4Q8ZA

Crystal structure of 1-hydroxy-4-methylpyridin-2(1h)-one bound to human carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Exploring the influence of the protein environment on metal-binding pharmacophores.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q8zA00
1RZEA 4E49A 3MHLA 2HL4A 5BRUA 1TTMA 2F14A 2FOQA 1I9NA 4YGLA 4QJXA 1CNHA 1CVAA 2FMGA 6CA2A 1JD0A 2AW1A 3HKQA 1CNCA 3P5LA 4CNXA 8CA2A 1BNUA 2POWA 5FNKA 3MNIA 1FQRA 1OQ5A 1CAJA 3FFPX 3NB5A 4CACA 1UGDA 1BNNA 3M1KA 4Q09A 2CBAA 3D92A 4QSJA 3M67A 4G7AA 5SZ7A 4XFWA 3BL0A 5EHEA 1G54A 3R16A 3U45X 1AZMA 4ZWIA 1BZMA 1IF8A 2ZNCA 5CACA 1RZCA 3T85A 3P3JA 3CYUA 5DSOA 1V9EA 1RJ5A 1LG6A 1JV0A 2FNMA 3F7UA 4PZHA 5A25A 1KOQA 3DC3A 1CCSA 4KNNA 3P4VA 3DVDA 4CNVA 4Z0QA 1ZFQA 5EH8A 4ZAOA 3OIKA 1CNKA 3S74B 1UGEA 4HBAA 2WD3A 3IBIA 3M2NA 3V3IB 5EHWA 5JEHB 3D8WA 3IBLA 5HPJA 3RZ5A 4DZ9A 3M5EA 3LXEA 5FLTA 1LG5A 3OKUA 4YXIA 3KS3A 3S73B 4Q8ZA 1CINA 4E3FA 3MMFA 3V3JA 2W2JA 4YGFA 4FU5A 5L6KA 4M2VA 1FSQA 1IF4A 3V5GA 3DBUA 4WL4A 5DSNA 1G6VA 5CJFA 3V2JA 2OSMA 4GL1X 4RN4A 3U3AX 1TBTX 4RFDA 3S76A 1TEUX 3M5SA 4DZ7A 4QK1A 4E4AA 3L14A 1G1DA 3N2PA 4Q99A 4UOVA 4RIVA 1HUHA 3DD0A 3OILA 1CVEA 2CA2A 3ML2A 3SAPA 3MNHA 3M40A 3UYNA 4MDGA 4KP8A 1AM6A 3T5ZA 3HKTA 2OSFA 2NWYA 2CBCA 3TVNX 1G45A 1G3ZA 1RZBA 1G52A 5DSLA 3M1JA 3PO6A 5SZ0A 4E3DA 4MO8A 4YXOA 5JEGB 1TB0X 3N3JA 5FNHA 1I91A 1HEAA 1HECA 4E3HA 2CBBA 1DCAA 3P55A 1XEGA 2NMXA 3RJ7A 1DMXA 4Q87A 4R5BA 4Q81A 2FNNA 2ABEA 4YGNA 1I9OA 2HOCA 3ML5A 3KWAA 4XIXA 4YWPA 3VBDA 4KAPA 3T5UA 3MHOA 4Q90A 3PYKA 2FOUA 1G53A 3S71B 2HFWA 3P44A 4KV0A 3RZ7A 4K0SA 7CA2A 2FMZA 1CNJA 4BF1A 1CALA 1H9NA 1H4NA 1MUAA 3SBIA 5JESB 3V3FA 4Q49A 5JG3B 1IF6A 4CQ0A 1CRMA 3DC9A 3ZNCA 1KWQA 1KEQA 4ETQC 4Z1JA 2EU3A 1YO2A 3MNAA 3CA2A 5FDCA 3K34A 1ZNCA 3MHMA 2WEHA 5FL4A 2X7UA 5JGSB 2HNCA 1HCAA 1HEDA 1CNYA 1BN1A 3GZ0A 3HFPA 5E2RA 4M2UA 4Q7WA 3DVBA 4Z1KA 1BNTA 5E28A 1TH9A 3S77B 3KIGA 4Q8XA 3PJJA 4WR7A 1AVNA 1XQ0A 3M1WA 3KNEA 4Q06A 5IPZA 3D93A 5DRSA 1FR7A 1BV3A 1RZAA 3M98A 5EOIA 4HEWA 3KOIA 1FQNA 1LUGA 