4Q9YA

Crystal structure of 3-methylthiophenol bound to human carbonic anhydrase ii
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Exploring the influence of the protein environment on metal-binding pharmacophores.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4q9yA00
2NXTA 2GEHA 4Z1JA 3OY0A 4QK3A 3IEOA 3T85A 5DSIA 5FLSA 3D0NA 1G1DA 1FR7A 1LGDA 5DSKA 3U3AX 3F4XA 4KNNA 1FQNA 1G4JA 5SZ6A 4KUWA 1G0EA 1JV0A 1I9MA 5A6HA 2CBEA 3M5EA 1FLJA 4HEWA 5SZ1A 5J8ZA 4LHIA 3EFIA 3KLDB 2QP6A 5EOIA 4WL4A 4HU1A 2X7UA 5EH7A 5JGSB 3N0NA 2NNOA 3KS3A 1CAYA 3MNJA 3MNUA 1KOQA 1CAIA 2NNVA 3S72B 5BRVA 3EFTA 4XE1A 1TB0X 4LP6A 3RG3A 4E49A 4K0ZA 1G3ZA 3KONA 2HOCA 3M1KA 4KNIA 1G45A 4ITOA 4PZHA 4YXUA 1CNGA 1UGDA 4M2WA 5EH5A 4FPTA 5DSLA 3R16A 3T5ZA 2GD8A 1CAHA 1THKA 3M14A 3MHMA 1BNVA 1IF9A 2H15A 1RZEA 4Q7WA 2FNMA 4PYYA 4IDRX 4Q08A 3KOIA 2FOVA 2FOSA 1HUGA 3P58A 1DCAA 3D8WA 5FLTA 3TVNX 3DVBA 2Q1QA 3DV7A 1I9LA 2WEJA 4WUPA 4RUYA 4Q6DA 3DC3A 3BL1A 3F7UA 4FVOA 3M2YA 4CQ0A 3P55A 1BN1A 1TTMA 2CBBA 4QTLA 1HVAA 3M2ZA 4FVNA 4YGFA 4QJPA 1CILA 2FNKA 3LXEA 2FOQA 4BF6A 3M3XA 1CVEA 4YX4A 4MO8A 3P4VA 1AM6A 3S75B 1FQMA 3RYYA 1UGGA 1ZNCA 4QK1A 5A25A 2WEOA 1URTA 3B4FA 1BN3A 4PYXA 3FW3A 5FDIA 4HT2A 4QJXA 4RUZA 5FDCA 3M67A 3V2MA 5E28A 1CAMA 1OKNA 1Y7WA 4Z0QA 1H4NA 1BNNA 1TBTX 2Q1BA 4K0TA 4Q9YA 5CLUA 4YGJA 1I8ZA 5DSPA 3RYXB 5SZ7A 2HL4A 4E9OX 1CINA 5HPJA 1CNYA 5BYIA 1IF7A 3IBIA 5E5RA 5FLOA 2FOUA 5EHEA 5E2KA 1OQ5A 3IBLA 5SZ4A 2NNSA 3D93A 2X7SA 3MYQA 4QIZA 5SZ0A 3DA2A 2HKKA 2O4ZA 3M2NA 3M1JA 3RYZA 3FE4A 1BN4A 3T82A 3C7PA 5BNLA 3RG4A 1IF6A 3ML2A 4XFWA 2HNCA 5E2NA 3M40A 1CNJA 1YO2A 3OYSA 2NXRA 2EU2A 4PXXA 3S73B 5FNIA 4DZ9A 5DOGA 1CA2A 3MMFA 1OKMA 4QJOA 2WD2A 2NMXA 5EHWA 3DBUA 4C3TA 3S78B 2AX2A 5CJFA 1HEDA 5DSOA 1ZSBA 3F8EA 1BNQA 2CBDA 4ZAOA 1EOUA 1UGCA 1CANA 5SZ5A 2OSMA 1BNTA 4QY3A 1G54A 3BL0A 4YVYA 1CVFA 1UGEA 3KOKA 4Q49A 4YGLA 5DVXA 4CNWA 3R17B 3V3IB 4HBAA 4DZ7A 3DCCA 3K34A 3HFPA 1CNBA 2F14A 3TVOX 5DOHA 4RIVA 3V5GA 5EH8A 3RLDA 1BICA 3V3FA 3BETA 4CA2A 4MTYA 1KOPA 