4ZWX | Genus

Total Genus 75

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	75
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVTFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLLQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDVGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTEGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLAECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__6493222819117257__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__6493222819117257__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/4zwx/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__6493222819117257__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"6493222819117257","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/4zwx/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__6493222819117257__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Mapping Selective Inhibition of the Cancer-Related Carbonic Anhydrase IX Using Structure-Activity Relationships of Glucosyl-Based Sulfamates. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
molecule tags	Lyase/lyase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	75
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2015-05-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	4zwxA00

4XFWA 1UGGA 4M2WA 1JCZA 1CAZA 4QSIA 3S72B 1DMYA 5SZ4A 1CILA 1TH9A 3SBHA 4COQA 1CNHA 3M1WA 5DSRA 1CVDA 1G54A 3T84A 2EZ7A 1BN1A 1CNJA 1CAHA 1RZCA 3HKQA 4RIVA 4TWMA 4XE1A 2NN1A 1ZGEA 1V9IC 1XPZA 5SZ6A 3OKVA 5JGSB 4R5AA 2FOVA 2GD8A 3M14A 5EH5A 1FSQA 2FNMA 1CVAA 2NXTA 5JDVB 4FVNA 5E2MA 4YHAA 4FIKA 1V9EA 3MDZA 3MMFA 4HT0A 3ZNCA 3W6HA 4KNMA 4CQ0A 4YGJA 1BNUA 1HEDA 3M1KA 5JESB 1LG5A 3ML5A 4ZAOA 2CBDA 5FLOA 4CNWA 3BL0A 1CNYA 1BNWA 4PYXA 3D93A 4Q7SA 3S74B 5FL4A 1YDBA 3M98A 12CAA 3DVCA 4WL4A 4Z1JA 3V7XA 5HPJA 4YWPA 3OILA 5C8IA 1URTA 4TWLA 2CBCA 5CA2A 4BCWA 4M2RA 4Q99A 2X7UA 5FL6A 1CANA 2FOQA 2H15A 3RLDA 3SBIA 4XIWA 3B4FA 4QSAA 4QJ0A 1RJ5A 4Q06A 5DSNA 1OQ5A 2EU3A 1I9NA 5JG3B 4HEWA 4WUQA 4ETQC 3RZ5A 1CINA 