5CLUA

The crystal structure of the complex of hcaii with a saccharine derivative
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A Combined Crystallographic and Theoretical Study Explains the Capability of Carboxylic Acids to Adopt Multiple Binding Modes in the Active Site of Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5cluA00
4Q49A 3T85A 1RZBA 4DZ7A 5L6KA 4PXXA 4RIVA 1CAIA 1FQMA 4YXUA 3M14A 3DD8A 1CIMA 4CNRA 2WEJA 4YVYA 1BN1A 4MTYA 1CNGA 4KP5A 4ZAOA 3RJ7A 1TG9A 1UGFA 4N0XB 2NWPA 5CLUA 5L3OA 5DRSA 2IT4A 4UOVA 4WUPA 2FMZA 3MMFA 4Y0JA 2Q1QA 1Z97A 5JQ0A 1I9NA 3R17B 3M1QA 1UGDA 3OIMA 3U45X 4YXIA 1TEUX 4M2WA 4JSSA 3RG4A 3M1WA 4M2VA 5FNGA 2FNKA 2H15A 3V3IB 2NWOA 1CNJA 2QP6A 5EIJA 3U7CA 4Q90A 1HCAA 3DVBA 4RUZA 1OKNA 4RFDA 4HU1A 4MDGA 5DSPA 4E3HA 1Z93A 4TWLA 2CBBA 2NXSA 4ZWIA 2GD8A 3TVNX 1FQLA 3M1JA 1HCBA 3S73B 3SAXA 3CA2A 3MHCA 3MNUA 2FNMA 4IDRX 4Q8XA 1UGAA 1G4JA 3P55A 2NNSA 1IF6A 4WL4A 1T9NA 3T83A 3RZ1B 1CNCA 4QSIA 2AX2A 1CVAA 1CCUA 4CNXA 1F2WA 1KEQA 1V9IC 1XEGA 4QTLA 2HOCA 1G52A 1BZMA 5FLRA 5SZ6A 5JESB 3EFTA 4K1QA 1ZFKA 1AZMA 1I8ZA 3S72B 4QJ0A 5BNLA 1UGCA 2HFWA 1CRMA 3JXGA 1CANA 1CVDA 3OY0A 3RGEA 4YGKA 3RYXB 1ZSBA 3EFIA 4Q81A 4TWMA 1IF8A 3KWAA 3JXHC 2EU2A 2F14A 2W2JA 3RZ8A 2CA2A 7CA2A 1AM6A 3M40A 3SAPA 3M2NA 5DVXA 1ZFQA 3LXEA 3Q31A 3KOKA 4C3TA 3V3HB 2POWA 1G48A 3BETA 3S74B 1V9EA 3V3GB 1HEAA 3D0NA 3MHLA 3OKVA 4JSAA 3OYQA 3MZCA 4Q7VA 3KKXA 3S77B 1HEDA 1YDAA 2ABEA 3SBHA 2Q1BA 2CBDA 2EZ7A 1BNTA 2VVBX 3M04A 2NNOA 4LU3A 4YGLA 3ML2A 12CAA 3RYVB 3C7PA 4MO8A 3P58A 3W6HA 4L5UA 4Q7SA 4Q9YA 5BRVA 3V2JA 1FSNA 2X7TA 3IBLA 4BF6A 1BNNA 5EOIA 1BN4A 1CNIA 1HUHA 5A6HA 4G0CA 3BL0A 3DCCA 3KIGA 3M2XA 5EH7A 4WR7A 4YXOA 4Q08A 4FU5A 5AMLA 5DOHA 3K2FA 1CA3A 1TBTX 4Q07A 4CACA 1G0EA 3MNHA 5G0BA 4RIUA 4Z1JA 1LZVA 3B1BA 3M1KA 4QK3A 5DSQA 1BNUA 3CYUA 5E2MA 4Q09A 4Q83A 4WW6A 5FL6A 4KV0A 4XIWA 2GEHA 3KS3A 1TB0X 3M67A 2NWYA 1I91A 2POUA 1CAYA 5JGTB 2WEHA 1BCDA 3MHMA 4BCWA 4KUWA 1BICA 4QSJA 5FL4A 4Q6DA 2NNGA 3TMJA 1G0FA 5J8ZA 3B4FA 3UYQA 4DZ9A 5FLTA 4LHIA 3D8WA 