1TG3A 4FIKA 4KNJA 4YHAA 4KUWA 5J8ZA 3MDZA 5EKMA 2NWPA 4QJMA 4RFCA 5FL6A 3HLJA 1CNGA 1Y7WA 1RAZA 5DSRA 4YXUA 5SZ4A 3V7XA 5BYIA 1RZDA 5FNMA 5SZ3A 3DVCA 2WEOA 3S75B 3S9TA 2POVA 1Z9YA 4WW6A 4QSIA 3W6HA 4L5VA 1CIMA 5BRVA 4FVNA 3DCCA 1ZSBA 4Q0LA 3DCSA 1H9QA 2FOVA 3S72B 2NWOA 5EHVA 1V9IC 3V3GB 3KKXA 2NXSA 2CBDA 4WUPA 3R17B 3OIMA 1CNWA 1CAKA 4QTLA 1I9MA 3U47A 3DV7A 1CNXA 4MDMA 1YO1A 5A6HA 3S8XA 1IF7A 4Y0JA 3T82A 1KOPA 4KUVA 4R59A 1YDCA 2EZ7A 4K13A 1G48A 3M1QA 3P3HA 3OKVA 1MOOA 5AMLA 4PQ7A 4FPTA 3M2YA 4ZWZA 3C7PA 5E5UA 1CAMA 4IDRX 5FNJA 1BN3A 3S97A 3HS4A 1I9QA 3P58A 4ZWXA 1TE3X 4M2WA 4K0TA 3MNJA 3UYQA 2ILIA 5FNGA 5DOGA 4QJPA 4JSWA 5AMDA 3K7KA 2NXRA 4PYXA 5FLPA 4YGJA 3M96A 4L5WA 5BRWA 3MHIA 3FE4A 3BL1A 1TG9A 3RGEA 3W6IA 4CNWA 2NNGA 1Z97A 1I9PA 4Q07A 4XE1A 5DSIA 5LMDA 1CVCA 1CNIA 4HT0A 1UGBA 1CVDA 3KLDB 1ZGEA 4QSAA 5FLSA 3M3XA 3MNUA 3JXFA 3JXHC 4RUZA 4LP6A 3U7CA 1RJ6A 3IEOA 5L3OA 1BNWA 4MLXA 4CA2A 1I9LA 1UGCA 2O4ZA 4QY3A 4QJ0A 3B1BA 2NNVA 3MNKA 2VVAX 1UGAA 5G0BA 5JDVB 1CAOA 2CABA 3N0NA 1UGGA 4E5QA 1CVHA 5BNLA 3NI5A 3RZ8A 4G0CA 4X5SA 4Z1NA 1ZSAA 2Q1QA 5FL5A 4WW8A 5EKHA 3V2MA 2QO8A 4E9OX 1BNVA 1CZMA 3CZVA 2QOAA 1CRAA 3F4XA 1LZVA 1ZGFA 9CA2A 3MZCA 3RYVB 4E3GA 1THKA 3MYQA 3DD8A 1CILA 1ZE8A 3RYYA 3OY0A 2HD6A 2GEHA 3OYQA 3IBUA 5G03A 4RIUA 1FQLA 3KONA 1G0EA 4MTYA 3T84A 3K2FA 3RLDA 4QEFA 2Q1BA 1CCTA 4JSAA 5E2MA 4CNRA 1G0FA 3SAXA 1BNMA 2WD2A 3NJ9A 1CVFA 3RYJB 5CLUA 4ZX0A 4LHIA 4N0XB 4Q8YA 4YGKA 3V3HB 3F7BA 1KWRA 1IF9A 3IBNA 4QIYA 1FSRA 2FNKA 5JG5B 4TWLA 4LU3A 4BCWA 5SZ6A 2FOYA 3CAJA 5EZTX 3M04A 3HKUA 2NN1A 2VVBX 1YDDA 3DAZA 5FNLA 4ITOA 1YDBA 4KUYA 4QIZA 4ZWYA 2H4NA 1HVAA 1EOUA 3M2XA 3D9ZA 4KNIA 4Q6EA 5FLOA 1HUGA 1ZFKA 3RG4A 3EFIA 3RZ0B 1OKMA 3IGPA 1FR4A 1I90A 3RYZA 4ILXA 3T83A 4JS6A 5AMGA 1BN4A 4Q9YA 1Z93A 5FDIA 4PXXA 5JGTB 3Q31A 5EH7A 1BICA 1JCZA 4ITPA 2X7TA 4Q08A 3N4BA 5DSJA 4IWZA 4HT2A 1I8ZA 1HEBA 1FLJA 4BF6A 4YVYA 2HKKA 4JSZA 5C8IA 4Z1EA 1J9WA 3B4FA 3P5AA 5DVXA 5E5RA 1G4OA 1XEVA 3MWOA 2FW4A 2NWZA 4KNMA 5DSPA 3RYXB 1CVBA 3SBHA 12CAA 3JXGA 2CBEA 2GD8A 