1RAYA 4PYYA 1LZVA 1UGCA 3IAIA 1Y7WA 5JQTA 4Q83A 4QJOA 1FSNA 3MYQA 3S73B 1JD0A 5AMDA 3QYKA 3M04A 3MHOA 1FQMA 4RIUA 1I8ZA 4RUZA 5DSQA 3V3JA 4Q87A 2HL4A 4RFCA 3RGEA 1LGDA 3HLJA 1CAKA 4MLTA 1CRMA 4Q7PA 4FVOA 3M5TA 1IF5A 3M40A 2HFWA 4YXOA 2Q38A 4ZX0A 1XQ0A 3HFPA 3EFTA 4PZHA 4Q7WA 8CA2A 4YX4A 2NWYA 2EU2A 3M5EA 3M1JA 1YDDA 2NXSA 5FLPA 4E5QA 1XEGA 5FDIA 3DAZA 3M2NA 4G0CA 4Q49A 1TB0X 4JSAA 4QJMA 4MDLA 1I9PA 1EOUA 4WW8A 5J8ZA 3RG3A 3U3AX 7CA2A 4QK2A 3KNEA 4DZ7A 5DSIA 3V3FA 5E2SA 3KLDB 4HF3A 5G0BA 1ZGFA 4CA2A 2FOUA 1CNKA 4HT2A 1THKA 3M2ZA 2FNNA 3P58A 1TEUX 4IDRX 1CZMA 1OKMA 3MNUA 4Q6DA 5L3OA 3MNAA 1FLJA 2ZNCA 3PO6A 4ZX1A 3RYXB 2F14A 3N0NA 5CLUA 3L14A 2FW4A 1A42A 5FLSA 4Q09A 3C7PA 1I91A 4FU5A 1YO2A 4MO8A 3M67A 5DOHA 3DVDA 5E2KA 3TMJA 4KV0A 2FOYA 3KOIA 3R17B 1ZNCA 5DSLA 3RZ8A 5JEPB 1CAJA 5FNKA 1CCUA 4Q07A 2GEHA 4KUVA 1CCSA 5JG5B 3OYQA 1XEVA 4QIYA 1DCAA 1HCBA 5EHEA 4L5UA 2QO8A 1HEAA 1HECA 1YDCA 5FLTA 4WUPA 3DCCA 1G4JA 3MNKA 3N4BA 5EH8A 4LP6A 3RYJB 1HVAA 1RAZA 3MHCA 6CA2A 3RZ7A 5LMDA 4DZ9A 5SZ7A 1G3ZA 1H9QA 1TE3X 1ZSBA 3M2YA 4RH2A 2FNKA 5DSOA 1Z97A 4E49A 2Q1BA 3JXFA 5EOIA 1CAMA 1G46A 1MUAA 5DOGA 3M2XA 3W6IA 4BF1A 5EH7A 2NWOA 2POUA 5FNMA 1CA3A 1CVHA 5JQ0A 2VVAX 4YVYA 2WD3A 1AVNA 3P5AA 2NN7A 3IBLA 1H4NA 4KNNA 1G45A 4M2UA 4Q08A 3KWAA 3ML2A 3HKUA 3HKTA 1TEQX 4QJWA 2WEJA 1ZFKA 4XIXA 4YYTA 3NI5A 4CNVA 4K13A 4KP8A 5EKJA 1RZDA 1IF9A 2CBAA 5G0CA 1TBTX 4Q8YA 1Z93A 2NNOA 4ZWIA 1CALA 1UGFA 3DC3A 1CA2A 3M96A 2Q1QA 3F7UA 4R5BA 5BRUA 3N2PA 1CIMA 2WEHA 1BNMA 3Q31A 3TVOX 3S76A 2HOCA 4L5WA 3MZCA 1HUHA 1G1DA 1F2WA 4KUWA 5G01A 4KP5A 4MDMA 3DVBA 5EKHA 4ZWYA 4RUXA 3RYYA 4Q0LA 4JS6A 5FLQA 1YO0A 4Q8XA 5FLRA 3KKXA 1G0FA 3BL1A 4L5VA 1CNBA 3HS4A 3B1BA 2AX2A 4ZWZA 1FQLA 1IF4A 4QIZA 5DSPA 3OY0A 1FR7A 5EKMA 2FMGA 4Q90A 1KEQA 1UGDA 2H4NA 5DSMA 3S75B 1OKNA 2NWPA 3IGPA 5BRWA 4RFDA 3S97A 1CCTA 2CA2A 4WR7A 4YGNA 3RYVB 3MNIA 1G48A 5DSJA 5EIJA 4E3HA 1RZAA 1I9OA 1BCDA 5SZ3A 1CVBA 3T82A 1J9WA 1MOOA 4ILXA 4Q9YA 1TG9A 3M1QA 1BV3A 3D8WA 4QTLA 3V5GA 1I9LA 1ZFQA 2IT4A 5A25A 3FE4A 4QSJA 3FW3A 5FNLA 2NNSA 3RZ1B 3DBUA 5CACA 5BYIA 4Q6EA 