5W A;  3HKQ A;  3DC3 A;  4KV0 A;  4QEF A;  5JEP B;  4G0C A;  1G4O A;  5JGS B;  1G0E A;  2POV A;  4M2R A;  4WW6 A;  4KNM A;  4JS6 A;  4Q7W A;  4TWL A;  4ETQ C;  1CNB A;  2ZNC A;  1I9L A;  1BN1 A;  4Q99 A;  4M2W A;  3VBD A;  6CA2 A;  5L6K A;  1CNY A;  2NWO A;  3M2X A;  4KP8 A;  3GZ0 A;  2HFW A;  2CBD A;  1IF8 A;  5EHE A;  4BF1 A;  2HKK A;  3MHC A;  4PQ7 A;  2QP6 A;  4KP5 A;  4Y0J A;  2QOA A;  4KAP A;  4R59 A;  1I9N A;  5SZ0 A;  1I9O A;  1BV3 A;  4UOV A;  3DBU A;  1UGD A;  3F7B A;  1CIM A;  1CNK A;  4ZX1 A;  1V9I C;  3Q31 A; 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