4L5UA

The structural implications of the secondary co2 binding pocket in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKIRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural, catalytic and stabilizing consequences of aromatic cluster variants in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 74
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4l5uA00
3M5TA 4RIVA 2HNCA 5SZ1A 5BYIA 4WW8A 3RZ8A 5BRWA 1HEDA 4PYYA 4Q08A 1I9QA 3MNKA 3RYVB 3RYJB 3SBHA 4Q07A 3W6IA 2NXRA 5FNHA 2FOQA 1TB0X 2W2JA 1TG9A 4R59A 3RZ1B 1G0EA 3M2NA 4L5UA 4Z1EA 3M5SA 3HLJA 4ZAOA 4RUYA 4YYTA 4JS6A 3V2MA 3S8XA 4QJXA 1BNVA 4Q90A 1Z97A 4JSZA 5G0CA 4Q8ZA 4E4AA 1G48A 5E5UA 1CAKA 2WEGA 4YVYA 5EHVA 2WEHA 4X5SA 1I9PA 1H9QA 2EZ7A 3P58A 5DOHA 1BNTA 4CACA 5AMGA 4RH2A 1IF9A 3RYYA 3MZCA 4Z0QA 3T84A 3RYZA 3TMJA 5LMDA 5E2MA 1V9IC 3KNEA 4QEFA 4FVOA 3QYKA 1BNQA 4Q0LA 4LP6A 4YWPA 2IT4A 2OSMA 3CAJA 3D93A 3DCSA 3M14A 4WW6A 4CNVA 1G4JA 4BCWA 4KNNA 1CINA 1DMXA 1YDCA 1AZMA 5L6KA 1CNXA 1BV3A 3CA2A 1FQMA 1BZMA 4G7AA 5EH7A 5FLOA 2Q1BA 3NI5A 1CNBA 2X7TA 5JGSB 5SZ5A 4RN4A 5FNJA 1LG5A 2HD6A 3DVDA 4E3FA 3MWOA 4XFWA 1CVAA 3VBDA 2CA2A 2H15A 3P3JA 5SZ3A 4ZWYA 1V9EA 4Q87A 3B4FA 3BL1A 4QSJA 1CA3A 1JD0A 3IBIA 4YGJA 5C8IA 4PXXA 1KOQA 5E2NA 3W6HA 5EKJA 3RZ5A 1ZSCA 3DBUA 2FNNA 1RAYA 2H4NA 1BICA 3DC3A 4BF6A 1CAZA 1KEQA 4FVNA 3V3IB 4N16A 4Q83A 2FOVA 4E5QA 1LG6A 1G0FA 1LGDA 12CAA 1FSRA 4MLTA 3HKQA 1YO2A 4Q99A 2NN1A 5EH5A 5FLQA 4YGNA 3M40A 4M2UA 1TH9A 1THKA 5E2KA 4WR7A 7CA2A 3OY0A 4ZWZA 1ZGEA 3HFPA 3RLDA 3JXHC 5DRSA 3IBNA 1MOOA 4Q78A 3S72B 3FE4A 1RZEA 3V5GA 4Q6DA 4QJMA 2CBDA 2X7UA 1UGDA 1XQ0A 1FLJA 4RFDA 5FL6A 3RJ7A 1CAJA 3S77B 1BN1A 2FW4A 1ZNCA 4YGLA 2OSFA 1OKMA 2CABA 3M1KA 2GD8A 2NXTA 3N3JA 3R16A 1YO0A 3LXEA 2NNSA 4CNRA 3GZ0A 3DD0A 4WL4A 3V3FA 1UGGA 3DVBA 5EKMA 2NNVA 3MHOA 1FQNA 1CVEA 3K34A 3RZ7A 2HL4A 5FDCA 3HS4A 5BRVA 5E5RA 1G3ZA 2POUA 1URTA 1LZVA 2HKKA 2NWPA 4MLXA 6CA2A 1G46A 1XEGA 4R5BA 5JEPB 1FSQA 3S73B 1HEAA 2VVAX 3P44A 4ITOA 4ETQC 3OIMA 8CA2A 4QSBA 4KNJA 4K0ZA 5EHWA 1UGCA 3DAZA 5AMDA 2WD3A 5SZ2A 