4YVYA

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii in complex with hydroxylamine-o-sulfonamide, a molecule incorporating two zinc-binding groups.
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title A VERSATILE ZINC-BINDING GROUP FOR CARBONIC ANHYDRASE INHIBITORS
rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-03-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4yvyA00
4GL1X 4CA2A 1CAHA 4QK2A 5A25A 4LHIA 3IBUA 4WW8A 4MDLA 1XQ0A 3S9TA 3P4VA 5JG5B 3KKXA 1CVEA 5EH8A 3S75B 4XIWA 4K13A 5DSOA 1CRMA 1RZBA 3N4BA 3M40A 4FRCA 3JXGA 2WD2A 4Z1JA 2NNGA 1KEQA 3M3XA 4QJMA 4FU5A 3V2JA 3RYYA 4C3TA 1ZSCA 2IT4A 5EH5A 3VBDA 4G0CA 1UGFA 1G53A 2NN1A 5BYIA 3DCWA 1TG3A 1RAYA 3OYSA 3MDZA 4JSWA 4L5WA 4RIUA 3KNEA 2NNSA 4Z0QA 1TEUX 4QEFA 3V3HB 5JG3B 2FOYA 3MYQA 4YGLA 2NXSA 1AZMA 4YHAA 1CZMA 2H4NA 1XEVA 3V3IB 5CJFA 1YO1A 3P3JA 3P55A 1XPZA 1ZSAA 3UYQA 4MO8A 4QJWA 1FSRA 1ZSBA 1G0EA 5JEPB 3RG4A 3DVBA 1YO2A 3M1KA 2CBCA 2ZNCA 1UGBA 3S73B 5JEGB 1TE3X 3B1BA 2OSMA 4X5SA 1CA3A 2NWPA 3M67A 3M98A 4LP6A 5DSQA 4Z1NA 5JGSB 4WUQA 5FNJA 1Y7WA 4Z1KA 4M2RA 4QSBA 3SBIA 3GZ0A 1CILA 3BL0A 3RLDA 4Y0JA 1BV3A 4K1QA 2H15A 1LG5A 3P3HA 4R5AA 5DSLA 2WEOA 3KWAA 1ZFKA 2WD3A 2GEHA 1BNQA 3M96A 3ML5A 3N3JA 2HNCA 4Q6EA 4WR7A 5DVXA 1YDDA 4CNRA 4M2WA 4ZAOA 3KIGA 1G45A 3S8XA 4BF1A 2GD8A 3DC9A 1Z97A 4JS6A 4Q8ZA 4QTLA 1KOQA 3LXEA 1CAKA 4XFWA 1FR7A 5E2KA 1BN3A 1G6VA 5EKMA 2WEGA 1UGAA 1I9OA 5BRVA 1YDBA 5E2RA 1CAJA 4Q49A 5E28A 2ABEA 5FLQA 1FSNA 2AX2A 3OILA 1CNYA 4WL4A 1BNMA 1LGDA 3MWOA 1LZVA 4CNVA 5DSIA 5JEHB 1AVNA 2HOCA 4QJXA 1RAZA 5JESB 3PYKA 1RZEA 1Z9YA 3T5ZA 7CA2A 3RZ1B 5FL6A 2EZ7A 3W6IA 4E4AA 3V3FA 4Q7PA 3DBUA 3DD0A 4ZWXA 2NMXA 2NWYA 4MDMA 1JD0A 1T9NA 5SZ7A 2X7UA 3OKVA 5HPJA 4N16A 3FFPX 3QYKA 5SZ2A 3MNJA 2CBDA 4QK1A 4WUPA 1BNWA 1HVAA 4QSIA 5FNKA 2CA2A 4ILXA 5AMGA 5FLTA 3MMFA 3S71B 1UGDA 4BCWA 3KONA 5L6KA 2POUA 2W2JA 3P5AA 1CA2A 4KNIA 2QP6A 1H9QA 1OQ5A 5EH7A 1CNHA 3U45X 4BF6A 5DSNA 1JCZA 1KWRA 4Q8YA 1BNNA 4Q99A 2HD6A 3F7BA 3RYZA 4DZ7A 3S97A 3T82A 5JGTB 3HKNA 1CAZA 1I9QA 1YDAA 3DAZA 3KS3A 3MHOA 4HU1A 1CCSA 2CBAA 