4KUY | Genus

Total Genus 79

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
Knots found	KnotProt 2.0: K +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__95448660461513__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__95448660461513__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4kuy/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__95448660461513__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"95448660461513","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4kuy/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__95448660461513__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	New classes of carbonic anhydrase inhibitors rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	79
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: K +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2013-05-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	4kuyA00

5EH5A 4Y0JA 3Q31A 2HFWA 1BICA 2HKKA 5DOHA 3RZ5A 4KUYA 5AMLA 1ZSBA 1H4NA 4MO8A 3M2ZA 5DSKA 3T82A 3S74B 1FLJA 4MDLA 2IT4A 5EHVA 3V5GA 1FQRA 1KOPA 4TWLA 5DRSA 1IF7A 1TB0X 4JS6A 3RLDA 3K7KA 4HEYA 3KLDB 1DMXA 2H15A 1I9MA 1BN4A 1LG5A 3HKQA 1I90A 2NXSA 3MHCA 3B4FA 4QJ0A 5EHWA 3ZP9A 2HOCA 3HFPA 4E49A 1G46A 2X7SA 1YDAA 4RIVA 1FSRA 5AMDA 3T84A 2EU3A 4FRCA 5SZ6A 4Q08A 4ZWXA 3V2JA 4XIWA 4YXOA 4QK1A 5FLPA 5EIJA 4LHIA 4BF1A 4MLTA 3M04A 2O4ZA 5FLQA 5DVXA 3CYUA 1HUGA 5E2KA 3U47A 3M2XA 1CCUA 4Q78A 1CAHA 5E2RA 1KEQA 5JQ0A 1CVAA 4CNWA 3V2MA 5JEHB 5E5UA 1G54A 3V7XA 4RUYA 1I9OA 4L5VA 4Q87A 5IPZA 4XZ5A 2QOAA 3D93A 3M1QA 1XEGA 3SBHA 3UYNA 4GL1X 1FQNA 2WD2A 3U45X 4Q90A 5FDCA 1FQMA 2WEHA 2FNMA 4FVNA 4PXXA 4HBAA 4MTYA 1G0EA 2FNNA 1RZEA 5CLUA 4ZWZA 5G01A 1JD0A 3MDZA 3L14A 3S78B 1CAJA 1Z93A 2AX2A 4M2WA 3UYQA 1CINA 1H9NA 2CBAA 3FE4A 1CNWA 5JEPB 2OSMA 4CNXA 3P55A 3TVOX 2CBEA 1HECA 1CA3A 1V9EA 4Q9YA 1OKMA 4Q8YA 3JXHC 1EOUA 1RAYA 3MZCA 4Z1EA 2FOYA 3DVCA 5FL5A 3M14A 3RYXB 2ABEA 2ILIA 3KS3A 3D92A 4RUZA 5EKMA 4Q81A 4RFCA 5SZ0A 