4QJ0A

Crystal structure of catalytic domain of human carbonic anhydrase isozyme xii with inhibitor
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
KWTYFGPDGENSWSKKYPSCGGLLQSPIDLHSDILQYDASLTPLEFQGYNLSANKQFLLTNNGHSVKLNLPSDMHIQGLQSRYSATQLHLHWGNPNDPHGSEHTVSGQHFAAELHIVHYNSDLYPDASTASNKSEGLAVLAVLIEMGSFNPSYDKIFSHLQHVKYKGQEAFVPGFNIEELLPERTAEYYRYRGSLTTPPCNPTVLWTVFRNPVQISQEQLLALETALYCTHMDDPSPREMINNFRQVQKFDERLVYTSFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Functionalization of Fluorinated Benzenesulfonamides and Their Inhibitory Properties toward Carbonic Anhydrases
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 12
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-06-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qj0A00
4WW8A 2NWYA 2X7TA 3F7BA 4ITPA 5DRSA 1I8ZA 4RUXA 4FPTA 4COQA 1G45A 1THKA 1LG6A 3IBUA 4K1QA 3OY0A 3P44A 3UYQA 1CILA 1CA3A 4Q7WA 4YGNA 4K0ZA 3MNIA 2FOUA 2QOAA 1Z93A 4Z1JA 5JEPB 4C3TA 5E5UA 2HOCA 3MDZA 5BNLA 5FNKA 4ZX1A 1FQNA 4Q8XA 1YDAA 5FNHA 4KNJA 1G4OA 6CA2A 3P55A 5FLQA 4XIWA 1UGGA 1CAHA 3KOKA 3MMFA 3S75B 1Z97A 4FU5A 4YHAA 3P3JA 2ILIA 1LG5A 2POWA 3M1QA 4FRCA 4Q8YA 3MNJA 1TEQX 3ZNCA 3M2YA 5SZ0A 3U47A 4RUZA 3MNUA 3MNAA 3NI5A 4Q06A 1KWQA 2AX2A 1RZCA 2NNGA 4Q07A 1ZSBA 1CANA 2OSFA 5FNGA 3BETA 3BL0A 2OSMA 1V9EA 5A6HA 1CNHA 3HKTA 3ML5A 4L5VA 3MNKA 4QJOA 4YGJA 3CZVA 2QP6A 1LZVA 5FDIA 4ZWXA 1XEGA 5FNLA 3MHMA 1CNBA 2HL4A 2WEHA 4Q87A 4YXUA 2W2JA 5JQTA 1IF7A 2CBBA 3MHIA 5DSOA 5L6KA 3IAIA 1ZH9A 5EKJA 1G3ZA 4TWLA 3QYKA 1ZGFA 1HCAA 5DSJA 4RUYA 1CNXA 2Q38A 3T83A 5CLUA 4CNWA 1CA2A 1UGFA 3DC3A 1RZEA 4QSIA 3CYUA 5CACA 4CA2A 4Y0JA 3UYNA 1G52A 1IF9A 2WEGA 4YGKA 1CCTA 3HS4A 3HFPA 4WUPA 4E3FA 4Q90A 2NNSA 4HU1A 4KUWA 5JGSB 1XPZA 3P5AA 5AMGA 2FOSA 2FW4A 4YGLA 1UGBA 5G03A 4Q8ZA 1CRMA 5BRWA 4QK1A 2X7UA 1HVAA 1CVCA 4KP8A 3B1BA 4E9OX 1YO0A 5C8IA 4QK3A 3GZ0A 1CNJA 5JG5B 3T84A 4R59A 1FR7A 4QJXA 1I9OA 1F2WA 1CVAA 3V2JA 1ZSCA 3P4VA 5E5RA 3P5LA 5EKHA 1DCBA 1FR4A 3M67A 5JQ0A 3OKVA 4MTYA 3V3HB 3SAXA 5SZ3A 2CBCA 3M2XA 5BRVA 3M40A 4RH2A 1CVDA 4HF3A 5EHVA 4BF6A 4KNIA 1ZGEA 3OYQA 1RZDA 4L5WA 4PYYA 3D93A 3DVDA 1FSQA 5SZ1A 3KKXA 2FOVA 3S78B 2ZNCA 2NWPA 3NB5A 1CNYA 2F14A 1TEUX 