1RZCA 1LG6A 4Q78A 5EZTX 1G0FA 3OYQA 1TTMA 2HL4A 3F7UA 1XEGA 4Q81A 5BNLA 1FSQA 4ZWYA 4M2UA 4KNNA 4ZX1A 3DV7A 3MNUA 3RYVB 3DCCA 1CNIA 4L5UA 5G0BA 4Q7VA 1CNJA 3V5GA 4Q7WA 4COQA 3V3JA 3PJJA 1I9NA 2FNKA 5FLOA 4QIZA 5CACA 3Q31A 1BNVA 3F8EA 3T84A 5DRSA 4YGFA 2F14A 4Q90A 1CRAA 3HS4A 4RFDA 4KNMA 5L3OA 3UYNA 1FR4A 2FNNA 5FLRA 3MHIA 1OKMA 5A6HA 3K34A 4FPTA 4Q09A 5E5RA 4K0SA 5EIJA 1IF6A 2X7TA 3HKQA 5FNLA 4PXXA 4Q06A 1CCTA 3KOIA 3M1WA 3BETA 1CNWA 2NXRA 3EFTA 1BCDA 3ML2A 1UGCA 4YXIA 5EKHA 4E3DA 4HF3A 4UOVA 2NWOA 1UGGA 5DSPA 5G01A 3MZCA 3CYUA 1TBTX 4JSAA 4N0XB 2VVBX 4QSAA 5FDIA 1F2WA 2X7SA 3RZ5A 2Q1QA 3TVNX 1YDCA 3R16A 1ZH9A 1CVCA 3RZ8A 3T83A 1DMYA 5E2NA 5JQTA 3DC3A 1TH9A 5FL5A 1H4NA 9CA2A 1CIMA 2OSFA 1G54A 1V9EA 5JDVB 3K2FA 1HUGA 3OKUA 2FMGA 3V7XA 4E3FA 4YGNA 3L14A 2CABA 1HECA 2Q1BA 3M2YA 3MHMA 3MNAA 1CVFA 2ILIA 4Q7SA 2FW4A 2WEJA 5DSKA 5FL4A 5SZ6A 1CAMA 1EOUA 1CVAA 1ZNCA 3FE4A 4CNWA 4YYTA 3DA2A 3NB5A 4WW6A 4YXUA 4KP8A 4ITPA 5FLPA 3D0NA 3SBHA 3PO6A 1HUHA 4FVNA 3M2XA 3RYXB 4QJPA 4RIVA 5AMDA 1BICA 4FVOA 4K0ZA 1CAIA 3MHLA 1YO0A 3IGPA 1BN1A 2FOQA 1IF8A 4Q83A 4R59A 2Q38A 3P58A 3SAXA 3RJ7A 5DOHA 1ZGFA 4YGJA 3SAPA 1CNCA 5C8IA 3N2PA 1URTA 4HBAA 4TWMA 1RZDA 1TEQX 4YGKA 3P5LA 3JXFA 2CBEA 4E9OX 3RGEA 4HT2A 4CNXA 8CA2A 2FOVA 3IBNA 4DZ9A 1MOOA 3HFPA 3RZ0B 2NWZA 5AMLA 1TG9A 5FLSA 1FQLA 4HEZA 1I90A 5FNMA 4K0TA 5DSJA 4M2VA 3M5TA 3T85A 1THKA 1TB0X 1BNUA 1I9LA 3S78B 3HKTA 4E3GA 1Z93A 3M5EA 1G4OA 1IF4A 1DCAA 3MNIA 5E2SA 1H9NA 3V2MA 1G1DA 1DCBA 3D93A 4RN4A 3TVOX 1CVBA 3U3AX 1FQNA 4PQ7A 1HEBA 4RUZA 4QK3A 4XZ5A 3V3GB 3W6HA 4IWZA 5SZ5A 3MNHA 4QIYA 4JSSA 5DSMA 3ZNCA 5BRUA 1MUAA 3M14A 4Q6DA 4CACA 4KUVA 4MTYA 1DMXA 2FNMA 4CQ0A 1LUGA 2AW1A 4PYXA 6CA2A 1KOPA 5EKJA 1ZFQA 4E49A 1IF5A 1OKLA 1HCBA 1RJ6A 1V9IC 2FMZA 5FNIA 4RH2A 1G48A 4YWPA 4Q08A 2CBBA 4KNJA 2QO8A 3M2NA 3U47A 4ITOA 4HEYA 3JXHC 2O4ZA 4RUXA 1CVDA 2EU3A 5FDCA 2HKKA 3MHCA 3D9ZA 3DD8A 4MDGA 4Z1EA 5FNGA 3CAJA 5EHWA 3K7KA 1CNBA 4YXOA 4QY3A 3DVCA 1HEAA 3D8WA 2NXTA 3D92A 4FIKA 1CNGA 4PYYA 2EU2A 4QJ0A 3RYJB 3KLDB 4RFCA 3IEOA 3M1QA 3OIKA 4R5BA 5EHVA 1BZMA 3T5UA 3MNKA 5SZ4A 3IBLA 1CCUA 2POWA 4E5QA 4IDRX 1FQMA 3S74B 1J9WA 3BL1A 4FL7A 5EHEA 4JSZA 4XE1A 2FOSA 3CA2A 1OKNA 3B4FA 3HKUA 4QSJA 4HT0A 4HEWA 4PZHA 3DCSA 1CAOA 1CNXA 3OIMA 1CANA 1CNKA 3NI5A 5EOIA 5G03A 1I9PA 5DOGA 5SZ3A 4Q8XA 4ZWZA 1HEDA 4ETQC 1KWQA 5J8ZA 3R17B 1G46A 4Q87A 1BN4A 3TMJA 2FOUA 3DVDA 1CALA 3FW3A 3KOKA 4ZX0A 1AM6A 1RZAA 1BNTA 4LU3A 3S72B 5JQ0A 1ZE8A 2HFWA 3M5SA 1IF7A 4YX4A 3M04A 2VVAX 3EFIA 3F4XA 4KAPA 5CA2A 3NJ9A 1JV0A 5CLUA 5BRWA 2NN7A 5DSRA 4KV0A 2NNOA 2WEHA 4Q9YA 1CAYA 4Q07A 3ZP9A 1CVHA 5IPZA 4E3HA 3IAIA 3S77B 5FNHA 3OY0A 1I8ZA 4KUWA 5SZ1A 4KP5A 4YVYA 3S76A 1RJ5A 3HLJA 1G4JA 4MLXA 3RG3A 12CAA 1IF9A 4MLTA 2QOAA 3M1JA 3IBIA 5E5UA 1CINA 4G7AA 4XIXA 1I9MA 3CZVA 3M2ZA 4ZWIA 3RZ7A 4L5VA 1FQRA 3N0NA 4RUYA 5SZ0A 3C7PA 5G0CA 1G3ZA 1I91A 4Q0LA 4TWLA 1HCAA 2NNVA 3U7CA 1G52A 1FLJA 5E2MA 1A42A 2POVA 4KUYA 5LMDA 1UGEA 1ZGEA 4QJOA 3P44A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GL1 X;  4CA2 A;  1CAH A;  4QK2 A;  5A25 A;  4LHI A;  3IBU A;  4WW8 A;  4MDL A;  1XQ0 A;  3S9T A;  3P4V A;  5JG5 B;  3KKX A;  1CVE A;  5EH8 A;  3S75 B;  4XIW A;  4K13 A;  5DSO A;  1CRM A;  1RZB A;  3N4B A;  3M40 A;  4FRC A;  3JXG A;  2WD2 A;  4Z1J A;  2NNG A;  1KEQ A;  3M3X A;  4QJM A;  4FU5 A;  3V2J A;  3RYY A;  4C3T A;  1ZSC A;  2IT4 A;  5EH5 A;  3VBD A;  4G0C A;  1UGF A;  1G53 A;  2NN1 A;  5BYI A;  3DCW A;  1TG3 A;  1RAY A;  3OYS A;  3MDZ A;  4JSW A;  4L5W A;  4RIU A;  3KNE A;  2NNS A;  4Z0Q A;  1TEU X;  4QEF A;  3V3H B;  5JG3 B;  2FOY A;  3MYQ A;  4YGL A;  2NXS A;  1AZM A;  4YHA A;  1CZM A;  2H4N A;  1XEV A;  3V3I B;  5CJF A;  1YO1 A;  3P3J A;  3P55 A;  1XPZ A;  1ZSA A;  3UYQ A;  4MO8 A;  4QJW A;  1FSR A;  1ZSB A;  1G0E A;  5JEP B;  3RG4 A;  3DVB A;  1YO2 A;  3M1K A;  2CBC A;  2ZNC A;  1UGB A;  3S73 B;  5JEG B;  1TE3 X;  3B1B A;  2OSM A;  4X5S A;  1CA3 A;  2NWP A;  3M67 A;  3M98 A;  4LP6 A;  5DSQ A;  4Z1N A;  5JGS B;  4WUQ A;  5FNJ A;  1Y7W A;  4Z1K A;  4M2R A;  4QSB A;  3SBI A;  3GZ0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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