3M1WA 2FMZA 1AZMA 4N16A 3ML5A 1CNBA 1G1DA 3MHIA 3V3FA 4HU1A 1ZH9A 5FLRA 1CNKA 3VBDA 4G0CA 4R5AA 3P5AA 1FSNA 4KV0A 3RYYA 1RAZA 4M2RA 4RFDA 1MUAA 3W6IA 1ZNCA 3M98A 3MNUA 1RJ6A 3GZ0A 4PYYA 1BNTA 3MNIA 4E9OX 2GEHA 3R16A 4FL7A 4XE1A 4K0TA 4YGKA 3DVDA 1AVNA 4WW8A 1KWQA 4X5SA 4QSIA 3HKTA 3DCSA 1BNMA 5EZTX 3M5EA 1LGDA 4RUXA 4Q83A 1CAOA 1CNIA 4FU5A 3DVBA 5SZ4A 2CBCA 1G4JA 5JGSB 4ETQC 5JESB 4JSWA 4ZX0A 4E3HA 3FFPX 1CVEA 3DCWA 3MHMA 3MYQA 4ZWIA 1CNCA 1UGDA 4Q7WA 5JEGB 1AM6A 1DCAA 1CAYA 4QSAA 5EKJA 5SZ2A 1CCTA 1Z9YA 4WW6A 1F2WA 1CVDA 3F7BA 4HT0A 3F8EA 2WEGA 3OY0A 1ZE8A 1T9NA 4M2VA 4MDMA 5L3OA 3M1KA 3JXGA 1I8ZA 3BETA 5SZ1A 4YYTA 2VVAX 4MLXA 3V3GB 4YHAA 4RH2A 5JGTB 5DSJA 2NWYA 3KOKA 4M2UA 4E3GA 4QK2A 4QJPA 2FW4A 4QSJA 7CA2A 2NNOA 4K0SA 3U3AX 1TTMA 4UOVA 3RJ7A 3RG3A 1G0FA 3D0NA 5FNKA 5EKHA 3F4XA 5G0CA 3SBIA 4YGLA 1J9WA 3HKNA 3DA2A 5DSOA 1FR4A 1THKA 4KNJA 1G3ZA 4PQ7A 5SZ7A 1CRMA 4ZWYA 1G53A 5FDIA 3DC3A 4YXIA 4WR7A 3IBLA 3RG4A 4ITPA 4KUWA 4LU3A 4Q07A 2NN7A 3OYQA 4XFWA 1YO1A 3JXFA 4YGJA 3RGEA 1CILA 3P58A 4HEZA 1I9QA 3N3JA 3NB5A 3CAJA 3K34A 5SZ3A 2FOQA 4KNIA 5DSLA 3C7PA 4RN4A 3ML2A 4FVOA 4Q09A 1IF4A 3RZ0B 5JQTA 5LMDA 1FSQA 3D8WA 4Q7VA 3T83A 1ZFQA 3T5UA 1CNXA 5FL4A 5C8IA 4Q6DA 4QTLA 2POWA 5BRWA 1TH9A 1RZDA 4R59A 1ZSAA 4PZHA 2NWOA 2GD8A 6CA2A 3TVNX 4COQA 4PYXA 4Z1NA 3HLJA 4KP5A 4QJOA 1CAIA 1BN3A 1TG3A 1KOQA 2WEJA 4DZ7A 3OYSA 4HEWA 2FMGA 1HEDA 4K13A 1IF6A 1KWRA 3OIKA 2X7TA 4Q8ZA 5HPJA 4Q49A 3KONA 1IF9A 3DD0A 3IAIA 1CNYA 3PYKA 3DCCA 2H4NA 3M2YA 1LG6A 2VVBX 3FW3A 3BL0A 3M96A 5FLTA 1RZCA 4KNMA 4JSAA 2FOUA 1G45A 3MNKA 3NJ9A 4TWMA 1I9PA 3S9TA 2EU2A 4LP6A 3IGPA 5CACA 5DSMA 1BNNA 1I9LA 3DV7A 3MHLA 3S72B 3N2PA 5EH8A 3M1JA 2POVA 1IF8A 4FPTA 2CBDA 4QIZA 3MNJA 3LXEA 4HF3A 1OQ5A 4L5WA 4YGNA 3M40A 3OKVA 2NWPA 3DC9A 2HD6A 3V3HB 1CVCA 4FIKA 3B1BA 5FNMA 3DBUA 5FL6A 1RZBA 1XQ0A 4C3TA 5BRVA 1G6VA 5JG3B 1A42A 5FNJA 2NXTA 2X7UA 5FLOA 1CZMA 4Z0QA 4XIXA 4CACA 5A6HA 1ZFKA 1LUGA 4E3DA 5FLSA 1YDBA 3ZNCA 5CJFA 5DSQA 1UGCA 1BZMA 1HCBA 4E4AA 