1BNWA 4LU3A 2EU3A 1TEUX 1YO0A 4JSSA 4N16A 5BRUA 1CCUA 4ETQC 2WD3A 1G0FA 1DMXA 3MHLA 1KEQA 5DSJA 3JXHC 2ZNCA 3S71B 3P5AA 1G4OA 3S74B 5BRWA 3QYKA 4ZWXA 4Q78A 4IWZA 1FR4A 3KWAA 4Q8ZA 2WEGA 4Q7VA 5EKJA 1CAOA 1TG3A 1TEQX 4HF3A 4QK2A 4Q8YA 5DRSA 1XPZA 5EHVA 3U45X 4E3GA 4L5WA 3HKQA 4XIWA 5DSNA 5JGTB 4FU5A 3NI5A 9CA2A 1RZAA 2FMGA 1IF4A 2ABEA 1CIMA 1FSRA 5JEGB 3NB5A 1Z97A 1FSQA 1MUAA 1LG6A 2Q38A 4ITPA 3M5TA 5AMGA 5AMLA 2OSFA 2WEHA 5DSRA 5FNLA 1TH9A 2VVAX 3ZNCA 3L14A 1HCBA 1RJ5A 2CA2A 3TMJA 1JD0A 6CA2A 1I9QA 1FSNA 5G0BA 1IF8A 3M96A 4Q99A 4ILXA 3M1WA 1G46A 3S8XA 4Z1NA 3F7BA 4L5UA 4YWPA 3MNKA 2HFWA 4CNVA 3DAZA 5IPZA 3RGEA 4BF1A 4KV0A 1I90A 5FNMA 4M2VA 1CVDA 1ZGFA 4JS6A 1HEBA 3JXFA 3RZ5A 4G7AA 1BNUA 3V3JA 5SZ3A 4Z1EA 4RIUA 1J9WA 3MHIA 1TG9A 4Q81A 3KNEA 1XQ0A 5E5UA 3W6HA 1H9NA 5L3OA 4MDMA 3OKVA 1RZBA 5JEPB 3DCWA 4Q8XA 2AW1A 5EKMA 4YGNA 3MDZA 3U7CA 1ZSAA 5FNHA 5EKHA 5FLQA 4RUXA 5LMDA 3RZ7A 4ZWIA 1BNMA 1G48A 1Z9YA 4R5BA 3RZ8A 1FQLA 4Q6EA 3SAPA 3B1BA 5JG5B 3U47A 1ZE8A 3PO6A 5AMDA 3OKUA 5G0CA 4WUQA 1CNXA 4GL1X 3ZP9A 2NN1A 1CZMA 1BV3A 4QJ0A 1TE3X 1DMYA 4Q90A 4CNRA 1I9PA 1F2WA 3HKNA 4KAPA 1CAKA 3V7XA 3PYKA 3D92A 4ZX1A 3DVCA 3M5SA 1YDAA 4M2UA 2POUA 3P3HA 1V9IC 3RJ7A 4CACA 1G52A 1BCDA 4R5AA 4TWMA 5SZ2A 3VBDA 4HT0A 4KUYA 5FLRA 2FOYA 5JQTA 3P3JA 3DVDA 1HCAA 1YDCA 2CABA 5FL4A 1CNCA 4HEYA 1XEVA 2NN7A 2QOAA 4Q83A 5FLPA 3ML5A 1JCZA 3GZ0A 5EIJA 1CVHA 1CNHA 3M98A 1MOOA 3K7KA 3MHOA 2CBCA 3MNHA 3MNIA 1CNKA 4QEFA 1CCSA 1RZCA 2FW4A 4Q06A 4QIYA 3P5LA 3V3GB 5JQ0A 4L5VA 2NWPA 4KP5A 5JESB 1UGFA 3M04A 3CZVA 4E5QA 5CA2A 4Y0JA 1XEGA 3KKXA 1CVBA 4E3FA 4QSIA 1CCTA 1ZFQA 4K13A 1ZSCA 5FNGA 4ZX0A 4MLTA 4Z1KA 4COQA 4ZWYA 3S77B 1RZDA 4WW6A 5FNKA 5EZTX 5G03A 3V3HB 3S76A 1HEAA 3Q31A 5E2RA 4Q87A 3MWOA 4RFDA 4XZ5A 3M1QA 4X5SA 3UYNA 4E4AA 1LUGA 4JSAA 1UGBA 1IF5A 3DD0A 3S9TA 8CA2A 5JDVB 5FL6A 3SBHA 4K0SA 4G0CA 4WW8A 3K2FA 4MLXA 3N3JA 4QSBA 1RJ6A 1CNIA 1RAZA 1YDBA 3RZ1B 1AVNA 2NWYA 4RN4A 1HECA 4N0XB 3T84A 3N2PA 2EZ7A 2HD6A 2W2JA 2X7TA 4FRCA 1RAYA 4Q09A 1AZMA 1LZVA 4JSWA 