4KUW | Genus

Total Genus 80

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	80
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__52841531619813__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__52841531619813__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4kuw/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__52841531619813__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"52841531619813","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4kuw/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__52841531619813__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	New classes of carbonic anhydrase inhibitors rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	80
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2013-05-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	4kuwA00

2FNKA 4CNVA 4Q07A 1H9QA 3MHIA 4LHIA 4QEFA 1G54A 4XFWA 3P55A 1UGGA 3TVNX 4QJXA 4JSAA 4CA2A 5SZ4A 1F2WA 4HF3A 2NNVA 5EH5A 5DSJA 1AVNA 1I9PA 5DSIA 2FW4A 5SZ6A 3HS4A 2O4ZA 2QO8A 4JSZA 4YX4A 4CACA 2NWZA 2VVAX 3FFPX 8CA2A 1CA2A 4DZ7A 4WUQA 5E5UA 3BL0A 5DOGA 3QYKA 4RIVA 1Z93A 3DC9A 5AMLA 4R5BA 4E4AA 2FNMA 4ITPA 1CZMA 3T82A 4KUWA 3B1BA 3F7UA 4ZAOA 1CAKA 3N2PA 1BNWA 3S72B 3S74B 3V3HB 1YDBA 3DD0A 1CANA 3OIKA 4Q0LA 1I90A 1YDAA 4L5WA 1URTA 3ZNCA 2NXSA 2GD8A 5E28A 1LG5A 3KNEA 2QP6A 4Q6DA 4ILXA 3M98A 1IF9A 5EIJA 3T5UA 1CNGA 1BNQA 3C7PA 3EFTA 4Q6EA 1H4NA 2NWPA 4Q9YA 4KNIA 5J8ZA 4Q49A 3UYNA 4RN4A 1G4JA 1CAJA 5JESB 5EHVA 5SZ0A 3DC3A 4Q8YA 5DVXA 3DCWA 3D8WA 3M1KA 4HEWA 3MHLA 4HT0A 4QK3A 5JQ0A 3MZCA 3N3JA 5JG5B 4KUVA 3U45X 4YVYA 1V9IC 1FLJA 4PQ7A 2FMGA 4Q87A 4ZWZA 5EKJA 3OYSA 3V3FA 2FOQA 2GEHA 3S97A 1UGAA 4E9OX 4E3DA 3S76A 3DCSA 1CNIA 3F4XA 1OQ5A 3KKXA 2FMZA 3L14A 1BV3A 1TEUX 5JGTB 2H15A 2X7UA 4RFCA 1ZSCA 3FW3A 3D9ZA 1ZNCA 5DSLA 4QIZA 5EHEA 1DCAA 5LMDA 4Z1EA 1ZGEA 3DBUA 5SZ1A 4L5UA 1FSNA 4M2UA 3MNJA 4HEYA 1OKNA 2X7SA 1I91A 3R16A 4Z0QA 3T85A 5E2RA 1IF7A 3V3JA 2CBBA 