4QJXA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with inhibitor
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
SWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Functionalization of Fluorinated Benzenesulfonamides and Their Inhibitory Properties toward Carbonic Anhydrases
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qjxA00
5EHVA 4CNXA 1CANA 4JSAA 1G53A 4FL7A 1AVNA 4YGFA 5SZ3A 5A6HA 5C8IA 1I9OA 5BRWA 3CZVA 5JG3B 3M1QA 1Z93A 3SAPA 1TB0X 2FMZA 1V9EA 2EU2A 2GD8A 1UGAA 2POWA 3T85A 5SZ1A 4YXIA 2NWPA 3OIKA 5E5RA 3S97A 2NNVA 3SAXA 3MHMA 4PYXA 2CBCA 3P44A 4QSBA 4ZWYA 9CA2A 3DV7A 2WEJA 3V5GA 3S72B 3M2XA 3MHOA 1UGGA 3IEOA 1HEBA 1BNQA 5FDIA 3OY0A 1T9NA 5DSJA 3RYVB 3VBDA 3M04A 1CNHA 1CVFA 4CNWA 3DCSA 4FPTA 4Q99A 3M1WA 1BN4A 5E2MA 4KP8A 3RZ5A 4Q83A 1RAZA 3CAJA 2IT4A 1CNYA 1G48A 1Z9YA 3F7BA 4ITPA 4Z1EA 1CILA 2HL4A 1FSNA 1LG5A 1CA3A 4L5VA 2ABEA 5FLPA 2H4NA 1YDCA 5FNKA 4Q49A 1BNVA 1ZGFA 3KLDB 5EHWA 3U3AX 3MHLA 3F8EA 1BNNA 3HKUA 1IF8A 5EKMA 1I9PA 3W6HA 1RAYA 3DVDA 5DSLA 4LU3A 5EH7A 4QJXA 5SZ6A 3KNEA 2Q1QA 4E9OX 1CAYA 3UYNA 5DSNA 5JGTB 3MNIA 1LZVA 4RUZA 5FNLA 12CAA 3DA2A 1KEQA 7CA2A 2FNMA 4QK3A 4HBAA 5DRSA 1CVEA 1YO2A 5L6KA 1OKMA 1OKNA 2X7UA 4RFDA 3SBHA 1G0FA 1BN1A 4DZ9A 4KUYA 5G0CA 2VVAX 4QTLA 5JEHB 3T84A 3IBLA 1CAMA 3L14A 5E2SA 3P5LA 3KOIA 3NJ9A 4Q6EA 1HCAA 3PO6A 3PJJA 5JQTA 1URTA 2HD6A 3RYYA 1OKLA 4WW6A 4YGJA 4Q07A 3DC3A 1TBTX 5FL4A 4CQ0A 1AM6A 1XEGA 5FLTA 5G01A 5DSMA 5DOGA 4R59A 3K2FA 4BF6A 4ZX0A 1I8ZA 1I9QA 4Q8YA 5G03A 1UGCA 3V3HB 4ZWXA 5DOHA 2QO8A 3S77B 2Q1BA 3S8XA 4PYYA 4Z1KA 2NWYA 2WD2A 3KWAA 3HKTA 3S73B 1H4NA 4Q90A 3TMJA 3EFTA 4UOVA 4G7AA 4QSJA 4YXOA 3M5SA 3N4BA 2EZ7A 4WUPA 1BZMA 2NNSA 5DVXA 3JXGA 3HKQA 4QSAA 1FQLA 2H15A 1ZE8A 5E2KA 2CBBA 3NI5A 1UGFA 3S71B 2FMGA 4QSIA 4E4AA 3BL0A 3M5TA 3TVOX 5FNJA 3D0NA 3RZ8A 2FNNA 1I91A 3P5AA 1BNUA 3RYXB 3BETA 4HF3A 3DAZA 1CAZA 1I9LA 3F7UA 4JS6A 2FOQA 4X5SA 3T82A 5BYIA 1DCAA 5EHEA 5EZTX 3OILA 4QK2A 1YDDA 4BCWA 1LGDA 2WEHA 4ZWIA 5E5UA 3R16A 2NXSA 1G54A 4RIVA 1Z97A 4YHAA 5G0BA 3T5ZA 3PYKA 