4M2RA 5C8IA 3W6IA 3HLJA 3DC9A 3RYJB 1CA3A 5DSMA 5E2SA 3JXGA 3V2JA 4MDGA 1V9EA 1UGAA 4JSZA 1I9NA 2FNNA 3MNAA 2NXSA 3IBUA 3RZ0B 2ILIA 4UOVA 4KP8A 5G01A 3CAJA 4Q7SA 2QO8A 5FL5A 4PQ7A 1CVCA 3T83A 4Q0LA 3RYVB 4E3DA 4FL7A 4Q7PA 1CRAA 4ZWZA 1FQRA 2VVBX 1G53A 4K1QA 4RFCA 3CYUA 3HKTA 3N4BA 2NNGA 3SBIA 1DCBA 2IT4A 1CNWA 3IGPA 1CAJA 3SAXA 3IAIA 3PJJA 1CAZA 3IBNA 4XIXA 3T5UA 1CALA 4MDLA 4YYTA 5JEHB 4KUVA 2FMZA 2NWZA 4YHAA 1YO1A 1A42A 4QJMA 4RH2A 1I91A 3D9ZA 3CA2A 3MHCA 4QJWA 1HUHA 3FFPX 5CACA 4TWLA 4YGKA 1ZGEA 2H4NA 1CRMA 7CA2A 12CAA 4WR7A 4HEZA 3DCSA 4FIKA 2POWA 1ZFKA 4Q07A 5FNJA 1G6VA 1KWQA 5JG3B 4R59A 3OIKA 2NWOA 1Z93A 4YXIA 3M2XA 1LG5A 3OILA 4KNJA 5L6KA 2POVA 3KIGA 1KWRA 3OYQA 3UYQA 1I9OA 2CBAA 3NJ9A 5DSQA 3OIMA 4KNMA 3S97A 1OKLA 4QSAA 4QSJA 3MZCA 3HKUA 4BCWA 4CNXA 5E2MA 1H9QA 4E3HA 1ZH9A 3DD8A 3HS4A 3P44A 1CVAA 1YDDA 1BZMA 4YXOA 1T9NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NXT A;  2GEH A;  4Z1J A;  3OY0 A;  4QK3 A;  3IEO A;  3T85 A;  5DSI A;  5FLS A;  3D0N A;  1G1D A;  1FR7 A;  1LGD A;  5DSK A;  3U3A X;  3F4X A;  4KNN A;  1FQN A;  1G4J A;  5SZ6 A;  4KUW A;  1G0E A;  1JV0 A;  1I9M A;  5A6H A;  2CBE A;  3M5E A;  1FLJ A;  4HEW A;  5SZ1 A;  5J8Z A;  4LHI A;  3EFI A;  3KLD B;  2QP6 A;  5EOI A;  4WL4 A;  4HU1 A;  2X7U A;  5EH7 A;  5JGS B;  3N0N A;  2NNO A;  3KS3 A;  1CAY A;  3MNJ A;  3MNU A;  1KOQ A;  1CAI A;  2NNV A;  3S72 B;  5BRV A;  3EFT A;  4XE1 A;  1TB0 X;  4LP6 A;  3RG3 A;  4E49 A;  4K0Z A;  1G3Z A;  3KON A;  2HOC A;  3M1K A;  4KNI A;  1G45 A;  4ITO A;  4PZH A;  4YXU A;  1CNG A;  1UGD A;  4M2W A;  5EH5 A;  4FPT A;  5DSL A;  3R16 A;  3T5Z A;  2GD8 A;  1CAH A;  1THK A;  3M14 A;  3MHM A;  1BNV A;  1IF9 A;  2H15 A;  1RZE A;  4Q7W A;  2FNM A;  4PYY A;  4IDR X;  4Q08 A;  3KOI A;  2FOV A;  2FOS A;  1HUG A;  3P58 A;  1DCA A;  3D8W A;  5FLT A;  3TVN X;  3DVB A;  2Q1Q A;  3DV7 A;  1I9L A;  2WEJ A;  4WUP A;  4RUY A;  4Q6D A;  3DC3 A;  3BL1 A;  3F7U A;  4FVO A;  3M2Y A; 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