4KNMA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 2-chloro-4-{[(4,6-dimethylpyrimidin-2-yl)sulfanyl]acetyl}benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
LSWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Benzenesulfonamides with pyrimidine moiety as inhibitors of human carbonic anhydrases I, II, VI, VII, XII, and XIII
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
total genus 78
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4knmA00
1TEQX 1CAIA 4Q83A 1RZAA 1UGAA 5EKJA 4KV0A 1BNVA 3IGPA 4ZAOA 5FNHA 3IEOA 1G0EA 3MHMA 4JSAA 3S77B 5E28A 3M1KA 3M2ZA 4QJPA 5FNJA 1G1DA 1FLJA 5DSJA 3MNIA 3SBHA 1LZVA 3HLJA 5JG5B 2WEJA 4BCWA 4ITPA 4KUVA 3K34A 1ZFKA 4Q07A 1EOUA 1XEGA 3D92A 3V2MA 3ZP9A 3ML2A 3FW3A 1LG6A 3DCSA 4PYYA 3T5ZA 3DCCA 3KLDB 2CBDA 3V3FA 3P44A 3PJJA 5DSRA 1THKA 3IAIA 4KUWA 5IPZA 3QYKA 3OYQA 3U47A 1FR7A 3OIKA 4FVNA 3RLDA 1I91A 5CA2A 4YYTA 4Q06A 4KNJA 5E2KA 5FNGA 1YO1A 3DVDA 3TMJA 1G52A 4HT2A 4YXIA 3S8XA 4FIKA 4K0SA 4MO8A 5DRSA 4QK1A 4Z1EA 2CBEA 1IF8A 4ZWXA 3RJ7A 4QK3A 4M2WA 4R5BA 1BZMA 4DZ9A 1HECA 1BICA 1CVDA 4UOVA 2ZNCA 2WEHA 4M2RA 4PYXA 4K0TA 3F8EA 1XPZA 3DA2A 2NNGA 3M14A 1AVNA 3M1JA 3BL1A 5JEPB 2POUA 4ITOA 4Q7SA 5SZ7A 1FSQA 1FQNA 3DC9A 3RYZA 3HKNA 4QK2A 1CNIA 4KNNA 4ZWZA 2FW4A 2NWYA 5G0CA 2FMGA 2FOYA 5BNLA 1CVAA 2HFWA 1CNJA 3SBIA 4MTYA 5EHWA 4E9OX 1G46A 5AMLA 4BF1A 1CANA 4FPTA 5G0BA 1FR4A 1MOOA 5E2NA 4CACA 1G4JA 4Q8XA 4Y0JA 3MYQA 3FFPX 3S74B 1H9QA 1IF4A 4WL4A 2HD6A 1RJ6A 1KEQA 5JGTB 3K7KA 3MNKA 1TB0X 1CIMA 1I9LA 2ABEA 2Q38A 4E5QA 5EH8A 3JXHC 3MNJA 2QP6A 4Q87A 4RN4A 3DV7A 3DC3A 1DCBA 4ZX1A 5HPJA 2NNSA 3MWOA 3S78B 5EH7A 3MNAA 4Z0QA 2EU2A 5FLTA 4FVOA 5SZ4A 4QEFA 3W6HA 3DD0A 1I9NA 5L3OA 1KOPA 3MHCA 1I9PA 3OILA 4ETQC 1YDBA 4KP8A 5FLPA 3CZVA 1OKLA 3KOIA 4HBAA 2VVBX 1CINA 1HUGA 4QY3A 3MZCA 1Z93A 4R5AA 1UGBA 3V2JA 1CAHA 3Q31A 1AZMA 4HF3A 3RZ0B 1ZGFA 4QSJA 1I8ZA 5JEHB 5SZ1A 1CVFA 2Q1QA 2WD3A 3S9TA 3R17B 3D9ZA 1CNCA 4Q08A 4QIYA 4TWMA 1J9WA 2AX2A 1BV3A 7CA2A 1BN1A 3N0NA 3KNEA 4CNRA 1YO2A 3LXEA 1CNHA 4QJWA 3NJ9A 1HVAA 3BL0A 1BN4A 4Z1NA 12CAA 1CNGA 3TVNX 1BNQA 