4QSJA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 2-chloro-4-{[(4-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl)thio]acetyl}benzenesulfonamide
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
RLSWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Intrinsic Thermodynamics and Structure Correlation of Benzenesulfonamides with a Pyrimidine Moiety Binding to Carbonic Anhydrases I, II, VII, XII, and XIII
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
total genus 77
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qsjA00
2F14A 4ZWIA 3M40A 3RZ8A 5EH8A 2NWPA 3IAIA 1BN1A 1ZGFA 2WD3A 1F2WA 4Q49A 5EKHA 1FQRA 4Q81A 4WUQA 2NMXA 1CVBA 4YVYA 1JD0A 1TEUX 5FNMA 4ETQC 5DSPA 4K13A 5JGTB 1CA2A 4Q99A 4CNXA 1CALA 1FR4A 3M1KA 4PZHA 3RGEA 3KS3A 2ILIA 5EIJA 4Y0JA 5E2MA 3EFTA 2VVAX 5CLUA 4YGLA 3NB5A 1UGCA 4HT2A 1YDDA 3OYQA 3NI5A 8CA2A 4HEZA 4KNIA 2NNGA 2FOYA 4QIZA 4XIXA 3RZ5A 3T5UA 1TG3A 3UYNA 3V2JA 4YYTA 3UYQA 2NNVA 1BV3A 5LMDA 1LG5A 3MDZA 2Q1BA 3K7KA 4KAPA 1LZVA 5E2KA 1HEBA 1HVAA 3P44A 3MMFA 4WUPA 3MNAA 4HEWA 3M1JA 1CNGA 5HPJA 3DAZA 3RZ1B 2FNMA 1HEAA 4RUXA 2H15A 1CAZA 4FRCA 3V3GB 5DSRA 1URTA 3FE4A 5DSNA 4YX4A 2NXTA 4ILXA 4DZ9A 1ZSAA 4LP6A 4RH2A 4KUWA 3RZ7A 4QJOA 4KUVA 2AX2A 2NXRA 2HNCA 4IWZA 2CA2A 5CJFA 1AM6A 4ZAOA 4MDMA 1IF4A 3MHLA 5FNIA 2NN1A 1A42A 2EU3A 3EFIA 3RZ0B 2POVA 2O4ZA 2VVBX 2CBDA 2QP6A 3N3JA 3KOKA 1KOQA 4M2RA 1G53A 5JQTA 4R59A 1BNMA 5BRVA 4Q7VA 5L6KA 1FQMA 4PYXA 5JGSB 5EHVA 5SZ4A 5FL4A 4QSJA 1KWQA 1JCZA 2NWYA 4FVOA 4Q8ZA 3MNHA 5J8ZA 5FL6A 3DCWA 3D9ZA 4ZX1A 1CCSA 2NWOA 3P4VA 3V3JA 3M1QA 3CZVA 4QSBA 1RJ6A 3KLDB 4KNJA 4E5QA 3CYUA 3JXGA 3S71B 3S75B 3T82A 4C3TA 2POUA 2X7SA 3HFPA 4Q06A 4YGFA 5FNKA 3FFPX 1CNXA 4HU1A 3S9TA 1CVHA 4TWLA 3DD8A 5SZ1A 1BICA 1BNTA 4BCWA 5JESB 3IGPA 3F7UA 5DSOA 4ZWYA 1I9QA 1CNIA 2AW1A 4E9OX 1CNKA 1KWRA 3KNEA 3M5TA 3MHCA 4RN4A 3DVBA 3ZNCA 1Z9YA 1CANA 2GD8A 5SZ6A 1CAIA 2NWZA 3S72B 4G0CA 1XEGA 3MNIA 4QSIA 4QK1A 5BRUA 2CABA 1G1DA 3NJ9A 1CA3A 5DRSA 4L5UA 3RJ7A 3JXFA 2W2JA 2EU2A 1V9EA 1UGFA 3PYKA 1CRMA 3HKQA 4ZX0A 4K0TA 5DSMA 1IF8A 5JG5B 1I91A 1CNHA 3D92A 4LU3A 3CAJA 