1TEUX 3IBUA 5FNLA 5E2MA 4MDGA 1BCDA 9CA2A 1CNJA 3MMFA 3S77B 2NXRA 4G7AA 4IWZA 4Q8XA 3S73B 5FNGA 3D9ZA 1HEBA 1FR7A 5EH7A 1TG9A 3QYKA 2EZ7A 1FQLA 3F7UA 5EOIA 3U7CA 1URTA 2NN1A 2QO8A 12CAA 4KP8A 1CVBA 5FNIA 2FOVA 5BYIA 5EHEA 3DD8A 1CCSA 1Y7WA 1DMYA 4QEFA 2POUA 3S8XA 4R5BA 3EFTA 3T5ZA 3S75B 5BRUA 5DSPA 4WUQA 3KIGA 2NNGA 5E2NA 1CNHA 2WD3A 4IDRX 4CA2A 3KWAA 4HT2A 1V9IC 1BNWA 3RZ7A 3MHOA 4YGFA 5DSIA 3BL1A 1HCAA 1UGGA 5JDVB 2ZNCA 4E3FA 4YXUA 1LZVA 4BF6A 2NNVA 4CNVA 1YDDA 4QJXA 4ZAOA 4K1QA 1I91A 1UGFA 5FNHA 4YVYA 4ITOA 3W6HA 3M67A 3OIMA 4Q6EA 1YDCA 1IF5A 4Q7SA 4WUPA 4QK3A 1BN1A 3HKUA 4YX4A 3OILA 5SZ5A 4JSSA 1TEQX 1ZGFA 4QSBA 1CIMA 1YO0A 2NMXA 1CAKA 2Q1BA 1XEVA 3MNAA 4CNRA 4DZ9A 4E5QA 3M5TA 4RIUA 1CNGA 1I9NA 3PJJA 3S76A 3N4BA 4Q0LA 1OKNA 5E2SA 3P3JA 2OSFA 1YO2A 1JCZA 1CVFA 3NI5A 4ILXA 4KNNA 3P4VA 1CA2A 1OKLA 2Q38A 4QY3A 5A25A 4Z1JA 3M2NA 1HUHA 1BNQA 1ZGEA 1MOOA 5DSRA 1G4OA 3DAZA 4KAPA 1CRAA 2FOSA 2WEOA 5DOGA 3V3IB 3IBIA 2HNCA 1CANA 2W2JA 3CZVA 3RYJB 4WL4A 5E28A 3M3XA 4Q7PA 3V3JA 1H9QA 3MNHA 1DCBA 4QJWA 1HVAA 3RZ8A 4YWPA 2CBBA 2F14A 1UGBA 4Z1KA 1BNVA 1RJ5A 1CAMA 4Q99A 1BV3A 4ZX1A 1TBTX 3MWOA 3OKUA 5E5RA 8CA2A 5BNLA 2HL4A 3P44A 3S71B 2Q1QA 3P3HA 3RYZA 3R17B 1G52A 3HS4A 3T85A 4N0XB 3IBNA 3N0NA 5G0BA 2CA2A 2FNKA 2QP6A 5CA2A 5L6KA 1UGAA 3KNEA 3CA2A 1CALA 2AW1A 3IEOA 4L5UA 3TMJA 3KKXA 3SAPA 4Q06A 1HEAA 3S97A 1BNUA 4QIYA 1CAZA 4BCWA 5DSNA 3RZ1B 5JG5B 1UGEA 3PO6A 1CVHA 3EFIA 5J8ZA 3K2FA 2CABA 3KOIA 3RYVB 5AMGA 4KUVA 5G03A 4CQ0A 4QJMA 4K0ZA 3SAXA 1RZAA 1TE3X 1Z97A 2NWZA 1JV0A 2NNSA 3M5SA 1G48A 3P5LA 1ZSCA 4JSZA 1XPZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5EH5 A;  4Y0J A;  3Q31 A;  2HFW A;  1BIC A;  2HKK A;  5DOH A;  3RZ5 A;  4KUY A;  5AML A;  1ZSB A;  1H4N A;  4MO8 A;  3M2Z A;  5DSK A;  3T82 A;  3S74 B;  1FLJ A;  4MDL A;  2IT4 A;  5EHV A;  3V5G A;  1FQR A;  1KOP A;  4TWL A;  5DRS A;  1IF7 A;  1TB0 X;  4JS6 A;  3RLD A;  3K7K A;  4HEY A;  3KLD B;  1DMX A;  2H15 A;  1I9M A;  1BN4 A;  1LG5 A;  3HKQ A;  1I90 