1FSNA 5CJFA 5E2SA 2WD3A 1CALA 3V3FA 3PYKA 1DCAA 3OYSA 5FL5A 4Q83A 5SZ7A 2WD2A 5DVXA 1G1DA 3DCWA 4XIXA 5DSPA 3DV7A 4E3HA 3DD0A 3HLJA 5E2MA 3R16A 1RAZA 1RZAA 8CA2A 3IGPA 2HD6A 3S9TA 3V7XA 1CNCA 3EFTA 3RZ5A 1BNMA 5DOGA 4QSAA 4KNNA 4E4AA 1BNTA 3LXEA 5JEGB 1UGEA 1CAIA 3M96A 1CAOA 1RZBA 1IF8A 1BNWA 2WEJA 1CIMA 4PXXA 4UOVA 3T5ZA 3N0NA 5JDVB 3RG3A 3RZ8A 1TH9A 2CA2A 4QJWA 3JXHC 3TVNX 1DMYA 3RYXB 5EKMA 2QO8A 1MOOA 2FNMA 3R17B 4FVNA 1H4NA 5EHWA 4Q7PA 1A42A 2FNNA 1RJ6A 3DBUA 5FNMA 1FLJA 3F8EA 5L3OA 2GEHA 1UGCA 4Q7VA 1G6VA 4R5AA 4YX4A 5FLRA 3M04A 5DSQA 1ZNCA 3M2ZA 2POVA 1AZMA 4CACA 1YDDA 4RN4A 4Q49A 3W6HA 4DZ9A 5BRUA 3IBLA 3PJJA 5FDCA 1CCUA 4ZAOA 4K0TA 2FOYA 5DSKA 4L5UA 3D92A 5E2KA 3IEOA 3U7CA 1BN4A 3CA2A 3NJ9A 3IBIA 3EFIA 1G53A 3KNEA 1G0EA 4PQ7A 4FIKA 4QY3A 3OILA 4YYTA 3U3AX 3B4FA 3MYQA 1G48A 3DVBA 5E2RA 4X5SA 5FLTA 1BNQA 3M98A 4M2VA 4KUYA 4RIVA 1JCZA 2FMZA 1CVBA 1KWRA 4QJMA 3V3GB 5FLOA 1CAYA 1I90A 4MLTA 3DAZA 1G0FA 3MHCA 3S74B 1OKMA 3JXGA 3FFPX 4QSBA 2NWZA 1G4JA 4Q9YA 5IPZA 3VBDA 2AW1A 3TVOX 3M5TA 5JEHB 1UGDA 1OKNA 3V3JA 1YDCA 3ZP9A 5JG3B 4YVYA 3JXFA 3SBHA 1J9WA 3DCCA 3L14A 1YDBA 4Q09A 1YO1A 3DVCA 3S77B 3M5EA 5DSMA 4Z1EA 1JD0A 2O4ZA 3T82A 5A25A 3M2NA 1BZMA 4HBAA 3P3HA 2EZ7A 3MHOA 1BN3A 3MZCA 4KNMA 1G54A 3KONA 4JS6A 2NNOA 3RYYA 4PZHA 3M1KA 1CAJA 4YGFA 3KWAA 1FQRA 3KS3A 4N16A 1ZE8A 3N4BA 4Q6EA 1V9IC 1T9NA 1BV3A 1ZSAA 3OIMA 3MWOA 4HEZA 4QJ0A 5AMLA 5DSIA 3DC9A 4TWMA 4CNRA 1I9NA 2NN1A 3W6IA 3OIKA 1LUGA 4KP5A 3TMJA 4E3GA 1CRAA 5EOIA 1TG9A 3DCSA 3K34A 1OQ5A 1IF4A 3IBNA 4N0XB 3RZ7A 2WEOA 1AVNA 4MO8A 2GD8A 1BNVA 1FQLA 4QTLA 1G46A 2ABEA 3V5GA 1YO2A 3M1JA 4CQ0A 5SZ6A 1HECA 1BNNA 4WUQA 4YXIA 4M2WA 1H9QA 2Q1QA 4JSWA 4M2RA 4Q6DA 3SAPA 4CNVA 1IF6A 1OKLA 3N2PA 4Z1KA 4YXOA 3D0NA 1CAKA 3FE4A 3C7PA 2FOQA 4Q7SA 3T85A 2H4NA 5FLSA 2NWOA 2HNCA 3V2MA 3D9ZA 1I9PA 1TE3X 1CAZA 2FNKA 5DSLA 3M5SA 5FNJA 1HCBA 3DD8A 5AMDA 3KIGA 2NNVA 5JGTB 5E2NA 5SZ4A 5FL6A 1RJ5A 5EH8A 5EH5A 1XQ0A 4ILXA 1TG3A 4FL7A 1URTA 1I91A 1CVFA 2CBEA 4HT0A 3S76A 1BICA 4JSAA 1I9QA 4ZWZA 1TB0X 3RYZA 1BNUA 2NXRA 3KOIA 3RLDA 1HUGA 1BCDA 2CBDA 4WL4A 3RZ0B 3K2FA 4CNXA 4ZX0A 3RGEA 1H9NA 4WW6A 5FNIA 3F4XA 1ZFQA 2VVAX 4XZ5A 5DSNA 1CVEA 1TTMA 4Z0QA 