1CIMA 1A42A 1FR7A 1V9IC 4QJPA 4JSWA 3IGPA 5SZ4A 3MWOA 1J9WA 1DMXA 4COQA 4Q0LA 1CRMA 1HEAA 4QIYA 5J8ZA 3B1BA 2NMXA 4RH2A 1BNTA 4WUQA 3MNAA 2WD3A 2NNOA 2ZNCA 4QK1A 3DBUA 2VVBX 1RZCA 1RJ5A 4Q7VA 4YX4A 4ZAOA 1ZH9A 1CCUA 4WW8A 4E49A 3KOKA 2WEOA 1I9NA 2POUA 3RZ7A 5AMGA 4Q06A 1H9NA 1TEUX 3P3JA 5DSOA 4QJWA 3M1JA 5A25A 3M96A 5JEGB 1CNKA 3D8WA 4DZ7A 3CA2A 4FU5A 1RJ6A 3M14A 4R5AA 5BRUA 3HLJA 2EU3A 4QEFA 3LXEA 1CZMA 5E2NA 3ML5A 3RG3A 4Z0QA 3D93A 2HNCA 5DSKA 1HVAA 3MHCA 4K13A 3RGEA 4KUWA 1Y7WA 4PXXA 4Z1JA 2NWZA 1KWQA 1G6VA 1G1DA 6CA2A 5JG5B 5CA2A 3M67A 1TG9A 4YGNA 3IBIA 4QJOA 1BV3A 2CBEA 3FW3A 4RIUA 1CAOA 3DCCA 4Q6DA 1CAHA 3DC9A 3OKVA 4QY3A 4Y0JA 1YO0A 1ZSAA 1TTMA 4ILXA 4MO8A 2AW1A 4N16A 1CALA 1TH9A 1THKA 1CVCA 4QIZA 3FE4A 4HEWA 3IAIA 2NXRA 1G3ZA 5SZ5A 1BNWA 3MMFA 1CVHA 3Q31A 1XEVA 4HEYA 5FNIA 4KV0A 4ITOA 3W6IA 1CCSA 1RZDA 4CACA 1IF4A 2FOSA 5FNMA 3MYQA 4KP5A 2FW4A 3V3IB 2X7TA 3UYQA 3M1KA 4QJ0A 3IBUA 3V3JA 4K0TA 4WR7A 5DSRA 3OYSA 3V7XA 1FR4A 2POVA 4XIWA 1BCDA 4C3TA 1G45A 1G46A 3S76A 3RJ7A 1XPZA 1BICA 2GEHA 3D92A 3ML2A 4CA2A 4E3GA 3N0NA 3KS3A 1UGBA 3TVNX 4IDRX 4XFWA 2QOAA 4HEZA 1TEQX 3M98A 3P55A 5EIJA 4E5QA 1LG6A 5FL6A 2HOCA 5JDVB 3K34A 3U45X 2OSMA 4YGKA 3MNHA 3BL1A 1FQRA 1CAIA 3QYKA 4M2RA 5EKHA 1HUHA 3M40A 4KNIA 1YO1A 3F4XA 4RFCA 5E28A 5FDCA 2WEGA 4PQ7A 4G0CA 5SZ7A 4YXUA 4JSZA 3MNJA 4L5WA 3M3XA 4MDLA 3V2JA 1FSQA 1KWRA 4MDMA 1CVAA 4KUVA 4K0ZA 4PZHA 4LHIA 1UGEA 2QP6A 3S78B 3OKUA 2Q38A 1IF5A 4Q8XA 4YVYA 4ZWZA 4Q08A 1YDBA 1CNGA 4FVOA 3B4FA 5BRVA 4KNNA 3EFIA 3M2ZA 4WL4A 3MNKA 3P4VA 5JGSB 1XQ0A 3KIGA 4TWLA 4Q7WA 4LP6A 4Q78A 4CNRA 3V3GB 3CYUA 4FIKA 1UGDA 1CNIA 1HEDA 2FOUA 3P58A 1CA2A 2OSFA 2F14A 3KKXA 4KNMA 1FLJA 4CNVA 1HECA 4HT0A 3RZ1B 3OIMA 1CVBA 1CNXA 4Q9YA 2HKKA 3OYQA 1ZNCA 3DVBA 1CINA 3DD0A 4ZX1A 3RG4A 2CBDA 2NNGA 5AMDA 4M2WA 3HS4A 4Q7SA 3MZCA 8CA2A 1HCBA 4Q7PA 5DSIA 4E3FA 3N3JA 1TE3X 4FVNA 4N0XB 4MLTA 4RUXA 3RLDA 2NN7A 2CBAA 5FLOA 3T5UA 1DCBA 3M2NA 3MHIA 4JSSA 4M2UA 5EOIA 4M2VA 4L5UA 5BNLA 5EH5A 1EOUA 5CACA 4GL1X 2HFWA 3DVCA 1IF7A 3JXHC 5EH8A 1FSRA 1IF9A 