5DVXA 5EZTX 3FFPX 5JEHB 4WW6A 4K0ZA 2VVBX 3DD8A 3CA2A 2FOSA 3IEOA 4Z1EA 3KOKA 4JSZA 1ZE8A 5E2RA 4MLXA 4LHIA 3S78B 3V3IB 4QEFA 5SZ0A 1BNQA 1LUGA 3EFIA 4GL1X 4YGLA 4RN4A 5DRSA 1CVCA 1G0EA 5BNLA 4QSBA 1FR4A 1CNCA 4FPTA 4YGFA 3UYQA 2AW1A 4RUYA 2HKKA 1TTMA 3OKUA 3MWOA 3RZ0B 5CJFA 4C3TA 1G53A 3P3JA 4HEZA 4E3DA 2ABEA 1UGBA 4LU3A 3R16A 5E28A 1FQNA 3GZ0A 3N3JA 3T5UA 2WD2A 2X7SA 1YO1A 3K34A 3IBUA 1IF6A 1BN3A 3D9ZA 1UGAA 1YDAA 2FMZA 2HNCA 4HU1A 4KAPA 3V3GB 5L6KA 5G03A 1RZBA 3U47A 3OIMA 4Z0QA 4QJXA 4E3GA 1BNNA 1FSRA 3F8EA 2O4ZA 1CVEA 4K0SA 1HEBA 3KIGA 1Z9YA 3PYKA 3F7BA 4CNRA 3V2JA 3TVNX 4BF6A 5FL5A 2NWZA 4HEYA 1H9NA 3U7CA 1KWQA 1BZMA 3IBIA 4E9OX 1LG6A 4JSSA 4ITPA 5SZ5A 5FNIA 3RJ7A 5IPZA 4KNIA 3S77B 3CAJA 5AMGA 2CABA 1JV0A 1OKLA 4E3FA 5A6HA 3KONA 5E2NA 4Q8ZA 3S8XA 1I9MA 3K7KA 1IF7A 5SZ2A 1CNWA 4KNJA 4K1QA 5EHVA 4KUYA 4Q7VA 1DCBA 3P5LA 4XZ5A 5FNJA 4HBAA 3DCSA 3SAPA 3T5ZA 4QK1A 5FNGA 3OYSA 4ITOA 5BRVA 3CZVA 3D0NA 2CBBA 1AZMA 3BETA 4X5SA 5FDCA 2QP6A 5EHWA 3K2FA 2QOAA 5AMLA 4FRCA 4UOVA 1I90A 4CACA 5JEGB 4MDGA 4Q78A 1BNTA 4G7AA 1G4OA 1HCAA 4N16A 3NB5A 9CA2A 2NMXA 3HKNA 2NNGA 4FL7A 3T83A 3VBDA 4Y0JA 3UYNA 4M2VA 1ZH9A 3S9TA 1BN4A 3RG4A 1KWRA 3NJ9A 3RYZA 5DSKA 3ZP9A 3P55A 4E4AA 3F4XA 3SAXA 3P3HA 3T85A 2X7TA 3JXGA 2HD6A 2W2JA 5JGTB 3DCWA 1CNIA 4JSWA 1T9NA 5E5RA 4Z1KA 4PQ7A 4Q81A 1BNVA 4QJPA 2NNVA 1CAIA 4ZWXA 1I9QA 1G6VA 1RZEA 1ZSAA 3KS3A 3LXEA 3M3XA 4IWZA 4YXUA 4PXXA 3M5SA 1BICA 2POWA 4MTYA 2OSMA 3MHMA 2POVA 1FQRA 3DV7A 3P4VA 3P44A 4YXIA 2OSFA 3D92A 4Z1NA 3V3HB 1CNGA 1UGEA 3MNJA 3U45X 3DA2A 3MHLA 5SZ1A 2CBEA 1CVFA 1G52A 2WEGA 4N0XB 3S71B 3V2MA 1RJ6A 1KOPA 4YGKA 3CYUA 2WEOA 3JXHC 1DMXA 1CNXA 3DD0A 1AM6A 1CRAA 4K0TA 3IBNA 4R59A 1CAOA 3PJJA 1ZSCA 1KOQA 4QK3A 2ILIA 2NXRA 1HUGA 1IF8A 1TG3A 4CNXA 5FNHA 3MNHA 3DC9A 3OIKA 3MHIA 4QY3A 5E5UA 1CAYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4XFW A;  1UGG A;  4M2W A;  1JCZ A;  1CAZ A;  4QSI A;  3S72 B;  1DMY A;  5SZ4 A;  1CIL A;  1TH9 A;  3SBH A;  4COQ A;  1CNH A;  3M1W A;  5DSR A;  1CVD A;  1G54 A;  3T84 A;  2EZ7 A;  1BN1 A;  1CNJ A;  1CAH A;  