4Q7SA

Crystal structure of 1-hydroxy-4-methylpyridine-2(1h)-thione bound to human carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Exploring the influence of the protein environment on metal-binding pharmacophores.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-04-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q7sA00
1CNKA 4RH2A 1JV0A 1Z9YA 4YGLA 3V3JA 3DVCA 3V3GB 4ETQC 3DCCA 3VBDA 1FQLA 4HEWA 4WW6A 1FSQA 4YHAA 1G46A 3MNAA 5JEHB 1ZGEA 4MTYA 1CNCA 3P3JA 1HVAA 1ZH9A 4E5QA 4Z1NA 5CLUA 1G48A 2NWOA 4K0TA 3S77B 2NNGA 3FW3A 5BRVA 4BCWA 4Q7VA 1DCAA 1HEAA 1I9QA 1ZSBA 4QSBA 4IDRX 3SAPA 1CVAA 4E49A 4Q6DA 4Q8ZA 4Q7SA 1I9MA 3T5UA 1TH9A 4ZX1A 4MLTA 4E3GA 1URTA 4RIVA 3CA2A 3RZ0B 1YDAA 3S73B 4KAPA 1XEVA 3RG4A 2IT4A 2NNSA 3DA2A 3T82A 3KONA 1CNHA 1H4NA 1UGBA 3S72B 3S78B 5JGSB 1Z93A 2FNNA 1OKLA 2NWZA 3D9ZA 3RYYA 2WEOA 3M96A 1ZFQA 1XPZA 4QJWA 3N2PA 1UGFA 2EZ7A 1Z97A 1AVNA 3OIMA 5EOIA 3W6HA 4E3DA 5DVXA 1CALA 4YVYA 3P55A 4Q49A 1YO2A 1BNMA 4YXOA 2VVBX 3R17B 2HD6A 5FLQA 2X7TA 3MHMA 4XE1A 1CA3A 4Z1EA 1CANA 2POWA 3D0NA 3V3HB 3P58A 3QYKA 4RFCA 4ZX0A 5SZ0A 4K0SA 4TWMA 4XFWA 4MDMA 3RYXB 1CAIA 1CNXA 4UOVA 4FU5A 3MHLA 4Q9YA 3IBLA 3D92A 2VVAX 3OKUA 4K0ZA 4JSSA 3KOIA 5DOHA 3IBIA 3T83A 4JSWA 1IF4A 3S9TA 4KNNA 1G45A 3OILA 4E3HA 3JXFA 5FNHA 1IF8A 5FL6A 4KP8A 4R5AA 1OKMA 3ML2A 1BNQA 3P44A 1HUHA 5FDCA 2POVA 5EKJA 4CNXA 1CCSA 4ZWIA 1G4OA 3LXEA 1FQNA 1G1DA 2ABEA 2NN1A 5JQTA 1RZEA 5DSJA 5G01A 1UGCA 4HEZA 1DCBA 4CA2A 2NWYA 1FSRA 3MNKA 3RZ8A 3U7CA 4IWZA 1XQ0A 4M2UA 5CACA 4PZHA 4MDLA 4DZ9A 3M5TA 1CNJA 2FNMA 5DSMA 1RAZA 3SAXA 4L5UA 2POUA 3PJJA 5LMDA 4JS6A 1CNWA 2FOYA 4QK2A 1YDBA 3HKTA 1ZFKA 4MDGA 1RZAA 1LG5A 3K2FA 3KS3A 2FOSA 4FPTA 1G53A 1I8ZA 1CILA 3IEOA 1V9IC 4FIKA 5G0BA 4WW8A 3U47A 2CBCA 2QOAA 3S8XA 3MYQA 4Q8YA 1I9NA 1HCAA 3MHOA 5EZTX 2H4NA 3U3AX 3DCSA 4FVNA 2FNKA 3P3HA 2NXTA 1RZCA 5E2RA 1ZSCA 2CBEA 4G7AA 3OKVA 5CJFA 4QJXA 4CACA 5G0CA 4Q7WA 2HL4A 5SZ7A 5E5RA 4C3TA 1HEBA 5FLRA 1FLJA 3V2MA 5EHWA 2AX2A 5JG5B 3L14A 5SZ2A 4Q78A 1CNBA 5FL5A 3M2XA 5J8ZA 4HEYA 3UYNA 