3M67A 2NWOA 1DMYA 1OKNA 5C8IA 3KOKA 3IBIA 4KNIA 4PXXA 3U7CA 3V3JA 1ZSBA 1LGDA 4YXOA 4G0CA 3N4BA 4WW6A 1CRAA 5JESB 1CILA 3P4VA 5SZ5A 3D8WA 3DD8A 3M04A 4KUYA 1FQLA 1ZH9A 1CNKA 5FNIA 4Z1KA 2AW1A 3P55A 1CZMA 4L5WA 4Q9YA 3MDZA 4QSBA 2Q1BA 5JDVB 3HKUA 3S76A 3RZ1B 3B1BA 4K0ZA 5DSQA 3JXGA 3DAZA 1I9OA 1RZCA 3SAPA 1YDCA 4Q81A 3S73B 3OKUA 4E3FA 1RZEA 5DSKA 4MLTA 4XFWA 1OKMA 3M40A 4Q8YA 1Z97A 4E4AA 5FNLA 1DMXA 4WUPA 1ZNCA 3EFIA 4PZHA 4XZ5A 3C7PA 3EFTA 1CALA 5E5RA 3DBUA 4Q7WA 4K1QA 3JXFA 3KS3A 4M2VA 4YGFA 1BNTA 1UGCA 3HKQA 5CJFA 1H4NA 1G45A 3UYNA 1G4OA 4KNMA 4RUYA 1T9NA 4FU5A 1CCUA 1RAYA 4Q8ZA 5BRUA 3RZ7A 1AM6A 3P5AA 1G48A 1JV0A 4YGNA 2NWPA 4LHIA 1CVEA 4HEYA 3RYXB 3P5LA 5FLQA 1KWQA 4L5UA 4RUZA 5LMDA 3T82A 4QTLA 1HCAA 3RYJB 4JSZA 1H9NA 8CA2A 5EHEA 2X7UA 2QO8A 3D0NA 3V3GB 4RIUA 5A25A 1CNBA 1G6VA 4CQ0A 1FSRA 5DSPA 4Q49A 2W2JA 4FL7A 3CA2A 1IF7A 2HL4A 5DOHA 1ZFQA 5EKHA 3RGEA 2WD2A 1TTMA 4IWZA 1UGEA 4K13A 2H4NA 4L5VA 5FDCA 1CRMA 4RFDA 5E2MA 3DCWA 3VBDA 1CAKA 3MHOA 1MUAA 1HUHA 3TVOX 2HOCA 2QOAA 3DVBA 1JCZA 5E2RA 5E2SA 1DCAA 4CA2A 2HKKA 3RYYA 4YVYA 1CAMA 3M5SA 1LG5A 1TBTX 5JG3B 5JEGB 1ZE8A 3KIGA 1TEUX 3GZ0A 3ZNCA 5DSMA 5BYIA 3KONA 3KKXA 3SAXA 4IDRX 1BNUA 1A42A 5JQ0A 3ML5A 3IBLA 2NXRA 1IF5A 2EZ7A 5DSLA 1UGGA 2FNNA 5SZ6A 5BRVA 2CA2A 2X7SA 4CNXA 1CAJA 2VVAX 3P58A 4Q7PA 5EKMA 2HNCA 1CCTA 2NWZA 4Q09A 4MDGA 3IBNA 4MLXA 1I9MA 1IF9A 5FLSA 4ZX0A 5JQTA 4HEZA 3U3AX 3PO6A 1V9IC 4CNVA 1TG9A 2OSMA 2FOVA 2OSFA 5G03A 5L6KA 4QJ0A 3S72B 2FOUA 1CVCA 2FOSA 4HEWA 1UGFA 4E49A 4ZWYA 5CACA 3M98A 4Q78A 1CAYA 4N16A 3PYKA 1CCSA 1XEVA 4WW8A 3T5UA 1I90A 3N3JA 5FDIA 3MHLA 4COQA 5EOIA 4YHAA 1TG3A 1V9EA 4M2UA 4WR7A 4E3GA 4YX4A 2NXTA 2F14A 5SZ2A 1CNXA 1TE3X 1HEAA 3M1QA 9CA2A 4RUXA 2EU3A 5G01A 2FOQA 3F4XA 3P3JA 2GD8A 3V3HB 1CNYA 2POVA 4RFCA 1RJ5A 3MMFA 4Q90A 4DZ7A 2POWA 4E3HA 1ZSAA 4TWLA 5EIJA 3K2FA 5SZ0A 5FNMA 5BRWA 3IBUA 5FL5A 5FLOA 4Q0LA 5CLUA 3M2XA 2CABA 3OY0A 1YDDA 1G0FA 2CBAA 5DSIA 4QJMA 3D93A 3MNHA 4BF6A 4Z1JA 1CNWA 1OQ5A 4YWPA 1URTA 1XQ0A 3P3HA 4ILXA 1FQMA 4JSSA 5E5UA 6CA2A 2GEHA 3OKVA 2IT4A 5FLRA 3M5TA 1ZGEA 1TH9A 1CA2A 