1RZC A;  3HKQ A;  4RIV A;  4TWM A;  4XE1 A;  2NN1 A;  1ZGE A;  1V9I C;  1XPZ A;  5SZ6 A;  3OKV A;  5JGS B;  4R5A A;  2FOV A;  2GD8 A;  3M14 A;  5EH5 A;  1FSQ A;  2FNM A;  1CVA A;  2NXT A;  5JDV B;  4FVN A;  5E2M A;  4YHA A;  4FIK A;  1V9E A;  3MDZ A;  3MMF A;  4HT0 A;  3ZNC A;  3W6H A;  4KNM A;  4CQ0 A;  4YGJ A;  1BNU A;  1HED A;  3M1K A;  5JES B;  1LG5 A;  3ML5 A;  4ZAO A;  2CBD A;  5FLO A;  4CNW A;  3BL0 A;  1CNY A;  1BNW A;  4PYX A;  3D93 A;  4Q7S A;  3S74 B;  5FL4 A;  1YDB A;  3M98 A;  12CA A;  3DVC A;  4WL4 A;  4Z1J A;  3V7X A;  5HPJ A;  4YWP A;  3OIL A;  5C8I A;  1URT A;  4TWL A;  2CBC A;  5CA2 A;  4BCW A;  4M2R A;  4Q99 A;  2X7U A;  5FL6 A;  1CAN A;  2FOQ A;  2H15 A;  3RLD A;  3SBI A;  4XIW A;  3B4F A;  4QSA A;  4QJ0 A;  1RJ5 A;  4Q06 A;  5DSN A;  1OQ5 A;  2EU3 A;  1I9N A;  5JG3 B;  4HEW A;  4WUQ A;  4ETQ C;  3RZ5 A;  1CIN A;  1RAY A;  4PYY A;  1LZV A;  1UGC A;  3IAI A;  1Y7W A;  5JQT A;  4Q83 A;  4QJO A;  1FSN A;  3MYQ A;  3S73 B;  1JD0 A;  5AMD A;  3QYK A;  3M04 A;  3MHO A;  1FQM A;  4RIU A;  1I8Z A;  4RUZ A;  5DSQ A;  3V3J A;  4Q87 A;  2HL4 A;  4RFC A;  3RGE A;  1LGD A;  3HLJ A;  1CAK A;  4MLT A;  1CRM A;  4Q7P A;  4FVO A;  3M5T A;  1IF5 A;  3M40 A;  2HFW A;  4YXO A;  2Q38 A;  4ZX0 A;  1XQ0 A;  3HFP A;  3EFT A;  4PZH A;  4Q7W A;  8CA2 A;  4YX4 A;  2NWY A;  2EU2 A;  3M5E A;  3M1J A;  1YDD A;  2NXS A;  5FLP A;  4E5Q A;  1XEG A;  5FDI A;  3DAZ A;  3M2N A;  4G0C A;  4Q49 A;  1TB0 X;  4JSA A;  4QJM A;  4MDL A;  1I9P A;  1EOU A;  4WW8 A;  5J8Z A;  3RG3 A;  3U3A X;  7CA2 A;  4QK2 A;  3KNE A;  4DZ7 A;  5DSI A;  3V3F A;  5E2S A;  3KLD B;  4HF3 A;  5G0B A;  1ZGF A;  4CA2 A;  2FOU A;  1CNK A;  4HT2 A;  1THK A;  3M2Z A;  2FNN A;  3P58 A;  1TEU X;  4IDR X;  1CZM A;  1OKM A;  3MNU A;  4Q6D A;  5L3O A;  3MNA A;  1FLJ A;  2ZNC A;  3PO6 A;  4ZX1 A;  3RYX B;  2F14 A;  3N0N A;  5CLU A;  3L14 A;  2FW4 A;  1A42 A;  5FLS A;  4Q09 A;  3C7P A;  1I91 A;  4FU5 A;  1YO2 A;  4MO8 A;  3M67 A;  5DOH A;  3DVD A;  5E2K A;  3TMJ A;  4KV0 A;  2FOY A;  3KOI A;  3R17 B;  1ZNC A;  5DSL A;  3RZ8 A;  