3V7XA 5HPJA 3S74B 2QP6A 4Q83A 4YGFA 3RYJB 3MNIA 4Q07A 5EH8A 3M14A 3BL1A 3DVDA 1CNYA 3W6IA 5E28A 1MOOA 2Q1BA 3DD8A 3OY0A 1BZMA 2WEJA 5AMGA 3D8WA 5DSOA 5JG3B 2FOVA 2HFWA 4R59A 4QIZA 3BL0A 3SBIA 2WD3A 4QK1A 1ZSAA 1TBTX 1J9WA 1I9OA 4ILXA 5JEGB 4MO8A 3DCWA 4N0XB 1CVCA 1CA2A 1YDCA 2Q38A 4JSZA 1DMXA 4ITPA 1IF5A 2HOCA 3NJ9A 4QJ0A 5BRUA 1TG9A 4ZWXA 4YGKA 5DSRA 1BN4A 1IF7A 3S75B 3R16A 1CAKA 1G54A 4XZ5A 1IF9A 3M3XA 1CCTA 4X5SA 3KOKA 3OYSA 3M1KA 2AW1A 4Q0LA 3DC3A 1RAYA 5JDVB 4Z1KA 1LG6A 3M98A 1THKA 4Z1JA 5EHEA 1G6VA 4QSJA 3N0NA 2FOQA 4RUZA 3P5LA 4PYYA 3B1BA 4KUVA 1ZGFA 3IBUA 4QTLA 5DOGA 1UGGA 3NI5A 4RIUA 1CCUA 2NMXA 3DVBA 2FMZA 4M2RA 2EU2A 4XIXA 3ML5A 1YO1A 4FRCA 1G4JA 4R5BA 5EH5A 1T9NA 3JXHC 4KP5A 4CNRA 1CRAA 1CVBA 1H9NA 5C8IA 1I91A 3RZ1B 3RG3A 4WUPA 1FR7A 1CNGA 3DC9A 3PO6A 1KWRA 4LHIA 4Q06A 4LP6A 3T5ZA 3GZ0A 1UGEA 4YXIA 3M2ZA 4Q08A 3S97A 1TE3X 4M2VA 3IGPA 2CABA 3HS4A 5DSIA 4Q7PA 4Q99A 5IPZA 3KIGA 4WL4A 2NNOA 2NN7A 2WEHA 4QIYA 4PYXA 4N16A 3V3IB 5DSKA 1TEQX 4WUQA 3RZ7A 3K7KA 5AMLA 1HUGA 2CA2A 2OSFA 3IBNA 3UYQA 3TVNX 3HKQA 1BCDA 1CAZA 5JESB 4HU1A 3M2YA 1BV3A 1CAJA 1BICA 3NB5A 3P5AA 4DZ7A 5BNLA 5DSNA 4ZAOA 1I9PA 3M40A 1MUAA 2CBAA 4BF1A 4Y0JA 3C7PA 1HECA 3EFTA 3DD0A 1KOQA 1CVDA 5FDIA 2H15A 2Q1QA 4Q87A 4ZWZA 4YWPA 1KEQA 4PXXA 1RJ5A 4QJPA 1G0FA 3MNUA 1EOUA 3MNHA 4QK3A 3T84A 3MMFA 5DRSA 1TTMA 1UGDA 1V9EA 5E5UA 3PYKA 3MHCA 5EH7A 5E2KA 1CVFA 1CNIA 5FNJA 1BNWA 3KWAA 3IAIA 3MDZA 5CA2A 3RJ7A 1CVEA 2X7SA 4E9OX 3V5GA 4BF6A 3B4FA 3CZVA 4FVOA 3SBHA 3ZP9A 3CYUA 5FNMA 4RN4A 1AM6A 5FLPA 1LGDA 5BYIA 4G0CA 2NXSA 2WD2A 3M1QA 4YYTA 2OSMA 5FNIA 5FNKA 5SZ3A 3D93A 3OIKA 1CRMA 3HKNA 1DMYA 2NXRA 3T85A 6CA2A 1CAOA 5EIJA 2ZNCA 5A6HA 3JXGA 5A25A 4Q81A 5JEPB 5EHVA 1A42A 5DSQA 4KNJA 4K13A 1RZDA 4KUYA 3RGEA 3ZNCA 4L5VA 3HFPA 1HCBA 4RFDA 2FOUA 3V3FA 3TMJA 1KOPA 4RUYA 4KUWA 2F14A 3CAJA 3MWOA 9CA2A 1RJ6A 1OQ5A 2CBBA 3MZCA 3V2JA 3N4BA 4KNIA 1FSNA 5FLSA 5BRWA 1CVHA 4GL1X 1FR4A 4FL7A 3RZ5A 1BN1A 4Q90A 4KV0A 1RZBA 1CIMA 4HT0A 1CAMA 3FE4A 5FL4A 4QSIA 3K34A 2QO8A 4PQ7A 2NNVA 3F8EA 1AZMA 