3HKQA 4PYYA 3MNKA 3FW3A 1CNXA 3QYKA 5SZ2A 3N0NA 1THKA 2NWZA 4BF1A 3F4XA 4M2UA 3UYNA 5JDVB 3T82A 4PQ7A 5FDCA 4Q7PA 5LMDA 3V3JA 1CINA 4XZ5A 1IF9A 1ZNCA 1RJ6A 3M2YA 1G46A 4K0TA 4Z1KA 1HEBA 2CABA 3FFPX 3MDZA 5FDIA 5FL5A 4E49A 2POVA 4Q06A 3CZVA 5SZ5A 1XEVA 1Z9YA 3L14A 4L5VA 2FW4A 2ILIA 3IEOA 1H9QA 3K34A 4Q6EA 1CVHA 3K7KA 1H4NA 4CQ0A 1XPZA 3MNIA 3IBIA 1JV0A 3R16A 5E5RA 2EU3A 3V2MA 4E3FA 5G03A 4E3GA 2QOAA 5DOGA 4K0ZA 4YX4A 5EHEA 3ML5A 5IPZA 4PZHA 5FNIA 5FNKA 4HT2A 3F8EA 3HKUA 4Q99A 4ETQC 5EKJA 1HVAA 4HEWA 2FOVA 4G7AA 1HECA 4QK1A 4MLTA 5CA2A 3ZNCA 4RH2A 5SZ0A 3S9TA 3PJJA 5JGSB 1H9NA 4HF3A 1ZSCA 3MYQA 3VBDA 1A42A 5G0CA 1CVEA 4JSZA 3GZ0A 4MDMA 1OKMA 4ZWYA 3U47A 5DSJA 4ZWXA 4KNJA 3ZP9A 3MNAA 4YGNA 4ITPA 5BYIA 1YDBA 3OYSA 4K0SA 4Q78A 1CVBA 4QIYA 5EHWA 1BNQA 3DC3A 3RG3A 4ILXA 1EOUA 5EH5A 4Q87A 4Q7WA 1FSRA 2WEGA 3OIKA 3PYKA 3DC9A 3N3JA 1CAMA 3P4VA 2NMXA 5E2SA 1CAHA 2NXRA 3M5EA 1IF4A 4QSAA 5EKHA 1CAKA 3FE4A 2VVAX 1RZDA 5EZTX 3P5LA 3S78B 4E3DA 5FNHA 5DSRA 2WD2A 4IWZA 5JEPB 4ITOA 5AMGA 4FVNA 2WD3A 3RYJB 4R59A 1ZE8A 3RZ0B 4KNIA 4FIKA 1KWQA 1YDDA 3S71B 1DCBA 1MUAA 3S75B 3T84A 3BL1A 5FLOA 3V7XA 1OQ5A 9CA2A 1YO1A 5JG5B 5SZ4A 5DSMA 3M3XA 1G1DA 3NJ9A 5DSKA 4QJXA 5HPJA 3IGPA 1RZCA 4PYXA 3U3AX 1CNBA 3HS4A 2X7SA 3DA2A 5BRUA 1JCZA 5CJFA 2NN7A 2ZNCA 4MLXA 1ZH9A 3S97A 5CACA 3DCWA 3RLDA 3DVCA 1BNWA 1CRAA 4QSBA 4HEYA 1KOPA 4Z1NA 2AW1A 4XIXA 1G53A 4MDLA 5FNMA 1RAZA 5G01A 1CZMA 3S76A 4R5AA 4K13A 5AMDA 1LUGA 1CNYA 2NXTA 5JEGB 3M5TA 5EKMA 4KNMA 5E2NA 1UGBA 4N16A 3MHOA 4X5SA 3MWOA 3V5GA 4E4AA 1G4OA 3NI5A 1CVCA 5E2RA 1BNMA 2OSFA 4QEFA 3N2PA 4ZWZA 4WW8A 4Z0QA 3F7BA 1I9MA 3KOIA 4WUQA 5SZ3A 2HD6A 2FOUA 1CILA 3SBIA 1G45A 1J9WA 3IBUA 1HUGA 5C8IA 4E9OX 3DV7A 4JSWA 3M96A 4COQA 1TTMA 1YDCA 4CNWA 3N4BA 1CA2A 4M2RA 4Q8YA 1ZSAA 3M2ZA 3P3JA 4QJMA 3RZ5A 3V3FA 1FQRA 3P3HA 2CBCA 1RZAA 4FRCA 4RFCA 5FNJA 4RUXA 3RYYA 3JXFA 2FOYA 1CCSA 1CAZA 1AVNA 1G54A 5SZ7A 4Q8ZA 1JD0A 2HL4A 1CNWA 4YGJA 5A25A 4XFWA 2Q38A 1LG5A 3TVOX 4QJWA 1CVFA 1RAYA 3DBUA 3NB5A 5FLSA 2OSMA 4CA2A 3KLDB 3T5UA 1FR7A 2QO8A 1ZGEA 