1AVNA 3F7UA 1YDDA 3M2YA 1FSNA 2AW1A 4E3DA 4Q8YA 1HUHA 1RZCA 2F14A 4PZHA 3IBUA 3RG3A 1IF7A 4MDLA 2NN7A 1CAOA 3M2XA 1F2WA 2NNGA 5FNMA 1H9NA 4RUXA 3UYQA 2FOUA 3V3HB 1T9NA 4MTYA 4YGFA 4FRCA 5JEHB 1UGAA 4QY3A 4CNXA 4KV0A 1CRAA 5DOGA 3IBLA 4IDRX 5E2SA 3V3GB 2FMZA 3MHLA 4DZ7A 2HFWA 3MNUA 4RFCA 2ABEA 5DSPA 4RIUA 4XE1A 3JXFA 3P5AA 5G0BA 1G54A 1YO1A 4Q7PA 5SZ4A 5JQ0A 1I9MA 3N4BA 1OQ5A 3C7PA 4RUZA 3SBIA 1BN4A 9CA2A 3T5UA 1I9LA 4PQ7A 1CNGA 5HPJA 4YHAA 4Y0JA 3MDZA 1OKNA 5AMLA 4COQA 2AX2A 4YXUA 1RZBA 1G6VA 3M2ZA 5SZ6A 1ZFKA 5JESB 3U47A 1Z93A 2ILIA 1CILA 2NWZA 3TVNX 3U45X 1CNCA 1J9WA 5A25A 3B1BA 5FNGA 3N2PA 3OILA 2FOSA 4HT0A 3KLDB 1CAMA 4N0XB 3RYXB 1CA2A 5DVXA 5FLTA 3M96A 4M2WA 3P55A 4QK3A 3S75B 4E3GA 3ZNCA 1KOPA 4FL7A 2FOYA 1Y7WA 2NWYA 2X7SA 4KNMA 4Q09A 3ML2A 3SAPA 4HBAA 3M1WA 4HEWA 5IPZA 5FLRA 5CJFA 3NB5A 1OKLA 2EU3A 3M98A 1TBTX 3K7KA 2CBBA 1I9OA 1CVBA 4LHIA 1CNHA 3M3XA 4TWLA 5FNIA 2QO8A 5BNLA 4QJWA 3OYSA 1BN3A 5FNLA 3N0NA 1JV0A 3MYQA 2FMGA 5FLPA 1CNYA 3MNIA 5JDVB 3KONA 3BETA 2CBAA 1TEQX 5DSKA 5DSQA 1XPZA 4YXIA 2O4ZA 5FDIA 1I8ZA 4FU5A 2ZNCA 3DC9A 4HEYA 4ITPA 2CBCA 4KNIA 2NXSA 4KAPA 4L5WA 5G01A 2GEHA 3MHMA 4XIXA 3KOIA 1UGBA 3P5LA 5DSNA 3D8WA 4QK2A 5E2RA 4PYXA 5DSIA 3D92A 3R17B 4QSAA 4KP5A 2CBEA 1ZSAA 1CNWA 3JXGA 4QIZA 3NJ9A 5SZ0A 1IF4A 1CVDA 1AM6A 3IAIA 4Q8XA 1CVFA 1LUGA 4YGKA 1CVHA 5FLSA 2QOAA 1G53A 2POWA 4KUYA 1G52A 3PO6A 3DV7A 1I90A 3IEOA 4IWZA 4JSWA 2FNKA 2FNMA 1YDBA 3Q31A 4K0SA 4Q49A 3FFPX 2QP6A 4K0TA 3P3HA 1CNIA 2WEOA 1FQLA 1XEVA 3V3JA 2HOCA 2POVA 5EOIA 4ZX1A 5DSMA 1IF5A 2NMXA 1CCSA 5EKHA 3DA2A 3KS3A 3CYUA 2VVBX 1KWQA 3S74B 5JG3B 1CCUA 1CIMA 4QJ0A 4Z1KA 3V7XA 4WUPA 2EU2A 4FIKA 5E28A 5FNKA 2Q38A 3HKUA 5L3OA 3IGPA 4L5VA 1JCZA 1FR4A 3EFTA 5EHEA 3MNHA 1CAYA 4QJPA 1HECA 5JGTB 1TE3X 4HF3A 3TVOX 3RZ0B 3U7CA 4E9OX 4Q9YA 5EH8A 3KOKA 1YDAA 4YX4A 2Q1QA 3UYNA 5JEGB 3S9TA 3KWAA 4K13A 3KKXA 3OIKA 4QJOA 5DSJA 1G4OA 3DCCA 3L14A 3MHIA 1BCDA 4KP8A 5SZ7A 4QK1A 3S76A 3T85A 1RAZA 2WD2A 3S71B 3DVCA 1IF8A 4C3TA 1HCBA 3S78B 3OYQA 3V2JA 4CQ0A 4Q7WA 3T5ZA 3RGEA 2NNOA 1ZGFA 5CA2A 