1ZSCA 3S74B 4XIXA 1HUGA 1OQ5A 3DD8A 1G52A 3N2PA 5E2RA 1ZGEA 3D9ZA 4RUYA 3MDZA 1CNWA 1TG3A 4XE1A 3NB5A 1KOQA 1AZMA 1FQNA 5IPZA 1I9MA 1MUAA 1BNMA 1ZFQA 3HKNA 3M5EA 5CJFA 1CNBA 3V3FA 5FLSA 2ILIA 1JV0A 4IWZA 1G4OA 5FL5A 4YGLA 2X7SA 4QJMA 4Z1NA 1RZAA 5EKJA 1DMYA 3RYZA 1CCTA 3MNUA 5DSPA 3HFPA 4BF1A 1CRAA 4KNJA 3P3HA 3ZP9A 4YYTA 4K0SA 3M2YA 4Q8ZA 5JESB 2FOVA 4R5BA 4TWMA 3SBIA 4HT2A 2O4ZA 2AX2A 5DSQA 5L3OA 1KOPA 4E3HA 5FLRA 5AMLA 1CNJA 5FNGA 5FNHA 3KONA 4K1QA 4ETQC 3S9TA 2FNKA 2NWOA 3GZ0A 1JCZA 1ZFKA 4YWPA 5JEPB 1LUGA 1I90A 1RZBA 3JXFA 1BN3A 3DCWA 2CA2A 3C7PA 1G4JA 1MOOA 4Q87A 3S75B 4MDGA 2CABA 3U47A 4Q81A 4RN4A 3RYJB 3V2MA 4MLXA 4KAPA 5FLQA 3IBNA 1IF6A 5SZ0A 1H9QA 2FOYA 3FFPX 3K7KA 1CAKA 1CVDA 1CNCA 5SZ2A 1JD0A 1RZEA 5LMDA 1YDAA 2NXTA 4FRCA 5HPJA 1FQMA 1G0EA 2W2JA 4HU1A 5CLUA 4E3DA 3T83A 3R17B 1ZSBA 5JQ0A 4Q09A 3ZNCA 4XZ5A 3U7CA 4MTYA 2NN1A 1F2WA 1CAJA 3RZ0B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5EHV A;  4CNX A;  1CAN A;  4JSA A;  1G53 A;  4FL7 A;  1AVN A;  4YGF A;  5SZ3 A;  5A6H A;  5C8I A;  1I9O A;  5BRW A;  3CZV A;  5JG3 B;  3M1Q A;  1Z93 A;  3SAP A;  1TB0 X;  2FMZ A;  1V9E A;  2EU2 A;  2GD8 A;  1UGA A;  2POW A;  3T85 A;  5SZ1 A;  4YXI A;  2NWP A;  3OIK A;  5E5R A;  3S97 A;  2NNV A;  3SAX A;  3MHM A;  4PYX A;  2CBC A;  3P44 A;  4QSB A;  4ZWY A;  9CA2 A;  3DV7 A;  2WEJ A;  3V5G A;  3S72 B;  3M2X A;  3MHO A;  1UGG A;  3IEO A;  1HEB A;  1BNQ A;  5FDI A;  3OY0 A;  1T9N A;  5DSJ A;  3RYV B;  3VBD A;  3M04 A;  1CNH A;  1CVF A;  4CNW A;  3DCS A;  4FPT A;  4Q99 A;  3M1W A;  1BN4 A;  5E2M A;  4KP8 A;  3RZ5 A;  4Q83 A;  1RAZ A;  3CAJ A;  2IT4 A;  1CNY A;  1G48 A;  1Z9Y A;  3F7B A;  4ITP A;  4Z1E A;  1CIL A;  2HL4 A;  1FSN A;  1LG5 A;  1CA3 A;  4L5V A;  2ABE A;  5FLP A;  2H4N A;  1YDC A;  5FNK A;  4Q49 A;  1BNV A;  1ZGF A;  3KLD B;  5EHW A;  3U3A X;  3MHL A;  3F8E A;  1BNN A;  3HKU A;  1IF8 A;  5EKM A;  1I9P A;  3W6H A;  1RAY A;  3DVD A;  5DSL A;  4LU3 A;  5EH7 A;  4QJX A;  5SZ6 A;  3KNE A; 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