5EKMA 1XEGA 1CALA 4QY3A 3P5AA 1CNYA 4Q7PA 5EZTX 4KNNA 1A42A 1G45A 4K0ZA 3DVCA 2X7TA 3RZ5A 4IDRX 3HKNA 5C8IA 3V3IB 4QIYA 5DRSA 4COQA 1DCBA 1IF4A 4QJMA 4Z1JA 4JSSA 3R17B 2NN7A 5FNLA 1IF8A 3RYZA 1BNTA 4Q90A 1BN3A 7CA2A 3LXEA 3BETA 3OY0A 1TEQX 1CAYA 1UGDA 3M40A 2AW1A 1CNJA 3SAPA 1KOPA 5IPZA 1KWQA 2NWOA 1HEAA 1ZSAA 3ML5A 2NMXA 4QK1A 1FR4A 3M2ZA 4KNJA 4LU3A 3KIGA 3CYUA 1TG9A 1YO1A 4CNRA 3M3XA 3RZ1B 1CCTA 1IF6A 3HLJA 3V7XA 1UGFA 1YO0A 4MDLA 5FLOA 3GZ0A 1LZVA 1TB0X 4YXUA 3K7KA 3UYQA 2NWYA 3NB5A 4PXXA 1CRMA 1CAMA 2OSFA 3DD8A 3MDZA 3VBDA 3F7BA 3U3AX 4GL1X 4JS6A 3RZ7A 1CAHA 2CABA 1G4OA 5DSKA 4FPTA 1G0EA 4FU5A 4E3FA 2NXTA 2ILIA 1IF5A 3P3JA 5G0CA 1JV0A 4E3GA 5FLQA 5SZ7A 1CVHA 3S77B 4MLXA 2WEHA 4WUPA 4WW6A 1CVDA 5BRVA 4XE1A 3KONA 4Q06A 1RAYA 3S71B 1XQ0A 2Q38A 4MTYA 3M1JA 4Q8ZA 1BNNA 1AM6A 5G03A 4Z1KA 5CLUA 4L5VA 1G52A 4KP5A 3W6HA 5EH7A 4G7AA 4ZWXA 3S78B 4ZX0A 4E49A 5BNLA 5JGSB 2ZNCA 5SZ5A 1HUGA 3S73B 3NJ9A 4QJWA 1XPZA 3P3HA 3RYYA 5E2MA 1DMXA 3MNKA 5CACA 3S8XA 4KNMA 3OYQA 2W2JA 1TH9A 1YDCA 4WL4A 4YGKA 1XEVA 4FVNA 3JXGA 4YXIA 4BF6A 3MWOA 3N0NA 1CVBA 2WEOA 2POUA 4M2VA 4XIXA 1I9OA 3OKUA 1MUAA 5CA2A 1CRAA 1LG6A 4KAPA 1FSRA 2NNOA 4N16A 1CVEA 3U47A 4ZWYA 2FOYA 2AX2A 5G0BA 1OKMA 4HU1A 1CVCA 4C3TA 3M1QA 2HFWA 5FLPA 3FE4A 5HPJA 3MNIA 1CILA 5FL4A 4TWLA 4MDGA 1CAOA 4RFDA 4X5SA 3K34A 3IGPA 3TVOX 3K2FA 1I9NA 1FQRA 4N0XB 5FNKA 4Q7SA 5SZ2A 3M5SA 2FOVA 2HOCA 3D93A 5A25A 1BN4A 3B4FA 1OKLA 2WEJA 3DCCA 4ZWIA 3RZ8A 4PYYA 4YXOA 4Z1NA 5JG3B 5EOIA 3MHMA 3M1WA 3HKQA 4Q09A 2HL4A 5BRUA 1CA3A 3V2MA 4G0CA 3MNHA 2H4NA 4KV0A 2ABEA 4QSAA 3HKUA 4BF1A 4YGFA 4K0SA 3ZP9A 2POVA 2Q1QA 3P4VA 4CNXA 1CNWA 1CNBA 1FR7A 1HECA 2VVBX 2EU2A 1I9LA 2EZ7A 3MNUA 3DV7A 2CBCA 4KP8A 4Q7VA 1KWRA 3M2XA 1Z97A 3DAZA 5FDIA 3PYKA 4Q78A 1MOOA 2IT4A 1BNMA 1Z9YA 5FL6A 1BCDA 3MHOA 3V5GA 1T9NA 4JSWA 3OKVA 4LP6A 5E2NA 1RZDA 4QSJA 1H9NA 1I9QA 3RYVB 1LUGA 4ITOA 1CCSA 2WD3A 1DMYA 4YGLA 1ZE8A 5FNGA 1HVAA 3KOIA 1BZMA 1UGBA 1CCUA 1V9EA 1Y7WA 3MHCA 