A;  2NXS A;  3MHC A;  3B4F A;  4QJ0 A;  5EHW A;  3ZP9 A;  2HOC A;  3HFP A;  4E49 A;  1G46 A;  2X7S A;  1YDA A;  4RIV A;  1FSR A;  5AMD A;  3T84 A;  2EU3 A;  4FRC A;  5SZ6 A;  4Q08 A;  4ZWX A;  3V2J A;  4XIW A;  4YXO A;  4QK1 A;  5FLP A;  5EIJ A;  4LHI A;  4BF1 A;  4MLT A;  3M04 A;  2O4Z A;  5FLQ A;  5DVX A;  3CYU A;  1HUG A;  5E2K A;  3U47 A;  3M2X A;  1CCU A;  4Q78 A;  1CAH A;  5E2R A;  1KEQ A;  5JQ0 A;  1CVA A;  4CNW A;  3V2M A;  5JEH B;  5E5U A;  1G54 A;  3V7X A;  4RUY A;  1I9O A;  4L5V A;  4Q87 A;  5IPZ A;  4XZ5 A;  2QOA A;  3D93 A;  3M1Q A;  1XEG A;  3SBH A;  3UYN A;  4GL1 X;  1FQN A;  2WD2 A;  3U45 X;  4Q90 A;  5FDC A;  1FQM A;  2WEH A;  2FNM A;  4FVN A;  4PXX A;  4HBA A;  4MTY A;  1G0E A;  2FNN A;  1RZE A;  5CLU A;  4ZWZ A;  5G01 A;  1JD0 A;  3MDZ A;  3L14 A;  3S78 B;  1CAJ A;  1Z93 A;  2AX2 A;  4M2W A;  3UYQ A;  1CIN A;  1H9N A;  2CBA A;  3FE4 A;  1CNW A;  5JEP B;  2OSM A;  4CNX A;  3P55 A;  3TVO X;  2CBE A;  1HEC A;  1CA3 A;  1V9E A;  4Q9Y A;  1OKM A;  4Q8Y A;  3JXH C;  1EOU A;  1RAY A;  3MZC A;  4Z1E A;  2FOY A;  3DVC A;  5FL5 A;  3M14 A;  3RYX B;  2ABE A;  2ILI A;  3KS3 A;  3D92 A;  4RUZ A;  5EKM A;  4Q81 A;  4RFC A;  5SZ0 A;  3M1W A;  2FMZ A;  1AZM A;  4N16 A;  3ML5 A;  1CNB A;  1G1D A;  3MHI A;  3V3F A;  4HU1 A;  1ZH9 A;  5FLR A;  1CNK A;  3VBD A;  4G0C A;  4R5A A;  3P5A A;  1FSN A;  4KV0 A;  3RYY A;  1RAZ A;  4M2R A;  4RFD A;  1MUA A;  3W6I A;  1ZNC A;  3M98 A;  3MNU A;  1RJ6 A;  3GZ0 A;  4PYY A;  1BNT A;  3MNI A;  4E9O X;  2GEH A;  3R16 A;  4FL7 A;  4XE1 A;  4K0T A;  4YGK A;  3DVD A;  1AVN A;  4WW8 A;  1KWQ A;  4X5S A;  4QSI A;  3HKT A;  3DCS A;  1BNM A;  5EZT X;  3M5E A;  1LGD A;  4RUX A;  4Q83 A;  1CAO A;  1CNI A;  4FU5 A;  3DVB A;  5SZ4 A;  2CBC A;  1G4J A;  5JGS B;  4ETQ C;  5JES B;  4JSW A;  4ZX0 A;  4E3H A;  3FFP X;  1CVE A;  3DCW A;  3MHM A;  3MYQ A;  4ZWI A;  1CNC A;  1UGD A;  4Q7W A;  5JEG B;  1AM6 A;  1DCA A;  1CAY A;  4QSA A;  5EKJ A;  5SZ2 A;  1CCT A;  1Z9Y A;  4WW6 