5A6HA

Synthesis, carbonic anhydrase inhibition and protein x-ray structure of the unusual natural product primary sulfonamide psammaplin c
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title An Unusual Natural Product Primary Sulfonamide: Synthesis, Carbonic Anhydrase Inhibition and Protein X-Ray Structures of Psammaplin C.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE 2
total genus 79
structure length 259
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-06-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5a6hA00
5DOHA 5FL6A 3S75B 3M98A 3DA2A 4K0SA 4E3FA 1DMXA 5E28A 2ILIA 2CA2A 1G4OA 1Y7WA 5JG5B 2VVAX 3DAZA 4Q9YA 3DBUA 5SZ2A 1OKLA 5JGTB 3HKQA 4KNNA 2ABEA 3V3FA 1TH9A 4QJMA 3DC3A 4Z1NA 4ZX1A 3BL1A 5EKJA 4MDGA 3KWAA 4ZWYA 1OKNA 1AM6A 3KOIA 3DCWA 1UGCA 1FR4A 4XZ5A 1RAZA 3OYQA 3VBDA 3MNIA 3U47A 1FSQA 2CABA 4FU5A 4Q81A 5SZ0A 5SZ7A 4E4AA 2QOAA 5L6KA 1YDDA 4ZX0A 4R5AA 2HL4A 1AZMA 1TEUX 3OIKA 2NNGA 3D0NA 3DVCA 4E9OX 4L5VA 1UGEA 2IT4A 2H4NA 1LUGA 12CAA 3KIGA 8CA2A 4JSAA 5EKHA 1AVNA 3F7BA 1ZE8A 5AMDA 4K0ZA 4M2RA 4R5BA 1CALA 5E5UA 4IWZA 4ZAOA 2NNVA 4QTLA 3UYQA 4R59A 3IGPA 1YDCA 5SZ3A 1KWRA 4QSJA 1BV3A 4Q90A 4MO8A 3R16A 3R17B 4QJXA 5SZ4A 2WEHA 2Q38A 1FQNA 1I8ZA 4WUQA 1RJ6A 3EFTA 4RUZA 3K2FA 1BZMA 4Q0LA 4QK1A 5DSMA 3V3JA 4KNIA 1I9QA 4CNVA 1G53A 4Q6EA 1I9NA 1RZBA 2QP6A 3S72B 2POUA 4Q08A 3V7XA 4MLXA 5CACA 3U7CA 3K34A 4UOVA 3P3HA 1H9QA 4QSAA 2HD6A 5FNKA 3KOKA 1CVFA 5EH5A 5EHEA 1BNWA 4Q8YA 1CAJA 3RYJB 1KWQA 1CVDA 4GL1X 5CJFA 3T85A 1BNUA 1RAYA 4HT2A 4M2UA 1IF8A 3DD0A 2FNKA 3Q31A 5C8IA 3HKTA 4WW8A 2NXSA 1MUAA 3IBLA 4Q09A 3S8XA 1HEAA 3D8WA 3NB5A 4HF3A 5EIJA 1TBTX 1XEVA 1ZFKA 3DVBA 3KNEA 4FPTA 3RZ5A 1HECA 1CVHA 5JEGB 4PYYA 4FIKA 3F4XA 4Q7WA 4JSSA 9CA2A 3F7UA 1FQRA 3MDZA 4G7AA 5EHVA 1CAOA 1MOOA 3IBNA 1JV0A 1CVEA 5A25A 4QJWA 1G3ZA 2VVBX 3M5SA 4YXOA 4Y0JA 5BNLA 3D9ZA 4PXXA 3PJJA 1ZSBA 5DSPA 1XQ0A 7CA2A 2NN7A 3MZCA 1G54A 4YXIA 4TWLA 1CRAA 4X5SA 1XEGA 2O4ZA 4YWPA 1TG9A 1BCDA 1CNYA 2HFWA 1TG3A 1G45A 2CBAA 2GEHA 1LGDA 4BCWA 4Q06A 4QK2A 1ZFQA 1IF7A 5CLUA 3JXHC 3JXFA 3P58A 3T83A 5FLOA 3RZ7A 4KNJA 1YO0A 5BRVA 