1LG6A 3W6IA 1YO0A 4KP8A 1I90A 5DSIA 4KUYA 1UGEA 5DSOA 3MHIA 3M5SA 5E28A 5E2KA 1CNHA 4ZX0A 3CAJA 3T5ZA 1KWRA 4HBAA 3D92A 1Y7WA 3PO6A 1TH9A 1XQ0A 3DD0A 1CAOA 4ZX1A 1CAJA 3D93A 1BV3A 1YO2A 3HLJA 3KNEA 4RUYA 3S8XA 2HNCA 4LP6A 1G6VA 1FSQA 1MOOA 5FNLA 4FL7A 1ZGFA 1I9LA 4QJPA 1CALA 1URTA 2FOSA 2H4NA 1TEQX 1RZEA 3KONA 1RJ5A 4QY3A 2NN1A 4QJOA 4FPTA 5DSLA 1BN3A 2FMGA 1FR4A 5DSNA 4QIZA 1DMXA 4QK2A 1I9OA 1DMYA 2CBAA 2WEOA 5JG3B 3DVDA 3HKNA 1FQNA 1FLJA 1CCTA 3MNJA 6CA2A 1OKLA 4Z1EA 3D9ZA 2FOQA 1TE3X 4Q0LA 5FLQA 3RYZA 4YHAA 5BRWA 2NNVA 5E5UA 2X7UA 5JQTA 3F7UA 4JS6A 1IF5A 4FVOA 3HKTA 1DCAA 2O4ZA 4KUVA 4L5WA 4R5BA 3RZ7A 4GL1X 3IBNA 4XE1A 4HEZA 8CA2A 4KNNA 1IF7A 2HKKA 1LGDA 3M98A 4HT0A 4E5QA 3OKUA 4RN4A 1TG3A 1UGGA 1BNVA 3HFPA 4CNVA 3OILA 4YWPA 2FNNA 1I9QA 1CNKA 4KAPA 4YYTA 3P44A 5SZ1A 3P5AA 1I9PA 2CBEA 1G3ZA 5JEHB 3IAIA 3DCSA 5FLPA 1KOQA 3DAZA 5EHVA 4YGFA 5EH8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q49 A;  3T85 A;  1RZB A;  4DZ7 A;  5L6K A;  4PXX A;  4RIV A;  1CAI A;  1FQM A;  4YXU A;  3M14 A;  3DD8 A;  1CIM A;  4CNR A;  2WEJ A;  4YVY A;  1BN1 A;  4MTY A;  1CNG A;  4KP5 A;  4ZAO A;  3RJ7 A;  1TG9 A;  1UGF A;  4N0X B;  2NWP A;  5CLU A;  5L3O A;  5DRS A;  2IT4 A;  4UOV A;  4WUP A;  2FMZ A;  3MMF A;  4Y0J A;  2Q1Q A;  1Z97 A;  5JQ0 A;  1I9N A;  3R17 B;  3M1Q A;  1UGD A;  3OIM A;  3U45 X;  4YXI A;  1TEU X;  4M2W A;  4JSS A;  3RG4 A;  3M1W A;  4M2V A;  5FNG A;  2FNK A;  2H15 A;  3V3I B;  2NWO A;  1CNJ A;  2QP6 A;  5EIJ A;  3U7C A;  4Q90 A;  1HCA A;  3DVB A;  4RUZ A;  1OKN A;  4RFD A;  4HU1 A;  4MDG A;  5DSP A;  4E3H A;  1Z93 A;  4TWL A;  2CBB A;  2NXS A;  4ZWI A;  2GD8 A;  3TVN X;  1FQL A;  3M1J A;  1HCB A;  3S73 B;  3SAX A;  3CA2 A;  3MHC A;  3MNU A;  2FNM A;  4IDR X;  4Q8X A;  1UGA A;  1G4J A;  3P55 A;  2NNS A;  1IF6 A;  4WL4 A;  1T9N A;  3T83 A;  3RZ1 B;  1CNC A;  4QSI A;  2AX2 A;  1CVA A;  1CCU A;  4CNX A;  1F2W A;  1KEQ A;  1V9I C;  1XEG A;  4QTL A;  2HOC A;  1G52 A;  1BZM A;  5FLR A; 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