4PYXA 4TWMA 4Q8XA 4UOVA 6CA2A 5JEHB 5JEPB 1ZH9A 3P5LA 3T5ZA 5E5RA 1HEDA 3SAXA 3T83A 4Q83A 5BRWA 4M2RA 3BL1A 4MO8A 1BN1A 1BNVA 4RIUA 3HFPA 1G1DA 5EHWA 4QSBA 2CBAA 3OIMA 3DVBA 4MDMA 1G6VA 5AMDA 1CIMA 3ML2A 3N4BA 3NI5A 1CINA 3PJJA 4PZHA 1HCAA 1RJ5A 3KS3A 3MMFA 4ZX1A 4RUZA 1FQNA 1RZCA 5DSMA 3M14A 4Q99A 4QJ0A 4WR7A 3W6IA 1UGCA 3SBIA 4QJOA 1ZGFA 5E2KA 1CVAA 4HT2A 5JDVB 2CBEA 3RJ7A 1THKA 5DOHA 2Q1BA 3M96A 5FL5A 4BCWA 1FQMA 1KOQA 5BYIA 1TE3X 5E2SA 1JCZA 4YWPA 5A6HA 3D0NA 3DA2A 1RJ6A 3Q31A 1HUHA 2CA2A 5DSNA 1J9WA 3P58A 4CQ0A 4MLTA 1TG3A 3U7CA 3IBIA 1CVFA 3CZVA 3RLDA 1YO2A 3JXFA 3T84A 4KUYA 5FDCA 4DZ9A 4YYTA 5JQTA 5FNIA 3V2JA 4QTLA 1RZAA 4Q08A 1ZSBA 1FSQA 2FOUA 2FNNA 3KOKA 4QK2A 4WW8A 3RYXB 1CNCA 3D92A 4Q81A 4R5AA 1HEBA 1BNUA 1RAZA 4K1QA 3RG4A 4QJPA 1G48A 4Y0JA 4E3HA 5DSPA 1CAZA 1CNHA 4CNWA 3SBHA 3RGEA 3HKTA 3PO6A 3RZ0B 3IEOA 3KLDB 3IAIA 1EOUA 3M67A 2HNCA 3TMJA 5G01A 5FNJA 1CNXA 5L3OA 3F8EA 3M5EA 3CAJA 1HCBA 4FL7A 1BICA 1I9MA 2HD6A 2QOAA 5FLRA 3IBUA 4M2WA 2NNSA 2OSMA 3M2YA 4XIWA 2NXRA 3RYJB 12CAA 4K0TA 4RUXA 3CA2A 3M04A 3MNAA 4YGJA 5JEGB 4R59A 2POWA 3P44A 3M2NA 5FLSA 4RH2A 2NNGA 3V3GB 5L6KA 1KEQA 1ZFQA 5DSRA 4QSIA 5FLTA 1ZFKA 5DSQA 1G53A 2EU3A 1G3ZA 4K13A 1LGDA 3MYQA 1CAIA 4XZ5A 5SZ3A 3RG3A 5CJFA 5FNMA 3OILA 1RZEA 4Q7WA 1RZBA 4FRCA 4YHAA 2F14A 1AZMA 4FIKA 4HEZA 4FVOA 5EKHA 3DVDA 5DSOA 2WEGA 4YGNA 1CNKA 4IWZA 4HBAA 4RUYA 1G0FA 3M5TA 3JXHC 5AMGA 9CA2A 1UGEA 2HKKA 1I8ZA 1TTMA 3KWAA 1FQLA 5FNHA 3IBLA 1YDDA 2WD2A 2FOSA 3S75B 3EFIA 1TBTX 5EH8A 3S9TA 4E5QA 4ETQC 2NN1A 1JD0A 2CBDA 3IBNA 1G46A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2FNK A;  4CNV A;  4Q07 A;  1H9Q A;  3MHI A;  4LHI A;  4QEF A;  1G54 A;  4XFW A;  3P55 A;  1UGG A;  3TVN X;  4QJX A;  4JSA A;  4CA2 A;  5SZ4 A;  1F2W A;  4HF3 A;  2NNV A;  5EH5 A;  5DSJ A;  1AVN A;  1I9P A;  5DSI A;  2FW4 A;  5SZ6 A;  3HS4 A;  2O4Z A;  2QO8 A;  4JSZ A;  4YX4 A;  4CAC A;  2NWZ A;  2VVA X;  3FFP X;  8CA2 A;  1CA2 A;  4DZ7 A;  4WUQ A;  5E5U A;  3BL0 A;  5DOG A;  3QYK A;  4RIV A;  1Z93 A;  3DC9 A;  5AML A;  4R5B A;  4E4A A;  2FNM A;  4ITP A;  1CZM A;  3T82 A;  4KUW A;  3B1B A;  3F7U A;  4ZAO A;  1CAK A;  3N2P A;  1BNW A;  3S72 B;  3S74 B;  3V3H B;  1YDB A;  3DD0 A;  1CAN A;  3OIK A;  4Q0L A;  1I90 A;  1YDA A;  4L5W A;  1URT A;  3ZNC A;  2NXS A;  2GD8 A;  5E28 A;  1LG5 A;  3KNE A;  2QP6 A;  4Q6D A;  4ILX A;  3M98 A;  1IF9 A;  5EIJ A;  3T5U A;  1CNG A;  1BNQ A;  3C7P A;  3EFT A;  4Q6E A;  1H4N A;  2NWP A;  4Q9Y A;  4KNI A;  5J8Z A;  4Q49 A;  3UYN A;  4RN4 A;  1G4J A;  1CAJ A;  5JES B;  5EHV A;  5SZ0 A;  3DC3 A;  4Q8Y A;  5DVX A;  3DCW A;  3D8W A;  3M1K A;  4HEW A;  3MHL A;  4HT0 A;  4QK3 A;  5JQ0 A;  3MZC A;  3N3J A;  5JG5 B;  4KUV A;  3U45 X;  4YVY A;  1V9I C;  1FLJ A;  4PQ7 A;  2FMG A;  4Q87 A;  4ZWZ A;  5EKJ A;  3OYS A;  3V3F A;  2FOQ A;  2GEH A;  3S97 A;  1UGA A;  4E9O X;  4E3D A;  3S76 A;  3DCS A;  1CNI A;  3F4X A;  1OQ5 A;  3KKX A;  2FMZ A;  3L14 A;  1BV3 A;  1TEU X;  5JGT B;  2H15 A;  2X7U A;  4RFC A;  1ZSC A;  3FW3 A;  3D9Z A;  1ZNC A;  5DSL A;  4QIZ A;  5EHE A;  1DCA A;  5LMD A;  4Z1E A;  1ZGE A;  3DBU A;  5SZ1 A;  4L5U A;  1FSN A;  4M2U A;  3MNJ A;  4HEY A;  1OKN A;  2X7S A;  1I91 A;  3R16 A;  4Z0Q A;  3T85 A;  5E2R A;  1IF7 A;  3V3J A;  2CBB A;  5EKM A;  1XEG A;  1CAL A;  4QY3 A;  3P5A A;  1CNY A;  4Q7P A;  5EZT X;  4KNN A;  1A42 A;  1G45 A;  4K0Z A;  3DVC A;  2X7T A;  3RZ5 A;  4IDR X;  3HKN A;  5C8I A;  3V3I B;  4QIY A;  5DRS A;  4COQ A;  1DCB A;  1IF4 A;  4QJM A;  4Z1J A;  4JSS A;  3R17 B;  2NN7 A;  5FNL A;  1IF8 A;  3RYZ A;  1BNT A;  4Q90 A;  1BN3 A;  7CA2 A;  3LXE A;  3BET A;  3OY0 A;  1TEQ X;  1CAY A;  1UGD A;  3M40 A;  2AW1 A;  1CNJ A;  3SAP A;  1KOP A;  5IPZ A;  1KWQ A;  2NWO A;  1HEA A;  1ZSA A;  3ML5 A;  2NMX A;  4QK1 A;  1FR4 A;  3M2Z A;  4KNJ A;  4LU3 A;  3KIG A;  3CYU A;  1TG9 A;  1YO1 A;  4CNR A;  3M3X A;  3RZ1 B;  1CCT A;  1IF6 A;  3HLJ A;  3V7X A;  1UGF A;  1YO0 A;  4MDL