A;  1F2W A;  1CVD A;  3F7B A;  4HT0 A;  3F8E A;  2WEG A;  3OY0 A;  1ZE8 A;  1T9N A;  4M2V A;  4MDM A;  5L3O A;  3M1K A;  3JXG A;  1I8Z A;  3BET A;  5SZ1 A;  4YYT A;  2VVA X;  4MLX A;  3V3G B;  4YHA A;  4RH2 A;  5JGT B;  5DSJ A;  2NWY A;  3KOK A;  4M2U A;  4E3G A;  4QK2 A;  4QJP A;  2FW4 A;  4QSJ A;  7CA2 A;  2NNO A;  4K0S A;  3U3A X;  1TTM A;  4UOV A;  3RJ7 A;  3RG3 A;  1G0F A;  3D0N A;  5FNK A;  5EKH A;  3F4X A;  5G0C A;  3SBI A;  4YGL A;  1J9W A;  3HKN A;  3DA2 A;  5DSO A;  1FR4 A;  1THK A;  4KNJ A;  1G3Z A;  4PQ7 A;  5SZ7 A;  1CRM A;  4ZWY A;  1G53 A;  5FDI A;  3DC3 A;  4YXI A;  4WR7 A;  3IBL A;  3RG4 A;  4ITP A;  4KUW A;  4LU3 A;  4Q07 A;  2NN7 A;  3OYQ A;  4XFW A;  1YO1 A;  3JXF A;  4YGJ A;  3RGE A;  1CIL A;  3P58 A;  4HEZ A;  1I9Q A;  3N3J A;  3NB5 A;  3CAJ A;  3K34 A;  5SZ3 A;  2FOQ A;  4KNI A;  5DSL A;  3C7P A;  4RN4 A;  3ML2 A;  4FVO A;  4Q09 A;  1IF4 A;  3RZ0 B;  5JQT A;  5LMD A;  1FSQ A;  3D8W A;  4Q7V A;  3T83 A;  1ZFQ A;  3T5U A;  1CNX A;  5FL4 A;  5C8I A;  4Q6D A;  4QTL A;  2POW A;  5BRW A;  1TH9 A;  1RZD A;  4R59 A;  1ZSA A;  4PZH A;  2NWO A;  2GD8 A;  6CA2 A;  3TVN X;  4COQ A;  4PYX A;  4Z1N A;  3HLJ A;  4KP5 A;  4QJO A;  1CAI A;  1BN3 A;  1TG3 A;  1KOQ A;  2WEJ A;  4DZ7 A;  3OYS A;  4HEW A;  2FMG A;  1HED A;  4K13 A;  1IF6 A;  1KWR A;  3OIK A;  2X7T A;  4Q8Z A;  5HPJ A;  4Q49 A;  3KON A;  1IF9 A;  3DD0 A;  3IAI A;  1CNY A;  3PYK A;  3DCC A;  2H4N A;  3M2Y A;  1LG6 A;  2VVB X;  3FW3 A;  3BL0 A;  3M96 A;  5FLT A;  1RZC A;  4KNM A;  4JSA A;  2FOU A;  1G45 A;  3MNK A;  3NJ9 A;  4TWM A;  1I9P A;  3S9T A;  2EU2 A;  4LP6 A;  3IGP A;  5CAC A;  5DSM A;  1BNN A;  1I9L A;  3DV7 A;  3MHL A;  3S72 B;  3N2P A;  5EH8 A;  3M1J A;  2POV A;  1IF8 A;  4FPT A;  2CBD A;  4QIZ A;  3MNJ A;  3LXE A;  4HF3 A;  1OQ5 A;  4L5W A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4KUYA

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Chain Sequence

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