3M14A 3S74B 3EFIA 3MNUA 5E2NA 5G0BA 1UGGA 1DMYA 3OY0A 3CYUA 4E49A 1BNQA 3SAPA 2EU2A 5G01A 1EOUA 5DVXA 3D93A 3M1KA 3M2ZA 1TB0X 1XPZA 2H15A 5DSLA 2NXRA 2FOVA 2POVA 1CAIA 4Q8XA 1RZEA 3MHCA 3MNJA 1Z93A 2NWYA 4Q99A 1ZSAA 5EH8A 5FDCA 3RZ8A 3V2MA 1BN3A 1IF6A 4RFDA 5JESB 1CANA 4XFWA 5G0CA 1CVBA 2Q1QA 3RYZA 1RJ5A 3DD8A 2FNMA 2FOQA 5FDIA 3DV7A 4L5UA 4XE1A 5AMLA 2FMZA 4YGKA 3HFPA 4JS6A 5FNIA 3CZVA 1DCBA 1BN1A 1JD0A 2GD8A 1CNIA 3V3IB 1I9OA 4FRCA 4Q07A 5SZ6A 4Q7SA 4N16A 5IPZA 2OSMA 3K7KA 4QIYA 4CACA 1CNJA 4YHAA 3F8EA 5L3OA 4ITPA 5FL5A 1LG5A 2NXTA 4CA2A 3HLJA 1FLJA 1RZAA 4BF6A 4ILXA 3M2NA 2CBCA 3N4BA 5CA2A 3NI5A 3P5AA 1TTMA 4MDMA 4Z1JA 5JG3B 3RG3A 1HEDA 3S76A 4G0CA 3N2PA 3IEOA 1JCZA 3HKUA 3RYXB 3S9TA 1CNHA 4QIZA 1CAMA 3RLDA 5DSIA 1RZDA 1CINA 1ZGFA 3KONA 5FNMA 1V9EA 1A42A 4JSZA 3T5UA 2QO8A 3KKXA 4HT0A 1HCAA 4CNXA 1URTA 4K13A 4QJ0A 1BNMA 1ZSCA 4MDLA 1CRMA 1HCBA 1H4NA 4PYXA 5EOIA 3FE4A 4YGFA 3SBHA 5E2RA 1IF9A 4QY3A 1UGBA 1LG6A 4IDRX 4E5QA 3M2YA 3OILA 1G6VA 1ZGEA 4QJPA 3GZ0A 5FLRA 3V2JA 4RIUA 5E5RA 1UGAA 1THKA 1Z97A 3KS3A 4M2WA 2AX2A 4Z1KA 4FVOA 2WEGA 5JEHB 3HKNA 1BICA 3DCCA 1CILA 4WW6A 4XIXA 4CQ0A 4RH2A 4RFCA 3TMJA 1OKMA 3MNKA 4ZWZA 5JQ0A 4RIVA 5DSJA 3N0NA 1IF5A 3CAJA 1I90A 3FFPX 1ZNCA 3SBIA 3P5LA 4RUYA 4ZWXA 1IF4A 3M5EA 1G4JA 1Z9YA 2AW1A 2FNNA 4Q87A 3P3JA 1G46A 2POWA 3MNAA 1I9LA 4Q7VA 5DRSA 1CCSA 4YX4A 2HOCA 4Z1EA 5DSKA 2W2JA 4WR7A 1CA2A 1I91A 3N3JA 1HVAA 4MLTA 3L14A 5FLSA 4ZWIA 5EHWA 3MYQA 5EZTX 3V3GB 3C7PA 4YVYA 2EU3A 3QYKA 3MHMA 2FW4A 1CIMA 3D92A 5HPJA 3CA2A 4HEYA 4HBAA 4E3DA 2FMGA 4N0XB 4WL4A 3MMFA 4CNWA 4PZHA 3SAXA 4BF1A 3B4FA 5FLPA 2NMXA 3RZ0B 2FOUA 1CNCA 1BN4A 2NWZA 1YDBA 1CNKA 5J8ZA 3RJ7A 4E3GA 3V3HB 3DC9A 3MHOA 1TEQX 4YGJA 1BNVA 5BRWA 2X7TA 1HEBA 4TWMA 3T82A 4DZ7A 3OKVA 4KAPA 4XIWA 3RG4A 4CNRA 3UYNA 1KOPA 1RZCA 3OYSA 3B1BA 1HUHA 3ML2A 3OIMA 3U45X 2Q1BA 2HNCA 4FL7A 1CAKA 2WEOA 5FNGA 3T5ZA 5FLTA 4YGNA 3RGEA 1T9NA 1FR7A 1J9WA 3P55A 3M96A 4JSWA 5BYIA 3M67A 1CCTA 3ML5A 4COQA 4YGLA 4LP6A 2X7UA 4KUYA 4YXUA 3M1QA 4RUXA 3DCSA 2CBBA 4Q6DA 4MTYA 3T84A 2FOSA 3RZ1B 5FNLA 1ZH9A 4LU3A 4M2VA 1OQ5A 2NNSA 1V9IC 3BETA 3S77B 5DSRA 