5JEP B;  1CAJ A;  5FNK A;  1CCU A;  4Q07 A;  2GEH A;  4KUV A;  1CCS A;  5JG5 B;  3OYQ A;  1XEV A;  4QIY A;  1DCA A;  1HCB A;  5EHE A;  4L5U A;  2QO8 A;  1HEA A;  1HEC A;  1YDC A;  5FLT A;  4WUP A;  3DCC A;  1G4J A;  3MNK A;  3N4B A;  5EH8 A;  4LP6 A;  3RYJ B;  1HVA A;  1RAZ A;  3MHC A;  6CA2 A;  3RZ7 A;  5LMD A;  4DZ9 A;  5SZ7 A;  1G3Z A;  1H9Q A;  1TE3 X;  1ZSB A;  3M2Y A;  4RH2 A;  2FNK A;  5DSO A;  1Z97 A;  4E49 A;  2Q1B A;  3JXF A;  5EOI A;  1CAM A;  1G46 A;  1MUA A;  5DOG A;  3M2X A;  3W6I A;  4BF1 A;  5EH7 A;  2NWO A;  2POU A;  5FNM A;  1CA3 A;  1CVH A;  5JQ0 A;  2VVA X;  4YVY A;  2WD3 A;  1AVN A;  3P5A A;  2NN7 A;  3IBL A;  1H4N A;  4KNN A;  1G45 A;  4M2U A;  4Q08 A;  3KWA A;  3ML2 A;  3HKU A;  3HKT A;  1TEQ X;  4QJW A;  2WEJ A;  1ZFK A;  4XIX A;  4YYT A;  3NI5 A;  4CNV A;  4K13 A;  4KP8 A;  5EKJ A;  1RZD A;  1IF9 A;  2CBA A;  5G0C A;  1TBT X;  4Q8Y A;  1Z93 A;  2NNO A;  4ZWI A;  1CAL A;  1UGF A;  3DC3 A;  1CA2 A;  3M96 A;  2Q1Q A;  3F7U A;  4R5B A;  5BRU A;  3N2P A;  1CIM A;  2WEH A;  1BNM A;  3Q31 A;  3TVO X;  3S76 A;  2HOC A;  4L5W A;  3MZC A;  1HUH A;  1G1D A;  1F2W A;  4KUW A;  5G01 A;  4KP5 A;  4MDM A;  3DVB A;  5EKH A;  4ZWY A;  4RUX A;  3RYY A;  4Q0L A;  4JS6 A;  5FLQ A;  1YO0 A;  4Q8X A;  5FLR A;  3KKX A;  1G0F A;  3BL1 A;  4L5V A;  1CNB A;  3HS4 A;  3B1B A;  2AX2 A;  4ZWZ A;  1FQL A;  1IF4 A;  4QIZ A;  5DSP A;  3OY0 A;  1FR7 A;  5EKM A;  2FMG A;  4Q90 A;  1KEQ A;  1UGD A;  2H4N A;  5DSM A;  3S75 B;  1OKN A;  2NWP A;  3IGP A;  5BRW A;  4RFD A;  3S97 A;  1CCT A;  2CA2 A;  4WR7 A;  4YGN A;  3RYV B;  3MNI A;  1G48 A;  5DSJ A;  5EIJ A;  4E3H A;  1RZA A;  1I9O A;  1BCD A;  5SZ3 A;  1CVB A;  3T82 A;  1J9W A;  1MOO A;  4ILX A;  4Q9Y A;  1TG9 A;  3M1Q A;  1BV3 A;  3D8W A;  4QTL A;  3V5G A;  1I9L A;  1ZFQ A;  2IT4 A;  5A25 A;  3FE4 A;  4QSJ A;  3FW3 A;  5FNL A;  2NNS A;  3RZ1 B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4ZWXA

Total Genus

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Chain Sequence

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