5FNLA 4CQ0A 3KKXA 4Q8YA 1TEQX 4KP5A 3JXHC 3MNKA 1ZSCA 3U45X 4PYYA 4HT0A 5FNGA 4CACA 5DOHA 1CAMA 3M2NA 4X5SA 5E2NA 4L5VA 1RAZA 1I9NA 1BNWA 3VBDA 1G46A 1KEQA 1HUHA 3DV7A 3MHIA 1G6VA 3KWAA 2FOVA 3M1WA 1YO1A 2ABEA 1ZFKA 1IF6A 4MDGA 4XIWA 5FDCA 1H9NA 5DSIA 5E2SA 5DSLA 5DVXA 2HL4A 4IDRX 3N0NA 1ZE8A 5BRWA 5JDVB 3M14A 1MUAA 3KONA 1DCAA 4YXIA 4QIYA 3DC3A 4QJWA 3RLDA 3M96A 5IPZA 5EKMA 2Q38A 3TVOX 3MNJA 2POWA 1G4JA 5AMLA 3S73B 5FLRA 3S77B 3RYVB 3S97A 1CINA 3F8EA 4FPTA 1UGDA 1CNJA 5E5RA 1Z93A 3V5GA 4FU5A 5A6HA 2HOCA 3IBIA 12CAA 1I9OA 2H4NA 4RFCA 3HKTA 2FOQA 3KOIA 4L5WA 4YHAA 5C8IA 3DD0A 3DCSA 3DVCA 5CA2A 3BL1A 1YO2A 3DC9A 4ITPA 2FW4A 3U7CA 4HEYA 1LG6A 5DSQA 1BN4A 1THKA 4RFDA 4E3FA 3OILA 3HS4A 3P55A 3R16A 1I9PA 1CAKA 4Q8XA 3M3XA 1HCBA 1XQ0A 5EH5A 3S8XA 3ML5A 4CA2A 4Q7PA 1G45A 1T9NA 3M5SA 1BCDA 3OIKA 4CNWA 3DA2A 4E3DA 1HEDA 1RJ5A 3W6IA 4E3HA 5FLOA 3M2YA 3D0NA 3M98A 4Q7SA 5A25A 1I9LA 1CVFA 1CNBA 3DVDA 1XEVA 4Q7WA 2FNNA 3TVNX 4JSSA 3T5ZA 1G48A 1BNUA 2HKKA 1FLJA 2FMGA 4KUYA 1HUGA 5AMGA 4WR7A 4Z0QA 3RYJB 5FNJA 4BF6A 1ZSBA 1DMXA 3PJJA 5G0CA 2CBBA 3RYZA 4QY3A 4KP8A 4QK3A 3MZCA 1FQNA 1UGBA 3M2XA 4MO8A 3M67A 3N2PA 4JSZA 2FNKA 5EKJA 1IF7A 3OIMA 3ML2A 5FL5A 2WD2A 3DBUA 3DCCA 1Z97A 2ZNCA 4XFWA 1Y7WA 5EH7A 5FLPA 4QTLA 3V2MA 1HCAA 2Q1QA 3D93A 5G01A 3S78B 5EHWA 1YDAA 4PQ7A 4Q0LA 1RZDA 5JG3B 3F7BA 3QYKA 5E28A 5JEHB 4PXXA 1G4OA 1RAYA 4Z1NA 3BL0A 1CVAA 3M5EA 1IF9A 3T85A 4Q08A 1YO0A 1TTMA 1G52A 3S74B 3D8WA 1IF5A 4E4AA 4JS6A 1RZCA 1CRAA 3C7PA 1TG9A 3RYXB 5EHEA 3IBLA 3MHOA 3MWOA 1OKMA 4Q09A 4Q78A 4Q83A 1BNVA 1FR7A 6CA2A 4Q07A 2WEHA 3L14A 4N16A 3MNUA 5E2RA 4Z1JA 1JV0A 5FLTA 1TB0X 1UGEA 4WW8A 4Q90A 4Z1EA 4CNVA 1H4NA 1XPZA 2FMZA 1TBTX 1ZNCA 3CA2A 3LXEA 3F4XA 3N4BA 4XE1A 4YGJA 3SBIA 3TMJA 4ZWXA 1CNWA 1AVNA 3OYSA 5JEPB 1CVDA 3V7XA 5FLSA 4G7AA 3ZP9A 4CNRA 3P3JA 3Q31A 4COQA 5BNLA 3P3HA 1CILA 4Q87A 1G3ZA 5EZTX 2HD6A 4QSAA 1V9IC 4HBAA 1FQLA 2QOAA 4M2UA 4K0SA 1BNNA 5SZ3A 5JQ0A 4QEFA 4RIUA 4QJPA 4N0XB 4R5AA 3T84A 3U47A 4E49A 4KV0A 4BF1A 3M04A 2NNOA 1BZMA 1RZBA 2IT4A 3U3AX 3K2FA 4RUYA 2EZ7A 3B4FA 4MLTA 2CBCA 3MYQA 1OKNA 1BNQA 4WW6A 3RG3A 4YXOA 1YDBA 1I8ZA 