1T9NA 1CCUA 1HCBA 1FQMA 1CANA 4HEZA 2NN7A 5EIJA 2Q38A 4Q83A 4QK2A 3MHCA 3RG3A 2AX2A 4ZX1A 3KOKA 5JQ0A 4RUXA 4RUYA 3QYKA 4COQA 1CA3A 1CAIA 1XPZA 4QJOA 3IAIA 5DSKA 4MLTA 4PYYA 3BETA 5EH5A 1BCDA 4HU1A 1CA2A 3F8EA 4WUQA 5FNIA 1OKLA 3OYSA 4YYTA 1IF5A 5E2SA 3TVOX 4FL7A 4TWMA 4YX4A 1FSNA 2EU2A 1G46A 3EFTA 4Q7SA 2POUA 4QK3A 3DA2A 1ZSCA 4Q7PA 1LGDA 1CAYA 1BNQA 5FLRA 5EKJA 2WEJA 1DCBA 1URTA 1ZH9A 3D0NA 4KP5A 2NNOA 5JQTA 4M2RA 3HKNA 1OKNA 5JEPB 4FVOA 5DSQA 5DOHA 5E2KA 4JSSA 1G4JA 2NXTA 5G0CA 3TMJA 5SZ1A 4Q78A 3M2ZA 3M5TA 4HEYA 4R5AA 2NNSA 3RZ1B 1A42A 5G01A 2X7SA 4C3TA 3FW3A 4N16A 5FLQA 1CNBA 5CA2A 1CAZA 2IT4A 3S78B 3ZP9A 4Q7VA 3DCWA 1DMYA 4HF3A 4MDLA 4XIWA 1TEQX 3M14A 4L5UA 1YDAA 1RAYA 1UGFA 4XZ5A 4Q6DA 4QJWA 2QP6A 1YO0A 2H15A 2WEGA 4K1QA 1CAHA 5E2NA 4K0ZA 2FOSA 4RH2A 5SZ5A 4FRCA 4QSBA 1F2WA 5SZ2A 5DSMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RZE A;  4E49 A;  3MHL A;  2HL4 A;  5BRU A;  1TTM A;  2F14 A;  2FOQ A;  1I9N A;  4YGL A;  4QJX A;  1CNH A;  1CVA A;  2FMG A;  6CA2 A;  1JD0 A;  2AW1 A;  3HKQ A;  1CNC A;  3P5L A;  4CNX A;  8CA2 A;  1BNU A;  2POW A;  5FNK A;  3MNI A;  1FQR A;  1OQ5 A;  1CAJ A;  3FFP X;  3NB5 A;  4CAC A;  1UGD A;  1BNN A;  3M1K A;  4Q09 A;  2CBA A;  3D92 A;  4QSJ A;  3M67 A;  4G7A A;  5SZ7 A;  4XFW A;  3BL0 A;  5EHE A;  1G54 A;  3R16 A;  3U45 X;  1AZM A;  4ZWI A;  1BZM A;  1IF8 A;  2ZNC A;  5CAC A;  1RZC A;  3T85 A;  3P3J A;  3CYU A;  5DSO A;  1V9E A;  1RJ5 A;  1LG6 A;  1JV0 A;  2FNM A;  3F7U A;  4PZH A;  5A25 A;  1KOQ A;  3DC3 A;  1CCS A;  4KNN A;  3P4V A;  3DVD A;  4CNV A;  4Z0Q A;  1ZFQ A;  5EH8 A;  4ZAO A;  3OIK A;  1CNK A;  3S74 B;  1UGE A;  4HBA A;  2WD3 A;  3IBI A;  3M2N A;  3V3I B;  5EHW A;  5JEH B;  3D8W A;  3IBL A;  5HPJ A;  3RZ5 A;  4DZ9 A;  3M5E A;  3LXE A;  5FLT A;  1LG5 A;  3OKU A;  4YXI A;  3KS3 A;  3S73 B;  4Q8Z A;  1CIN A;  4E3F A;  3MMF A;  3V3J A;  2W2J A;  4YGF A;  4FU5 A;  5L6K A;  4M2V A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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