A;  5FLO A;  3GZ0 A;  1LZV A;  1TB0 X;  4YXU A;  3K7K A;  3UYQ A;  2NWY A;  3NB5 A;  4PXX A;  1CRM A;  1CAM A;  2OSF A;  3DD8 A;  3MDZ A;  3VBD A;  3F7B A;  3U3A X;  4GL1 X;  4JS6 A;  3RZ7 A;  1CAH A;  2CAB A;  1G4O A;  5DSK A;  4FPT A;  1G0E A;  4FU5 A;  4E3F A;  2NXT A;  2ILI A;  1IF5 A;  3P3J A;  5G0C A;  1JV0 A;  4E3G A;  5FLQ A;  5SZ7 A;  1CVH A;  3S77 B;  4MLX A;  2WEH A;  4WUP A;  4WW6 A;  1CVD A;  5BRV A;  4XE1 A;  3KON A;  4Q06 A;  1RAY A;  3S71 B;  1XQ0 A;  2Q38 A;  4MTY A;  3M1J A;  4Q8Z A;  1BNN A;  1AM6 A;  5G03 A;  4Z1K A;  5CLU A;  4L5V A;  1G52 A;  4KP5 A;  3W6H A;  5EH7 A;  4G7A A;  4ZWX A;  3S78 B;  4ZX0 A;  4E49 A;  5BNL A;  5JGS B;  2ZNC A;  5SZ5 A;  1HUG A;  3S73 B;  3NJ9 A;  4QJW A;  1XPZ A;  3P3H A;  3RYY A;  5E2M A;  1DMX A;  3MNK A;  5CAC A;  3S8X A;  4KNM A;  3OYQ A;  2W2J A;  1TH9 A;  1YDC A;  4WL4 A;  4YGK A;  1XEV A;  4FVN A;  3JXG A;  4YXI A;  4BF6 A;  3MWO A;  3N0N A;  1CVB A;  2WEO A;  2POU A;  4M2V A;  4XIX A;  1I9O A;  3OKU A;  1MUA A;  5CA2 A;  1CRA A;  1LG6 A;  4KAP A;  1FSR A;  2NNO A;  4N16 A;  1CVE A;  3U47 A;  4ZWY A;  2FOY A;  2AX2 A;  5G0B A;  1OKM A;  4HU1 A;  1CVC A;  4C3T A;  3M1Q A;  2HFW A;  5FLP A;  3FE4 A;  5HPJ A;  3MNI A;  1CIL A;  5FL4 A;  4TWL A;  4MDG A;  1CAO A;  4RFD A;  4X5S A;  3K34 A;  3IGP A;  3TVO X;  3K2F A;  1I9N A;  1FQR A;  4N0X B;  5FNK A;  4Q7S A;  5SZ2 A;  3M5S A;  2FOV A;  2HOC A;  3D93 A;  5A25 A;  1BN4 A;  3B4F A;  1OKL A;  2WEJ A;  3DCC A;  4ZWI A;  3RZ8 A;  4PYY A;  4YXO A;  4Z1N A;  5JG3 B;  5EOI A;  3MHM A;  3M1W A;  3HKQ A;  4Q09 A;  2HL4 A;  5BRU A;  1CA3 A;  3V2M A;  4G0C A;  3MNH A;  2H4N A;  4KV0 A;  2ABE A;  4QSA A;  3HKU A;  4BF1 A;  4YGF A;  4K0S A;  3ZP9 A;  2POV A;  2Q1Q A;  3P4V A;  4CNX A;  1CNW A;  1CNB A;  1FR7 A;  1HEC A;  2VVB X;  2EU2 A;  1I9L A;  2EZ7 A;  3MNU A; 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4KUWA

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