2CBEA 3P58A 5AMDA 4FL7A 1RZAA 4YGKA 1H9QA 1CAYA 4M2WA 1YDCA 2X7TA 4QJMA 5G0BA 4RIVA 2HFWA 5JEGB 1CNCA 1DCBA 2FOSA 1AZMA 2WEOA 4KNMA 3SBHA 4K0ZA 5SZ2A 3V3IB 4Q9YA 2NXSA 4UOVA 4QK2A 1BN3A 3OKVA 3OKUA 5FDIA 3BETA 3MHMA 1J9WA 4FIKA 4K1QA 4MTYA 5DSKA 2QO8A 1CCUA 1CIMA 1FSQA 1UGGA 1EOUA 1RZEA 1TH9A 2X7UA 3K34A 5BYIA 1I9MA 3GZ0A 3V3HB 5E5UA 1LGDA 1G54A 1OQ5A 3IBUA 3SAPA 4DZ7A 5FLQA 4TWMA 4XZ5A 4MDLA 5SZ7A 1LUGA 7CA2A 2NN7A 4ITOA 5EOIA 4MLXA 4YGNA 3RG4A 9CA2A 4FVNA 1CVCA 4GL1X 4Q6EA 1CCTA 5DOGA 4JSAA 1CAOA 1I90A 2FOUA 1CVEA 1KOPA 5FNHA 3R17B 5SZ0A 1ZFQA 5CACA 2CBAA 4HF3A 4ZWZA 1FSRA 1DMYA 1OKLA 4WL4A 2NNSA 5DSJA 2GEHA 3PO6A 4KNNA 4Q6DA 4QJ0A 4YWPA 3V3FA 2OSMA 4YXUA 3B1BA 2WEJA 3W6HA 1HECA 1TE3X 3P5AA 3P5LA 3IBNA 4E3GA 4QJXA 1CAHA 3OY0A 1G0FA 4RUZA 1ZGEA 5L3OA 4LHIA 1ZH9A 3KIGA 3SAXA 4Z1KA 5G03A 1G0EA 1CNYA 3RYYA 2OSFA 1MOOA 3HLJA 1CAJA 3HKNA 1UGAA 3IEOA 1CZMA 3HKUA 4R5BA 2WEGA 3FW3A 3T83A 1FSNA 4M2VA 3M2ZA 3S76A 4JSWA 5SZ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2F14 A;  4ZWI A;  3M40 A;  3RZ8 A;  5EH8 A;  2NWP A;  3IAI A;  1BN1 A;  1ZGF A;  2WD3 A;  1F2W A;  4Q49 A;  5EKH A;  1FQR A;  4Q81 A;  4WUQ A;  2NMX A;  1CVB A;  4YVY A;  1JD0 A;  1TEU X;  5FNM A;  4ETQ C;  5DSP A;  4K13 A;  5JGT B;  1CA2 A;  4Q99 A;  4CNX A;  1CAL A;  1FR4 A;  3M1K A;  4PZH A;  3RGE A;  3KS3 A;  2ILI A;  5EIJ A;  4Y0J A;  5E2M A;  3EFT A;  2VVA X;  5CLU A;  4YGL A;  3NB5 A;  1UGC A;  4HT2 A;  1YDD A;  3OYQ A;  3NI5 A;  8CA2 A;  4HEZ A;  4KNI A;  2NNG A;  2FOY A;  4QIZ A;  4XIX A;  3RZ5 A;  3T5U A;  1TG3 A;  3UYN A;  3V2J A;  4YYT A;  3UYQ A;  2NNV A;  1BV3 A;  5LMD A;  1LG5 A;  3MDZ A;  2Q1B A;  3K7K A;  4KAP A;  1LZV A;  5E2K A;  1HEB A;  1HVA A;  3P44 A;  3MMF A;  4WUP A;  3MNA A;  4HEW A;  3M1J A;  1CNG A;  5HPJ A;  3DAZ A;  3RZ1 B;  2FNM A;  1HEA A;  4RUX A;  2H15 A;  1CAZ A;  4FRC A;  3V3G B;  5DSR A;  1URT A;  3FE4 A;  5DSN A;  4YX4 A;  2NXT A;  4ILX A;  4DZ9 A;  1ZSA A;  4LP6 A;  4RH2 A;  4KUW A;  3RZ7 A;  4QJO A;  4KUV A;  2AX2 A;  2NXR A;  2HNC A;  4IWZ A;  2CA2 A; 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