4Q7PA 4YYTA 3HS4A 3RYYA 1CNGA 2OSFA 4QK3A 5A6HA 3ZNCA 1UGFA 1G1DA 4L5WA 1TE3X 1CA3A 3M5TA 4LHIA 4Z0QA 2WD2A 3PO6A 4PQ7A 1CAZA 1CNWA 5G03A 1H9NA 4KUVA 5E2SA 2WEJA 4K1QA 2WD3A 3V5GA 3DVDA 3RYVB 3IBIA 1YDAA 1FSNA 1FSRA 3TVNX 5EH7A 5E2KA 5JDVB 1CVCA 4QEFA 2CBDA 1F2WA 1CCUA 3M1JA 1UGDA 2NN1A 3M3XA 3M40A 3MHLA 5JQTA 1YO1A 1KEQA 5SZ1A 4Q83A 3KLDB 4RN4A 5EKMA 1FQLA 2FOYA 1KOQA 5SZ5A 4QJOA 1CNBA 3FW3A 5FNJA 3S73B 3ZP9A 3MNHA 2CBEA 2ZNCA 2X7SA 3S97A 2NWOA 1FQMA 2NWPA 4HU1A 4HEWA 5DSOA 3S71B 5E2MA 3S78B 5FLQA 4Q78A 1CAHA 4ITOA 3M2XA 1CNXA 5AMGA 6CA2A 3P4VA 4WUPA 3W6IA 2NNOA 1LZVA 3M1WA 3MHIA 1G0EA 4C3TA 1CAYA 4E3HA 2HKKA 1CZMA 1I9PA 3IAIA 5DSNA 1BNNA 1HUGA 3P44A 3MWOA 4DZ9A 4K0TA 3TVOX 5DOGA 1BNTA 5BRUA 2F14A 3M04A 4QSIA 3NJ9A 4HEZA 4KUWA 4ETQC 1G48A 3U3AX 1G0FA 5JEPB 3LXEA 5FL4A 4Q49A 5JGSB 1DCAA 2EZ7A 1I9MA 1CVAA 1YO2A 4KV0A 4QSBA 5LMDA 3IBUA 3W6HA 4FVNA 1G52A 4KNMA 4KP5A 5DSQA 3JXGA 3PYKA 4KP8A 5FNHA 4Q8ZA 3BL0A 3OKUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5DOH A;  5FL6 A;  3S75 B;  3M98 A;  3DA2 A;  4K0S A;  4E3F A;  1DMX A;  5E28 A;  2ILI A;  2CA2 A;  1G4O A;  1Y7W A;  5JG5 B;  2VVA X;  3DAZ A;  4Q9Y A;  3DBU A;  5SZ2 A;  1OKL A;  5JGT B;  3HKQ A;  4KNN A;  2ABE A;  3V3F A;  1TH9 A;  4QJM A;  3DC3 A;  4Z1N A;  4ZX1 A;  3BL1 A;  5EKJ A;  4MDG A;  3KWA A;  4ZWY A;  1OKN A;  1AM6 A;  3KOI A;  3DCW A;  1UGC A;  1FR4 A;  4XZ5 A;  1RAZ A;  3OYQ A;  3VBD A;  3MNI A;  3U47 A;  1FSQ A;  2CAB A;  4FU5 A;  4Q81 A;  5SZ0 A;  5SZ7 A;  4E4A A;  2QOA A;  5L6K A;  1YDD A;  4ZX0 A;  4R5A A;  2HL4 A;  1AZM A;  1TEU X;  3OIK A;  2NNG A;  3D0N A;  3DVC A;  4E9O X;  4L5V A;  1UGE A;  2IT4 A;  2H4N A;  1LUG A;  12CA A;  3KIG A;  8CA2 A;  4JSA A;  5EKH A;  1AVN A;  3F7B A;  1ZE8 A;  5AMD A;  4K0Z A;  4M2R A;  4R5B A;  1CAL A;  5E5U A;  4IWZ A;  4ZAO A;  2NNV A;  4QTL A;  3UYQ A;  4R59 A;  3IGP A;  1YDC A;  5SZ3 A;  1KWR A;  4QSJ A;  1BV3 A;  4Q90 A;  4MO8 A;  3R16 A;  3R17 B;  4QJX A;  5SZ4 A;  2WEH A;  2Q38 A;  1FQN A;  1I8Z A;  4WUQ A;  1RJ6 A;  3EFT A;  4RUZ A; 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