5BYIA 3M14A 12CAA 4MDLA 4Q0LA 5EIJA 2FMGA 3RG4A 3DA2A 3ML2A 4Q81A 1CNGA 4QK2A 4GL1X 4E49A 4LHIA 5EZTX 4E5QA 4E3DA 1FSRA 2NMXA 4RFDA 3OKUA 4IWZA 1KOPA 1TBTX 5SZ5A 2EU2A 1HEBA 2IT4A 4BCWA 1CNWA 5EH7A 3RYVB 4WR7A 3BL1A 1ZFKA 3T5UA 1AM6A 4MLXA 4MDMA 4JSZA 5G01A 1CCSA 1CNIA 5JESB 4K13A 3RJ7A 5DOHA 4Q78A 1CVHA 4KV0A 2HKKA 3P58A 3HKUA 4R5BA 2VVBX 1HUHA 4LP6A 1DMXA 3KLDB 1UGAA 1XEVA 5G0CA 2CBAA 2POUA 4DZ7A 3MHLA 5J8ZA 2NXSA 3HKNA 4MDGA 4HT2A 5CA2A 1IF5A 3S71B 1LGDA 4M2UA 3U45X 1FQMA 3V3IB 2X7SA 4LU3A 1EOUA 4QJPA 3K7KA 4HEYA 4KUVA 1Z9YA 1CZMA 4RFCA 4ZWIA 5SZ2A 9CA2A 3S73B 3SBIA 2EU3A 3F7UA 1RAYA 4Q08A 1KOQA 1I9MA 7CA2A 3Q31A 1I9LA 4PYXA 4FVOA 2NN7A 3S97A 1CNKA 3CAJA 4QIZA 1HEDA 2HFWA 5FLPA 2H15A 1CAMA 4QIYA 5DSRA 5LMDA 3RYJB 2CABA 4JSSA 4QEFA 3M1WA 5G0BA 4Z1NA 3D8WA 3M3XA 4XE1A 1KEQA 4K0SA 3S72B 1MUAA 4G0CA 3PO6A 4YWPA 4KAPA 4HEWA 3S8XA 4ITOA 4QSJA 3N3JA 4ZWYA 5FL4A 4Q99A 4BF1A 5HPJA 1CINA 4G7AA 1JV0A 4ETQC 3MNHA 1Y7WA 5E28A 1BN1A 2NXTA 1HEAA 4XFWA 3RZ1B 2Q1BA 4IDRX 5EHEA 4RIUA 3HKQA 3FW3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WW8 A;  2NWY A;  2X7T A;  3F7B A;  4ITP A;  5DRS A;  1I8Z A;  4RUX A;  4FPT A;  4COQ A;  1G45 A;  1THK A;  1LG6 A;  3IBU A;  4K1Q A;  3OY0 A;  3P44 A;  3UYQ A;  1CIL A;  1CA3 A;  4Q7W A;  4YGN A;  4K0Z A;  3MNI A;  2FOU A;  2QOA A;  1Z93 A;  4Z1J A;  5JEP B;  4C3T A;  5E5U A;  2HOC A;  3MDZ A;  5BNL A;  5FNK A;  4ZX1 A;  1FQN A;  4Q8X A;  1YDA A;  5FNH A;  4KNJ A;  1G4O A;  6CA2 A;  3P55 A;  5FLQ A;  4XIW A;  1UGG A;  1CAH A;  3KOK A;  3MMF A;  3S75 B;  1Z97 A;  4FU5 A;  4YHA A;  3P3J A;  2ILI A;  1LG5 A;  2POW A;  3M1Q A;  4FRC A;  4Q8Y A;  3MNJ A;  1TEQ X;  3ZNC A;  3M2Y A;  5SZ0 A;  3U47 A;  4RUZ A;  3MNU A;  3MNA A;  3NI5 A;  4Q06 A;  1KWQ A;  2AX2 A;  1RZC A;  2NNG A;  4Q07 A;  1ZSB A;  1CAN A;  2OSF A;  5FNG A;  3BET A;  3BL0 A;  2OSM A;  1V9E A;  5A6H A;  1CNH A;  3HKT A;  3ML5 A;  4L5V A;  3MNK A;  4QJO A;  4YGJ A;  3CZV A;  2QP6 A;  1LZV A;  5FDI A;  4ZWX A;  1XEG A;  5FNL A;  3MHM A;  1CNB A;  2HL4 A;  2WEH A;  4Q87 A;  4YXU A;  2W2J A;  5JQT A;  1IF7 A;  2CBB A;  3MHI A;  5DSO A; 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