3M5SA 3F7UA 8CA2A 1G0EA 4YGJA 1JCZA 2ILIA 1Y7WA 4QY3A 4KNMA 3N3JA 4LU3A 1BNUA 4CQ0A 3M2NA 1HEDA 1I90A 5EKMA 3RYVB 3U45X 1CZMA 1FQMA 3OYQA 2EU3A 3S71B 4YX4A 5AMDA 1XEGA 1TEUX 5SZ4A 4QJOA 5FLOA 5G03A 2X7UA 5L3OA 4MLXA 2W2JA 2O4ZA 1H9QA 3M67A 4Q8XA 4Z0QA 3M1WA 3DV7A 4L5WA 2HKKA 4HBAA 3S76A 4COQA 2CBDA 5SZ5A 4XIWA 4QEFA 4QJMA 4E4AA 4YGNA 1YDDA 3P4VA 2HNCA 5FNGA 1ZNCA 1JD0A 4HT2A 3RLDA 4QSAA 3BETA 5E2SA 1YO0A 4CNWA 5JGTB 3RYZA 3DAZA 4TWLA 5FLTA 2WEGA 1CAYA 5L6KA 4ITOA 3HKUA 4JSAA 1I9LA 4WR7A 3TVOX 3Q31A 5DSLA 3KLDB 5DSPA 4K1QA 2GD8A 3MHIA 4YXUA 1KWQA 1OKNA 3F4XA 1G3ZA 2GEHA 5E2MA 1CAHA 3M04A 4Q09A 1IF6A 3M5EA 5SZ1A 5SZ6A 4ZWYA 1FQRA 2NWPA 3KKXA 5E2NA 7CA2A 1BNTA 2FMGA 4CNVA 1ZE8A 3EFIA 1TB0X 5JQ0A 1LUGA 5FNLA 4Q6EA 12CAA 1TG3A 1UGAA 4RUXA 5EKHA 1CINA 3HLJA 1BNNA 1F2WA 1G52A 3DBUA 3F7BA 4M2WA 4HF3A 1BN3A 1LZVA 2FW4A 3KNEA 3M1JA 3MNJA 4E3FA 1BNVA 3FFPX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CNK A;  4RH2 A;  1JV0 A;  1Z9Y A;  4YGL A;  3V3J A;  3DVC A;  3V3G B;  4ETQ C;  3DCC A;  3VBD A;  1FQL A;  4HEW A;  4WW6 A;  1FSQ A;  4YHA A;  1G46 A;  3MNA A;  5JEH B;  1ZGE A;  4MTY A;  1CNC A;  3P3J A;  1HVA A;  1ZH9 A;  4E5Q A;  4Z1N A;  5CLU A;  1G48 A;  2NWO A;  4K0T A;  3S77 B;  2NNG A;  3FW3 A;  5BRV A;  4BCW A;  4Q7V A;  1DCA A;  1HEA A;  1I9Q A;  1ZSB A;  4QSB A;  4IDR X;  3SAP A;  1CVA A;  4E49 A;  4Q6D A;  4Q8Z A;  4Q7S A;  1I9M A;  3T5U A;  1TH9 A;  4ZX1 A;  4MLT A;  4E3G A;  1URT A;  4RIV A;  3CA2 A;  3RZ0 B;  1YDA A;  3S73 B;  4KAP A;  1XEV A;  3RG4 A;  2IT4 A;  2NNS A;  3DA2 A;  3T82 A;  3KON A;  1CNH A;  1H4N A;  1UGB A;  3S72 B;  3S78 B;  5JGS B;  1Z93 A;  2FNN A;  1OKL A;  2NWZ A;  3D9Z A;  3RYY A;  2WEO A;  3M96 A;  1ZFQ A;  1XPZ A;  4QJW A;  3N2P A;  1UGF A;  2EZ7 A;  1Z97 A;  1AVN A;  3OIM A;  5EOI A;  3W6H A;  4E3D A;  5DVX A;  1CAL A;  4YVY A;  3P55 A;  4Q49 A;  1YO2 A;  1BNM A;  4YXO A;  2VVB X;  3R17 B;  2HD6 A;  5FLQ A;  2X7T A;  3MHM A;  4XE1 A;  1CA3 A;  4Z1E A; 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