3M1JA 3HKNA 3OKUA 5DSOA 1EOUA 1A42A 1DMYA 5DSLA 4QIYA 1KWRA 3MHCA 5DSRA 3M67A 4KUWA 3F7BA 4M2VA 3BL0A 4LU3A 4Z1NA 1TTMA 4Q7SA 3SAXA 1ZE8A 1BNMA 4XIWA 3M1QA 1RZAA 2NWOA 4MO8A 5CACA 1G45A 1ZH9A 3FW3A 3D0NA 1RJ5A 5A6HA 1DCAA 1FQRA 4QTLA 1IF6A 3RG4A 5BRUA 4ZX0A 4E49A 1CNKA 1CANA 1H4NA 4R5AA 3ZP9A 1ZFQA 4Q81A 4QSIA 2WEJA 4Q7VA 3P4VA 4WUQA 4ZWIA 4MDMA 3S97A 1HUGA 3T82A 4Q06A 1HVAA 4Z1JA 1I91A 4FPTA 4ZWXA 1CAIA 3OKVA 1DCBA 3U3AX 3MNJA 4BF1A 4GL1X 1MUAA 3M04A 4HT2A 1HEBA 3DCWA 3DD8A 5FL4A 5JQTA 4M2RA 3ML5A 4K1QA 3MNAA 4CNWA 1RZDA 3KIGA 3K2FA 1BNWA 1ZSBA 4MDGA 4YXOA 1Z9YA 1RJ6A 4TWMA 3PJJA 5EZTX 4CA2A 1HCAA 1FR7A 1UGFA 4Q6EA 3D9ZA 4E3HA 1TG3A 3F8EA 1CCTA 1G1DA 4JSAA 5JG5B 4UOVA 1I9NA 4XZ5A 1UGEA 3MMFA 3EFIA 3T83A 1CRMA 4JSSA 5FL5A 4DZ9A 1CAHA 1TEUX 1BNUA 3CZVA 3F4XA 4ILXA 5EIJA 4HU1A 4HEZA 3M5EA 5G03A 1CALA 3PYKA 5J8ZA 3HKTA 4KUVA 5CLUA 1CZMA 1BNNA 1CNJA 1CVCA 4G0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3M5T A;  4RIV A;  2HNC A;  5SZ1 A;  5BYI A;  4WW8 A;  3RZ8 A;  5BRW A;  1HED A;  4PYY A;  4Q08 A;  1I9Q A;  3MNK A;  3RYV B;  3RYJ B;  3SBH A;  4Q07 A;  3W6I A;  2NXR A;  5FNH A;  2FOQ A;  1TB0 X;  2W2J A;  1TG9 A;  4R59 A;  3RZ1 B;  1G0E A;  3M2N A;  4L5U A;  4Z1E A;  3M5S A;  3HLJ A;  4ZAO A;  4RUY A;  4YYT A;  4JS6 A;  3V2M A;  3S8X A;  4QJX A;  1BNV A;  4Q90 A;  1Z97 A;  4JSZ A;  5G0C A;  4Q8Z A;  4E4A A;  1G48 A;  5E5U A;  1CAK A;  2WEG A;  4YVY A;  5EHV A;  2WEH A;  4X5S A;  1I9P A;  1H9Q A;  2EZ7 A;  3P58 A;  5DOH A;  1BNT A;  4CAC A;  5AMG A;  4RH2 A;  1IF9 A;  3RYY A;  3MZC A;  4Z0Q A;  3T84 A;  3RYZ A;  3TMJ A;  5LMD A;  5E2M A;  1V9I C;  3KNE A;  4QEF A;  4FVO A;  3QYK A;  1BNQ A;  4Q0L A;  4LP6 A;  4YWP A;  2IT4 A;  2OSM A;  3CAJ A;  3D93 A;  3DCS A;  3M14 A;  4WW6 A;  4CNV A;  1G4J A;  4BCW A;  4KNN A;  1CIN A;  1DMX A;  1YDC A;  1AZM A;  5L6K A;  1CNX A;  1BV3 A;  3CA2 A;  1FQM A;  1BZM A;  4G7A A;  5EH7 A;  5FLO A;  2Q1B A;  3NI5 A;  1CNB A;  2X7T A;  5JGS B;  5SZ5 A;  4RN4 A; 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