1CA3A 4QJXA 2ILIA 4Q6DA 3F7BA 3M96A 3MHIA 3S71B 5EH5A 4JS6A 3V3IB 1RZBA 3OYSA 4XIXA 3KWAA 2FNMA 4MDLA 3S75B 4QJOA 2NN1A 2NN7A 2CBCA 1UGDA 2H15A 1LUGA 2NMXA 4HT0A 5DVXA 2O4ZA 3NI5A 4CNWA 1KWRA 4N0XB 5FL4A 1CVHA 2WEGA 4JSWA 4WUQA 3N2PA 1BNNA 1G54A 3M2YA 4HU1A 1CAZA 5DOGA 1BCDA 4RH2A 4LP6A 5AMDA 5FNKA 5AMGA 4QSAA 4PQ7A 1G53A 3T84A 4Q6EA 1HEBA 4Q99A 3FE4A 1YDAA 4LU3A 1G3ZA 2NNVA 4QIZA 3V5GA 3BETA 4YXUA 2NXSA 1CVBA 4X5SA 4Q7VA 3HFPA 1F2WA 1YO0A 4YGLA 3UYQA 1I9QA 3T83A 5DSOA 4FRCA 4ZWIA 4E3DA 3L14A 3MNUA 1FQRA 3M2NA 1BN3A 3RG3A 2CBBA 3R16A 3F7UA 4GL1X 2FNKA 5EHVA 3U45X 4KP5A 1HCBA 3DVCA 4XIWA 1JD0A 3M3XA 3OIMA 1FSNA 5FL6A 3CYUA 3S97A 3HS4A 4MDMA 3M1WA 3M5EA 2NNOA 4YGJA 4G7AA 3V7XA 4KAPA 3CAJA 2FMZA 5EZTX 5JGSB 3RYVB 1RAZA 3RG4A 1CAOA 4C3TA 1ZSCA 5A6HA 3B4FA 1IF6A 1KOQA 4QSIA 1BNWA 5SZ3A 1Z9YA 2WEOA 5J8ZA 3RZ5A 1Y7WA 3HKTA 4R59A 3RZ8A 4YGKA 5DSNA 3T85A 2X7TA 3W6IA 4XE1A 1HEDA 1BNMA 3NB5A 4RIVA 1RZDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1TEQ X;  1CAI A;  4Q83 A;  1RZA A;  1UGA A;  5EKJ A;  4KV0 A;  1BNV A;  3IGP A;  4ZAO A;  5FNH A;  3IEO A;  1G0E A;  3MHM A;  4JSA A;  3S77 B;  5E28 A;  3M1K A;  3M2Z A;  4QJP A;  5FNJ A;  1G1D A;  1FLJ A;  5DSJ A;  3MNI A;  3SBH A;  1LZV A;  3HLJ A;  5JG5 B;  2WEJ A;  4BCW A;  4ITP A;  4KUV A;  3K34 A;  1ZFK A;  4Q07 A;  1EOU A;  1XEG A;  3D92 A;  3V2M A;  3ZP9 A;  3ML2 A;  3FW3 A;  1LG6 A;  3DCS A;  4PYY A;  3T5Z A;  3DCC A;  3KLD B;  2CBD A;  3V3F A;  3P44 A;  3PJJ A;  5DSR A;  1THK A;  3IAI A;  4KUW A;  5IPZ A;  3QYK A;  3OYQ A;  3U47 A;  1FR7 A;  3OIK A;  4FVN A;  3RLD A;  1I91 A;  5CA2 A;  4YYT A;  4Q06 A;  4KNJ A;  5E2K A;  5FNG A;  1YO1 A;  3DVD A;  3TMJ A;  1G52 A;  4HT2 A;  4YXI A;  3S8X A;  4FIK A;  4K0S A;  4MO8 A;  5DRS A;  4QK1 A;  4Z1E A;  2CBE A;  1IF8 A;  4ZWX A;  3RJ7 A;  4QK3 A;  4M2W A;  4R5B A;  1BZM A;  4DZ9 A;  1HEC A;  1BIC A;  1CVD A;  4UOV A;  2ZNC A;  2WEH A;  4M2R A;  4PYX A;  4K0T A;  3F8E A;  1XPZ A;  3DA2 A;  2NNG A;  3M14 A;  1AVN A;  3M1J A;  3BL1 A;  5JEP B; 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